当前蛋白身份:Q88678 重新检索
本组结构的主要差异维度
构建体不同 突变/修饰不同 组装状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量指标不同

差异标签只比较当前检索结果;所有PDB和assembly原始记录仍分别保留。

相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
6XO4 CryoEM structure of Eastern Equine Encephalitis (EEEV) VLP 提交 2020-07-06 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 720 PDB 声明:720-meric(720) 与蛋白数一致
链 A 802–1242(441 aa)
链 B 325–744(420 aa)
链 C 1–261(261 aa)
链 D 802–1242(441 aa)
链 E 325–744(420 aa)
链 F 1–261(261 aa)
链 G 802–1242(441 aa)
链 H 325–744(420 aa)
链 I 1–261(261 aa)
链 J 802–1242(441 aa)
链 K 325–744(420 aa)
链 L 1–261(261 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE;blot time 2.5s blot force 9
分辨率 4.20 Å
6XO4 CryoEM structure of Eastern Equine Encephalitis (EEEV) VLP 提交 2020-07-06 Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 12 PDB 声明:dodecameric(12) 与蛋白数一致
链 A 802–1242(441 aa)
链 B 325–744(420 aa)
链 C 1–261(261 aa)
链 D 802–1242(441 aa)
链 E 325–744(420 aa)
链 F 1–261(261 aa)
链 G 802–1242(441 aa)
链 H 325–744(420 aa)
链 I 1–261(261 aa)
链 J 802–1242(441 aa)
链 K 325–744(420 aa)
链 L 1–261(261 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE;blot time 2.5s blot force 9
分辨率 4.20 Å
6XO4 CryoEM structure of Eastern Equine Encephalitis (EEEV) VLP 提交 2020-07-06 Assembly 3 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 60 PDB 声明:60-meric(60) 与蛋白数一致
链 A 802–1242(441 aa)
链 B 325–744(420 aa)
链 C 1–261(261 aa)
链 D 802–1242(441 aa)
链 E 325–744(420 aa)
链 F 1–261(261 aa)
链 G 802–1242(441 aa)
链 H 325–744(420 aa)
链 I 1–261(261 aa)
链 J 802–1242(441 aa)
链 K 325–744(420 aa)
链 L 1–261(261 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE;blot time 2.5s blot force 9
分辨率 4.20 Å
6XO4 CryoEM structure of Eastern Equine Encephalitis (EEEV) VLP 提交 2020-07-06 Assembly 4 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 72 PDB 声明:72-meric(72) 与蛋白数一致
链 A 802–1242(441 aa)
链 B 325–744(420 aa)
链 C 1–261(261 aa)
链 D 802–1242(441 aa)
链 E 325–744(420 aa)
链 F 1–261(261 aa)
链 G 802–1242(441 aa)
链 H 325–744(420 aa)
链 I 1–261(261 aa)
链 J 802–1242(441 aa)
链 K 325–744(420 aa)
链 L 1–261(261 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE;blot time 2.5s blot force 9
分辨率 4.20 Å
6XO4 CryoEM structure of Eastern Equine Encephalitis (EEEV) VLP 提交 2020-07-06 Assembly 5 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 12 PDB 声明:dodecameric(12) 与蛋白数一致
链 A 802–1242(441 aa)
链 B 325–744(420 aa)
链 C 1–261(261 aa)
链 D 802–1242(441 aa)
链 E 325–744(420 aa)
链 F 1–261(261 aa)
链 G 802–1242(441 aa)
链 H 325–744(420 aa)
链 I 1–261(261 aa)
链 J 802–1242(441 aa)
链 K 325–744(420 aa)
链 L 1–261(261 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE;blot time 2.5s blot force 9
分辨率 4.20 Å
6XOB CryoEM structure of Eastern Equine Encephalitis (EEEV) VLP with Fab EEEV-143. 提交 2020-07-06 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 1200 PDB 声明:1200-meric(1200) 与蛋白数一致
链 A 802–1242(441 aa)
链 B 325–744(420 aa)
链 C 1–261(261 aa)
