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Protein Structures and Oligomeric States

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Current Protein Identity：Q6D0W6 New Search
5PDB entries
5Biological assembly
97chain/assembly records
Main Difference Dimensions in This Set
Different assembly state Different structure-quality metrics

Difference tags compare only the current result set; every original PDB and assembly record remains separate.

Related-Structure Differences

Each row represents one biological assembly in one PDB entry; multiple monomers of the same protein are listed separately.

PDB Entry Assembly / Oligomeric State Construct Mutations and Modifications Ligands, Ions and Non-polymers Experimental Method Experimental Conditions Structure Quality
9IRF Cryo-EM Structure of csy1-4 with crRNA Deposited 2024-07-15 Assembly 1 Protein–RNA Heteromer；Protein × 9 PDB declaration: decameric（10） Consistent with all polymers
Chain C 1–337（337 aa）
Chain D 1–337（337 aa）
Chain E 1–337（337 aa）
Chain F 1–337（337 aa）
Chain G 1–337（337 aa）
Chain H 1–337（337 aa）
Not recorded No recorded non-water small molecule ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM buffer pH 7.4
cryo-EM vitrification conditions Cryogen ETHANE
Resolution 2.80 Å
9IRG Cryo-EM Structure of RNA Deposited 2024-07-16 Assembly 1 Protein–RNA Homooligomer；Protein × 26 PDB declaration: 27-meric（27） Consistent with all polymers
Chain A 1–337（337 aa）
Chain B 1–337（337 aa）
Chain C 1–337（337 aa）
Chain D 1–337（337 aa）
Chain E 1–337（337 aa）
Chain F 1–337（337 aa）
Chain G 1–337（337 aa）
Chain H 1–337（337 aa）
Chain I 1–337（337 aa）
Chain J 1–337（337 aa）
Chain K 1–337（337 aa）
Chain L 1–337（337 aa）
Chain N 1–337（337 aa）
Chain O 1–337（337 aa）
Chain P 1–337（337 aa）
Chain Q 1–337（337 aa）
Chain S 1–337（337 aa）
Chain T 1–337（337 aa）
Chain U 1–337（337 aa）
Chain V 1–337（337 aa）
Chain W 1–337（337 aa）
Chain Y 1–337（337 aa）
Chain Z 1–337（337 aa）
Chain a 1–337（337 aa）
Chain b 1–337（337 aa）
Chain f 1–337（337 aa）
Not recorded No recorded non-water small molecule ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM buffer pH 7.4
cryo-EM vitrification conditions Cryogen ETHANE
Resolution 4.59 Å
9IRI Cryo-EM Structure of D-RNA Deposited 2024-07-16 Assembly 1 Protein–RNA Heteromer；Protein × 10 PDB declaration: undecameric（11） Consistent with all polymers
Chain A 1–337（337 aa）
Chain C 1–337（337 aa）
Chain D 1–337（337 aa）
Chain E 1–337（337 aa）
Chain F 1–337（337 aa）
Chain G 1–337（337 aa）
Chain I 1–337（337 aa）
Chain J 1–337（337 aa）
Chain K 1–337（337 aa）
Not recorded No recorded non-water small molecule ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM buffer pH 7.4
cryo-EM vitrification conditions Cryogen ETHANE
Resolution 2.80 Å
9XCF Cryo-EM structure of csy3 with crRNA Deposited 2025-10-25 Assembly 1 Protein–RNA Homooligomer；Protein × 30 PDB declaration: 31-meric（31） Consistent with all polymers
Chain A 1–337（337 aa）
Chain B 1–337（337 aa）
Chain C 1–337（337 aa）
Chain D 1–337（337 aa）
Chain E 1–337（337 aa）
Chain F 1–337（337 aa）
Chain G 1–337（337 aa）
Chain H 1–337（337 aa）
Chain I 1–337（337 aa）
Chain J 1–337（337 aa）
Chain K 1–337（337 aa）
Chain L 1–337（337 aa）
Chain N 1–337（337 aa）
Chain O 1–337（337 aa）
Chain P 1–337（337 aa）
Chain Q 1–337（337 aa）
Chain S 1–337（337 aa）
Chain T 1–337（337 aa）
Chain U 1–337（337 aa）
Chain V 1–337（337 aa）
Chain W 1–337（337 aa）
Chain Y 1–337（337 aa）
Chain Z 1–337（337 aa）
Chain a 1–337（337 aa）
Chain b 1–337（337 aa）
Chain f 1–337（337 aa）
Chain i 1–337（337 aa）
Chain o 1–337（337 aa）
Chain p 1–337（337 aa）
Chain q 1–337（337 aa）
Not recorded No recorded non-water small molecule ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM buffer pH 7.4
cryo-EM vitrification conditions Cryogen ETHANE
Resolution 4.58 Å
9XCG Cryo-EM structure of csy3 with crRNA Deposited 2025-10-25 Assembly 1 Protein–RNA Homooligomer；Protein × 26 PDB declaration: 27-meric（27） Consistent with all polymers
Chain A 1–337（337 aa）
Chain B 1–337（337 aa）
Chain C 1–337（337 aa）
Chain D 1–337（337 aa）
Chain E 1–337（337 aa）
Chain F 1–337（337 aa）
Chain G 1–337（337 aa）
Chain H 1–337（337 aa）
Chain I 1–337（337 aa）
Chain J 1–337（337 aa）
Chain K 1–337（337 aa）
Chain L 1–337（337 aa）
Chain N 1–337（337 aa）
Chain O 1–337（337 aa）
Chain P 1–337（337 aa）
Chain Q 1–337（337 aa）
Chain S 1–337（337 aa）
Chain T 1–337（337 aa）
Chain U 1–337（337 aa）
Chain V 1–337（337 aa）
Chain W 1–337（337 aa）
Chain Y 1–337（337 aa）
Chain Z 1–337（337 aa）
Chain a 1–337（337 aa）
Chain b 1–337（337 aa）
Chain f 1–337（337 aa）
Not recorded No recorded non-water small molecule ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM buffer pH 7.4
cryo-EM vitrification conditions Cryogen ETHANE
Resolution 4.85 Å

This page presents structural evidence recorded in PDB/mmCIF.“No recorded non-water small molecule” does not prove that the experimental sample was ligand-free; experimental conditions belong to the PDB experiment, while ligands and copy counts are shown for each biological assembly.