当前蛋白身份:Q6ZRS2 重新检索
本组结构的主要差异维度
构建体不同 组装状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量指标不同

差异标签只比较当前检索结果;所有PDB和assembly原始记录仍分别保留。

相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
6IGM Cryo-EM Structure of Human SRCAP Complex 提交 2018-09-25 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 9 PDB 声明:nonameric(9) 与蛋白数一致
链 H 1–3230(3230 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.00 Å
8X15 Structure of nucleosome-bound SRCAP-C in the apo state 提交 2023-11-06 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 23 PDB 声明:25-meric(25) 与全部聚合物一致
链 I 1–3230(3230 aa)
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
8X19 Structure of nucleosome-bound SRCAP-C in the ADP-BeFx-bound state 提交 2023-11-06 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 23 PDB 声明:25-meric(25) 与全部聚合物一致
链 I 1–3230(3230 aa)
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 7 MG MAGNESIUM ION × 1 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
8X1C Structure of nucleosome-bound SRCAP-C in the ADP-bound state 提交 2023-11-06 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 23 PDB 声明:25-meric(25) 与全部聚合物一致
链 I 1–3230(3230 aa)
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 7 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
9CA7 Cryo-EM structure of human SRCAP-nucleosome complex in the fully-engaged state (composite structure) 提交 2024-06-17 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 18 PDB 声明:20-meric(20) 与全部聚合物一致
链 A 1–3230(3230 aa)
未记录 AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 MG MAGNESIUM ION × 5 ZN ZINC ION × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.35 Å
9CA8 Cryo-EM structure of human SRCAP-nucleosome complex in the partially-engaged state (composite structure) 提交 2024-06-17 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 18 PDB 声明:20-meric(20) 与全部聚合物一致
链 A 1–3230(3230 aa)
未记录 AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 MG MAGNESIUM ION × 5 ZN ZINC ION × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.92 Å
9CA9 Cryo-EM structure of the human SRCAP complex in the unbound state (composite structure) 提交 2024-06-17 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 10 PDB 声明:decameric(10) 与蛋白数一致
链 A 1–3230(3230 aa)
未记录 AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 4 ZN ZINC ION × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.56 Å
9CAA Cryo-EM structure of human SRCAP-nucleosome complex in the pre-engaged state (composite structure) 提交 2024-06-17 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 18 PDB 声明:20-meric(20) 与全部聚合物一致
链 A 1–3230(3230 aa)
未记录 AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 4 ZN ZINC ION × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.04 Å
9CAB Cryo-EM structure of human SRCAP-nucleosome complex in the encounter state (composite structure) 提交 2024-06-17 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 18 PDB 声明:20-meric(20) 与全部聚合物一致
链 A 1–3230(3230 aa)
未记录 AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 MG MAGNESIUM ION × 5 ZN ZINC ION × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.94 Å
9UBD The Structural Basis of the Recognition of the Histone Variant H2A.Z by the SRCAP Catalytic Subunit 提交 2025-04-02 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 10 PDB 声明:decameric(10) 与蛋白数一致
链 C 531–560(30 aa)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;289.15 K;0.2 M Potassium thiocyanate 15 % w/v PEG 3,350 pH 7.0
分辨率 2.53 Å R-free 0.288