链 D 802–1242(441 aa)
链 E 325–744(420 aa)
链 F 1–261(261 aa)
链 G 802–1242(441 aa)
链 H 325–744(420 aa)
链 I 1–261(261 aa)
链 J 802–1242(441 aa)
链 K 325–744(420 aa)
链 L 1–261(261 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE;blot time 2.5s blot force 9
分辨率 8.50 Å
6XOB CryoEM structure of Eastern Equine Encephalitis (EEEV) VLP with Fab EEEV-143. 提交 2020-07-06 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 20 PDB 声明:eicosameric(20) 与蛋白数一致
链 A 802–1242(441 aa)
链 B 325–744(420 aa)
链 C 1–261(261 aa)
链 D 802–1242(441 aa)
链 E 325–744(420 aa)
链 F 1–261(261 aa)
链 G 802–1242(441 aa)
链 H 325–744(420 aa)
链 I 1–261(261 aa)
链 J 802–1242(441 aa)
链 K 325–744(420 aa)
链 L 1–261(261 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE;blot time 2.5s blot force 9
分辨率 8.50 Å
6XOB CryoEM structure of Eastern Equine Encephalitis (EEEV) VLP with Fab EEEV-143. 提交 2020-07-06 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 100 PDB 声明:100-meric(100) 与蛋白数一致
链 A 802–1242(441 aa)
链 B 325–744(420 aa)
链 C 1–261(261 aa)
链 D 802–1242(441 aa)
链 E 325–744(420 aa)
链 F 1–261(261 aa)
链 G 802–1242(441 aa)
链 H 325–744(420 aa)
链 I 1–261(261 aa)
链 J 802–1242(441 aa)
链 K 325–744(420 aa)
链 L 1–261(261 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE;blot time 2.5s blot force 9
分辨率 8.50 Å
6XOB CryoEM structure of Eastern Equine Encephalitis (EEEV) VLP with Fab EEEV-143. 提交 2020-07-06 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 120 PDB 声明:120-meric(120) 与蛋白数一致
链 A 802–1242(441 aa)
链 B 325–744(420 aa)
链 C 1–261(261 aa)
链 D 802–1242(441 aa)
链 E 325–744(420 aa)
链 F 1–261(261 aa)
链 G 802–1242(441 aa)
链 H 325–744(420 aa)
链 I 1–261(261 aa)
链 J 802–1242(441 aa)
链 K 325–744(420 aa)
链 L 1–261(261 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE;blot time 2.5s blot force 9
分辨率 8.50 Å
6XOB CryoEM structure of Eastern Equine Encephalitis (EEEV) VLP with Fab EEEV-143. 提交 2020-07-06 Assembly 5 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 20 PDB 声明:eicosameric(20) 与蛋白数一致
链 A 802–1242(441 aa)
链 B 325–744(420 aa)
链 C 1–261(261 aa)
链 D 802–1242(441 aa)
链 E 325–744(420 aa)
链 F 1–261(261 aa)
链 G 802–1242(441 aa)
链 H 325–744(420 aa)
链 I 1–261(261 aa)
链 J 802–1242(441 aa)
链 K 325–744(420 aa)
链 L 1–261(261 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE;blot time 2.5s blot force 9
分辨率 8.50 Å
8DWO Cryo-EM Structure of Eastern Equine Encephalitis Virus in complex with SKE26 Fab 提交 2022-08-01 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 12 PDB 声明:dodecameric(12) 与蛋白数一致
链 A 802–1242(441 aa)
链 B 325–744(420 aa)
链 F 802–1242(441 aa)
链 G 325–744(420 aa)
链 J 802–1242(441 aa)
链 K 325–744(420 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
8UA4 Structure of eastern equine encephalitis virus VLP in complex with VLDLR LA1 提交 2023-09-20 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 17 PDB 声明:heptadecameric(17) 与蛋白数一致
链 A 802–1242(441 aa)
链 B 325–744(420 aa)
链 C 1–261(261 aa)
链 D 802–1242(441 aa)
