当前蛋白身份:Q06265 重新检索
本组结构的主要差异维度
构建体不同 组装状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量指标不同

差异标签只比较当前检索结果;所有PDB和assembly原始记录仍分别保留。

相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
6D6Q Human nuclear exosome-MTR4 RNA complex - overall reconstruction 提交 2018-04-22 Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 13 PDB 声明:pentadecameric(15) 与全部聚合物一致
链 A 1–456(456 aa)
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 1 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE;30 sec wait time, 2.5 sec blot time
分辨率 3.45 Å
6D6R Human nuclear exosome-MTR4 RNA complex - composite map after focused reconstruction 提交 2018-04-22 Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 13 PDB 声明:pentadecameric(15) 与全部聚合物一致
链 A 1–456(456 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE;30 sec wait time, 2.5 sec blot time
分辨率 3.45 Å
6H25 Human nuclear RNA exosome EXO-10-MPP6 complex 提交 2018-07-13 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 11 PDB 声明:dodecameric(12) 与全部聚合物一致
链 A 1–439(439 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.80 Å
9G8M human 80S ribosome bound by a SKI2-exosome complex 提交 2024-07-23 Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 87 PDB 声明:92-meric(92) 与全部聚合物一致
链 K 1–439(439 aa)
未记录 MG MAGNESIUM ION × 232 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.30 Å
9G8N 80S-bound human Ski2-exosome complex 提交 2024-07-23 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 12 PDB 声明:13-meric(13) 与全部聚合物一致
链 K 1–439(439 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.70 Å
9G8O human 40S ribosome bound by a SKI238-exosome complex 提交 2024-07-23 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 49 PDB 声明:51-meric(51) 与全部聚合物一致
链 K 1–439(439 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.40 Å
9G8P 40S-bound human SKI2-exosome complex 提交 2024-07-23 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 12 PDB 声明:13-meric(13) 与全部聚合物一致
链 K 1–439(439 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 7.00 Å