当前蛋白身份:Q8WV22
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2CT0 Solution structure of the RING domain of the Non-SMC element 1 protein 提交 2005-05-23 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致 |
链 A
171–231(61 aa)
片段:RING domain
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未记录 | ZN ZINC ION × 2 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 7;296 K;离子强度(mmCIF原始值)120;压力 ambient
NMR样品组成
1.27mM RING domain U-13C,15N; 20mM d-Tris-HCl(pH7.0); 100mM NaCl; 1mM d-DTT; 0.02% NaN3; 0.05mM ZNCl2; 0.1mM NTA; 90% H2O, 10% D2O | 90% H2O/10% D2O
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分辨率未提供 |
| 5HVQ Alternative model of the MAGE-G1 NSE-1 complex 提交 2016-01-28 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 C
9–246(238 aa)
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未记录 | ZN ZINC ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;277 K;As for entry 3nw0
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分辨率 2.92 Å R-free 0.268 |
| 5WY5 Crystal structure of MAGEG1 and NSE1 complex 提交 2017-01-11 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 A
9–246(238 aa)
片段:UNP RESIDUES 9-246
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突变:YES | MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
EVAPORATION;pH 5.5;291 K;22%(V/V) PEG 500, 0.1M SODIUM CITRATR
PH5.5, 2%(V/V) 1,1,1,3,3,3-HEXAFLUORO-2-PROPANOL, VAPOR
DIFFUSION, HANGING DROP, TEMPERATURE 291K
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分辨率 2.92 Å R-free 0.270 |
| 9LWI The head region of HBx-Smc5/6 ubiquitination complex 提交 2025-02-15 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 9 PDB 声明:nonameric(9) 与蛋白数一致 |
链 F
1–266(266 aa)
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未记录 | ZN ZINC ION × 6 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 3.12 Å |
| 9LWJ The head-arm region of HBx-Smc5/6 ubiquitination complex 提交 2025-02-15 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 10 PDB 声明:decameric(10) 与蛋白数一致 |
链 F
1–266(266 aa)
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未记录 | ZN ZINC ION × 6 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 7.19 Å |
| 9LWL HBx-Smc5/6 ubiquitination complex 提交 2025-02-15 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 10 PDB 声明:decameric(10) 与蛋白数一致 |
链 F
1–266(266 aa)
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未记录 | ZN ZINC ION × 6 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 7.25 Å |