当前蛋白身份：Q92793
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| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1JSP NMR Structure of CBP Bromodomain in complex with p53 peptide 提交 2001-08-17 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
1081–1197（117 aa）
片段：bromodomain
|
未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 6.5；298 K；压力 ambient
NMR测量条件
pH 6.5；298 K；压力 ambient
NMR测量条件
pH 6.5；298 K；压力 ambient
NMR测量条件
pH 6.5；298 K；压力 ambient
NMR样品组成
0.5mM CBP bromodomain U-15N; 0.5mM P53 peptide; 100mM phosphate buffer; pH 6.5 | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
0.5mM CBP bromodomain U-15N,13C; 0.5mM P53 peptide;100mM phosphate buffer; pH 6.5 | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
0.5mM CBP bromodomain U-15N,13C; 0.5mM P53 peptide;100mM phosphate buffer; pH 6.5 | 99.9%D2O
NMR样品组成
0.5mM CBP bromodomain U-15N,13C,75% 2H; 0.5mM P53 peptide;100mM phosphate buffer; pH 6.5 | 90% H2O/10% D2O
|
分辨率未提供 |
| 1LIQ Non-native Solution Structure of a fragment of the CH1 domain of CBP 提交 2002-04-18 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
376–402（27 aa）
片段：RESIDUES 1-27
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 6.5；275 K；压力 ambient
NMR样品组成
0.4mM CBP(376-402), 0.6mM TCEP, 0.6mM ZnSO4, 95% H2O, 10% D2O | 95% H2O, 10% D2O
NMR样品组成
0.4mM CBP(376-402), 0.6mM TCEP, 0.6mM ZnSO4, 100% D2O | 100% D2O
|
分辨率未提供 |
| 1WO3 Solution structure of Minimal Mutant 1 (MM1): Multiple alanine mutant of non-native CHANCE domain 提交 2004-08-12 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
376–400（25 aa）
片段：CBP
|
突变：E1A, R3S, S6A, H9K, R11A, T12A, M13A, K14A, L17A, N18A, Q24A, A25K | ZN ZINC ION × 1 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 6.9；275 K；离子强度（mmCIF原始值）0；压力 ambient
NMR样品组成
0.4mM MM1, 0.5mM TCEP, 1mM ZnSO4, 5% D2O | 95% H2O/5% D2O
NMR样品组成
0.4mM MM1, 0.5mM TCEP, 1mM ZnSO4, 100% D2O | 100% D2O
|
分辨率未提供 |
| 1WO4 Solution structure of Minimal Mutant 2 (MM2): Multiple alanine mutant of non-native CHANCE domain 提交 2004-08-12 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
376–400（25 aa）
片段：CBP
|
突变：E1A, R3S, S6A, P8S, H9K, R11A, T12A, M13A, K14A, L17A, N18A, Q24A, A25K | ZN ZINC ION × 1 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 6.9；275 K；离子强度（mmCIF原始值）0；压力 ambient
NMR样品组成
0.4mM MM2, 0.5mM TCEP, 1mM ZnSO4, 5% D2O | 95% H2O/5% D2O
NMR样品组成
0.4mM MM2, 0.5mM TCEP, 1mM ZnSO4, 100% D2O | 100% D2O
|
分辨率未提供 |
| 1WO5 Solution structure of Designed Functional Finger 2 (DFF2): Designed mutant based on non-native CHANCE domain 提交 2004-08-12 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
376–400（25 aa）
片段：CBP
|
突变：E1R, R3I, S6F, P8K, H9V, R11A, T12A, M13A, K14A, L17A, N18A, Q24A, A25K | ZN ZINC ION × 1 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 6.9；275 K；离子强度（mmCIF原始值）0；压力 ambient
NMR样品组成
0.3mM DFF2, 0.5mM TCEP, 1mM ZnSO4, 5% D2O | 95% H2O/5% D2O
|
分辨率未提供 |
| 1WO6 Solution structure of Designed Functional Finger 5 (DFF5): Designed mutant based on non-native CHANCE domain 提交 2004-08-12 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
376–400（25 aa）
片段：CBP
|
突变：E1A, R3Y, A4Y, S6I, H9K, R11A, T12A, M13A, K14A, L17A, N18A, M20T, Q24F, A25K | ZN ZINC ION × 1 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 7.2；275 K；离子强度（mmCIF原始值）0；压力 ambient
NMR样品组成
0.3mM DFF5, 0.5mM TCEP, 1mM ZnSO4, 5% D2O | 95% H2O/5% D2O
|
分辨率未提供 |
| 1WO7 Solution structure of Designed Functional Finger 7 (DFF7): Designed mutant based on non-native CHANCE domain 提交 2004-08-12 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
376–400（25 aa）
片段：CBP
|
突变：E1F, R3S, A4T, S6Y, H9K, R11A, T12A, M13A, K14A, L17A, N18A, M20I, Q24Y, A25K | ZN ZINC ION × 1 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 7；275 K；离子强度（mmCIF原始值）0；压力 ambient
NMR样品组成
0.25mM DFF7, 0.5mM TCEP, 1mM ZnSO4, 5% D2O | 95% H2O/5% D2O
