当前蛋白身份：Q90922
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 4PLM Crystal Structure of Chicken Netrin-1 (LN-LE3) 提交 2014-05-18 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
26–457（432 aa）
片段：LN-LE3 (UNP residues 26-457)
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3 CA CALCIUM ION × 1 CL CHLORIDE ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 6.5；298 K；NaoAc, NaCacodylate
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.257 |
| 4PLM Crystal Structure of Chicken Netrin-1 (LN-LE3) 提交 2014-05-18 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
26–457（432 aa）
片段：LN-LE3 (UNP residues 26-457)
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 6 CA CALCIUM ION × 2 CL CHLORIDE ION × 4 MG MAGNESIUM ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 6.5；298 K；NaoAc, NaCacodylate
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.257 |
| 4PLN Crystal Structure of Chicken Netrin-1 (LN-LE3) complexed with mouse Neogenin (FN4-5) 提交 2014-05-18 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
26–457（432 aa）
片段：LN-LE3 (UNP residues 26-457)
链 B
26–457（432 aa）
片段：LN-LE3 (UNP residues 26-457)
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未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 6 CA CALCIUM ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；0.1M Hepes pH 7.0, 12% PEG3350
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分辨率 3.20 Å R-free 0.239 |
| 4PLO Crystal Structure of chicken Netrin-1 (LN-LE3) in complex with mouse DCC (FN4-5) 提交 2014-05-18 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
26–457（432 aa）
片段：LN-LE3 (UNP residues 26-457)
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未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 6 SO4 SULFATE ION × 10 CA CALCIUM ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；0.05 M Ammonium sulfate, 0.05 M BIS-TRIS pH 6.5, 30% v/v Pentaerythritol ethoxylate
|
分辨率 2.90 Å R-free 0.288 |
| 7LER Netrin-1 filament assembly 提交 2021-01-14 | Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 48 PDB 声明：48-meric（48） 与蛋白数一致 |
链 A
26–458（433 aa）
链 B
26–458（433 aa）
链 C
26–458（433 aa）
链 D
26–458（433 aa）
链 E
26–458（433 aa）
链 F
26–458（433 aa）
链 G
26–458（433 aa）
链 H
26–458（433 aa）
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 96 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；293.15 K；40% MPD, 100 mM Tris
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分辨率 5.99 Å R-free 0.368 |
| 7LRF Netrin-1 in complex with SOS 提交 2021-02-16 | Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
26–458（433 aa）
链 B
26–458（433 aa）
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未记录 | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 4 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 2 CA CALCIUM ION × 2 NA SODIUM ION × 1 NHE 2-[N-CYCLOHEXYLAMINO]ETHANE SULFONIC ACID × 1 CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9.5；293.15 K；20% PEG 8000, 100 mM CHES
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分辨率 3.21 Å R-free 0.281 |
| 8TSM Crystal structure of chicken Netrin-1 LN LE1-2 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
26–405（380 aa）
片段：residues 26-405
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未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.2 M Sodium phosphate dibasic dihydrate, 20% w/v Polyethylene glycol 3,350
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分辨率 3.90 Å R-free 0.319 |
| 9D77 Crystal form of Netrin-1 mimics nanotubes 提交 2024-08-16 | Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
26–458（433 aa）
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未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 CA CALCIUM ION × 2 CL CHLORIDE ION × 2 MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；40% v/v 2-methyl-2,4-pentanediol; 5% w/v polyethylene glycol 8000; 100 mM 2-(N-morpholino)ethanesulfonic acid; pH 6.5
|
分辨率 3.40 Å R-free 0.335 |