当前蛋白身份：Q0ZME7
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 5I08 Prefusion structure of a human coronavirus spike protein 提交 2016-02-03 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
14–1276（1263 aa）
链 B
14–1276（1263 aa）
链 C
14–1276（1263 aa）
|
突变：R751G, R752G, K753S, R754G, R755S,R751G, R752G, K753S, R754G, R755S 突变：R751G, R752G, K753S, R754G, R755S,R751G, R752G, K753S, R754G, R755S 突变：R751G, R752G, K753S, R754G, R755S,R751G, R752G, K753S, R754G, R755S | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；3 uL sample was applied to grid, blotted, and plunged into liquid ethane.
|
分辨率 4.04 Å |
| 8S0M Crystal structure of the HKU1 receptor binding domain in complex with TMPRSS2 and the nanobody A01 提交 2024-02-14 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
307–672（366 aa）
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3 PO4 PHOSPHATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；0.35 M NaH2PO4, 0.65 M K2HPO4
|
分辨率 3.55 Å R-free 0.221 |
| 8S0M Crystal structure of the HKU1 receptor binding domain in complex with TMPRSS2 and the nanobody A01 提交 2024-02-14 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 D
307–672（366 aa）
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；0.35 M NaH2PO4, 0.65 M K2HPO4
|
分辨率 3.55 Å R-free 0.221 |
| 8Y87 Structure of HCoV-HKU1C spike in the functionally anchored-1up conformation with 1TMPRSS2 提交 2024-02-06 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
14–1276（1263 aa）
链 B
14–1276（1263 aa）
链 C
14–1276（1263 aa）
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 22 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.26 Å |
| 8Y88 Structure of HCoV-HKU1C spike in the functionally anchored-2up conformation with 2TMPRSS2 提交 2024-02-06 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 A
14–1276（1263 aa）
链 B
14–1276（1263 aa）
链 C
14–1276（1263 aa）
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 18 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.03 Å |
| 8Y89 Structure of HCoV-HKU1C spike in the functionally anchored-3up conformation with 2TMPRSS2 提交 2024-02-06 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 A
14–1276（1263 aa）
链 B
14–1276（1263 aa）
链 C
14–1276（1263 aa）
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 13 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.32 Å |
| 8Y8A Structure of HCoV-HKU1C spike in the functionally anchored-3up conformation with 3TMPRSS2 提交 2024-02-06 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 A
14–1276（1263 aa）
链 B
14–1276（1263 aa）
链 C
14–1276（1263 aa）
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 10 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.19 Å |
| 8Y8B Local structure of HCoV-HKU1C spike in complex with TMPRSS2 and glycan 提交 2024-02-06 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
14–1276（1263 aa）
链 B
14–1276（1263 aa）
|
未记录 | MJJ methyl 9-O-acetyl-5-acetamido-3,5-dideoxy-D-glycero-alpha-D-galacto-non-2-ulopyranosidonic acid × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 5 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.01 Å |
| 8Y8C Structure of HCoV-HKU1C spike in the inactive-closed conformation 提交 2024-02-06 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
14–1276（1263 aa）
链 B
14–1276（1263 aa）
链 C
14–1276（1263 aa）
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 25 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.95 Å |
| 8Y8D Structure of HCoV-HKU1C spike in the inactive-1up conformation 提交 2024-02-06 | Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
14–1276（1263 aa）
链 B
14–1276（1263 aa）
链 C
14–1276（1263 aa）
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 26 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.41 Å |
| 8Y8E Structure of HCoV-HKU1C spike in the inactive-2up conformation 提交 2024-02-06 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
14–1276（1263 aa）
链 B
14–1276（1263 aa）
链 C
14–1276（1263 aa）
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 16 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.62 Å |
| 8Y8F Structure of HCoV-HKU1C spike in the glycan-activated-closed conformation 提交 2024-02-06 | Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
14–1276（1263 aa）
链 B
14–1276（1263 aa）
链 C
14–1276（1263 aa）
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 32 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.07 Å |
| 8Y8G Structure of HCoV-HKU1C spike in the glycan-activated-1up conformation 提交 2024-02-06 | Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
14–1276（1263 aa）
链 B
14–1276（1263 aa）
链 C
14–1276（1263 aa）
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 20 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.23 Å |
| 8Y8H Structure of HCoV-HKU1C spike in the glycan-activated-2up conformation 提交 2024-02-06 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
14–1276（1263 aa）
链 B
14–1276（1263 aa）
链 C
14–1276（1263 aa）
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 11 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.65 Å |
| 8Y8I Structure of HCoV-HKU1C spike in the glycan-activated-3up conformation 提交 2024-02-06 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
14–1276（1263 aa）
链 B
14–1276（1263 aa）
链 C
14–1276（1263 aa）
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 6 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.58 Å |
| 8Y8J Local structure of HCoV-HKU1C spike in complex with glycan 提交 2024-02-06 | Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
14–1276（1263 aa）
链 B
14–1276（1263 aa）
|
未记录 | MJJ methyl 9-O-acetyl-5-acetamido-3,5-dideoxy-D-glycero-alpha-D-galacto-non-2-ulopyranosidonic acid × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.57 Å |
| 8YQQ Structure of HKU1B RBD with TMPRSS2 提交 2024-03-19 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
323–607（285 aa）
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 6 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.95 Å |