|
分辨率未提供 |
| 1ZOQ IRF3-CBP complex 提交 2005-05-13 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 C
2065–2111（47 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；0.2 M ammonium acetate, 0.15 M Mg acetate, 5% (v/v) PEG 4000, 50 mM Na HEPES, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.37 Å R-free 0.226 |
| 1ZOQ IRF3-CBP complex 提交 2005-05-13 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 D
2065–2111（47 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；0.2 M ammonium acetate, 0.15 M Mg acetate, 5% (v/v) PEG 4000, 50 mM Na HEPES, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.37 Å R-free 0.226 |
| 2D82 Target Structure-Based Discovery of Small Molecules that Block Human p53 and CREB Binding Protein (CBP) Association 提交 2005-12-01 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1081–1197（117 aa）
片段：Bromodomain
|
未记录 | TTR 9-ACETYL-2,3,4,9-TETRAHYDRO-1H-CARBAZOL-1-ONE × 1 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 6.5；298 K；压力 AMBIENT
NMR样品组成
0.5MM CBP BROMODOMAIN U-15N, 13C; 3.0MM CRB Ligand; 100MM PHOSPHATE BUFFER; PH 6.5 | 100% D2O
NMR样品组成
0.5MM CBP BROMODOMAIN U-15N, 13C, 75% 2H; 3.0MM CRB Ligand; 100MM PHOSPHATE BUFFER; PH 6.5 | 90% H2O/10% D2O
|
分辨率未提供 |
| 2KJE NMR structure of CBP TAZ2 and adenoviral E1A complex 提交 2009-05-27 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1763–1854（92 aa）
片段：UNP residues 1763-1854
|
未记录 | ZN ZINC ION × 3 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 6.8；298 K；离子强度（mmCIF原始值）0；压力 ambient
NMR样品组成
1-1.5 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] TRIS-1, 1-1.5 mM [U-100% 15N] TRIS-2, 100% D2O | 100% D2O
|
分辨率未提供 |
| 2KWF The structure of E-protein activation domain 1 bound to the KIX domain of CBP/p300 elucidates leukemia induction by E2A-PBX1 提交 2010-04-08 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
587–673（87 aa）
片段：UNP residues 587-673, KIX domain
|
未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 6；298 K；离子强度（mmCIF原始值）0；压力 ambient
NMR样品组成
1 mM DSS-1, 20 mM MES-2, 1 mM beta-mercaptoethanol-3, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
|
分辨率未提供 |
| 2L84 Solution NMR structures of CBP bromodomain with small molecule j28 提交 2011-01-03 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1081–1197（117 aa）
片段：Bromo domain residues 1081-1197
|
未记录 | J28 5-[(E)-(2-amino-4-hydroxy-5-methylphenyl)diazenyl]-2,4-dimethylbenzenesulfonic acid × 1 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 6.5；298 K；压力 ambient
NMR样品组成
0.5 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] protein, 3 mM J28, 100 mM sodium phosphate, 3 mM [U-100% 2H] DTT, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
0.5 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] protein, 3 mM J28, 100 mM sodium phosphate, 3 mM [U-100% 2H] DTT, 100% D2O | 100% D2O
|
分辨率未提供 |
| 2L85 Solution NMR structures of CBP bromodomain with small molecule of HBS 提交 2011-01-04 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1081–1197（117 aa）
片段：BROMO DOMAIN residues 1081-1197
|
未记录 | L85 4-[(E)-(4-hydroxyphenyl)diazenyl]benzenesulfonic acid × 1 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 6.5；298 K；压力 ambient
NMR样品组成
0.5 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] protein, 3 mM (E)-4-((4-hydroxyphenyl)diazenyl)benzenesulfonic acid, 100 mM sodium phosphate, 3 mM [U-100% 2H] DTT, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
0.5 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] protein, 3 mM (E)-4-((4-hydroxyphenyl)diazenyl)benzenesulfonic acid, 100 mM sodium phosphate, 3 mM [U-100% 2H] DTT, 100% D2O | 100% D2O
|
分辨率未提供 |
| 2LXS Allosteric communication in the KIX domain proceeds through dynamic re-packing of the hydrophobic core 提交 2012-08-31 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
