当前蛋白身份：Q12809
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| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1BYW STRUCTURE OF THE N-TERMINAL DOMAIN OF THE HUMAN-ERG POTASSIUM CHANNEL 提交 1998-10-15 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
26–135（110 aa）
片段：N-TERMINAL DOMAIN
|
突变：R73C | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 7；PROTEIN SOLUTION AT 10MG/ML IN 10MM DTT, 5 MM N-OCTYL-GLUCO MIXED WITH EQUAL VOLUME OF 100 MM HEPES PH 7.0, 0.8-1.0 M SODIUM AND POTASSIUM TARTRAT
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.286 |
| 1UJL Solution Structure of the HERG K+ channel S5-P extracellular linker 提交 2003-08-05 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
570–611（42 aa）
片段：RESIDUES 1-42
|
未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 3.3；303 K；离子强度（mmCIF原始值）0；压力 ambient
NMR样品组成
1.4mM S5-P peptide | 100mM SDS, 90% H2O, 10% D2O
|
分辨率未提供 |
| 2L1M Solution structure of the eag domain of the hERG (Kv11.1) K+ channel 提交 2010-07-29 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–135（135 aa）
片段：UNP residues 1-135
|
未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 5；298 K；离子强度（mmCIF原始值）0.02；压力 ambient
NMR样品组成
0.4 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] protein, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
0.4 mM [U-100% 15N] protein, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
|
分辨率未提供 |
| 2L4R NMR solution structure of the N-terminal PAS domain of hERG 提交 2010-10-13 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–135（135 aa）
片段：UNP RESIDUES 1-135
|
未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 6.5；298 K；离子强度（mmCIF原始值）150；压力 AMBIENT
NMR样品组成
0.5-1 mM [U-99% 13C; U-99% 15N] entity-1, 5 mM DTT-2, 1 mM EDTA-3, 150 mM sodium chloride-4, 20 mM sodium phosphate-5, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
|
分辨率未提供 |
| 2LE7 Solution nmr structure of the S4S5 linker of herg potassium channel 提交 2011-06-13 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
532–551（20 aa）
片段：residues 532-551
|
未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 6.6；300 K；压力 AMBIENT
NMR样品组成
100mM DPC-1, 90%(v/v) H2O-2, 10%(v/v) [U-2H] D2O-3, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
|
分辨率未提供 |
| 2N7G Structure of the cyclic nucleotide-binding homology domain of the hERG channel 提交 2015-09-10 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
734–864（131 aa）
片段：UNP residues 734-869
|
未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 7.2；298 K；离子强度（mmCIF原始值）170；压力 ambient
NMR样品组成
0.4 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] the cyclic nucleotide-binding homology domain of the hERG channel-1, 20 mM sodium phosphate-2, 150 mM sodium chloride-3, 1 mM DTT-4, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
|
分辨率未提供 |
| 4HP9 Crystal structure of the N-terminal truncated PAS domain from the hERG potassium channel 提交 2012-10-23 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
10–135（126 aa）
片段：PAS domain of KCNH channel, UNP residues 10-135
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；298 K；30% PEG-MME2000, 0.1M potasiumm thiocyanate, 1.0% benzamidine-HCl, vapor diffusion, sitting drop, temperature 298K
|
分辨率 2.12 Å R-free 0.238 |
| 4HQA Crystal structure of PAS domain from the human ERG (hERG) potassium channel 提交 2012-10-25 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–135（135 aa）
片段：PAS domain of KCNH channel, UNP residues 1-135
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；298 K；1.0M sodium/potassium tartrate, 0.1M Hepes, pH 7.0, vapor diffusion, sitting drop, temperature 298K
|
分辨率 1.96 Å R-free 0.239 |
| 5VA1 Cryo-EM structure of the human ether-a-go-go related K+ channel 提交 2017-03-24 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
1–140（140 aa）
片段：UNP residues 1-140,381-870,1006-1159
链 A
381–870（490 aa）
片段：UNP residues 1-140,381-870,1006-1159
链 A
1006–1159（154 aa）
片段：UNP residues 1-140,381-870,1006-1159
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4；pH 7.4, adjusted with NaOH
