当前蛋白身份:Q88678
重新检索
差异标签只比较当前检索结果;所有PDB和assembly原始记录仍分别保留。
相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 6XO4 CryoEM structure of Eastern Equine Encephalitis (EEEV) VLP 提交 2020-07-06 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 720 PDB 声明:720-meric(720) 与蛋白数一致 |
链 A
802–1242(441 aa)
链 B
325–744(420 aa)
链 C
1–261(261 aa)
链 D
802–1242(441 aa)
链 E
325–744(420 aa)
链 F
1–261(261 aa)
链 G
802–1242(441 aa)
链 H
325–744(420 aa)
链 I
1–261(261 aa)
链 J
802–1242(441 aa)
链 K
325–744(420 aa)
链 L
1–261(261 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;blot time 2.5s blot force 9
|
分辨率 4.20 Å |
| 6XO4 CryoEM structure of Eastern Equine Encephalitis (EEEV) VLP 提交 2020-07-06 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 12 PDB 声明:dodecameric(12) 与蛋白数一致 |
链 A
802–1242(441 aa)
链 B
325–744(420 aa)
链 C
1–261(261 aa)
链 D
802–1242(441 aa)
链 E
325–744(420 aa)
链 F
1–261(261 aa)
链 G
802–1242(441 aa)
链 H
325–744(420 aa)
链 I
1–261(261 aa)
链 J
802–1242(441 aa)
链 K
325–744(420 aa)
链 L
1–261(261 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;blot time 2.5s blot force 9
|
分辨率 4.20 Å |
| 6XO4 CryoEM structure of Eastern Equine Encephalitis (EEEV) VLP 提交 2020-07-06 | Assembly 3 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 60 PDB 声明:60-meric(60) 与蛋白数一致 |
链 A
802–1242(441 aa)
链 B
325–744(420 aa)
链 C
1–261(261 aa)
链 D
802–1242(441 aa)
链 E
325–744(420 aa)
链 F
1–261(261 aa)
链 G
802–1242(441 aa)
链 H
325–744(420 aa)
链 I
1–261(261 aa)
链 J
802–1242(441 aa)
链 K
325–744(420 aa)
链 L
1–261(261 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;blot time 2.5s blot force 9
|
分辨率 4.20 Å |
| 6XO4 CryoEM structure of Eastern Equine Encephalitis (EEEV) VLP 提交 2020-07-06 | Assembly 4 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 72 PDB 声明:72-meric(72) 与蛋白数一致 |
链 A
802–1242(441 aa)
链 B
325–744(420 aa)
链 C
1–261(261 aa)
链 D
802–1242(441 aa)
链 E
325–744(420 aa)
链 F
1–261(261 aa)
链 G
802–1242(441 aa)
链 H
325–744(420 aa)
链 I
1–261(261 aa)
链 J
802–1242(441 aa)
链 K
325–744(420 aa)
链 L
1–261(261 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;blot time 2.5s blot force 9
|
分辨率 4.20 Å |
| 6XO4 CryoEM structure of Eastern Equine Encephalitis (EEEV) VLP 提交 2020-07-06 | Assembly 5 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 12 PDB 声明:dodecameric(12) 与蛋白数一致 |
链 A
802–1242(441 aa)
链 B
325–744(420 aa)
链 C
1–261(261 aa)
链 D
802–1242(441 aa)
链 E
325–744(420 aa)
链 F
1–261(261 aa)
链 G
802–1242(441 aa)
链 H
325–744(420 aa)
链 I
1–261(261 aa)
链 J
802–1242(441 aa)
链 K
325–744(420 aa)
链 L
1–261(261 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;blot time 2.5s blot force 9
|
分辨率 4.20 Å |
| 6XOB CryoEM structure of Eastern Equine Encephalitis (EEEV) VLP with Fab EEEV-143. 提交 2020-07-06 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 1200 PDB 声明:1200-meric(1200) 与蛋白数一致 |
链 A
802–1242(441 aa)
链 B
325–744(420 aa)
链 C
1–261(261 aa)
链 D
802–1242(441 aa)
链 E
325–744(420 aa)
链 F
1–261(261 aa)
链 G
802–1242(441 aa)
链 H
