当前蛋白身份：Q13485
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1DD1 CRYSTAL STRUCTURE ANALYSIS OF THE SMAD4 ACTIVE FRAGMENT 提交 1999-11-05 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
285–552（268 aa）
片段：SMAD4 ACTIVE FRAGMENT
链 B
285–552（268 aa）
片段：SMAD4 ACTIVE FRAGMENT
链 C
285–552（268 aa）
片段：SMAD4 ACTIVE FRAGMENT
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 9 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；PEG 4000, LISO4, HEPES, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
|
分辨率 2.62 Å R-free 0.175 |
| 1DD1 CRYSTAL STRUCTURE ANALYSIS OF THE SMAD4 ACTIVE FRAGMENT 提交 1999-11-05 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 A
285–552（268 aa）
片段：SMAD4 ACTIVE FRAGMENT
链 B
285–552（268 aa）
片段：SMAD4 ACTIVE FRAGMENT
链 C
285–552（268 aa）
片段：SMAD4 ACTIVE FRAGMENT
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 18 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；PEG 4000, LISO4, HEPES, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
|
分辨率 2.62 Å R-free 0.175 |
| 1G88 S4AFL3ARG515 MUTANT 提交 2000-11-16 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
285–552（268 aa）
片段：SMAD4 ACTIVE FRAGMENT
链 B
285–552（268 aa）
片段：SMAD4 ACTIVE FRAGMENT
链 C
285–552（268 aa）
片段：SMAD4 ACTIVE FRAGMENT
|
突变：R515S 突变：R515S 突变：R515S | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；pH 7, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 3.00 Å R-free 0.263 |
| 1MR1 Crystal Structure of a Smad4-Ski Complex 提交 2002-09-17 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
319–552（234 aa）
片段：MH2 domain
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；295 K；dioxane, potassium phosphate, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
|
分辨率 2.85 Å R-free 0.280 |
| 1MR1 Crystal Structure of a Smad4-Ski Complex 提交 2002-09-17 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
319–552（234 aa）
片段：MH2 domain
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；295 K；dioxane, potassium phosphate, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
|
分辨率 2.85 Å R-free 0.280 |
| 1U7F Crystal Structure of the phosphorylated Smad3/Smad4 heterotrimeric complex 提交 2004-08-03 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 B
314–552（239 aa）
片段：MH2 and Linker domains
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；298 K；50 mM Tris-HCl, 0-15 mM magnesium chloride, 5-15% ethanol, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.247 |
| 1U7V Crystal Structure of the phosphorylated Smad2/Smad4 heterotrimeric complex 提交 2004-08-04 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 B
314–549（236 aa）
片段：MH2 and Linker domains
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；298 K；50 mM Tris-HCl, 0-15 mM magnesium chloride, 5-15% ethanol, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.279 |
| 1YGS CRYSTAL STRUCTURE OF THE SMAD4 TUMOR SUPPRESSOR C-TERMINAL DOMAIN 提交 1997-10-03 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
319–552（234 aa）
片段：C-TERMINAL DOMAIN, RESIDUES 319 - 552
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 6.5；100 MM NAMES, PH6.5, 25% PEG MONOMETHYLETHER 5000, 5 MM DTT, 200 MM (NH4)2SO4
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.279 |
| 5C4V Ski-like protein 提交 2015-06-18 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
314–549（236 aa）
片段：residues 314-549
|
未记录 | GOL GLYCEROL × 1 ZN ZINC ION × 1 NI NICKEL (II) ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；293 K；2.8-3.3 M sodium chloride, 0.1 M Bis-Tris pH 5.5
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.242 |
| 5C4V Ski-like protein 提交 2015-06-18 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 C
314–549（236 aa）
片段：residues 314-549
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；293 K；2.8-3.3 M sodium chloride, 0.1 M Bis-Tris pH 5.5
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.242 |
| 5C4V Ski-like protein 提交 2015-06-18 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 E
314–549（236 aa）
片段：residues 314-549
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；293 K；2.8-3.3 M sodium chloride, 0.1 M Bis-Tris pH 5.5
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.242 |
| 5MEY Crystal structure of Smad4-MH1 bound to the GGCGC site. 提交 2016-11-16 | Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric（4） 与全部聚合物一致 |
链 A
10–140（131 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 CL CHLORIDE ION × 8 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 4 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 CA CALCIUM ION × 10 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；17% PEG 6000, 0.2 M NaCl, 0.1 M sodium acetate pH 5.0
|
分辨率 2.05 Å R-free 0.238 |
| 5MEZ Crystal structure of Smad4-MH1 bound to the GGCT site. 提交 2016-11-16 | Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric（4） 与全部聚合物一致 |
链 A
10–140（131 aa）
链 B
10–140（131 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；24% PEG 3350, 0.2 M calcium chloride
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分辨率 2.98 Å R-free 0.252 |
| 5MF0 Crystal structure of Smad4-MH1 bound to the GGCCG site. 提交 2016-11-16 | Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric（4） 与全部聚合物一致 |
链 A
10–140（131 aa）
链 B
10–140（131 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 CL CHLORIDE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；16% PEG MME 2000 and 0.1 M sodium acetate pH 5.0
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分辨率 3.03 Å R-free 0.270 |