当前蛋白身份:Q15080 重新检索
本组结构的主要差异维度
构建体不同 突变/修饰不同 组装状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量指标不同

差异标签只比较当前检索结果;所有PDB和assembly原始记录仍分别保留。

相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
1H6H Structure of the PX domain from p40phox bound to phosphatidylinositol 3-phosphate 提交 2001-06-15 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 2–144(143 aa) 片段:PX DOMAIN RESIDUES 2-144
未记录 PIB 2-(BUTANOYLOXY)-1-{[(HYDROXY{[2,3,4,6-TETRAHYDROXY-5-(PHOSPHONOOXY)CYCLOHEXYL]OXY}PHOSPHORYL)OXY]METHYL}ETHYL BUTANOATE × 1 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7.5;pH 7.50
分辨率 1.70 Å R-free 0.232
1OEY Heterodimer of p40phox and p67phox PB1 domains from human NADPH oxidase 提交 2003-04-02 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 J 237–339(103 aa) 片段:PB1 DOMAIN, RESIDUES 237-339
突变:YES 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 9;18% PEG 3350, 17% PEG 400, 4.8% ISOPROPYL ALCOHOL, 0.1 M CAPSO PH 9.0
分辨率 2.00 Å R-free 0.252
1OEY Heterodimer of p40phox and p67phox PB1 domains from human NADPH oxidase 提交 2003-04-02 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 K 237–339(103 aa) 片段:PB1 DOMAIN, RESIDUES 237-339
突变:YES 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 9;18% PEG 3350, 17% PEG 400, 4.8% ISOPROPYL ALCOHOL, 0.1 M CAPSO PH 9.0
分辨率 2.00 Å R-free 0.252
1OEY Heterodimer of p40phox and p67phox PB1 domains from human NADPH oxidase 提交 2003-04-02 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 L 237–339(103 aa) 片段:PB1 DOMAIN, RESIDUES 237-339
突变:YES 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 9;18% PEG 3350, 17% PEG 400, 4.8% ISOPROPYL ALCOHOL, 0.1 M CAPSO PH 9.0
分辨率 2.00 Å R-free 0.252
1OEY Heterodimer of p40phox and p67phox PB1 domains from human NADPH oxidase 提交 2003-04-02 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 M 237–339(103 aa) 片段:PB1 DOMAIN, RESIDUES 237-339
突变:YES 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 9;18% PEG 3350, 17% PEG 400, 4.8% ISOPROPYL ALCOHOL, 0.1 M CAPSO PH 9.0
分辨率 2.00 Å R-free 0.252
1W6X SH3 domain of p40phox, component of the NADPH oxidase 提交 2004-08-24 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 174–228(55 aa) 片段:SH3 DOMAIN, RESIDUES 174-228
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION;287 K;VAPOR DIFFUSION AT 14 DEGRE C, PROTEIN AT 14 MG/ML, 20 MM HEPES PH 7.5, 150 MM NACL MIXED WITH 40% PEG2K MME, 100 MM AS 200 MM NA AC PH 4.6.
分辨率 2.00 Å R-free 0.250
1W6X SH3 domain of p40phox, component of the NADPH oxidase 提交 2004-08-24 Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 B 174–228(55 aa) 片段:SH3 DOMAIN, RESIDUES 174-228
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION;287 K;VAPOR DIFFUSION AT 14 DEGRE C, PROTEIN AT 14 MG/ML, 20 MM HEPES PH 7.5, 150 MM NACL MIXED WITH 40% PEG2K MME, 100 MM AS 200 MM NA AC PH 4.6.
分辨率 2.00 Å R-free 0.250
1W70 SH3 domain of p40phox complexed with C-terminal polyProline region of p47phox 提交 2004-08-26 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 174–228(55 aa) 片段:SH3 DOMAIN, RESIDUES 174-228
未记录 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION;293 K;VAPOR DIFFUSION AT 20 DEGRE C AT 14MG/ML OF P40PHOX SH3 WITH A1/5 RATIO WITH POLYPROLINE PEPTIDE, 20 MM HEPES PH 7.5, 150 MM NACL MIXED WITH 100 MM NA-CITRATE/CITRIC ACID PH5, 2.4 M SA
分辨率 1.46 Å R-free 0.207
1W70 SH3 domain of p40phox complexed with C-terminal polyProline region of p47phox 提交 2004-08-26 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 B 174–228(55 aa) 片段:SH3 DOMAIN, RESIDUES 174-228
未记录 SO4 SULFATE ION × 3 TFA trifluoroacetic acid × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION;293 K;VAPOR DIFFUSION AT 20 DEGRE C AT 14MG/ML OF P40PHOX SH3 WITH A1/5 RATIO WITH POLYPROLINE PEPTIDE, 20 MM HEPES PH 7.5, 150 MM NACL MIXED WITH 100 MM NA-CITRATE/CITRIC ACID PH5, 2.4 M SA
分辨率 1.46 Å R-free 0.207
1Z9Q Solution structure of SH3 domain of p40phox 提交 2005-04-04 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 168–233(66 aa) 片段:SH3 domain
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 7;298 K;离子强度(mmCIF原始值)150mM NaCl;压力 ambient
NMR样品组成 0.5mM p40phoxSH3 U-13C, 15N; 50mM NaPi pH7.0; 150mM NaCl | 90% H2O/10% D2O
分辨率未提供
2DYB The crystal structure of human p40(phox) 提交 2006-09-08 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 1–339(339 aa)
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293 K;5% PEG 20000, 200mM Bis-tris-HCl, 10mM sodium cacodylate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
分辨率 3.15 Å R-free 0.302
2DYB The crystal structure of human p40(phox) 提交 2006-09-08 Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 B 1–339(339 aa)
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293 K;5% PEG 20000, 200mM Bis-tris-HCl, 10mM sodium cacodylate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
分辨率 3.15 Å R-free 0.302