当前蛋白身份:Q2TAY7 重新检索
本组结构的主要差异维度
构建体不同 组装状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量指标不同

差异标签只比较当前检索结果;所有PDB和assembly原始记录仍分别保留。

相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
5O9Z Cryo-EM structure of a pre-catalytic human spliceosome primed for activation (B complex) 提交 2017-06-20 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 52 PDB 声明:57-meric(57) 与全部聚合物一致
链 L 1–513(513 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.50 Å
6AHD The Cryo-EM Structure of Human Pre-catalytic Spliceosome (B complex) at 3.8 angstrom resolution 提交 2018-08-17 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 58 PDB 声明:63-meric(63) 与全部聚合物一致
链 Y 1–513(513 aa)
未记录 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
6Q8F Nterminal domain of human SMU1 提交 2018-12-14 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 2–513(512 aa)
链 B 2–513(512 aa)
未记录 BTB 2-[BIS-(2-HYDROXY-ETHYL)-AMINO]-2-HYDROXYMETHYL-PROPANE-1,3-DIOL × 1 CL CHLORIDE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 5.5;293 K;0.1 M Bis-Tris pH 5.5, 16-20 % PEG 10K, 0.1 M ammonium acetate
分辨率 1.90 Å R-free 0.214
6Q8I Nterminal domain of human SMU1 in complex with human REDmid 提交 2018-12-14 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致
链 A 2–513(512 aa)
链 B 2–513(512 aa)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293 K;0.1 M Hepes pH 7.0-7.5, 8-10 % PEG 8K
分辨率 3.17 Å R-free 0.277
6Q8I Nterminal domain of human SMU1 in complex with human REDmid 提交 2018-12-14 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致
链 E 2–513(512 aa)
链 F 2–513(512 aa)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293 K;0.1 M Hepes pH 7.0-7.5, 8-10 % PEG 8K
分辨率 3.17 Å R-free 0.277
6Q8I Nterminal domain of human SMU1 in complex with human REDmid 提交 2018-12-14 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致
链 I 2–513(512 aa)
链 J 2–513(512 aa)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293 K;0.1 M Hepes pH 7.0-7.5, 8-10 % PEG 8K
分辨率 3.17 Å R-free 0.277
6Q8I Nterminal domain of human SMU1 in complex with human REDmid 提交 2018-12-14 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致
链 M 2–513(512 aa)
链 N 2–513(512 aa)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293 K;0.1 M Hepes pH 7.0-7.5, 8-10 % PEG 8K
分辨率 3.17 Å R-free 0.277
6Q8J Nterminal domain of human SMU1 in complex with LSP641 提交 2018-12-14 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 2–196(195 aa)
未记录 XS4 1-~{tert}-butyl-3-[6-(3,5-dimethoxyphenyl)-2-[[1-[1-(phenylmethyl)piperidin-4-yl]-1,2,3-triazol-4-yl]methylamino]pyrido[2,3-d]pyrimidin-7-yl]urea × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6;293 K;0.1 M Bis-Tris pH 6, 16-20 % PEG 10K, 0.2 M ammonium acetate
分辨率 1.80 Å R-free 0.220
8H6K Cryo-EM structure of human exon-defined spliceosome in the mature B state. 提交 2022-10-18 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 58 PDB 声明:63-meric(63) 与全部聚合物一致
链 4Z 1–513(513 aa)
未记录 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
8H6L Cryo-EM structure of human exon-defined spliceosome in the early B state. 提交 2022-10-18 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 54 PDB 声明:59-meric(59) 与全部聚合物一致
链 4Z 1–513(513 aa)
未记录 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.60 Å
8QO9 Cryo-EM structure of a human spliceosomal B complex protomer 提交 2023-09-28 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 66 PDB 声明:71-meric(71) 与全部聚合物一致
链 v 1–513(513 aa)
链 w 1–513(513 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.29 Å
8QZS Cryo-EM structure of the cross-exon B-like complex 提交 2023-10-29 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 61 PDB 声明:68-meric(68) 与全部聚合物一致
链 v 1–513(513 aa)
链 w 1–513(513 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.10 Å
9R8V Cryo-EM structure of the human pre-Bact-OTS complex (whole map) 提交 2025-05-17 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 59 PDB 声明:63-meric(63) 与全部聚合物一致
链 v 1–513(513 aa)
链 w 1–513(513 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 8.50 Å