当前蛋白身份：Q16548
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| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2VM6 Human Bcl2-A1 in complex with Bim-BH3 peptide 提交 2008-01-23 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–149（149 aa）
片段：RESIDUES 1-149
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.8；293 K；0.1M BIS, TRIS PH 5.8, 2M AMSO4
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.250 |
| 3I1H Crystal structure of human BFL-1 in complex with BAK BH3 peptide 提交 2009-06-26 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–151（151 aa）
片段：residues 1-151
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.8；298 K；1.5 M sodium malonate, pH 5.8
protein 1.67 mg/ml, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.238 |
| 3MQP Crystal Structure of human BFL-1 in complex with NOXA BH3 peptide, Northeast Structural Genomics Consortium Target HR2930 提交 2010-04-28 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–151（151 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.4；296 K；Protein solution: 100mM NaCl, 5mM DTT, 0.02% NaN3, 10mM Tris-HCl (pH 7.5) . Reservoir solution: 1.5 M Sodium Malonate, 0.1 M sodium Acetate, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 296K
|
分辨率 2.24 Å R-free 0.230 |
| 4ZEQ Crystal Structure of human BFL-1 in complex with tBid BH3 peptide, Northeast Structural Genomics Consortium Target HX9247 提交 2015-04-20 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–151（151 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；295 K；Sodium Malonate
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.239 |
| 5UUK Human Bfl-1 in complex with a Bfl-1-specific selected peptide 提交 2017-02-17 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–151（151 aa）
片段：UNP residues 1-151
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；1.8 M ammonium sulfate, 0.1 M MES pH 7.0
|
分辨率 1.20 Å R-free 0.163 |
| 5UUL Human Bfl-1 in complex with PUMA BH3 提交 2017-02-17 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–151（151 aa）
片段：UNP residues 1-151
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；1.8 M ammonium sulfate, 0.1 M MES pH 7.0
|
分辨率 1.33 Å R-free 0.155 |
| 5UUP Human Bfl-1 covalently cross-linked to an electrophilic variant of a Bfl-1-specific selected peptide 提交 2017-02-17 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–151（151 aa）
片段：UNP residues 1-151
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；1.8 M ammonium sulfate, 0.1 M MES pH 7.0
|
分辨率 1.73 Å R-free 0.206 |
| 5WHH Crystal Structure of Bcl-2-related protein A1 in complex with stapled peptide (AQ7)T(0EH)LRRFGD(MK8)INFRQ(NH2) 提交 2017-07-17 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–151（151 aa）
|
突变：C4S, C19S | CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；298 K；PEG3350 20%, 0.2M Sodium malonate
|
分辨率 2.38 Å R-free 0.293 |
| 5WHI Crystal Structure of Bcl-2-related protein A1 提交 2017-07-17 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–151（151 aa）
片段：BFL1
|
突变：C4S, C19S | CAD CACODYLIC ACID × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；298 K；PEG2000
|
分辨率 1.69 Å R-free 0.233 |
| 6E3I Human Bfl-1 in complex with the Bfl-1-specific designed peptide srt.F4 提交 2018-07-14 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–151（151 aa）
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；1.8 M ammonium sulfate, 0.1 M MES pH 7.0
|
分辨率 1.48 Å R-free 0.173 |
