Current Protein Identity：Q88678
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Related-Structure Differences
Each row represents one biological assembly in one PDB entry; multiple monomers of the same protein are listed separately.
| PDB Entry | Assembly / Oligomeric State | Construct | Mutations and Modifications | Ligands, Ions and Non-polymers | Experimental Method | Experimental Conditions | Structure Quality |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 6XO4 CryoEM structure of Eastern Equine Encephalitis (EEEV) VLP Deposited 2020-07-06 | Assembly 1 Protein homooligomer Homooligomer；Protein × 720 PDB declaration: 720-meric（720） Consistent with protein count |
Chain A
802–1242（441 aa）
Chain B
325–744（420 aa）
Chain C
1–261（261 aa）
Chain D
802–1242（441 aa）
Chain E
325–744（420 aa）
Chain F
1–261（261 aa）
Chain G
802–1242（441 aa）
Chain H
325–744（420 aa）
Chain I
1–261（261 aa）
Chain J
802–1242（441 aa）
Chain K
325–744（420 aa）
Chain L
1–261（261 aa）
|
Not recorded | No recorded non-water small molecule | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM buffer
pH 7.5
cryo-EM vitrification conditions
Cryogen ETHANE；blot time 2.5s blot force 9
|
Resolution 4.20 Å |
| 6XO4 CryoEM structure of Eastern Equine Encephalitis (EEEV) VLP Deposited 2020-07-06 | Assembly 2 Protein homooligomer Homooligomer；Protein × 12 PDB declaration: dodecameric（12） Consistent with protein count |
Chain A
802–1242（441 aa）
Chain B
325–744（420 aa）
Chain C
1–261（261 aa）
Chain D
802–1242（441 aa）
Chain E
325–744（420 aa）
Chain F
1–261（261 aa）
Chain G
802–1242（441 aa）
Chain H
325–744（420 aa）
Chain I
1–261（261 aa）
Chain J
802–1242（441 aa）
Chain K
325–744（420 aa）
Chain L
1–261（261 aa）
|
Not recorded | No recorded non-water small molecule | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM buffer
pH 7.5
cryo-EM vitrification conditions
Cryogen ETHANE；blot time 2.5s blot force 9
|
Resolution 4.20 Å |
| 6XO4 CryoEM structure of Eastern Equine Encephalitis (EEEV) VLP Deposited 2020-07-06 | Assembly 3 Protein homooligomer Homooligomer；Protein × 60 PDB declaration: 60-meric（60） Consistent with protein count |
Chain A
802–1242（441 aa）
Chain B
325–744（420 aa）
Chain C
1–261（261 aa）
Chain D
802–1242（441 aa）
Chain E
325–744（420 aa）
Chain F
1–261（261 aa）
Chain G
802–1242（441 aa）
Chain H
325–744（420 aa）
Chain I
1–261（261 aa）
Chain J
802–1242（441 aa）
Chain K
325–744（420 aa）
Chain L
1–261（261 aa）
|
Not recorded | No recorded non-water small molecule | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM buffer
pH 7.5
cryo-EM vitrification conditions
Cryogen ETHANE；blot time 2.5s blot force 9
|
Resolution 4.20 Å |
| 6XO4 CryoEM structure of Eastern Equine Encephalitis (EEEV) VLP Deposited 2020-07-06 | Assembly 4 Protein homooligomer Homooligomer；Protein × 72 PDB declaration: 72-meric（72） Consistent with protein count |
Chain A
802–1242（441 aa）
Chain B
325–744（420 aa）
Chain C
1–261（261 aa）
Chain D
802–1242（441 aa）
Chain E
325–744（420 aa）
Chain F
1–261（261 aa）
Chain G
802–1242（441 aa）
Chain H
325–744（420 aa）
Chain I
1–261（261 aa）
Chain J
802–1242（441 aa）
Chain K
325–744（420 aa）
Chain L
1–261（261 aa）
|