587–673（87 aa）
片段：UNP RESIDUES 587-673
|
未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 5.8；300 K；压力 ambient
NMR样品组成
1 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] entity_1-1, 2 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] entity_2-2, 25 mM sodium chloride-3, 50 mM potassium phosphate-4, 1 mM sodium azide-5, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
|
分辨率未提供 |
| 2LXT Allosteric communication in the KIX domain proceeds through dynamic re-packing of the hydrophobic core 提交 2012-08-31 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
587–673（87 aa）
片段：UNP RESIDUES 587-673
|
未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 5.8；300 K；压力 ambient
NMR样品组成
1 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] entity_1-1, 2 mM entity_2-2, 2 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] entity_3-3, 25 mM sodium chloride-4, 50 mM potassium phosphate-5, 1 mM sodium azide-6, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
|
分辨率未提供 |
| 2N1A Docked structure between SUMO1 and ZZ-domain from CBP 提交 2015-03-26 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
1699–1751（53 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 6；298 K；压力 ambient
NMR样品组成
20 mM MES, 93% H2O/7% D2O | 93% H2O/7% D2O
NMR样品组成
20 mM MES, 90% H2O, 10% D2O | 90% H2O/10% D2O
|
分辨率未提供 |
| 2RNY Complex Structures of CBP Bromodomain with H4 ack20 Peptide 提交 2008-02-03 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1081–1197（117 aa）
片段：UNP residues 1081-1197
|
未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 6.5；298 K；离子强度（mmCIF原始值）0.1；压力 ambient
NMR样品组成
0.5mM [U-100% 13C; U-100% 15N] sodium phosphate, 100% D2O | 100% D2O
|
分辨率未提供 |
| 3DWY Crystal Structure of the Bromodomain of Human CREBBP 提交 2008-07-23 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1081–1197（117 aa）
片段：Bromo domain: residues 1084-1197
|
未记录 | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；277 K；0.2M KSCN, 25% PEG3350, 5% EtGly, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
|
分辨率 1.98 Å R-free 0.219 |
| 3DWY Crystal Structure of the Bromodomain of Human CREBBP 提交 2008-07-23 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1081–1197（117 aa）
片段：Bromo domain: residues 1084-1197
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；277 K；0.2M KSCN, 25% PEG3350, 5% EtGly, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
|
分辨率 1.98 Å R-free 0.219 |
| 3P1C Crystal structure of the bromodomain of human CREBBP in complex with acetylated lysine 提交 2010-09-30 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1081–1197（117 aa）
|
未记录 | ALY N(6)-ACETYLLYSINE × 1 SCN THIOCYANATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；277 K；0.2M KSCN
25% PEG3350
5% EtGly, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
|
分辨率 1.82 Å R-free 0.218 |
| 3P1C Crystal structure of the bromodomain of human CREBBP in complex with acetylated lysine 提交 2010-09-30 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1081–1197（117 aa）
|
未记录 | ALY N(6)-ACETYLLYSINE × 1 K POTASSIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；277 K；0.2M KSCN
25% PEG3350
5% EtGly, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
|
分辨率 1.82 Å R-free 0.218 |
| 3P1D Crystal structure of the bromodomain of human CREBBP in complex with N-Methyl-2-pyrrolidone (NMP) 提交 2010-09-30 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1081–1197（117 aa）
片段：Bromo domain, UNP residues 1081-1197
|
未记录 | SCN THIOCYANATE ION × 1 MB3 1-methylpyrrolidin-2-one × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；277 K；0.2M KSCN
20% PEG3350
5% EtGly, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
|
分辨率 1.86 Å R-free 0.218 |
| 3P1D Crystal structure of the bromodomain of human CREBBP in complex with N-Methyl-2-pyrrolidone (NMP) 提交 2010-09-30 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1081–1197（117 aa）
