当前蛋白身份:Q8WV22 重新检索
本组结构的主要差异维度
构建体不同 突变/修饰不同 组装状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量指标不同

差异标签只比较当前检索结果;所有PDB和assembly原始记录仍分别保留。

相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
2CT0 Solution structure of the RING domain of the Non-SMC element 1 protein 提交 2005-05-23 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 171–231(61 aa) 片段:RING domain
未记录 ZN ZINC ION × 2 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 7;296 K;离子强度(mmCIF原始值)120;压力 ambient
NMR样品组成 1.27mM RING domain U-13C,15N; 20mM d-Tris-HCl(pH7.0); 100mM NaCl; 1mM d-DTT; 0.02% NaN3; 0.05mM ZNCl2; 0.1mM NTA; 90% H2O, 10% D2O | 90% H2O/10% D2O
分辨率未提供
5HVQ Alternative model of the MAGE-G1 NSE-1 complex 提交 2016-01-28 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 C 9–246(238 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION;277 K;As for entry 3nw0
分辨率 2.92 Å R-free 0.268
5WY5 Crystal structure of MAGEG1 and NSE1 complex 提交 2017-01-11 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 9–246(238 aa) 片段:UNP RESIDUES 9-246
突变:YES MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 EVAPORATION;pH 5.5;291 K;22%(V/V) PEG 500, 0.1M SODIUM CITRATR PH5.5, 2%(V/V) 1,1,1,3,3,3-HEXAFLUORO-2-PROPANOL, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, TEMPERATURE 291K
分辨率 2.92 Å R-free 0.270
9LWI The head region of HBx-Smc5/6 ubiquitination complex 提交 2025-02-15 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 9 PDB 声明:nonameric(9) 与蛋白数一致
链 F 1–266(266 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.12 Å
9LWJ The head-arm region of HBx-Smc5/6 ubiquitination complex 提交 2025-02-15 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 10 PDB 声明:decameric(10) 与蛋白数一致
链 F 1–266(266 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 7.19 Å
9LWL HBx-Smc5/6 ubiquitination complex 提交 2025-02-15 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 10 PDB 声明:decameric(10) 与蛋白数一致
链 F 1–266(266 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 7.25 Å