| 6E3J Human Bfl-1 in complex with the Bfl-1-specific designed peptide srt.F10 提交 2018-07-14 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–151（151 aa）
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；1.8 M ammonium sulfate, 0.1 M MES pH 7.0
|
分辨率 1.48 Å R-free 0.178 |
| 6MBB Human Bfl-1 in complex with the designed peptide dF1 提交 2018-08-29 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–151（151 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；1.8 M ammonium sulfate, 0.1 M MES pH 6.5
|
分辨率 1.59 Å R-free 0.196 |
| 6MBC Human Bfl-1 in complex with the designed peptide dF4 提交 2018-08-29 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–151（151 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；1.8 - 2.0 M NH4SO4, 50 mM MES pH 6.5
|
分辨率 1.75 Å R-free 0.212 |
| 6RJP Bfl-1 in complex with alpha helical peptide 提交 2019-04-29 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–149（149 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
EVAPORATION；293 K；0.1 M sodium acetate pH 4.6
16% (w/v) PEG smear high
|
分辨率 2.57 Å R-free 0.266 |
| 6RJP Bfl-1 in complex with alpha helical peptide 提交 2019-04-29 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
1–149（149 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
EVAPORATION；293 K；0.1 M sodium acetate pH 4.6
16% (w/v) PEG smear high
|
分辨率 2.57 Å R-free 0.266 |
| 6VO4 Crystal Structure Analysis of BFL1 提交 2020-01-29 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–151（151 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；3.5M Sodium formate, pH 7.0
|
分辨率 1.74 Å R-free 0.283 |
| 8RPO BFL1 in complex with a reversible covalent ligand 提交 2024-01-16 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–151（151 aa）
|
未记录 | A1H2C (~{E})-2-cyano-3-(2-dimethylphosphorylphenyl)-~{N}-[[1-[4-(trifluoromethyl)phenyl]cyclopropyl]methyl]prop-2-enamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；293 K；sodium citrate 0.3M, PCTP pH 6
|
分辨率 1.79 Å R-free 0.262 |
| 9EW8 Discovery of a Series of Covalent, Cell Active Bfl-1 Inhibitors 提交 2024-04-03 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–151（151 aa）
|
未记录 | A1H7Q 1-[(2R)-2-phenylpyrrolidin-1-yl]propan-1-one × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.85M sodium citrate, 0.1M PCTP pH 6
|
分辨率 1.49 Å R-free 0.271 |
| 9FKY Discovery of a Series of Covalent, Cell Active Bfl-1 Inhibitors 提交 2024-06-04 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–151（151 aa）
|
未记录 | A1IDP ~{N}-[4-[(1~{R},3~{R})-3-azanylcyclopentyl]oxyphenyl]-~{N}-[(1~{S})-1-[3-cyano-4-(trifluoromethyl)phenyl]ethyl]propanamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；310 K；PCPT 0.1M pH 5, Na3 Cit 1.1M
|
分辨率 1.56 Å R-free 0.237 |
| 9FKY Discovery of a Series of Covalent, Cell Active Bfl-1 Inhibitors 提交 2024-06-04 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1–151（151 aa）
|
未记录 | A1IDP ~{N}-[4-[(1~{R},3~{R})-3-azanylcyclopentyl]oxyphenyl]-~{N}-[(1~{S})-1-[3-cyano-4-(trifluoromethyl)phenyl]ethyl]propanamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；310 K；PCPT 0.1M pH 5, Na3 Cit 1.1M
|
分辨率 1.56 Å R-free 0.237 |
| 9FKZ Discovery of a Series of Covalent, Cell Active Bfl-1 Inhibitors 提交 2024-06-04 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–151（151 aa）
|
未记录 | A1IDO ~{N}-[4-[(1~{R},3~{R})-3-azanylcyclopentyl]oxyphenyl]-~{N}-[(4-chlorophenyl)methyl]prop-2-enamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；310 K；Na3 Cit 1M, PCPT 0.1M pH 7