片段：Bromo domain, UNP residues 1081-1197
|
未记录 | MB3 1-methylpyrrolidin-2-one × 1 K POTASSIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；277 K；0.2M KSCN
20% PEG3350
5% EtGly, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
|
分辨率 1.86 Å R-free 0.218 |
| 3P1E Crystal structure of the bromodomain of human CREBBP in complex with dimethyl sulfoxide (DMSO) 提交 2010-09-30 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1081–1197（117 aa）
片段：Bromo domain, UNP residues 1081-1197
|
未记录 | SCN THIOCYANATE ION × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；277 K；0.2M KSCN
25% PEG3350
5% EtGly, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.236 |
| 3P1E Crystal structure of the bromodomain of human CREBBP in complex with dimethyl sulfoxide (DMSO) 提交 2010-09-30 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1081–1197（117 aa）
片段：Bromo domain, UNP residues 1081-1197
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 K POTASSIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；277 K；0.2M KSCN
25% PEG3350
5% EtGly, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.236 |
| 3P1F Crystal structure of the bromodomain of human CREBBP in complex with a hydroquinazolin ligand 提交 2010-09-30 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1081–1197（117 aa）
片段：Bromo domain, UNP residues 1081-1197
|
未记录 | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 K POTASSIUM ION × 1 3PF 3-methyl-3,4-dihydroquinazolin-2(1H)-one × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；277 K；0.15M KSCN
20% PEG3350
10% EtGly, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
|
分辨率 1.63 Å R-free 0.218 |
| 3P1F Crystal structure of the bromodomain of human CREBBP in complex with a hydroquinazolin ligand 提交 2010-09-30 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1081–1197（117 aa）
片段：Bromo domain, UNP residues 1081-1197
|
未记录 | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 5 K POTASSIUM ION × 1 3PF 3-methyl-3,4-dihydroquinazolin-2(1H)-one × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；277 K；0.15M KSCN
20% PEG3350
10% EtGly, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
|
分辨率 1.63 Å R-free 0.218 |
| 3SVH Crystal Structure of the bromdomain of human CREBBP in complex with a 3,5-dimethylisoxazol ligand 提交 2011-07-12 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1081–1197（117 aa）
|
未记录 | KRG 3-(3,5-dimethyl-1,2-oxazol-4-yl)-5-ethoxybenzoic acid × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；277 K；0.25M KSCN, 10% PEG 3350, 5% EtGly, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.224 |
| 3SVH Crystal Structure of the bromdomain of human CREBBP in complex with a 3,5-dimethylisoxazol ligand 提交 2011-07-12 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1081–1197（117 aa）
|
未记录 | KRG 3-(3,5-dimethyl-1,2-oxazol-4-yl)-5-ethoxybenzoic acid × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；277 K；0.25M KSCN, 10% PEG 3350, 5% EtGly, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.224 |
| 4A9K BROMODOMAIN OF HUMAN CREBBP WITH N-(4-hydroxyphenyl)acetamide 提交 2011-11-26 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1081–1197（117 aa）
片段：BROMODOMAIN, RESIDUES 1081-1197
|
未记录 | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 TYL N-(4-HYDROXYPHENYL)ACETAMIDE (TYLENOL) × 1 SCN THIOCYANATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
277 K；150 MM KSCN, 20% PEG 3350, 4 DEGREES CELSIUS.
|
分辨率 1.81 Å R-free 0.197 |
| 4A9K BROMODOMAIN OF HUMAN CREBBP WITH N-(4-hydroxyphenyl)acetamide 提交 2011-11-26 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1081–1197（117 aa）
片段：BROMODOMAIN, RESIDUES 1081-1197
|
未记录 | TYL N-(4-HYDROXYPHENYL)ACETAMIDE (TYLENOL) × 1 K POTASSIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