325–744(420 aa)
链 I
1–261(261 aa)
链 J
802–1242(441 aa)
链 K
325–744(420 aa)
链 L
1–261(261 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;blot time 2.5s blot force 9
|
分辨率 8.50 Å |
| 6XOB CryoEM structure of Eastern Equine Encephalitis (EEEV) VLP with Fab EEEV-143. 提交 2020-07-06 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 20 PDB 声明:eicosameric(20) 与蛋白数一致 |
链 A
802–1242(441 aa)
链 B
325–744(420 aa)
链 C
1–261(261 aa)
链 D
802–1242(441 aa)
链 E
325–744(420 aa)
链 F
1–261(261 aa)
链 G
802–1242(441 aa)
链 H
325–744(420 aa)
链 I
1–261(261 aa)
链 J
802–1242(441 aa)
链 K
325–744(420 aa)
链 L
1–261(261 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;blot time 2.5s blot force 9
|
分辨率 8.50 Å |
| 6XOB CryoEM structure of Eastern Equine Encephalitis (EEEV) VLP with Fab EEEV-143. 提交 2020-07-06 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 100 PDB 声明:100-meric(100) 与蛋白数一致 |
链 A
802–1242(441 aa)
链 B
325–744(420 aa)
链 C
1–261(261 aa)
链 D
802–1242(441 aa)
链 E
325–744(420 aa)
链 F
1–261(261 aa)
链 G
802–1242(441 aa)
链 H
325–744(420 aa)
链 I
1–261(261 aa)
链 J
802–1242(441 aa)
链 K
325–744(420 aa)
链 L
1–261(261 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;blot time 2.5s blot force 9
|
分辨率 8.50 Å |
| 6XOB CryoEM structure of Eastern Equine Encephalitis (EEEV) VLP with Fab EEEV-143. 提交 2020-07-06 | Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 120 PDB 声明:120-meric(120) 与蛋白数一致 |
链 A
802–1242(441 aa)
链 B
325–744(420 aa)
链 C
1–261(261 aa)
链 D
802–1242(441 aa)
链 E
325–744(420 aa)
链 F
1–261(261 aa)
链 G
802–1242(441 aa)
链 H
325–744(420 aa)
链 I
1–261(261 aa)
链 J
802–1242(441 aa)
链 K
325–744(420 aa)
链 L
1–261(261 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;blot time 2.5s blot force 9
|
分辨率 8.50 Å |
| 6XOB CryoEM structure of Eastern Equine Encephalitis (EEEV) VLP with Fab EEEV-143. 提交 2020-07-06 | Assembly 5 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 20 PDB 声明:eicosameric(20) 与蛋白数一致 |
链 A
802–1242(441 aa)
链 B
325–744(420 aa)
链 C
1–261(261 aa)
链 D
802–1242(441 aa)
链 E
325–744(420 aa)
链 F
1–261(261 aa)
链 G
802–1242(441 aa)
链 H
325–744(420 aa)
链 I
1–261(261 aa)
链 J
802–1242(441 aa)
链 K
325–744(420 aa)
链 L
1–261(261 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;blot time 2.5s blot force 9
|
分辨率 8.50 Å |
| 8DWO Cryo-EM Structure of Eastern Equine Encephalitis Virus in complex with SKE26 Fab 提交 2022-08-01 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 12 PDB 声明:dodecameric(12) 与蛋白数一致 |
链 A
802–1242(441 aa)
链 B
325–744(420 aa)
链 F
802–1242(441 aa)
链 G
325–744(420 aa)
链 J
802–1242(441 aa)
链 K
325–744(420 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.50 Å |
| 8UA4 Structure of eastern equine encephalitis virus VLP in complex with VLDLR LA1 提交 2023-09-20 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 17 PDB 声明:heptadecameric(17) 与蛋白数一致 |
链 A
802–1242(441 aa)
链 B
325–744(420 aa)
链 C
1–261(261 aa)
链 D
802–1242(441 aa)
链 E
325–744(420 aa)
链 F
1–261(261 aa)
链 G
802–1242(441 aa)