链 E 325–744(420 aa)
链 F 1–261(261 aa)
链 G 802–1242(441 aa)
链 H 325–744(420 aa)
链 I 1–261(261 aa)
链 J 802–1242(441 aa)
链 K 325–744(420 aa)
链 L 1–261(261 aa)
突变:K67N 突变:K67N 突变:K67N 突变:K67N NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 12 CA CALCIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.58 Å
8UA9 Structure of eastern equine encephalitis virus VLP unliganded quasi-threefold spike protein 提交 2023-09-20 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 16 PDB 声明:hexadecameric(16) 与蛋白数一致
链 A 802–1242(441 aa)
链 B 325–742(418 aa) 片段:UNP residues 325-744
链 D 1–261(261 aa)
链 E 802–1242(441 aa)
链 F 325–742(418 aa) 片段:UNP residues 325-744
链 H 1–261(261 aa)
链 I 802–1242(441 aa)
链 J 325–742(418 aa) 片段:UNP residues 325-744
链 L 1–261(261 aa)
链 M 802–1242(441 aa)
链 N 325–742(418 aa) 片段:UNP residues 325-744
链 P 1–261(261 aa)
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 9 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
8UFA Eastern equine encephalitis virus (PE-6) VLP (asymmetric unit) 提交 2023-10-04 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 12 PDB 声明:dodecameric(12) 与蛋白数一致
链 A 802–1242(441 aa) 片段:UNP residues 802-1242
链 B 325–738(414 aa) 片段:UNP residues 325-738
链 D 802–1242(441 aa) 片段:UNP residues 802-1242
链 E 325–738(414 aa) 片段:UNP residues 325-738
链 G 802–1242(441 aa) 片段:UNP residues 802-1242
链 H 325–738(414 aa) 片段:UNP residues 325-738
链 J 802–1242(441 aa) 片段:UNP residues 802-1242
链 K 325–738(414 aa) 片段:UNP residues 325-738
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.86 Å
8UFB Eastern equine encephalitis virus (PE-6) VLP in complex with full-length VLDLR (asymmetric unit) 提交 2023-10-04 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 20 PDB 声明:eicosameric(20) 与蛋白数一致
链 A 802–1242(441 aa) 片段:UNP residues 802-1242
链 B 325–738(414 aa) 片段:UNP residues 325-738
链 D 802–1242(441 aa) 片段:UNP residues 802-1242
链 E 325–738(414 aa) 片段:UNP residues 325-738
链 G 802–1242(441 aa) 片段:UNP residues 802-1242
链 H 325–738(414 aa) 片段:UNP residues 325-738
链 J 802–1242(441 aa) 片段:UNP residues 802-1242
链 K 325–738(414 aa) 片段:UNP residues 325-738
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 8 CA CALCIUM ION × 12 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.89 Å
8UFC Eastern equine encephalitis virus (PE-6) VLP in complex with VLDLR LA(1-2) (asymmetric unit) 提交 2023-10-04 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 16 PDB 声明:hexadecameric(16) 与蛋白数一致
链 A 802–1242(441 aa) 片段:UNP residues 802-1242
链 B 325–738(414 aa) 片段:UNP residues 325-738
链 D 802–1242(441 aa) 片段:UNP residues 802-1242
链 E 325–738(414 aa) 片段:UNP residues 325-738
链 G 802–1242(441 aa) 片段:UNP residues 802-1242
链 H 325–738(414 aa) 片段:UNP residues 325-738
链 J 802–1242(441 aa) 片段:UNP residues 802-1242
链 K 325–738(414 aa) 片段:UNP residues 325-738
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 8 CA CALCIUM ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.09 Å