277 K；150 MM KSCN, 20% PEG 3350, 4 DEGREES CELSIUS.
|
分辨率 1.81 Å R-free 0.197 |
| 4N3W Crystal Structure of the Bromodomain-PHD Finger Module of Human Transcriptional Co-Activator CBP in complex with Acetylated Histone 4 Peptide (H4K20ac). 提交 2013-10-07 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1080–1316（237 aa）
片段：Bromodomain-PHD Finger Module, residues 1080-1316
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；25% PEG 3,350, 0.2 M magnesium chloride, and 0.1 M HEPES, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.286 |
| 4N4F Crystal Structure of the Bromodomain-PHD Finger Module of Human Transcriptional Co-Activator CBP in complex with di-Acetylated Histone 4 Peptide (H412acK16ac). 提交 2013-10-08 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1080–1316（237 aa）
片段：Bromodomain residues 1080-1316
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293 K；20% PEG MME 2,000, 0.2 M trimethylamine N-oxide, and 0.1 M Tris, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
|
分辨率 1.83 Å R-free 0.241 |
| 4NR4 Crystal structure of the bromodomain of human CREBBP in complex with an isoxazolyl-benzimidazole ligand 提交 2013-11-26 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1081–1197（117 aa）
片段：UNP residues 1081-1197
|
未记录 | 2LK 1-(4-chlorobenzyl)-5-(3,5-dimethyl-1,2-oxazol-4-yl)-1H-benzimidazole × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；277 K；0.1M MgCl, 0.1M Tris pH 8.0, 20% PEG 6K, 10% EtGly, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
|
分辨率 1.69 Å R-free 0.192 |
| 4NR4 Crystal structure of the bromodomain of human CREBBP in complex with an isoxazolyl-benzimidazole ligand 提交 2013-11-26 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1081–1197（117 aa）
片段：UNP residues 1081-1197
|
未记录 | 2LK 1-(4-chlorobenzyl)-5-(3,5-dimethyl-1,2-oxazol-4-yl)-1H-benzimidazole × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；277 K；0.1M MgCl, 0.1M Tris pH 8.0, 20% PEG 6K, 10% EtGly, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
|
分辨率 1.69 Å R-free 0.192 |
| 4NR5 Crystal structure of the bromodomain of human CREBBP in complex with an isoxazolyl-benzimidazole ligand 提交 2013-11-26 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1081–1197（117 aa）
片段：UNP residues 1081-1197
|
未记录 | 2LL 5-(3,5-dimethyl-1,2-oxazol-4-yl)-1-[2-(morpholin-4-yl)ethyl]-2-(2-phenylethyl)-1H-benzimidazole × 1 NO3 NITRATE ION × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；277 K；0.20M NaNO3, 20.0% PEG 3350, 10.0% EtGly, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
|
分辨率 1.66 Å R-free 0.226 |
| 4NR6 Crystal structure of the bromodomain of human CREBBP in complex with an oxazepin ligand 提交 2013-11-26 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1081–1197（117 aa）
片段：UNP residues 1081-1197
|
未记录 | 2LN 1-[7-(3,4-dimethoxyphenyl)-9-{[(3R)-1-methylpiperidin-3-yl]methoxy}-2,3-dihydro-1,4-benzoxazepin-4(5H)-yl]propan-1-one × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；277 K；0.10M MgCl2, 0.1M MES pH 6.0, 20.0% PEG 6K, 10.0% EtGly, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
|
分辨率 1.66 Å R-free 0.231 |
| 4NR7 Crystal structure of the bromodomain of human CREBBP in complex with an isoxazolyl-benzimidazole ligand 提交 2013-11-26 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1081–1197（117 aa）
片段：UNP residues 1081-1197
|
未记录 | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 2LO 2-[2-(3-chloro-4-methoxyphenyl)ethyl]-5-(3,5-dimethyl-1,2-oxazol-4-yl)-1-[(2S)-2-(morpholin-4-yl)propyl]-1H-benzimidazole × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；277 K；0.20M NH4Cl, 0.1M MES pH 6.0, 20.0% PEG 6K, 10.0% EtGly, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
|
分辨率 1.20 Å R-free 0.144 |
| 4NYV Crystal Structure of the Bromodomain of human CREBBP in complex with a quinazolin-one ligand 提交 2013-12-11 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1081–1197（117 aa）
片段：UNP residues 1081-1197
|
未记录 | 15E 6-bromo-3-methyl-3,4-dihydroquinazolin-2(1H)-one × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；277 K；0.15M KSCN, 25% PEG_3350, 5% ethylene glycol, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
|
分辨率 1.83 Å R-free 0.251 |
