当前蛋白身份：Q86VP1
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一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2M7Q Solution structure of TAX1BP1 UBZ1+2 提交 2013-04-29 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
725–789（65 aa）
片段：UNP residues 725-789
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 6；298 K；离子强度（mmCIF原始值）0；压力 ambient
NMR样品组成
0.5-1.0 mM [U-98% 13C; U-98% 15N] UBZ1+2-1, 93% H2O/7% D2O | 93% H2O/7% D2O
|
分辨率未提供 |
| 4BMJ Structure of the UBZ1and2 tandem of the ubiquitin-binding adaptor protein TAX1BP1 提交 2013-05-09 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
725–789（65 aa）
片段：RESIDUES 725-789
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 8.5；0.1 M TRIS PH 8.5, 1 M LISO4
|
分辨率 2.75 Å R-free 0.255 |
| 4BMJ Structure of the UBZ1and2 tandem of the ubiquitin-binding adaptor protein TAX1BP1 提交 2013-05-09 | Assembly 10 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 J
725–789（65 aa）
片段：RESIDUES 725-789
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 8.5；0.1 M TRIS PH 8.5, 1 M LISO4
|
分辨率 2.75 Å R-free 0.255 |
| 4BMJ Structure of the UBZ1and2 tandem of the ubiquitin-binding adaptor protein TAX1BP1 提交 2013-05-09 | Assembly 11 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 K
725–789（65 aa）
片段：RESIDUES 725-789
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 8.5；0.1 M TRIS PH 8.5, 1 M LISO4
|
分辨率 2.75 Å R-free 0.255 |
| 4BMJ Structure of the UBZ1and2 tandem of the ubiquitin-binding adaptor protein TAX1BP1 提交 2013-05-09 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
725–789（65 aa）
片段：RESIDUES 725-789
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 CL CHLORIDE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 8.5；0.1 M TRIS PH 8.5, 1 M LISO4
|
分辨率 2.75 Å R-free 0.255 |
| 4BMJ Structure of the UBZ1and2 tandem of the ubiquitin-binding adaptor protein TAX1BP1 提交 2013-05-09 | Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 C
725–789（65 aa）
片段：RESIDUES 725-789
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 8.5；0.1 M TRIS PH 8.5, 1 M LISO4
|
分辨率 2.75 Å R-free 0.255 |
| 4BMJ Structure of the UBZ1and2 tandem of the ubiquitin-binding adaptor protein TAX1BP1 提交 2013-05-09 | Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 D
725–789（65 aa）
片段：RESIDUES 725-789
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 8.5；0.1 M TRIS PH 8.5, 1 M LISO4
|
分辨率 2.75 Å R-free 0.255 |
| 4BMJ Structure of the UBZ1and2 tandem of the ubiquitin-binding adaptor protein TAX1BP1 提交 2013-05-09 | Assembly 5 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 E
725–789（65 aa）
片段：RESIDUES 725-789
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 8.5；0.1 M TRIS PH 8.5, 1 M LISO4
|
分辨率 2.75 Å R-free 0.255 |
| 4BMJ Structure of the UBZ1and2 tandem of the ubiquitin-binding adaptor protein TAX1BP1 提交 2013-05-09 | Assembly 6 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 F
725–789（65 aa）
片段：RESIDUES 725-789
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 8.5；0.1 M TRIS PH 8.5, 1 M LISO4
|
分辨率 2.75 Å R-free 0.255 |
| 4BMJ Structure of the UBZ1and2 tandem of the ubiquitin-binding adaptor protein TAX1BP1 提交 2013-05-09 | Assembly 7 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 G
725–789（65 aa）
片段：RESIDUES 725-789
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 8.5；0.1 M TRIS PH 8.5, 1 M LISO4
|
分辨率 2.75 Å R-free 0.255 |
| 4BMJ Structure of the UBZ1and2 tandem of the ubiquitin-binding adaptor protein TAX1BP1 提交 2013-05-09 | Assembly 8 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 H
725–789（65 aa）
片段：RESIDUES 725-789
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 8.5；0.1 M TRIS PH 8.5, 1 M LISO4
|
分辨率 2.75 Å R-free 0.255 |
| 4BMJ Structure of the UBZ1and2 tandem of the ubiquitin-binding adaptor protein TAX1BP1 提交 2013-05-09 | Assembly 9 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 I
725–789（65 aa）
片段：RESIDUES 725-789
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 8.5；0.1 M TRIS PH 8.5, 1 M LISO4
|
分辨率 2.75 Å R-free 0.255 |
| 4NLH SKICH domain of human TAX1BP1 提交 2013-11-14 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
15–147（133 aa）
链 B
15–147（133 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；298 K；PEG 3350, MES 7.2, KBr, pH 8.0, vapor diffusion, hanging drop, temperature 298K
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.278 |
| 4NLH SKICH domain of human TAX1BP1 提交 2013-11-14 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
15–147（133 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；298 K；PEG 3350, MES 7.2, KBr, pH 8.0, vapor diffusion, hanging drop, temperature 298K
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.278 |
| 4NLH SKICH domain of human TAX1BP1 提交 2013-11-14 | Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
15–147（133 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；298 K；PEG 3350, MES 7.2, KBr, pH 8.0, vapor diffusion, hanging drop, temperature 298K
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.278 |
| 4Z4K Crystal structure of GFP-TAX1BP1 UBZ1+2 domain fusion protein 提交 2015-04-02 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
725–781（57 aa）
片段：UBZ1 and UBZ2
链 B
725–781（57 aa）
片段：UBZ1 and UBZ2
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | ZN ZINC ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；293 K；0.2 M Lithium sulfate monohydrate, 0.1 M Tris pH 8.5, 25% w/v PEG 3350.
