当前蛋白身份：Q5NBT9
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 4ZHE Crystal structure of the SeMet substituted Topless related protein 2 (TPR2) N-terminal domain (1-209) from rice 提交 2015-04-24 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
1–209（209 aa）
片段：N-TERMINAL DOMAIN (UNP residues 1-209)
链 B
1–209（209 aa）
片段：N-TERMINAL DOMAIN (UNP residues 1-209)
链 C
1–209（209 aa）
片段：N-TERMINAL DOMAIN (UNP residues 1-209)
链 D
1–209（209 aa）
片段：N-TERMINAL DOMAIN (UNP residues 1-209)
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；25% w/v PEG 3,350, 0.2 M Magnesium chloride, 0.1 M BIS-TRIS, pH 6.5, 19.6 mM 5-Methyl-6-O-(N-heptylcarbamoyl)-alpha-D-glucopyranoside
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.242 |
| 5C6Q Crystal structure of the apo TOPLESS related protein 2 (TPR2) N-terminal domain (1-209) from rice 提交 2015-06-23 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
1–209（209 aa）
片段：N-terminal domain (UNP residues 1-209)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；25% PEG 3350, 0.2 M magnesium chloride, 0.1 M BIS-TRIS, pH 6.5
|
分辨率 3.25 Å R-free 0.270 |
| 5C6V Crystal structure of the rice Topless related protein 2 (TPR2) N-terminal domain (1-209) in complex with Arabidopsis NINJA peptide 提交 2015-06-23 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 A
1–209（209 aa）
片段：N-terminal domain (UNP residues 1-209)
链 B
1–209（209 aa）
片段：N-terminal domain (UNP residues 1-209)
链 C
1–209（209 aa）
片段：N-terminal domain (UNP residues 1-209)
链 D
1–209（209 aa）
片段：N-terminal domain (UNP residues 1-209)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；293 K；25% w/v PEG 3,350, 0.2 M NaCl, 0.1 M BIS-TRIS pH 5.5, 3.0% w/v D-(+)-glucose monohydrate
|
分辨率 3.10 Å R-free 0.286 |
| 5C7E Crystal structure of the rice Topless related protein 2 (TPR2) N-terminal domain (1-209) in complex with Arabidopsis IAA10 peptide 提交 2015-06-24 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 A
1–209（209 aa）
片段：N-terminal domain (UNP residues 1-209)
链 B
1–209（209 aa）
片段：N-terminal domain (UNP residues 1-209)
链 C
1–209（209 aa）
片段：N-terminal domain (UNP residues 1-209)
链 D
1–209（209 aa）
片段：N-terminal domain (UNP residues 1-209)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；20% w/v PEG 3,350, 0.2 M sodium citrate tribasic dihydrate
|
分辨率 3.10 Å R-free 0.229 |
| 5C7E Crystal structure of the rice Topless related protein 2 (TPR2) N-terminal domain (1-209) in complex with Arabidopsis IAA10 peptide 提交 2015-06-24 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 E
1–209（209 aa）
片段：N-terminal domain (UNP residues 1-209)
链 F
1–209（209 aa）
片段：N-terminal domain (UNP residues 1-209)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；20% w/v PEG 3,350, 0.2 M sodium citrate tribasic dihydrate
|
分辨率 3.10 Å R-free 0.229 |
| 5C7F Crystal structure of the rice Topless related protein 2 (TPR2) N-terminal domain (1-209) in complex with Arabidopsis IAA1 peptide 提交 2015-06-24 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 A
1–209（209 aa）
片段：N-terminal domain (UNP residues 1-209)
链 B
1–209（209 aa）
片段：N-terminal domain (UNP residues 1-209)
链 C
1–209（209 aa）
片段：N-terminal domain (UNP residues 1-209)
链 D
1–209（209 aa）
片段：N-terminal domain (UNP residues 1-209)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；293 K；25% w/v PEG 3,350, 0.2 M NaCl, 0.1 M BIS-TRIS pH 5.5
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.256 |
| 5J9K Crystal structure of the rice Topless related protein 2 (TPR2) N-terminal topless domain (1-209) in complex with rice D53 repressor EAR peptide motif 提交 2016-04-10 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 A
1–209（209 aa）
片段：N-terminal topless domain (UNP residues 1-209)
链 B
1–209（209 aa）
片段：N-terminal topless domain (UNP residues 1-209)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；25% w/v Polyethylene glycol 3350, 0.2 M Ammonium sulfate, 0.1 M BIS-TRIS, pH 6.5
|
分辨率 2.55 Å R-free 0.253 |
| 5JA5 Crystal structure of the rice Topless related protein 2 (TPR2) N-terminal topless domain (1-209) L111A and L130A mutant in complex with rice D53 repressor EAR peptide motif 提交 2016-04-12 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 A
1–209（209 aa）
片段：N-terminal topless domain (UNP residues 1-209)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.8；293 K；20% w/v Polyethylene glycol 3350, 0.2 M Potassium phosphate monobasic, pH 4.8
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.228 |
| 5JGC Crystal structure of the rice Topless related protein 2 (TPR2) N-terminal topless domain (1-209) L111A, L130A, L179A and I195A mutant 提交 2016-04-20 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
1–209（209 aa）
片段：N-terminal topless domain (UNP residues 1-209)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293 K；15% w/v Polyethylene glycol 4000, 0.2 M Magnesium chloride hexahydrate, 0.1 M TRIS hydrochloride pH 8.5
|
分辨率 2.08 Å R-free 0.246 |
| 5JHP Crystal structure of the rice Topless related protein 2 (TPR2) N-terminal topless domain (1-209) L179A and I195A mutant in complex with rice D53 repressor EAR peptide motif 提交 2016-04-21 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 A
1–209（209 aa）
片段：N-terminal topless domain (UNP residues 1-209)
链 B
1–209（209 aa）
片段：N-terminal topless domain (UNP residues 1-209)
链 C
1–209（209 aa）
片段：N-terminal topless domain (UNP residues 1-209)
链 D
1–209（209 aa）
片段：N-terminal topless domain (UNP residues 1-209)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；293 K；20% w/v Polyethylene glycol 3350, 0.2 M Lithium sulfate monohydrate, pH 6.0
|
分辨率 3.15 Å R-free 0.284 |