| 4NYV Crystal Structure of the Bromodomain of human CREBBP in complex with a quinazolin-one ligand 提交 2013-12-11 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1081–1197（117 aa）
片段：UNP residues 1081-1197
|
未记录 | 15E 6-bromo-3-methyl-3,4-dihydroquinazolin-2(1H)-one × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；277 K；0.15M KSCN, 25% PEG_3350, 5% ethylene glycol, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
|
分辨率 1.83 Å R-free 0.251 |
| 4NYV Crystal Structure of the Bromodomain of human CREBBP in complex with a quinazolin-one ligand 提交 2013-12-11 | Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 C
1081–1197（117 aa）
片段：UNP residues 1081-1197
|
未记录 | 15E 6-bromo-3-methyl-3,4-dihydroquinazolin-2(1H)-one × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；277 K；0.15M KSCN, 25% PEG_3350, 5% ethylene glycol, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
|
分辨率 1.83 Å R-free 0.251 |
| 4NYV Crystal Structure of the Bromodomain of human CREBBP in complex with a quinazolin-one ligand 提交 2013-12-11 | Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 D
1081–1197（117 aa）
片段：UNP residues 1081-1197
|
未记录 | 15E 6-bromo-3-methyl-3,4-dihydroquinazolin-2(1H)-one × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；277 K；0.15M KSCN, 25% PEG_3350, 5% ethylene glycol, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
|
分辨率 1.83 Å R-free 0.251 |
| 4NYW Crystal Structure of the Bromodomain of human CREBBP in complex with a dihydroquinoxalinone ligand 提交 2013-12-11 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1081–1197（117 aa）
片段：UNP residues 1081-1197
|
未记录 | SCN THIOCYANATE ION × 1 2O3 (3R)-N-[3-(3,4-dihydroquinolin-1(2H)-yl)propyl]-3-methyl-2-oxo-1,2,3,4-tetrahydroquinoxaline-5-carboxamide × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；277 K；20% PEG 3350, 9% Ethylene Glycol, 0.18M KSCN, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
|
分辨率 1.43 Å R-free 0.187 |
| 4NYX Crystal Structure of the Bromodomain of human CREBBP in complex with a dihydroquinoxalinone ligand 提交 2013-12-11 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1081–1197（117 aa）
片段：UNP residues 1081-1197
|
未记录 | 2O4 (3R)-N-[3-(7-methoxy-3,4-dihydroquinolin-1(2H)-yl)propyl]-3-methyl-2-oxo-1,2,3,4-tetrahydroquinoxaline-5-carboxamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；277 K；0.05M CaCl2, 0.1M TRIS, 20.0% PEG 6K, 10.0% EtGly, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
|
分辨率 1.10 Å R-free 0.135 |
| 4OUF Crystal Structure of CBP bromodomain 提交 2014-02-17 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1082–1197（116 aa）
片段：Bromo domain: residues 1082-1197
|
未记录 | PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；277 K；0.1 M HEPES-Na pH 7.0, 0.2M KSCN, 25% PEG3350 and 5% Ethylene Glycol, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 1.40 Å R-free 0.191 |
| 4OUF Crystal Structure of CBP bromodomain 提交 2014-02-17 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1082–1197（116 aa）
片段：Bromo domain: residues 1082-1197
|
未记录 | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；277 K；0.1 M HEPES-Na pH 7.0, 0.2M KSCN, 25% PEG3350 and 5% Ethylene Glycol, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 1.40 Å R-free 0.191 |
| 4TQN Crystal structure of the bromodomain of human CREBBP in complex with UL04 提交 2014-06-11 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：Monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1081–1197（117 aa）
片段：Kinase domain, Residues 1081-1197
|
未记录 | UL4 3-[(5-acetyl-2-ethoxyphenyl)carbamoyl]benzoic acid × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；0.1M MES pH 6.5, 0.1M MgCl2, 20% PEG 6000, 10% EtGly
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.199 |
| 4TS8 Crystal structure of the bromodomain of human CREBBP in complex with XZ08 提交 2014-06-18 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：Monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1081–1197（117 aa）
片段：Kinase domain, residues 1081-1197
|
未记录 | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 XZ8 4-(1-acetyl-1H-indol-3-yl)-5-methyl-1,2-dihydro-3H-pyrazol-3-one × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；0.1M MES pH 6.5, 0.1M MgCl2, 20% PEG 3350 10% EtGly
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.254 |
