当前蛋白身份:Q2TAY7
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 5O9Z Cryo-EM structure of a pre-catalytic human spliceosome primed for activation (B complex) 提交 2017-06-20 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 52 PDB 声明:57-meric(57) 与全部聚合物一致 |
链 L
1–513(513 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.50 Å |
| 6AHD The Cryo-EM Structure of Human Pre-catalytic Spliceosome (B complex) at 3.8 angstrom resolution 提交 2018-08-17 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 58 PDB 声明:63-meric(63) 与全部聚合物一致 |
链 Y
1–513(513 aa)
|
未记录 | IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.80 Å |
| 6Q8F Nterminal domain of human SMU1 提交 2018-12-14 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 A
2–513(512 aa)
链 B
2–513(512 aa)
|
未记录 | BTB 2-[BIS-(2-HYDROXY-ETHYL)-AMINO]-2-HYDROXYMETHYL-PROPANE-1,3-DIOL × 1 CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 5.5;293 K;0.1 M Bis-Tris pH 5.5, 16-20 % PEG 10K, 0.1 M ammonium acetate
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.214 |
| 6Q8I Nterminal domain of human SMU1 in complex with human REDmid 提交 2018-12-14 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致 |
链 A
2–513(512 aa)
链 B
2–513(512 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293 K;0.1 M Hepes pH 7.0-7.5, 8-10 % PEG 8K
|
分辨率 3.17 Å R-free 0.277 |
| 6Q8I Nterminal domain of human SMU1 in complex with human REDmid 提交 2018-12-14 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致 |
链 E
2–513(512 aa)
链 F
2–513(512 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293 K;0.1 M Hepes pH 7.0-7.5, 8-10 % PEG 8K
|
分辨率 3.17 Å R-free 0.277 |
| 6Q8I Nterminal domain of human SMU1 in complex with human REDmid 提交 2018-12-14 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致 |
链 I
2–513(512 aa)
链 J
2–513(512 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293 K;0.1 M Hepes pH 7.0-7.5, 8-10 % PEG 8K
|
分辨率 3.17 Å R-free 0.277 |
| 6Q8I Nterminal domain of human SMU1 in complex with human REDmid 提交 2018-12-14 | Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致 |
链 M
2–513(512 aa)
链 N
2–513(512 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293 K;0.1 M Hepes pH 7.0-7.5, 8-10 % PEG 8K
|
分辨率 3.17 Å R-free 0.277 |
| 6Q8J Nterminal domain of human SMU1 in complex with LSP641 提交 2018-12-14 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 A
2–196(195 aa)
|
未记录 | XS4 1-~{tert}-butyl-3-[6-(3,5-dimethoxyphenyl)-2-[[1-[1-(phenylmethyl)piperidin-4-yl]-1,2,3-triazol-4-yl]methylamino]pyrido[2,3-d]pyrimidin-7-yl]urea × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6;293 K;0.1 M Bis-Tris pH 6, 16-20 % PEG 10K, 0.2 M ammonium acetate
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.220 |
| 8H6K Cryo-EM structure of human exon-defined spliceosome in the mature B state. 提交 2022-10-18 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 58 PDB 声明:63-meric(63) 与全部聚合物一致 |
链 4Z
1–513(513 aa)
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未记录 | IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.70 Å |
| 8H6L Cryo-EM structure of human exon-defined spliceosome in the early B state. 提交 2022-10-18 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 54 PDB 声明:59-meric(59) 与全部聚合物一致 |
链 4Z
1–513(513 aa)
|
未记录 | IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.60 Å |
| 8QO9 Cryo-EM structure of a human spliceosomal B complex protomer 提交 2023-09-28 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 66 PDB 声明:71-meric(71) 与全部聚合物一致 |
链 v
1–513(513 aa)
链 w
1–513(513 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 5.29 Å |
| 8QZS Cryo-EM structure of the cross-exon B-like complex 提交 2023-10-29 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 61 PDB 声明:68-meric(68) 与全部聚合物一致 |
链 v
1–513(513 aa)
链 w
1–513(513 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.10 Å |
| 9R8V Cryo-EM structure of the human pre-Bact-OTS complex (whole map) 提交 2025-05-17 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 59 PDB 声明:63-meric(63) 与全部聚合物一致 |
链 v
1–513(513 aa)
链 w
1–513(513 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 8.50 Å |