Not recorded | No recorded non-water small molecule | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM buffer
pH 7.5
cryo-EM vitrification conditions
Cryogen ETHANE；blot time 2.5s blot force 9
|
Resolution 4.20 Å |
| 6XO4 CryoEM structure of Eastern Equine Encephalitis (EEEV) VLP Deposited 2020-07-06 | Assembly 5 Protein homooligomer Homooligomer；Protein × 12 PDB declaration: dodecameric（12） Consistent with protein count |
Chain A
802–1242（441 aa）
Chain B
325–744（420 aa）
Chain C
1–261（261 aa）
Chain D
802–1242（441 aa）
Chain E
325–744（420 aa）
Chain F
1–261（261 aa）
Chain G
802–1242（441 aa）
Chain H
325–744（420 aa）
Chain I
1–261（261 aa）
Chain J
802–1242（441 aa）
Chain K
325–744（420 aa）
Chain L
1–261（261 aa）
|
Not recorded | No recorded non-water small molecule | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM buffer
pH 7.5
cryo-EM vitrification conditions
Cryogen ETHANE；blot time 2.5s blot force 9
|
Resolution 4.20 Å |
| 6XOB CryoEM structure of Eastern Equine Encephalitis (EEEV) VLP with Fab EEEV-143. Deposited 2020-07-06 | Assembly 1 Protein heterocomplex Heteromer；Protein × 1200 PDB declaration: 1200-meric（1200） Consistent with protein count |
Chain A
802–1242（441 aa）
Chain B
325–744（420 aa）
Chain C
1–261（261 aa）
Chain D
802–1242（441 aa）
Chain E
325–744（420 aa）
Chain F
1–261（261 aa）
Chain G
802–1242（441 aa）
Chain H
325–744（420 aa）
Chain I
1–261（261 aa）
Chain J
802–1242（441 aa）
Chain K
325–744（420 aa）
Chain L
1–261（261 aa）
|
Not recorded | No recorded non-water small molecule | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM buffer
pH 7.5
cryo-EM vitrification conditions
Cryogen ETHANE；blot time 2.5s blot force 9
|
Resolution 8.50 Å |
| 6XOB CryoEM structure of Eastern Equine Encephalitis (EEEV) VLP with Fab EEEV-143. Deposited 2020-07-06 | Assembly 2 Protein heterocomplex Heteromer；Protein × 20 PDB declaration: eicosameric（20） Consistent with protein count |
Chain A
802–1242（441 aa）
Chain B
325–744（420 aa）
Chain C
1–261（261 aa）
Chain D
802–1242（441 aa）
Chain E
325–744（420 aa）
Chain F
1–261（261 aa）
Chain G
802–1242（441 aa）
Chain H
325–744（420 aa）
Chain I
1–261（261 aa）
Chain J
802–1242（441 aa）
Chain K
325–744（420 aa）
Chain L
1–261（261 aa）
|
Not recorded | No recorded non-water small molecule | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM buffer
pH 7.5
cryo-EM vitrification conditions
Cryogen ETHANE；blot time 2.5s blot force 9
|
Resolution 8.50 Å |
| 6XOB CryoEM structure of Eastern Equine Encephalitis (EEEV) VLP with Fab EEEV-143. Deposited 2020-07-06 | Assembly 3 Protein heterocomplex Heteromer；Protein × 100 PDB declaration: 100-meric（100） Consistent with protein count |
Chain A
802–1242（441 aa）
Chain B
325–744（420 aa）
Chain C
1–261（261 aa）
Chain D
802–1242（441 aa）
Chain E
325–744（420 aa）
Chain F
1–261（261 aa）
Chain G
802–1242（441 aa）
Chain H
325–744（420 aa）
Chain I
1–261（261 aa）
Chain J
802–1242（441 aa）
Chain K
325–744（420 aa）
Chain L
1–261（261 aa）
|
Not recorded | No recorded non-water small molecule | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM buffer
pH 7.5
cryo-EM vitrification conditions
Cryogen ETHANE；blot time 2.5s blot force 9
|
Resolution 8.50 Å |