| 4WHU BROMO domain of CREB binding protein 提交 2014-09-23 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1081–1197（117 aa）
片段：UNP residues 1081-1197
|
未记录 | 3OT 2-methoxy-4-{1-[2-(morpholin-4-yl)ethyl]-2-(2-phenylethyl)-1H-benzimidazol-5-yl}cyclohepta-2,4,6-trien-1-one × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；obtained through screen with Hampton Research kits (HT and Index)
|
分辨率 2.11 Å R-free 0.261 |
| 4YK0 Crystal structure of the CBP bromodomain in complex with CPI098 提交 2015-03-03 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1045–1158（114 aa）
片段：bromodomain
|
未记录 | 986 (4R)-4-methyl-1,3,4,5-tetrahydro-2H-1,5-benzodiazepin-2-one × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；277 K；0.1M Bis-Tris, pH 6.5
27% PEG3350
0.1M magnesium chloride
|
分辨率 1.65 Å R-free 0.269 |
| 4YK0 Crystal structure of the CBP bromodomain in complex with CPI098 提交 2015-03-03 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1045–1158（114 aa）
片段：bromodomain
|
未记录 | 986 (4R)-4-methyl-1,3,4,5-tetrahydro-2H-1,5-benzodiazepin-2-one × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；277 K；0.1M Bis-Tris, pH 6.5
27% PEG3350
0.1M magnesium chloride
|
分辨率 1.65 Å R-free 0.269 |
| 4YK0 Crystal structure of the CBP bromodomain in complex with CPI098 提交 2015-03-03 | Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 C
1045–1158（114 aa）
片段：bromodomain
|
未记录 | 986 (4R)-4-methyl-1,3,4,5-tetrahydro-2H-1,5-benzodiazepin-2-one × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；277 K；0.1M Bis-Tris, pH 6.5
27% PEG3350
0.1M magnesium chloride
|
分辨率 1.65 Å R-free 0.269 |
| 4YK0 Crystal structure of the CBP bromodomain in complex with CPI098 提交 2015-03-03 | Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 D
1045–1158（114 aa）
片段：bromodomain
|
未记录 | 986 (4R)-4-methyl-1,3,4,5-tetrahydro-2H-1,5-benzodiazepin-2-one × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；277 K；0.1M Bis-Tris, pH 6.5
27% PEG3350
0.1M magnesium chloride
|
分辨率 1.65 Å R-free 0.269 |
| 5CGP Selective pharmacological inhibition of the CREB binding protein bromodomain regulates inflammatory cytokines in macrophages and RGS4 in neurons 提交 2015-07-09 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1081–1197（117 aa）
片段：UNP residues 1081-1197
|
未记录 | 53W 5-(3,5-dimethyl-1,2-oxazol-4-yl)-2-[2-(4-methoxyphenyl)ethyl]-1-[2-(morpholin-4-yl)ethyl]-1H-benzimidazole × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；15-20% PEG 8000, 0.2M CaAcetate, 0.1 M cacodylate ph 6-7
|
分辨率 1.96 Å R-free 0.249 |
| 5DBM Crystal structure of the CBP bromodomain in complex with CPI703 提交 2015-08-21 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1082–1197（116 aa）
片段：bromodomain (UNP residues 1082-1197)
|
未记录 | 58N (4R)-6-(1-tert-butyl-1H-pyrazol-4-yl)-4-methyl-1,3,4,5-tetrahydro-2H-1,5-benzodiazepin-2-one × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9；277 K；0.1 M BICINE:NaOH pH 9.0, 20% (w/v) PEG 6000 (CPI703)
|
分辨率 1.86 Å R-free 0.220 |
| 5DBM Crystal structure of the CBP bromodomain in complex with CPI703 提交 2015-08-21 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1082–1197（116 aa）
片段：bromodomain (UNP residues 1082-1197)
|
未记录 | 58N (4R)-6-(1-tert-butyl-1H-pyrazol-4-yl)-4-methyl-1,3,4,5-tetrahydro-2H-1,5-benzodiazepin-2-one × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9；277 K；0.1 M BICINE:NaOH pH 9.0, 20% (w/v) PEG 6000 (CPI703)
|
分辨率 1.86 Å R-free 0.220 |
| 5DBM Crystal structure of the CBP bromodomain in complex with CPI703 提交 2015-08-21 | Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 C
1082–1197（116 aa）
片段：bromodomain (UNP residues 1082-1197)
|
未记录 | 58N (4R)-6-(1-tert-butyl-1H-pyrazol-4-yl)-4-methyl-1,3,4,5-tetrahydro-2H-1,5-benzodiazepin-2-one × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9；277 K；0.1 M BICINE:NaOH pH 9.0, 20% (w/v) PEG 6000 (CPI703)
|
分辨率 1.86 Å R-free 0.220 |
| 5EIC Crystal structure of the bromodomain of human CREBBP in complex with AYC 提交 2015-10-29 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1081–1197（117 aa）
|
未记录 | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；277 K；0.2M KSCN, 20% PEG3350, 10% EtGly, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
|
分辨率 1.50 Å R-free 0.209 |