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分辨率 2.80 Å R-free 0.280 |
| 4Z4M Crystal structure of GFP-TAX1BP1 UBZ2 domain fusion protein 提交 2015-04-02 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
755–781（27 aa）
片段：UBZ2
链 B
755–781（27 aa）
片段：UBZ2
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | ZN ZINC ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 7.4；293 K；0.2 M Ammonium fluoride, 20% w/v Polyethylene glycol 3,350
|
分辨率 2.15 Å R-free 0.298 |
| 5AAS The selective autophagy receptor TAX1BP1 is required for autophagy- dependent capture of cytosolic Salmonella typhimurium 提交 2015-07-28 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
722–784（63 aa）
片段：RESIDUES 722-784
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未记录 | ZN ZINC ION × 2 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 6.5；298 K；离子强度（mmCIF原始值）100；压力 1.0
NMR样品组成
95% WATER/5% D2O
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分辨率未提供 |
| 5YT6 Crystal structure of TAX1BP1 UBZ2 in complex with mono-ubiquitin 提交 2017-11-17 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 F
754–787（34 aa）
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未记录 | ZN ZINC ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；289 K；Ammonium sulfate, BIS TRIS propane
|
分辨率 1.50 Å R-free 0.225 |
| 5YT6 Crystal structure of TAX1BP1 UBZ2 in complex with mono-ubiquitin 提交 2017-11-17 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
754–787（34 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 SO4 SULFATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；289 K；Ammonium sulfate, BIS TRIS propane
|
分辨率 1.50 Å R-free 0.225 |
| 5YT6 Crystal structure of TAX1BP1 UBZ2 in complex with mono-ubiquitin 提交 2017-11-17 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 D
754–787（34 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 SO4 SULFATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；289 K；Ammonium sulfate, BIS TRIS propane
|
分辨率 1.50 Å R-free 0.225 |
| 5YT6 Crystal structure of TAX1BP1 UBZ2 in complex with mono-ubiquitin 提交 2017-11-17 | Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 H
754–787（34 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 GOL GLYCEROL × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；289 K；Ammonium sulfate, BIS TRIS propane
|
分辨率 1.50 Å R-free 0.225 |
| 5Z7G Crystal structure of TAX1BP1 SKICH region in complex with NAP1 提交 2018-01-28 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
1–121（121 aa）
链 B
1–121（121 aa）
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未记录 | GOL GLYCEROL × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；289 K；PEG 8000, 0.1 M HEPES
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.233 |
| 8W6A Crystal structure of TAX1BP1 LIR region in complex with GABARAP 提交 2023-08-28 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 C
123–151（29 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；289 K；2.8 M Sodium acetate trihydrate and 0.1 M BIS-TRIS propane at pH 7.0
|
分辨率 1.53 Å R-free 0.187 |
| 8W6A Crystal structure of TAX1BP1 LIR region in complex with GABARAP 提交 2023-08-28 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 E
123–151（29 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；289 K；2.8 M Sodium acetate trihydrate and 0.1 M BIS-TRIS propane at pH 7.0
|
分辨率 1.53 Å R-free 0.187 |
| 8W6A Crystal structure of TAX1BP1 LIR region in complex with GABARAP 提交 2023-08-28 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 F
123–151（29 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；289 K；2.8 M Sodium acetate trihydrate and 0.1 M BIS-TRIS propane at pH 7.0
|
分辨率 1.53 Å R-free 0.187 |
| 8W6A Crystal structure of TAX1BP1 LIR region in complex with GABARAP 提交 2023-08-28 | Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 H
123–151（29 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；289 K；2.8 M Sodium acetate trihydrate and 0.1 M BIS-TRIS propane at pH 7.0
|
分辨率 1.53 Å R-free 0.187 |
| 8W6B crystal structure of TAX1BP1 SKICH domain in complex with RB1CC1 coiled-coil domain 提交 2023-08-28 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 A
1–121（121 aa）
链 B
1–121（121 aa）
链 E
1–121（121 aa）
链 F
1–121（121 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；289 K；5% (w/v) PEG 4000, 50 mM Magnesium chloride, 100 mM MES at pH 6.5, 10% 2-propanol
|
分辨率 2.39 Å R-free 0.234 |