|
分辨率 1.68 Å R-free 0.339 |
| 9FL0 Discovery of a Series of Covalent, Cell Active Bfl-1 Inhibitors 提交 2024-06-04 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–151（151 aa）
|
未记录 | A1IDG ~{N}-[(4-chlorophenyl)methyl]-~{N}-(4-fluorophenyl)prop-2-enamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；310 K；PCPT 0.1M pH 7, Na3 Cit 1M
|
分辨率 1.94 Å R-free 0.281 |
| 9FL0 Discovery of a Series of Covalent, Cell Active Bfl-1 Inhibitors 提交 2024-06-04 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1–151（151 aa）
|
未记录 | A1IDG ~{N}-[(4-chlorophenyl)methyl]-~{N}-(4-fluorophenyl)prop-2-enamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；310 K；PCPT 0.1M pH 7, Na3 Cit 1M
|
分辨率 1.94 Å R-free 0.281 |
| 9GIP BFL1 covalently bound to inhibitor compound 7 提交 2024-08-19 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–151（151 aa）
|
未记录 | A1ILY ~{N}-[4-[(1~{R},3~{R})-3-azanylcyclopentyl]oxyphenyl]-~{N}-[(1~{S})-1-(4-chlorophenyl)ethyl]propanamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.71；293 K；Protein:ligand complex at ~4mg/ml in 20 mM HEPES pH 7.5, 150 mM NaCl, 5% glycerol,
2 mM TCEP, 1%DMSO. 150nL mixed with 150nL of well solution, 0.1M PCPT* pH 8.71, Na3 Citrate 0.93 M. *PCPT = Sodium propionate, sodium cacodylate trihydrate, bis-tris propane buffer system. Using STPLabtech Mosquito.
|
分辨率 1.46 Å R-free 0.249 |
| 9GIQ BFL1 covalently bound to inhibitor compound 13 提交 2024-08-19 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–151（151 aa）
|
未记录 | BUD (2S,3S)-butane-2,3-diol × 1 A1ILV ~{N}-[4-[(1~{R},3~{R})-3-azanylcyclopentyl]oxyphenyl]-~{N}-[(1~{S})-1-(4-chlorophenyl)-3-methyl-3-oxidanyl-butyl]propanamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9.5；293 K；Protein:ligand complex at ~4mg/ml in 20 mM HEPES pH 7.5, 150 mM NaCl, 5% glycerol,
2 mM TCEP, 1%DMSO. 150nL mixed with 150nL of well solution, 0.1M PCPT* pH 9.50, Na3 Citrate 0.60 M. *PCPT = Sodium propionate, sodium cacodylate trihydrate, bis-tris propane buffer system. Using STPLabtech Mosquito.
|
分辨率 1.42 Å R-free 0.257 |
| 9GIR BFL1 covalently bound to inhibitor compound 39 提交 2024-08-19 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–151（151 aa）
|
未记录 | A1ILX ~{N}-[4-[(1~{R},3~{R})-3-[[(3~{R})-1,1-bis(oxidanylidene)thiolan-3-yl]carbamoylamino]cyclopentyl]oxy-3-chloranyl-phenyl]-~{N}-[(1~{S})-1-(4-chlorophenyl)ethyl]propanamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.71；293 K；Protein:ligand complex at ~4mg/ml in 20 mM HEPES pH 7.5, 150 mM NaCl, 5% glycerol,
2 mM TCEP, 1%DMSO. 150nL mixed with 150nL of well solution, 0.1M PCPT* pH 4.78, Na3 Citrate 0.60 M. *PCPT = Sodium propionate, sodium cacodylate trihydrate, bis-tris propane buffer system. Using STPLabtech Mosquito.
|
分辨率 1.07 Å R-free 0.210 |
| 9GIS BFL1 covalently bound to inhibitor compound 17 提交 2024-08-19 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–151（151 aa）
|
未记录 | A1ILU ~{N}-[(1~{S})-1-(4-chlorophenyl)ethyl]-~{N}-[4-[(1~{R},3~{R})-3-[[(3~{S})-pyrrolidin-3-yl]carbamoylamino]cyclopentyl]oxyphenyl]propanamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.93；293 K；Protein:ligand complex at ~4mg/ml in 20 mM HEPES pH 7.5, 150 mM NaCl, 5% glycerol,
2 mM TCEP, 1%DMSO. 150nL mixed with 150nL of well solution, 0.1M PCPT* pH 7.93, Na3 Citrate 0.60 M. *PCPT = Sodium propionate, sodium cacodylate trihydrate, bis-tris propane buffer system. Using STPLabtech Mosquito.