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；one blot: 3 second blot time, 0 blot force
|
分辨率 3.70 Å |
| 5VA1 Cryo-EM structure of the human ether-a-go-go related K+ channel 提交 2017-03-24 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–140（140 aa）
片段：UNP residues 1-140,381-870,1006-1159
链 A
381–870（490 aa）
片段：UNP residues 1-140,381-870,1006-1159
链 A
1006–1159（154 aa）
片段：UNP residues 1-140,381-870,1006-1159
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4；pH 7.4, adjusted with NaOH
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；one blot: 3 second blot time, 0 blot force
|
分辨率 3.70 Å |
| 5VA1 Cryo-EM structure of the human ether-a-go-go related K+ channel 提交 2017-03-24 | Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–140（140 aa）
片段：UNP residues 1-140,381-870,1006-1159
链 A
381–870（490 aa）
片段：UNP residues 1-140,381-870,1006-1159
链 A
1006–1159（154 aa）
片段：UNP residues 1-140,381-870,1006-1159
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4；pH 7.4, adjusted with NaOH
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；one blot: 3 second blot time, 0 blot force
|
分辨率 3.70 Å |
| 5VA2 Cryo-EM structure of the human ether-a-go-go related K+ channel 提交 2017-03-24 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
1–140（140 aa）
片段：UNP residues 1-140,381-870,1006-1159
链 A
351–870（520 aa）
片段：UNP residues 1-140,381-870,1006-1159
链 A
1006–1159（154 aa）
片段：UNP residues 1-140,381-870,1006-1159
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4；pH 7.4, adjusted with NaOH
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；one blot: 3 second blot time, 0 blot force
|
分辨率 3.80 Å |
| 5VA2 Cryo-EM structure of the human ether-a-go-go related K+ channel 提交 2017-03-24 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–140（140 aa）
片段：UNP residues 1-140,381-870,1006-1159
链 A
351–870（520 aa）
片段：UNP residues 1-140,381-870,1006-1159
链 A
1006–1159（154 aa）
片段：UNP residues 1-140,381-870,1006-1159
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4；pH 7.4, adjusted with NaOH
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；one blot: 3 second blot time, 0 blot force
|
分辨率 3.80 Å |
| 5VA2 Cryo-EM structure of the human ether-a-go-go related K+ channel 提交 2017-03-24 | Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–140（140 aa）
片段：UNP residues 1-140,381-870,1006-1159
链 A
351–870（520 aa）
片段：UNP residues 1-140,381-870,1006-1159
链 A
1006–1159（154 aa）
片段：UNP residues 1-140,381-870,1006-1159
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4；pH 7.4, adjusted with NaOH
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；one blot: 3 second blot time, 0 blot force
|
分辨率 3.80 Å |
| 5VA3 Cryo-EM structure of the human ether-a-go-go related K+ channel 提交 2017-03-24 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
1–140（140 aa）
片段：UNP residues 1-140,381-870,1006-1159
链 A
381–870（490 aa）
片段：UNP residues 1-140,381-870,1006-1159
链 A
1006–1159（154 aa）
片段：UNP residues 1-140,381-870,1006-1159
|
突变：S631A 突变：S631A 突变：S631A | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4；pH 7.4, adjusted with NaOH
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；one blot: 3 second blot time, 0 blot force
|
分辨率 4.00 Å |
| 5VA3 Cryo-EM structure of the human ether-a-go-go related K+ channel 提交 2017-03-24 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–140（140 aa）
片段：UNP residues 1-140,381-870,1006-1159
链 A
381–870（490 aa）
片段：UNP residues 1-140,381-870,1006-1159
链 A
1006–1159（154 aa）
片段：UNP residues 1-140,381-870,1006-1159
|
突变：S631A 突变：S631A 突变：S631A | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4；pH 7.4, adjusted with NaOH
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；one blot: 3 second blot time, 0 blot force
|
分辨率 4.00 Å |
| 5VA3 Cryo-EM structure of the human ether-a-go-go related K+ channel 提交 2017-03-24 | Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–140（140 aa）
片段：UNP residues 1-140,381-870,1006-1159
链 A
381–870（490 aa）
片段：UNP residues 1-140,381-870,1006-1159
链 A
1006–1159（154 aa）
