当前蛋白身份:Q2H9W4 重新检索
本组结构的主要差异维度
组装状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量指标不同

差异标签只比较当前检索结果;所有PDB和assembly原始记录仍分别保留。

相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
7OLC Thermophilic eukaryotic 80S ribosome at idle POST state 提交 2021-05-19 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 80 PDB 声明:84-meric(84) 与全部聚合物一致
链 Lb 1–65(65 aa)
未记录 MG MAGNESIUM ION × 571 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
7OLD Thermophilic eukaryotic 80S ribosome at pe/E (TI)-POST state 提交 2021-05-19 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 80 PDB 声明:85-meric(85) 与全部聚合物一致
链 Lb 1–65(65 aa)
未记录 MG MAGNESIUM ION × 3 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
8OO0 Chaetomium thermophilum Methionine Aminopeptidase 2 autoproteolysis product at the 80S ribosome 提交 2023-04-04 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 81 PDB 声明:85-meric(85) 与全部聚合物一致
链 Lb 1–65(65 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8PV6 Chaetomium thermophilum pre-60S State 3 - post-5S rotation with Rix1 complex with Foot - composite structure 提交 2023-07-17 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 60 PDB 声明:64-meric(64) 与全部聚合物一致
链 Lb 1–65(65 aa)
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.94 Å
8PV8 Chaetomium thermophilum pre-60S State 4 - post-5S rotation with Rix1 complex without Foot - composite structure 提交 2023-07-17 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 57 PDB 声明:60-meric(60) 与全部聚合物一致
链 Lb 1–65(65 aa)
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.91 Å
9I78 Cryo-EM structure of Chaetomium thermophilum ribosome-bound SND3 translocon 提交 2025-01-31 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 47 PDB 声明:50-meric(50) 与全部聚合物一致
链 Lb 1–65(65 aa)
未记录 MG MAGNESIUM ION × 379 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE;waiting time: 15 s blot force: 0
分辨率 2.20 Å