链 H
325–744(420 aa)
链 I
1–261(261 aa)
链 J
802–1242(441 aa)
链 K
325–744(420 aa)
链 L
1–261(261 aa)
|
突变:K67N 突变:K67N 突变:K67N 突变:K67N | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 12 CA CALCIUM ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.58 Å |
| 8UA9 Structure of eastern equine encephalitis virus VLP unliganded quasi-threefold spike protein 提交 2023-09-20 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 16 PDB 声明:hexadecameric(16) 与蛋白数一致 |
链 A
802–1242(441 aa)
链 B
325–742(418 aa)
片段:UNP residues 325-744
链 D
1–261(261 aa)
链 E
802–1242(441 aa)
链 F
325–742(418 aa)
片段:UNP residues 325-744
链 H
1–261(261 aa)
链 I
802–1242(441 aa)
链 J
325–742(418 aa)
片段:UNP residues 325-744
链 L
1–261(261 aa)
链 M
802–1242(441 aa)
链 N
325–742(418 aa)
片段:UNP residues 325-744
链 P
1–261(261 aa)
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 9 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.00 Å |
| 8UFA Eastern equine encephalitis virus (PE-6) VLP (asymmetric unit) 提交 2023-10-04 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 12 PDB 声明:dodecameric(12) 与蛋白数一致 |
链 A
802–1242(441 aa)
片段:UNP residues 802-1242
链 B
325–738(414 aa)
片段:UNP residues 325-738
链 D
802–1242(441 aa)
片段:UNP residues 802-1242
链 E
325–738(414 aa)
片段:UNP residues 325-738
链 G
802–1242(441 aa)
片段:UNP residues 802-1242
链 H
325–738(414 aa)
片段:UNP residues 325-738
链 J
802–1242(441 aa)
片段:UNP residues 802-1242
链 K
325–738(414 aa)
片段:UNP residues 325-738
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 8 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.86 Å |
| 8UFB Eastern equine encephalitis virus (PE-6) VLP in complex with full-length VLDLR (asymmetric unit) 提交 2023-10-04 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 20 PDB 声明:eicosameric(20) 与蛋白数一致 |
链 A
802–1242(441 aa)
片段:UNP residues 802-1242
链 B
325–738(414 aa)
片段:UNP residues 325-738
链 D
802–1242(441 aa)
片段:UNP residues 802-1242
链 E
325–738(414 aa)
片段:UNP residues 325-738
链 G
802–1242(441 aa)
片段:UNP residues 802-1242
链 H
325–738(414 aa)
片段:UNP residues 325-738
链 J
802–1242(441 aa)
片段:UNP residues 802-1242
链 K
325–738(414 aa)
片段:UNP residues 325-738
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 8 CA CALCIUM ION × 12 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.89 Å |
| 8UFC Eastern equine encephalitis virus (PE-6) VLP in complex with VLDLR LA(1-2) (asymmetric unit) 提交 2023-10-04 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 16 PDB 声明:hexadecameric(16) 与蛋白数一致 |
链 A
802–1242(441 aa)
片段:UNP residues 802-1242
链 B
325–738(414 aa)
片段:UNP residues 325-738
链 D
802–1242(441 aa)
片段:UNP residues 802-1242
链 E
325–738(414 aa)
片段:UNP residues 325-738
链 G
802–1242(441 aa)
片段:UNP residues 802-1242
链 H
325–738(414 aa)
片段:UNP residues 325-738
链 J
802–1242(441 aa)
片段:UNP residues 802-1242
链 K
325–738(414 aa)
片段:UNP residues 325-738
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 8 CA CALCIUM ION × 8 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.09 Å |