当前蛋白身份：Q12778
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 3CO6 Crystal Structure of FoxO1 DBD Bound to DBE1 DNA 提交 2008-03-27 | Assembly 1 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：trimeric（3） 与全部聚合物一致 |
链 C
151–249（99 aa）
|
未记录 | CL CHLORIDE ION × 1 CA CALCIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.9；277 K；22% PEG 4000, pH 7.9, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.256 |
| 3CO7 Crystal Structure of FoxO1 DBD Bound to DBE2 DNA 提交 2008-03-27 | Assembly 1 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：trimeric（3） 与全部聚合物一致 |
链 C
151–266（116 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；277 K；21% PEG 4000, pH 6.4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.91 Å R-free 0.276 |
| 3CO7 Crystal Structure of FoxO1 DBD Bound to DBE2 DNA 提交 2008-03-27 | Assembly 2 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：trimeric（3） 与全部聚合物一致 |
链 F
151–266（116 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；277 K；21% PEG 4000, pH 6.4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.91 Å R-free 0.276 |
| 3COA Crystal Structure of FoxO1 DBD Bound to IRE DNA 提交 2008-03-27 | Assembly 1 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：trimeric（3） 与全部聚合物一致 |
链 C
151–266（116 aa）
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.8；277 K；30% PEG 4000, pH 6.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.250 |
| 3COA Crystal Structure of FoxO1 DBD Bound to IRE DNA 提交 2008-03-27 | Assembly 2 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：trimeric（3） 与全部聚合物一致 |
链 F
151–266（116 aa）
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.8；277 K；30% PEG 4000, pH 6.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.250 |
| 4LG0 Structure of a ternary FOXO1-ETS1 DNA complex 提交 2013-06-27 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric（4） 与全部聚合物一致 |
链 A
143–270（128 aa）
片段：DNA Binding Domain, UNP residues 143-270
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未记录 | CA CALCIUM ION × 1 PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；291 K；30% PEG 400, 0.05M 2-Amino-2-hydroxymethyl-propane-1,3-diol, 0.1M potassium chloride, 0.01M magnesium chloride, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 291K
|
分辨率 2.19 Å R-free 0.243 |
| 5DUI Identification of a new FoxO1 binding site that precludes CREB binding at the glucose-6-phosphatase catalytic subunit gene promoter 提交 2015-09-18 | Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric（4） 与全部聚合物一致 |
链 A
151–259（109 aa）
片段：unp residues 151-259
链 B
151–259（109 aa）
片段：unp residues 151-259
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；14-18% PEG 8000
0.1M Ammonium sulfate
20mM Magnesium chloride
50mM MES pH 5.6
10% glycerol
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分辨率 2.31 Å R-free 0.245 |
| 6LBI Crystal Structure of FOXO1-DBD homodimer bound to a palindromic DNA sequence 提交 2019-11-14 | Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric（4） 与全部聚合物一致 |
链 C
151–265（115 aa）
链 D
151–265（115 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；50 mM NaAc, pH 4.7, 12%-18% PEG4000 (w/v), 200 mM NaCl, 10 mM MgCl2 and 1 mM TCEP.
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分辨率 3.07 Å R-free 0.264 |
| 6LBI Crystal Structure of FOXO1-DBD homodimer bound to a palindromic DNA sequence 提交 2019-11-14 | Assembly 2 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric（4） 与全部聚合物一致 |
链 G
151–265（115 aa）
链 H
151–265（115 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；50 mM NaAc, pH 4.7, 12%-18% PEG4000 (w/v), 200 mM NaCl, 10 mM MgCl2 and 1 mM TCEP.
|
分辨率 3.07 Å R-free 0.264 |
| 6LBI Crystal Structure of FOXO1-DBD homodimer bound to a palindromic DNA sequence 提交 2019-11-14 | Assembly 3 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric（4） 与全部聚合物一致 |
链 K
151–265（115 aa）
链 L
151–265（115 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；50 mM NaAc, pH 4.7, 12%-18% PEG4000 (w/v), 200 mM NaCl, 10 mM MgCl2 and 1 mM TCEP.