| 6XOB CryoEM structure of Eastern Equine Encephalitis (EEEV) VLP with Fab EEEV-143. Deposited 2020-07-06 | Assembly 4 Protein heterocomplex Heteromer；Protein × 120 PDB declaration: 120-meric（120） Consistent with protein count |
Chain A
802–1242（441 aa）
Chain B
325–744（420 aa）
Chain C
1–261（261 aa）
Chain D
802–1242（441 aa）
Chain E
325–744（420 aa）
Chain F
1–261（261 aa）
Chain G
802–1242（441 aa）
Chain H
325–744（420 aa）
Chain I
1–261（261 aa）
Chain J
802–1242（441 aa）
Chain K
325–744（420 aa）
Chain L
1–261（261 aa）
|
Not recorded | No recorded non-water small molecule | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM buffer
pH 7.5
cryo-EM vitrification conditions
Cryogen ETHANE；blot time 2.5s blot force 9
|
Resolution 8.50 Å |
| 6XOB CryoEM structure of Eastern Equine Encephalitis (EEEV) VLP with Fab EEEV-143. Deposited 2020-07-06 | Assembly 5 Protein heterocomplex Heteromer；Protein × 20 PDB declaration: eicosameric（20） Consistent with protein count |
Chain A
802–1242（441 aa）
Chain B
325–744（420 aa）
Chain C
1–261（261 aa）
Chain D
802–1242（441 aa）
Chain E
325–744（420 aa）
Chain F
1–261（261 aa）
Chain G
802–1242（441 aa）
Chain H
325–744（420 aa）
Chain I
1–261（261 aa）
Chain J
802–1242（441 aa）
Chain K
325–744（420 aa）
Chain L
1–261（261 aa）
|
Not recorded | No recorded non-water small molecule | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM buffer
pH 7.5
cryo-EM vitrification conditions
Cryogen ETHANE；blot time 2.5s blot force 9
|
Resolution 8.50 Å |
| 8DWO Cryo-EM Structure of Eastern Equine Encephalitis Virus in complex with SKE26 Fab Deposited 2022-08-01 | Assembly 1 Protein heterocomplex Heteromer；Protein × 12 PDB declaration: dodecameric（12） Consistent with protein count |
Chain A
802–1242（441 aa）
Chain B
325–744（420 aa）
Chain F
802–1242（441 aa）
Chain G
325–744（420 aa）
Chain J
802–1242（441 aa）
Chain K
325–744（420 aa）
|
Not recorded | No recorded non-water small molecule | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM buffer
pH 7.4
cryo-EM vitrification conditions
Cryogen ETHANE
|
Resolution 3.50 Å |
| 8UA4 Structure of eastern equine encephalitis virus VLP in complex with VLDLR LA1 Deposited 2023-09-20 | Assembly 1 Protein heterocomplex Heteromer；Protein × 17 PDB declaration: heptadecameric（17） Consistent with protein count |
Chain A
802–1242（441 aa）
Chain B
325–744（420 aa）
Chain C
1–261（261 aa）
Chain D
802–1242（441 aa）
Chain E
325–744（420 aa）
Chain F
1–261（261 aa）
Chain G
802–1242（441 aa）
Chain H
325–744（420 aa）
Chain I
1–261（261 aa）
Chain J
802–1242（441 aa）
Chain K
325–744（420 aa）
Chain L
1–261（261 aa）
|
Mutation：K67N Mutation：K67N Mutation：K67N Mutation：K67N | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 12 CA CALCIUM ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM buffer
pH 7.2
cryo-EM vitrification conditions
Cryogen ETHANE
|
Resolution 3.58 Å |
| 8UA9 Structure of eastern equine encephalitis virus VLP unliganded quasi-threefold spike protein Deposited 2023-09-20 | Assembly 1 Protein heterocomplex Heteromer；Protein × 16 PDB declaration: hexadecameric（16） Consistent with protein count |
Chain A
802–1242（441 aa）
Chain B
325–742（418 aa）
Fragment：UNP residues 325-744
Chain D
1–261（261 aa）
Chain E
802–1242（441 aa）
Chain F
325–742（418 aa）
