当前蛋白身份:Q8WTX7 重新检索
本组结构的主要差异维度
构建体不同 突变/修饰不同 组装状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量指标不同

差异标签只比较当前检索结果;所有PDB和assembly原始记录仍分别保留。

相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
5GS9 Crystal structure of CASTOR1-arginine 提交 2016-08-15 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 1–329(329 aa)
链 B 1–329(329 aa)
未记录 ARG ARGININE × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5;289 K;0.1M sodium citrate (pH 5.0), 20% (w/v) PEG 8000
分辨率 2.50 Å R-free 0.224
5GS9 Crystal structure of CASTOR1-arginine 提交 2016-08-15 Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 C 1–329(329 aa)
链 D 1–329(329 aa)
未记录 ARG ARGININE × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5;289 K;0.1M sodium citrate (pH 5.0), 20% (w/v) PEG 8000
分辨率 2.50 Å R-free 0.224
5GT7 Crystal Structure of Arg-bound CASTOR1 提交 2016-08-18 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 1–323(323 aa)
链 B 1–323(323 aa)
未记录 ARG ARGININE × 2 MLI MALONATE ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION;291 K;5 % (w/v) PEG3350, 0.1 M Na Malonate pH 5.0
分辨率 2.05 Å R-free 0.211
5GT7 Crystal Structure of Arg-bound CASTOR1 提交 2016-08-18 Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 C 1–323(323 aa)
链 D 1–323(323 aa)
未记录 ARG ARGININE × 2 MLI MALONATE ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION;291 K;5 % (w/v) PEG3350, 0.1 M Na Malonate pH 5.0
分辨率 2.05 Å R-free 0.211
5GT8 Crystal Structure of apo-CASTOR1 提交 2016-08-18 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 1–329(329 aa)
链 C 1–329(329 aa)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;291 K;21%(w/v) PEG3350, 0.1M Tris pH 5.0, 0.2M MgCl2, 0.2% n- dodecyl- N, N- dimethylamine-N-oxide
分辨率 2.80 Å R-free 0.265
5GT8 Crystal Structure of apo-CASTOR1 提交 2016-08-18 Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 B 1–329(329 aa)
链 D 1–329(329 aa) 片段:UNP residues A285I
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;291 K;21%(w/v) PEG3350, 0.1M Tris pH 5.0, 0.2M MgCl2, 0.2% n- dodecyl- N, N- dimethylamine-N-oxide
分辨率 2.80 Å R-free 0.265
5GV2 Crystal structure of Arginine-bound CASTOR1 from Homo sapiens 提交 2016-09-01 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 1–329(329 aa)
链 C 1–329(329 aa)
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ARG ARGININE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;287 K;PEG 3350, Magnesium acetate tetrahydrate
分辨率 2.06 Å R-free 0.238
5I2C Arginine-bound CASTOR1 from Homo sapiens 提交 2016-02-08 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 1–329(329 aa)
链 B 1–329(329 aa)
未记录 ARG ARGININE × 2 ACT ACETATE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5;291.15 K;0.1 M sodium acetate, 0.25 M ammonium acetate, 22.5% PEG 3350
分辨率 1.80 Å R-free 0.204
5I2C Arginine-bound CASTOR1 from Homo sapiens 提交 2016-02-08 Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 C 1–329(329 aa)
链 D 1–329(329 aa)
未记录 ARG ARGININE × 2 ACT ACETATE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5;291.15 K;0.1 M sodium acetate, 0.25 M ammonium acetate, 22.5% PEG 3350
分辨率 1.80 Å R-free 0.204
9DX2 Human GATOR2 complex - CASTOR1 bound state 提交 2024-10-10 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric(8) 与蛋白数一致
链 E 1–328(328 aa)
链 F 1–328(328 aa)
链 G 1–328(328 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
9KP4 Crystal structure of human CASTOR1 in apo form 提交 2024-11-22 Assembly 1 信息不足 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 1–329(329 aa)
链 B 1–329(329 aa)
未记录 NH4 AMMONIUM ION × 2 ACY ACETIC ACID × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;289 K;0.1 M Barium chloride, 30% v/v ethanol, 0.2 M NH4Ac, 0.1 M Tris pH 8.5, and 25% PEG 3350.
分辨率 3.08 Å R-free 0.264
9KP4 Crystal structure of human CASTOR1 in apo form 提交 2024-11-22 Assembly 2 信息不足 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 C 1–329(329 aa)
链 D 1–329(329 aa)
未记录 NH4 AMMONIUM ION × 2 ACY ACETIC ACID × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;289 K;0.1 M Barium chloride, 30% v/v ethanol, 0.2 M NH4Ac, 0.1 M Tris pH 8.5, and 25% PEG 3350.
分辨率 3.08 Å R-free 0.264
9LVK Cryo-EM structure of CASTOR1 bound human GATOR2 complex 提交 2025-02-12 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 18 PDB 声明:octadecameric(18) 与蛋白数一致
链 U 1–329(329 aa)
链 V 1–329(329 aa)
突变:D304A 突变:D304A ZN ZINC ION × 31 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.59 Å
9LWF Cryo-EM structure of dual sensor bound GATOR2 complex 提交 2025-02-14 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 20 PDB 声明:eicosameric(20) 与蛋白数一致
链 U 1–329(329 aa)
链 V 1–329(329 aa)
突变:D304A 突变:D304A ZN ZINC ION × 32 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.41 Å
9OTI GATOR2 complex bound to arginine sensor CASTOR1 提交 2025-05-27 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 18 PDB 声明:octadecameric(18) 与蛋白数一致
链 U 1–329(329 aa)
链 V 1–329(329 aa)
突变:D304A, S111A 突变:D304A, S111A ZN ZINC ION × 29 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å