|
分辨率 3.07 Å R-free 0.264 |
| 6QVW Solution structure of the free FOXO1 DNA binding domain 提交 2019-03-05 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
159–272（114 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 6.5；298 K；离子强度（mmCIF原始值）70；压力 1
NMR样品组成
380 uM [U-13C; U-15N] FOXO1 DBD, 20 mM sodium phosphate, 50 mM potassium chloride, 2 mM TCEP, 100 % n/a n/a, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
|
分辨率未提供 |
| 6QZR 14-3-3 sigma in complex with FOXO1 pT24 peptide 提交 2019-03-12 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 N
19–29（11 aa）
链 O
19–29（11 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | B3P 2-[3-(2-HYDROXY-1,1-DIHYDROXYMETHYL-ETHYLAMINO)-PROPYLAMINO]-2-HYDROXYMETHYL-PROPANE-1,3-DIOL × 1 GOL GLYCEROL × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；277 K；0.1M Bis-Tris propane pH 7, 0.2M Sodium nitrate, 28% (w/v) PEG400, 5% (w/v) glycerol
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.267 |
| 6QZR 14-3-3 sigma in complex with FOXO1 pT24 peptide 提交 2019-03-12 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 M
19–29（11 aa）
链 P
19–29（11 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | B3P 2-[3-(2-HYDROXY-1,1-DIHYDROXYMETHYL-ETHYLAMINO)-PROPYLAMINO]-2-HYDROXYMETHYL-PROPANE-1,3-DIOL × 1 GOL GLYCEROL × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；277 K；0.1M Bis-Tris propane pH 7, 0.2M Sodium nitrate, 28% (w/v) PEG400, 5% (w/v) glycerol
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.267 |
| 6QZR 14-3-3 sigma in complex with FOXO1 pT24 peptide 提交 2019-03-12 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 J
19–29（11 aa）
链 U
19–29（11 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | B3P 2-[3-(2-HYDROXY-1,1-DIHYDROXYMETHYL-ETHYLAMINO)-PROPYLAMINO]-2-HYDROXYMETHYL-PROPANE-1,3-DIOL × 1 GOL GLYCEROL × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；277 K；0.1M Bis-Tris propane pH 7, 0.2M Sodium nitrate, 28% (w/v) PEG400, 5% (w/v) glycerol
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.267 |
| 6QZR 14-3-3 sigma in complex with FOXO1 pT24 peptide 提交 2019-03-12 | Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 R
19–29（11 aa）
链 T
19–29（11 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | B3P 2-[3-(2-HYDROXY-1,1-DIHYDROXYMETHYL-ETHYLAMINO)-PROPYLAMINO]-2-HYDROXYMETHYL-PROPANE-1,3-DIOL × 1 GOL GLYCEROL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；277 K；0.1M Bis-Tris propane pH 7, 0.2M Sodium nitrate, 28% (w/v) PEG400, 5% (w/v) glycerol
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.267 |
| 8A62 Small molecule stabilizer (compound 2) for FOXO1 and 14-3-3 提交 2022-06-16 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 B
20–29（10 aa）
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非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | MG MAGNESIUM ION × 4 L7L (3~{S})-1-[3,5-bis(chloranyl)-4-oxidanyl-phenyl]carbonyl-~{N}-[2-[2-(dimethylamino)ethyldisulfanyl]ethyl]piperidine-3-carboxamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；0.095 M HEPES pH 7.5, 0.19 M CaCl2, 5% glycerol, 24% PEG 400
|
分辨率 1.60 Å R-free 0.182 |
| 8A65 Small molecule stabilizer (compound 3) for FOXO1 and 14-3-3 提交 2022-06-16 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 B
21–28（8 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | MG MAGNESIUM ION × 4 L70 (3~{S})-1-[2-azanyl-3,5-bis(chloranyl)phenyl]carbonyl-~{N}-[2-[2-(dimethylamino)ethyldisulfanyl]ethyl]piperidine-3-carboxamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；0.095 M HEPES pH 7.3,
0.19 M CaCl2, 5% glycerol, 25% PEG 400
|
分辨率 1.60 Å R-free 0.193 |