Fragment：UNP residues 325-744
Chain H
1–261（261 aa）
Chain I
802–1242（441 aa）
Chain J
325–742（418 aa）
Fragment：UNP residues 325-744
Chain L
1–261（261 aa）
Chain M
802–1242（441 aa）
Chain N
325–742（418 aa）
Fragment：UNP residues 325-744
Chain P
1–261（261 aa）
|
Not recorded | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 9 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM buffer
pH 7.2
cryo-EM vitrification conditions
Cryogen ETHANE
|
Resolution 3.00 Å |
| 8UFA Eastern equine encephalitis virus (PE-6) VLP (asymmetric unit) Deposited 2023-10-04 | Assembly 1 Protein heterocomplex Heteromer；Protein × 12 PDB declaration: dodecameric（12） Consistent with protein count |
Chain A
802–1242（441 aa）
Fragment：UNP residues 802-1242
Chain B
325–738（414 aa）
Fragment：UNP residues 325-738
Chain D
802–1242（441 aa）
Fragment：UNP residues 802-1242
Chain E
325–738（414 aa）
Fragment：UNP residues 325-738
Chain G
802–1242（441 aa）
Fragment：UNP residues 802-1242
Chain H
325–738（414 aa）
Fragment：UNP residues 325-738
Chain J
802–1242（441 aa）
Fragment：UNP residues 802-1242
Chain K
325–738（414 aa）
Fragment：UNP residues 325-738
|
Not recorded | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 8 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM buffer
pH 7.4
cryo-EM vitrification conditions
Cryogen ETHANE
|
Resolution 2.86 Å |
| 8UFB Eastern equine encephalitis virus (PE-6) VLP in complex with full-length VLDLR (asymmetric unit) Deposited 2023-10-04 | Assembly 1 Protein heterocomplex Heteromer；Protein × 20 PDB declaration: eicosameric（20） Consistent with protein count |
Chain A
802–1242（441 aa）
Fragment：UNP residues 802-1242
Chain B
325–738（414 aa）
Fragment：UNP residues 325-738
Chain D
802–1242（441 aa）
Fragment：UNP residues 802-1242
Chain E
325–738（414 aa）
Fragment：UNP residues 325-738
Chain G
802–1242（441 aa）
Fragment：UNP residues 802-1242
Chain H
325–738（414 aa）
Fragment：UNP residues 325-738
Chain J
802–1242（441 aa）
Fragment：UNP residues 802-1242
Chain K
325–738（414 aa）
Fragment：UNP residues 325-738
|
Not recorded | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 8 CA CALCIUM ION × 12 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM buffer
pH 7.4
cryo-EM vitrification conditions
Cryogen ETHANE
|
Resolution 3.89 Å |
| 8UFC Eastern equine encephalitis virus (PE-6) VLP in complex with VLDLR LA(1-2) (asymmetric unit) Deposited 2023-10-04 | Assembly 1 Protein heterocomplex Heteromer；Protein × 16 PDB declaration: hexadecameric（16） Consistent with protein count |
Chain A
802–1242（441 aa）
Fragment：UNP residues 802-1242
Chain B
325–738（414 aa）
Fragment：UNP residues 325-738
Chain D
802–1242（441 aa）
Fragment：UNP residues 802-1242
Chain E
325–738（414 aa）
Fragment：UNP residues 325-738
Chain G
802–1242（441 aa）
Fragment：UNP residues 802-1242
Chain H
325–738（414 aa）
Fragment：UNP residues 325-738
Chain J
802–1242（441 aa）
Fragment：UNP residues 802-1242
Chain K
325–738（414 aa）
Fragment：UNP residues 325-738
|
Not recorded | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 8 CA CALCIUM ION × 8 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM buffer
pH 7.4
cryo-EM vitrification conditions
Cryogen ETHANE
|
Resolution 3.09 Å |