当前蛋白身份:Q15080
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1H6H Structure of the PX domain from p40phox bound to phosphatidylinositol 3-phosphate 提交 2001-06-15 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致 |
链 A
2–144(143 aa)
片段:PX DOMAIN RESIDUES 2-144
|
未记录 | PIB 2-(BUTANOYLOXY)-1-{[(HYDROXY{[2,3,4,6-TETRAHYDROXY-5-(PHOSPHONOOXY)CYCLOHEXYL]OXY}PHOSPHORYL)OXY]METHYL}ETHYL BUTANOATE × 1 GOL GLYCEROL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 7.5;pH 7.50
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.232 |
| 1OEY Heterodimer of p40phox and p67phox PB1 domains from human NADPH oxidase 提交 2003-04-02 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 J
237–339(103 aa)
片段:PB1 DOMAIN, RESIDUES 237-339
|
突变:YES 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 9;18% PEG 3350, 17% PEG 400, 4.8% ISOPROPYL ALCOHOL, 0.1 M CAPSO PH 9.0
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.252 |
| 1OEY Heterodimer of p40phox and p67phox PB1 domains from human NADPH oxidase 提交 2003-04-02 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 K
237–339(103 aa)
片段:PB1 DOMAIN, RESIDUES 237-339
|
突变:YES 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 9;18% PEG 3350, 17% PEG 400, 4.8% ISOPROPYL ALCOHOL, 0.1 M CAPSO PH 9.0
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.252 |
| 1OEY Heterodimer of p40phox and p67phox PB1 domains from human NADPH oxidase 提交 2003-04-02 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 L
237–339(103 aa)
片段:PB1 DOMAIN, RESIDUES 237-339
|
突变:YES 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 9;18% PEG 3350, 17% PEG 400, 4.8% ISOPROPYL ALCOHOL, 0.1 M CAPSO PH 9.0
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.252 |
| 1OEY Heterodimer of p40phox and p67phox PB1 domains from human NADPH oxidase 提交 2003-04-02 | Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 M
237–339(103 aa)
片段:PB1 DOMAIN, RESIDUES 237-339
|
突变:YES 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 9;18% PEG 3350, 17% PEG 400, 4.8% ISOPROPYL ALCOHOL, 0.1 M CAPSO PH 9.0
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.252 |
| 1W6X SH3 domain of p40phox, component of the NADPH oxidase 提交 2004-08-24 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致 |
链 A
174–228(55 aa)
片段:SH3 DOMAIN, RESIDUES 174-228
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;287 K;VAPOR DIFFUSION AT 14 DEGRE C, PROTEIN AT 14 MG/ML, 20 MM HEPES PH 7.5, 150 MM NACL MIXED WITH 40% PEG2K MME, 100 MM AS 200 MM NA AC PH 4.6.
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.250 |
| 1W6X SH3 domain of p40phox, component of the NADPH oxidase 提交 2004-08-24 | Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致 |
链 B
174–228(55 aa)
片段:SH3 DOMAIN, RESIDUES 174-228
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;287 K;VAPOR DIFFUSION AT 14 DEGRE C, PROTEIN AT 14 MG/ML, 20 MM HEPES PH 7.5, 150 MM NACL MIXED WITH 40% PEG2K MME, 100 MM AS 200 MM NA AC PH 4.6.
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.250 |
| 1W70 SH3 domain of p40phox complexed with C-terminal polyProline region of p47phox 提交 2004-08-26 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 A
174–228(55 aa)
片段:SH3 DOMAIN, RESIDUES 174-228
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;293 K;VAPOR DIFFUSION AT 20 DEGRE C AT 14MG/ML OF P40PHOX SH3 WITH A1/5 RATIO WITH POLYPROLINE PEPTIDE, 20 MM HEPES PH 7.5, 150 MM NACL MIXED WITH 100 MM NA-CITRATE/CITRIC ACID PH5, 2.4 M SA
|
分辨率 1.46 Å R-free 0.207 |
| 1W70 SH3 domain of p40phox complexed with C-terminal polyProline region of p47phox 提交 2004-08-26 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 B
174–228(55 aa)
片段:SH3 DOMAIN, RESIDUES 174-228
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 3 TFA trifluoroacetic acid × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;293 K;VAPOR DIFFUSION AT 20 DEGRE C AT 14MG/ML OF P40PHOX SH3 WITH A1/5 RATIO WITH POLYPROLINE PEPTIDE, 20 MM HEPES PH 7.5, 150 MM NACL MIXED WITH 100 MM NA-CITRATE/CITRIC ACID PH5, 2.4 M SA
|
分辨率 1.46 Å R-free 0.207 |
| 1Z9Q Solution structure of SH3 domain of p40phox 提交 2005-04-04 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致 |
链 A
168–233(66 aa)
片段:SH3 domain
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未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 7;298 K;离子强度(mmCIF原始值)150mM NaCl;压力 ambient
NMR样品组成
0.5mM p40phoxSH3 U-13C, 15N; 50mM NaPi pH7.0; 150mM NaCl | 90% H2O/10% D2O
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分辨率未提供 |
| 2DYB The crystal structure of human p40(phox) 提交 2006-09-08 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致 |
链 A
1–339(339 aa)
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非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293 K;5% PEG 20000, 200mM Bis-tris-HCl, 10mM sodium cacodylate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
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分辨率 3.15 Å R-free 0.302 |
| 2DYB The crystal structure of human p40(phox) 提交 2006-09-08 | Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致 |
链 B
1–339(339 aa)
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非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293 K;5% PEG 20000, 200mM Bis-tris-HCl, 10mM sodium cacodylate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
|
分辨率 3.15 Å R-free 0.302 |