当前蛋白身份：Q5I7L1
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 4V3P The molecular structure of the left-handed supra-molecular helix of eukaryotic polyribosomes 提交 2014-10-20 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 1863 PDB 声明：2001-meric（2001） 与全部聚合物一致 |
链 LK
1–206（206 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
25MM HEPES-KOH, 3MM MG(OAC)2, 85MM KOAC,1.6MM DTT, 0.25MM SPERMIDINE；pH 7.6；25MM HEPES-KOH, 3MM MG(OAC)2, 85MM KOAC,1.6MM DTT, 0.25MM SPERMIDINE
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；VITRIFICATION 1 --CRYOGEN- ETHANE, HUMIDITY-95, TEMPERATURE- 120,INSTRUMENT- FEI VITROBOT
MARK IV, METHOD- 3UL OF SAMPLE APPLIED ON 300 MESH HOLY CARBON QUANTIFOIL GRID. BLOTTING
WAS DONE IN VITROBOT MARK IV, BLOT TIME 0.5 SEC, BLOT FORCE 5
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分辨率 34.00 Å |
| 4V7E Model of the small subunit RNA based on a 5.5 A cryo-EM map of Triticum aestivum translating 80S ribosome 提交 2013-11-22 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 82 PDB 声明：88-meric（88） 与全部聚合物一致 |
链 CO
1–206（206 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
20 mM HEPES/KOH, pH 7.5, 100 mM KOAc, 10 mM Mg(OAc)2, 0.01 mg/mL cycloheximide, 1 mM DTT, 0.01% Nikkol；pH 7.5；20 mM HEPES/KOH, pH 7.5, 100 mM KOAc, 10 mM Mg(OAc)2, 0.01 mg/mL cycloheximide, 1 mM DTT, 0.01% Nikkol
cryo-EM玻璃化条件
Blot for 10 seconds before plunging, use 2 layers of filter paper；冷冻剂 ETHANE；Blot for 10 seconds (using 2 layers of filter paper) before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT).
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分辨率 5.50 Å |
| 8IP8 Wheat 80S ribosome stalled on AUG-Stop boron dependently 提交 2023-03-14 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 74 PDB 声明：81-meric（81） 与全部聚合物一致 |
链 FB
1–206（206 aa）
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未记录 | MG MAGNESIUM ION × 307 ZN ZINC ION × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 2.90 Å |
| 8IPA Wheat 80S ribosome stalled on AUG-Stop boron dependently with cycloheximide 提交 2023-03-14 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 74 PDB 声明：80-meric（80） 与全部聚合物一致 |
链 FB
1–206（206 aa）
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未记录 | MG MAGNESIUM ION × 284 ZN ZINC ION × 4 3HE 4-{(2R)-2-[(1S,3S,5S)-3,5-dimethyl-2-oxocyclohexyl]-2-hydroxyethyl}piperidine-2,6-dione × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 3.40 Å |
| 8IPB Wheat 80S ribosome pausing on AUG-Stop with cycloheximide 提交 2023-03-14 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 73 PDB 声明：79-meric（79） 与全部聚合物一致 |
链 FB
1–206（206 aa）
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未记录 | MG MAGNESIUM ION × 265 ZN ZINC ION × 4 3HE 4-{(2R)-2-[(1S,3S,5S)-3,5-dimethyl-2-oxocyclohexyl]-2-hydroxyethyl}piperidine-2,6-dione × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.40 Å |
| 8JIV Atomic structure of wheat ribosome reveals unique features of the plant ribosomes 提交 2023-05-28 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 41 PDB 声明：44-meric（44） 与全部聚合物一致 |
链 CO
1–206（206 aa）
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未记录 | K POTASSIUM ION × 72 MG MAGNESIUM ION × 242 ZN ZINC ION × 3 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 2.84 Å |