当前蛋白身份：Q16763
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1ZDN Ubiquitin-conjugating enzyme E2S 提交 2005-04-14 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–156（156 aa）
片段：N-terminal domain, residues 1-156
|
未记录 | NA SODIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；3M Na formate, 0.1M bisTris, pH6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.93 Å R-free 0.234 |
| 1ZDN Ubiquitin-conjugating enzyme E2S 提交 2005-04-14 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1–156（156 aa）
片段：N-terminal domain, residues 1-156
|
未记录 | NA SODIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；3M Na formate, 0.1M bisTris, pH6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.93 Å R-free 0.234 |
| 1ZDN Ubiquitin-conjugating enzyme E2S 提交 2005-04-14 | Assembly 3 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–156（156 aa）
片段：N-terminal domain, residues 1-156
链 B
1–156（156 aa）
片段：N-terminal domain, residues 1-156
|
未记录 | NA SODIUM ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；3M Na formate, 0.1M bisTris, pH6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.93 Å R-free 0.234 |
| 5BNB Crystal structure of a Ube2S-ubiquitin conjugate 提交 2015-05-25 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–156（156 aa）
|
突变：C118M | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；293 K；0.1M Tris, 20% PEG 4000
|
分辨率 2.49 Å R-free 0.304 |
| 5BNB Crystal structure of a Ube2S-ubiquitin conjugate 提交 2015-05-25 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
1–156（156 aa）
|
突变：C118M | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；293 K；0.1M Tris, 20% PEG 4000
|
分辨率 2.49 Å R-free 0.304 |
| 5BNB Crystal structure of a Ube2S-ubiquitin conjugate 提交 2015-05-25 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 C
1–156（156 aa）
|
突变：C118M | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；293 K；0.1M Tris, 20% PEG 4000
|
分辨率 2.49 Å R-free 0.304 |
| 5BNB Crystal structure of a Ube2S-ubiquitin conjugate 提交 2015-05-25 | Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 D
1–156（156 aa）
|
突变：C118M | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；293 K；0.1M Tris, 20% PEG 4000
|
分辨率 2.49 Å R-free 0.304 |
| 5L9T Model of human Anaphase-promoting complex/Cyclosome (APC/C-CDH1) with E2 UBE2S poised for polyubiquitination where UBE2S, APC2, and APC11 are modeled into low resolution density 提交 2016-06-11 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 22 PDB 声明：22-meric（22） 与蛋白数一致 |
链 T
1–222（222 aa）
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突变：C118F, delta 161-201 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 6.40 Å |
| 6QH3 Catalytic domain of the human ubiquitin-conjugating enzyme UBE2S C118M 提交 2019-01-15 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1–156（156 aa）
|
突变：C118M | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.2 M magnesium chloride, 0.1 M hepes pH 7.5, 25% PEG 3350
|
分辨率 2.90 Å R-free 0.230 |
| 6QH3 Catalytic domain of the human ubiquitin-conjugating enzyme UBE2S C118M 提交 2019-01-15 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–156（156 aa）
|
突变：C118M | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.2 M magnesium chloride, 0.1 M hepes pH 7.5, 25% PEG 3350
|
分辨率 2.90 Å R-free 0.230 |
| 6QHK PAO-linked dimer of the catalytic domain of the human ubiquitin-conjugating enzyme UBE2S 提交 2019-01-16 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–156（156 aa）
链 B
1–156（156 aa）
|
未记录 | CL CHLORIDE ION × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 PA0 Phenylarsine oxide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293 K；1 mM TCEP, 11.74 mg/ml PAO, 0.2 M magnesium chloride, 0.1 M Tris pH 8.5, 30% PEG 4000
|
分辨率 1.96 Å R-free 0.223 |
| 6S96 Crystal structure of the catalytic domain of UBE2S C118A. 提交 2019-07-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–156（156 aa）
链 B
1–156（156 aa）
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未记录 | FMT FORMIC ACID × 3 NA SODIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 6.5；293.15 K；2.5 M potassium formate, 0.1 M sodium cacodylate
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分辨率 2.18 Å R-free 0.246 |
| 6S98 Crystal structure of the catalytic domain of UBE2S WT. 提交 2019-07-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–156（156 aa）
链 B
1–156（156 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | NA SODIUM ION × 3 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 ACT ACETATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 8.5；293 K；0.2 M sodium-acetate-trihydrate; 0.1 M Tris; 30% PEG4000
|
分辨率 1.55 Å R-free 0.184 |
| 7AHF Dimeric structure of the catalytic domain of the human ubiquitin-conjugating enzyme UBE2S L114E varaiant 提交 2020-09-24 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–156（156 aa）
链 B
1–156（156 aa）
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未记录 | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 4 GOL GLYCEROL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；1.33 M magnesium formate dihydrate, 15% PEG 3350
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分辨率 2.15 Å R-free 0.239 |
| 8TAU APC/C-CDH1-UBE2C-UBE2S-Ubiquitin-CyclinB 提交 2023-06-27 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：23-meric（23） 与蛋白数一致 |
链 E
205–222（18 aa）
片段：C-terminal 18 residues
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未记录 | ZN ZINC ION × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 3.50 Å |