当前蛋白身份：Q05123
重新检索
差异标签只比较当前检索结果；所有PDB和assembly原始记录仍分别保留。
相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 3WEE Structure of the full-length yeast Arp7-Arp9 Heterodimer 提交 2013-07-06 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–467（467 aa）
|
突变：M1G 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | SO4 SULFATE ION × 4 CXS 3-CYCLOHEXYL-1-PROPYLSULFONIC ACID × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 10.5；277 K；2M sodium/potassium phosphate, 100mM CAPS/NaOH, pH 10.5, 200mM lithium sulfate, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
|
分辨率 3.10 Å R-free 0.220 |
| 4I6M Structure of Arp7-Arp9-Snf2(HSA)-RTT102 subcomplex of SWI/SNF chromatin remodeler. 提交 2012-11-29 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 B
1–246（246 aa）
片段：UNP residues 1-246, 275-467
链 B
275–467（193 aa）
片段：UNP residues 1-246, 275-467
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | PO4 PHOSPHATE ION × 12 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；294 K；1.6 - 2.0 M Ammonium Phosphate, 0.1mM HEPES, pH 7.5, 1mM DTT, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 294K
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.223 |
| 5TGC Structure of the hetero-trimer of Rtt102-Arp7/9 bound to ATP 提交 2016-09-27 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 B
1–467（467 aa）
|
未记录 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SO4 SULFATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291.5 K；0.17M Ammonium Sulfate, 20% PEG 3350, 17 mM EDTA
|
分辨率 3.25 Å R-free 0.322 |
| 5TGC Structure of the hetero-trimer of Rtt102-Arp7/9 bound to ATP 提交 2016-09-27 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 E
1–467（467 aa）
|
未记录 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SO4 SULFATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291.5 K；0.17M Ammonium Sulfate, 20% PEG 3350, 17 mM EDTA
|
分辨率 3.25 Å R-free 0.322 |
| 5TGC Structure of the hetero-trimer of Rtt102-Arp7/9 bound to ATP 提交 2016-09-27 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 B
1–467（467 aa）
链 E
1–467（467 aa）
|
未记录 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 SO4 SULFATE ION × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291.5 K；0.17M Ammonium Sulfate, 20% PEG 3350, 17 mM EDTA
|
分辨率 3.25 Å R-free 0.322 |
| 6KW3 The ClassA RSC-Nucleosome Complex 提交 2019-09-05 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric（28） 与全部聚合物一致 |
链 g
1–467（467 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 7.13 Å |
| 6KW4 The ClassB RSC-Nucleosome Complex 提交 2019-09-06 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric（28） 与全部聚合物一致 |
链 g
1–467（467 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 7.55 Å |
| 6KW5 The ClassC RSC-Nucleosome Complex 提交 2019-09-06 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric（28） 与全部聚合物一致 |
链 g
1–467（467 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 10.13 Å |
| 6TDA Structure of SWI/SNF chromatin remodeler RSC bound to a nucleosome 提交 2019-11-08 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 21 PDB 声明：23-meric（23） 与全部聚合物一致 |
链 U
2–467（466 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | ZN ZINC ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 15.00 Å |
| 6UXW SWI/SNF nucleosome complex with ADP-BeFx 提交 2019-11-08 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric（28） 与全部聚合物一致 |
链 Q
1–467（467 aa）
|
未记录 | PO4 PHOSPHATE ION × 12 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.9；10 mM HEPES, pH 7.9, 10 mM MgCl2, 50 mM KCl, 1 mM DTT, 5% glycerol, 0.05% NP-40
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 8.96 Å |
| 6V92 RSC-NCP 提交 2019-12-13 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 33 PDB 声明：35-meric（35） 与全部聚合物一致 |
链 B
1–467（467 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 20.00 Å |
| 6VZ4 Cryo-EM structure of Sth1-Arp7-Arp9-Rtt102 bound to the nucleosome in ADP Beryllium Fluoride state 提交 2020-02-27 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：tetradecameric（14） 与全部聚合物一致 |
链 M
1–467（467 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；4 second blot time, blot force 20
|
分辨率 3.90 Å |
| 6VZG Cryo-EM structure of Sth1-Arp7-Arp9-Rtt102 提交 2020-02-28 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 M
1–467（467 aa）
|
未记录 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；4 second blot time, blot force 20
|
分辨率 4.20 Å |
| 7C4J Cryo-EM structure of the yeast Swi/Snf complex in a nucleosome free state 提交 2020-05-18 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric（12） 与蛋白数一致 |
链 L
1–467（467 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.89 Å |
| 7EGP The structure of SWI/SNF-nucleosome complex 提交 2021-03-24 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 19 PDB 声明：21-meric（21） 与全部聚合物一致 |
链 N
1–467（467 aa）
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 6.90 Å |