当前蛋白身份:Q27J81 重新检索
本组结构的主要差异维度
构建体不同 突变/修饰不同 组装状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量指标不同

差异标签只比较当前检索结果;所有PDB和assembly原始记录仍分别保留。

相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
8RV2 Structure of the formin INF2 bound to the barbed end of F-actin. 提交 2024-01-31 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric(6) 与蛋白数一致
链 E 469–1240(772 aa)
链 F 469–1240(772 aa)
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 3 MG MAGNESIUM ION × 4 PO4 PHOSPHATE ION × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.1;12 mM HEPES pH 7.1, 100 mM KCl, 2.1 mM MgCl2, 1 mM EGTA, 1 mM TCEP, 0.2 mM ATP
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE;3 seconds, force 0.
分辨率 3.41 Å
9AZ4 INF2 at the Barbed End of F-Actin 提交 2024-03-10 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric(8) 与蛋白数一致
链 G 551–987(437 aa)
链 H 551–987(437 aa)
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 MG MAGNESIUM ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.37 Å
9AZP INF2 at the Barbed End of F-Actin with Incoming Profilin-Actin 提交 2024-03-11 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 10 PDB 声明:decameric(10) 与蛋白数一致
链 G 1–1249(1249 aa)
链 H 1–1249(1249 aa)
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 MG MAGNESIUM ION × 7 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.79 Å
9AZQ INF2 at the Barbed End of F-Actin with Incoming Actin 提交 2024-03-11 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 9 PDB 声明:nonameric(9) 与蛋白数一致
链 G 551–610(60 aa)
链 H 625–947(323 aa)
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 7 MG MAGNESIUM ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.82 Å
9B03 INF2 in the Middle of F-Actin (Up state) 提交 2024-03-11 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric(8) 与蛋白数一致
链 G 551–987(437 aa)
链 H 551–987(437 aa)
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 MG MAGNESIUM ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.95 Å
9B0K INF2 in the Middle of F-Actin (Down state) 提交 2024-03-12 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric(8) 与蛋白数一致
链 G 551–987(437 aa)
链 H 551–987(437 aa)
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 MG MAGNESIUM ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.03 Å
9FJN Solution NMR structure of a peptide encompassing residues 2-19 of the human formin INF2 提交 2024-05-31 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 2–19(18 aa)
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 5.5;298 K;离子强度(mmCIF原始值)0;压力 1
NMR样品组成 1 mM INF2(2-19), 7 % v/v [U-2H] D2O, 63 % v/v H2O, 30 % v/v [U-98% 2H] TFE, 0.1 mM DSS, trifluoroethanol/water | trifluoroethanol/water
分辨率未提供
9FJW Solution NMR structure of a peptide encompassing residues 2-36 of the human formin INF2 提交 2024-05-31 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 2–36(35 aa)
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 5.5;298 K;离子强度(mmCIF原始值)0;压力 1
NMR样品组成 1 mM INF2(2-36), 7 % v/v [U-2H] D2O, 63 % v/v H2O, 30 % v/v [U-98% 2H] TFE, 0.1 mM DSS, trifluoroethanol/water | trifluoroethanol/water
分辨率未提供
9G7T Solution NMR structure of a peptide encompassing residues 967-991 of the human formin INF2 提交 2024-07-22 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 967–991(25 aa)
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 5.5;298 K;离子强度(mmCIF原始值)0;压力 1
NMR样品组成 1 mM DAD, 63 % v/v H2O, 7 % v/v [U-2H] D2O, 30 % v/v [U-99% 2H] TFE, 0.1 mM DSS, trifluoroethanol/water | trifluoroethanol/water
NMR样品组成 0.5 mM DAD, 70 % v/v [U-2H] D2O, 30 % v/v [U-99% 2H] TFE, 0.1 mM DSS, trifluoroethanol/water | trifluoroethanol/water
分辨率未提供
9RWF Solution NMR structure of a peptide encompassing residues 967-991 of the human formin INF2 提交 2025-07-09 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 967–991(25 aa)
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 5.5;298 K;离子强度(mmCIF原始值)0;压力 1
NMR样品组成 0.5 mM DAD, 0.1 mM DSS, 10 % v/v [U-2H] D2O, 90 % H2O, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 0.5 mM DAD, 0.1 mM DSS, 100 % [U-2H] D2O, 100% D2O | 100% D2O
分辨率未提供