当前蛋白身份:Q15036
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 3FOG Crystal structure of the PX domain of sorting nexin-17 (SNX17) 提交 2008-12-30 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致 |
链 A
1–108(108 aa)
片段:residues 1-115
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未记录 | NA SODIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;277 K;20% PEG 3350, 0.2M sodium fluoride, 0.1M bis-Tris propane, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
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分辨率 2.80 Å R-free 0.279 |
| 3LUI Crystal structure of the SNX17 PX domain with bound sulphate 提交 2010-02-17 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致 |
链 A
1–112(112 aa)
片段:SNX17 PX domain (residues 1-112)
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未记录 | SO4 SULFATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;1.8M lithium sulphate, 0.1M Tris, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
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分辨率 1.80 Å R-free 0.245 |
| 3LUI Crystal structure of the SNX17 PX domain with bound sulphate 提交 2010-02-17 | Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致 |
链 B
1–112(112 aa)
片段:SNX17 PX domain (residues 1-112)
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未记录 | SO4 SULFATE ION × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;1.8M lithium sulphate, 0.1M Tris, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.245 |
| 3LUI Crystal structure of the SNX17 PX domain with bound sulphate 提交 2010-02-17 | Assembly 3 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致 |
链 C
1–112(112 aa)
片段:SNX17 PX domain (residues 1-112)
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未记录 | SO4 SULFATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;1.8M lithium sulphate, 0.1M Tris, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
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分辨率 1.80 Å R-free 0.245 |
| 4GXB Structure of the SNX17 atypical FERM domain bound to the NPxY motif of P-selectin 提交 2012-09-04 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 A
111–388(278 aa)
片段:FERM domain, UNP residues 111-388
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未记录 | GOL GLYCEROL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 5.5;293 K;0.1M sodium acetate, 0.2M magnesium chloride, 15% PEG4000, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
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分辨率 1.80 Å R-free 0.204 |
| 4TKN Structure of the SNX17 FERM domain bound to the second NPxF motif of KRIT1 提交 2014-05-27 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 A
108–391(284 aa)
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.5;298 K;1.9 M Ammonium Sulfate, 0.1 M HEPES pH 7.5, 5% PEG 400
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分辨率 3.00 Å R-free 0.268 |
| 4TKN Structure of the SNX17 FERM domain bound to the second NPxF motif of KRIT1 提交 2014-05-27 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 B
108–391(284 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.5;298 K;1.9 M Ammonium Sulfate, 0.1 M HEPES pH 7.5, 5% PEG 400
|
分辨率 3.00 Å R-free 0.268 |
| 4TKN Structure of the SNX17 FERM domain bound to the second NPxF motif of KRIT1 提交 2014-05-27 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 C
108–391(284 aa)
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.5;298 K;1.9 M Ammonium Sulfate, 0.1 M HEPES pH 7.5, 5% PEG 400
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分辨率 3.00 Å R-free 0.268 |
| 7RM8 Solution NMR structure of PDLIM7 PDZ bound to SNX17 peptide 提交 2021-07-26 | Assembly 1 信息不足 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致 |
链 A
457–470(14 aa)
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未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 5.8;298 K;离子强度(mmCIF原始值)75 mM NaCl;压力 1
NMR样品组成
1 mM [U-13C; U-15N] PDLIM7_SNX17_Fusion, 95% H2O/5% D2O | 95% H2O/5% D2O
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分辨率未提供 |
| 9AU7 Human Retriever VPS35L/VPS29/VPS26C complex bound to SNX17 peptide (Composite Map) 提交 2024-02-28 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致 |
链 D
451–470(20 aa)
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未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 3.40 Å |