片段：UNP residues 1-140,381-870,1006-1159
|
突变：S631A 突变：S631A 突变：S631A | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4；pH 7.4, adjusted with NaOH
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；one blot: 3 second blot time, 0 blot force
|
分辨率 4.00 Å |
| 6SYG Crystal structure of the Cyclic Nucleotide-Binding Homology Domain of the human KCNH2 channel 提交 2019-09-27 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
734–864（131 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；292 K；20% w/v PEG 3350, 2% v/v Tacsimate, 0.1M Bis-Tris, pH 6.8
|
分辨率 1.50 Å R-free 0.184 |
| 8IO4 Herg1a-herg1b open state 提交 2023-03-10 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
1–1159（1159 aa）
链 B
1–1159（1159 aa）
链 C
1–1159（1159 aa）
链 D
1–1159（1159 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.50 Å |
| 8ZYN Cryo-EM Structure of inhibitor-free hERG Channel 提交 2024-06-18 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
1–140（140 aa）
链 A
351–870（520 aa）
链 A
1006–1159（154 aa）
链 B
1–140（140 aa）
链 B
351–870（520 aa）
链 B
1006–1159（154 aa）
链 C
1–140（140 aa）
链 C
351–870（520 aa）
链 C
1006–1159（154 aa）
链 D
1–140（140 aa）
链 D
351–870（520 aa）
链 D
1006–1159（154 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.27 Å |
| 8ZYO Cryo-EM Structure of astemizole-bound hERG Channel 提交 2024-06-18 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
1–140（140 aa）
链 A
351–870（520 aa）
链 A
1006–1159（154 aa）
链 B
1–140（140 aa）
链 B
351–870（520 aa）
链 B
1006–1159（154 aa）
链 C
1–140（140 aa）
链 C
351–870（520 aa）
链 C
1006–1159（154 aa）
链 D
1–140（140 aa）
链 D
351–870（520 aa）
链 D
1006–1159（154 aa）
|
未记录 | XB7 1-[(4-fluorophenyl)methyl]-N-{1-[2-(4-methoxyphenyl)ethyl]piperidin-4-yl}-1H-benzimidazol-2-amine × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.29 Å |
| 8ZYP Cryo-EM Structure of E-4031-bound hERG Channel 提交 2024-06-18 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
1–140（140 aa）
链 A
351–870（520 aa）
链 A
1006–1159（154 aa）
链 B
1–140（140 aa）
链 B
351–870（520 aa）
链 B
1006–1159（154 aa）
链 C
1–140（140 aa）
链 C
351–870（520 aa）
链 C
1006–1159（154 aa）
链 D
1–140（140 aa）
链 D
351–870（520 aa）
链 D
1006–1159（154 aa）
|
未记录 | A1L2J ~{N}-[4-[1-[2-(6-methylpyridin-2-yl)ethyl]piperidin-4-yl]carbonylphenyl]methanesulfonamide × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.19 Å |
| 8ZYQ Cryo-EM Structure of pimozide-bound hERG Channel 提交 2024-06-18 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
1–140（140 aa）
链 A
351–870（520 aa）
链 A
1006–1159（154 aa）
链 B
1–140（140 aa）
链 B
351–870（520 aa）
链 B
1006–1159（154 aa）
链 C
1–140（140 aa）
链 C
351–870（520 aa）
链 C
1006–1159（154 aa）
链 D
1–140（140 aa）
链 D
351–870（520 aa）
链 D
1006–1159（154 aa）
|
未记录 | 1II 3-[1-[4,4-bis(4-fluorophenyl)butyl]piperidin-4-yl]-1~{H}-benzimidazol-2-one × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.18 Å |
| 9CHP Cryo-EM structure of the human ether-a-go-go related K+ channel (hERG) in 300 mM K+ 提交 2024-07-01 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
1–1159（1159 aa）
链 B
1–1159（1159 aa）
链 C
1–1159（1159 aa）
链 D
1–1159（1159 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.30 Å |
| 9CHQ Cryo-EM structure of the human ether-a-go-go related K+ channel (hERG) in 3 mM K+ 提交 2024-07-01 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
1–1159（1159 aa）
链 B
1–1159（1159 aa）
链 C
1–1159（1159 aa）
链 D
1–1159（1159 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.00 Å |
| 9CHR Cryo-EM structure of the human ether-a-go-go related K+ channel (hERG) in 300 mM K+ without symmetry 提交 2024-07-01 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
1–1159（1159 aa）
链 B
1–1159（1159 aa）
链 C
1–1159（1159 aa）
链 D
1–1159（1159 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.50 Å |
| 9CHS Cryo-EM structure of the human ether-a-go-go related K+ channel (hERG) in 3 mM K+ without symmetry 提交 2024-07-01 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
1–1159（1159 aa）
链 B
1–1159（1159 aa）
链 C
1–1159（1159 aa）
链 D
1–1159（1159 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.40 Å |