|
分辨率 1.39 Å R-free 0.254 |
| 9GIS BFL1 covalently bound to inhibitor compound 17 提交 2024-08-19 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1–151（151 aa）
|
未记录 | A1ILU ~{N}-[(1~{S})-1-(4-chlorophenyl)ethyl]-~{N}-[4-[(1~{R},3~{R})-3-[[(3~{S})-pyrrolidin-3-yl]carbamoylamino]cyclopentyl]oxyphenyl]propanamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.93；293 K；Protein:ligand complex at ~4mg/ml in 20 mM HEPES pH 7.5, 150 mM NaCl, 5% glycerol,
2 mM TCEP, 1%DMSO. 150nL mixed with 150nL of well solution, 0.1M PCPT* pH 7.93, Na3 Citrate 0.60 M. *PCPT = Sodium propionate, sodium cacodylate trihydrate, bis-tris propane buffer system. Using STPLabtech Mosquito.
|
分辨率 1.39 Å R-free 0.254 |
| 9GIT BFL1 covalently bound to inhibitor compound 43 提交 2024-08-19 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–151（151 aa）
|
未记录 | A1ILW (3~{S})-3-[[4-[(1~{R},3~{R})-3-[[(3~{R})-1,1-bis(oxidanylidene)thiolan-3-yl]carbamoylamino]cyclopentyl]oxy-3-fluoranyl-phenyl]-propanoyl-amino]-3-(4-chlorophenyl)propanamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.14；293 K；Protein:ligand complex at ~4mg/ml in 20 mM HEPES pH 7.5, 150 mM NaCl, 5% glycerol,
2 mM TCEP, 1%DMSO. 150nL mixed with 150nL of well solution, 0.1M PCPT* pH 7.14, Na3 Citrate 0.92 M. *PCPT = Sodium propionate, sodium cacodylate trihydrate, bis-tris propane buffer system. Using STPLabtech Mosquito.
|
分辨率 1.15 Å R-free 0.212 |
| 9S6M Structure of BFL1 in complex with a covalent inhibitor, alternative series, cmpd25 提交 2025-08-01 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–151（151 aa）
|
未记录 | A1JL2 (1~{R},2~{R})-2-azanyl-~{N}-[4-[(1~{R})-1-[propanoyl-[4-(trifluoromethyloxy)phenyl]amino]ethyl]phenyl]cyclopentane-1-carboxamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；Crystallization of adducted protein was carried out using a 2D optimization grid, (sodium citrate 0.6-1.1 M, vs PCTP buffer, 0.1 M pH 4.5-9.5). 300 nL drops (150 nL protein, 150 nL mother liquor) were incubated at 293 K in a sitting drop vapour diffusion format, dispensed using a Mosquito (SPT Labtech) and SWISSCI MRC 2-drop plates
|
分辨率 1.43 Å R-free 0.214 |
| 9S6M Structure of BFL1 in complex with a covalent inhibitor, alternative series, cmpd25 提交 2025-08-01 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1–151（151 aa）
|
未记录 | A1JL2 (1~{R},2~{R})-2-azanyl-~{N}-[4-[(1~{R})-1-[propanoyl-[4-(trifluoromethyloxy)phenyl]amino]ethyl]phenyl]cyclopentane-1-carboxamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；Crystallization of adducted protein was carried out using a 2D optimization grid, (sodium citrate 0.6-1.1 M, vs PCTP buffer, 0.1 M pH 4.5-9.5). 300 nL drops (150 nL protein, 150 nL mother liquor) were incubated at 293 K in a sitting drop vapour diffusion format, dispensed using a Mosquito (SPT Labtech) and SWISSCI MRC 2-drop plates
|
分辨率 1.43 Å R-free 0.214 |