| 5EIC Crystal structure of the bromodomain of human CREBBP in complex with AYC 提交 2015-10-29 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1081–1197（117 aa）
|
未记录 | 5J5 2-[(chloroacetyl)amino]-5-[(E)-(4-sulfophenyl)diazenyl]benzenesulfonic acid × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；277 K；0.2M KSCN, 20% PEG3350, 10% EtGly, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
|
分辨率 1.50 Å R-free 0.209 |
| 5ENG Crystal structure of the bromodomain of human CREBBP in complex with UP39 提交 2015-11-09 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1081–1197（117 aa）
|
未记录 | 5QN methyl 2-[2-(3,5-dihydro-2~{H}-pyrazin-4-yl)ethoxy]-5-[(5-ethanoyl-2-ethoxy-phenyl)carbamoyl]benzoate × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；277 K；0.2M KSCN, 20% PEG3350, 10% EtGly, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
|
分辨率 1.30 Å R-free 0.172 |
| 5EP7 Crystal structure of the bromodomain of human CREBBP in complex with UN32 提交 2015-11-11 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1081–1197（117 aa）
片段：UNP residues 1081-1197
|
未记录 | 5QR 3-[(1-methyl-6-oxidanylidene-pyridin-3-yl)carbonylamino]benzoic acid × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；277 K；0.2M KSCN, 20% PEG3350, 10% EtGly, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
|
分辨率 1.20 Å R-free 0.176 |
| 5GH9 Crystal structure of CBP Bromodomain with H3K56ac peptide 提交 2016-06-19 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1081–1196（116 aa）
片段：UNP residues 1081-1196
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.05 M Cadmium sulfate hydrate, 0.1 M HEPES, 1.0 M Sodium acetate trihydrate,
|
分辨率 1.45 Å R-free 0.176 |
| 5H85 Crystal structure of the bromodomain of human CREBBP in complex with UO37D 提交 2015-12-23 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1081–1197（117 aa）
片段：UNP residues 1081-1197
|
未记录 | 5XS methyl 3-(7~{H}-purin-6-ylcarbamoyl)benzoate × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；277 K；0.15M KSCN, 20% PEG 3350, 10% EtGly
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.199 |
| 5I83 Crystal structure of the bromodomain of human CREBBP bound to the benzodiazepinone G02773986 提交 2016-02-18 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1082–1197（116 aa）
片段：bromodomain (UNP residues 1082-1197)
|
未记录 | SCN THIOCYANATE ION × 1 68Y (4R)-4-methyl-7-[(1R)-1-phenylethoxy]-1,3,4,5-tetrahydro-2H-1,5-benzodiazepin-2-one × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277.15 K；0.2 M potassium thiocyanate, 0.1 M Bis-Tris, pH 5.5, 5% v/v ethylene glycol, 23% PEG3350
|
分辨率 1.35 Å R-free 0.188 |
| 5I86 Crystal structure of the bromodomain of human CREBBP bound to the benzodiazepinone G02778174 提交 2016-02-18 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1082–1197（116 aa）
片段：bromodomain (UNP residues 1082-1197)
|
未记录 | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 SCN THIOCYANATE ION × 1 69A (4R)-N-benzyl-4-methyl-2-oxo-2,3,4,5-tetrahydro-1H-1,5-benzodiazepine-6-carboxamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277.15 K；0.2 M potassium thiocyanate, 0.1 M Bis-Tris, pH 5.5, 5% v/v ethylene glycol, 23% PEG3350
|
分辨率 1.05 Å R-free 0.161 |
| 5I86 Crystal structure of the bromodomain of human CREBBP bound to the benzodiazepinone G02778174 提交 2016-02-18 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1082–1197（116 aa）
片段：bromodomain (UNP residues 1082-1197)
|
未记录 | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 69A (4R)-N-benzyl-4-methyl-2-oxo-2,3,4,5-tetrahydro-1H-1,5-benzodiazepine-6-carboxamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277.15 K；0.2 M potassium thiocyanate, 0.1 M Bis-Tris, pH 5.5, 5% v/v ethylene glycol, 23% PEG3350
|
分辨率 1.05 Å R-free 0.161 |
| 5I89 Crystal structure of the bromodomain of human CREBBP bound to the benzodiazepinone G02857790 提交 2016-02-18 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1082–1197（116 aa）
片段：bromodomain (UNP residues 1082-1197)
|
未记录 | ACT ACETATE ION × 1 CA CALCIUM ION × 1 69B (4R)-6-(3-cyclopropyl-1-methyl-1H-indazol-5-yl)-4-methyl-1,3,4,5-tetrahydro-2H-1,5-benzodiazepin-2-one × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277.15 K；0.2 M calcium acetate hydrate, and 20% w/v PEG3350
|
分辨率 1.07 Å R-free 0.137 |
| 5I8B CBP in complex with Cpd23 ((R)-6-(3-(benzyloxy)phenyl)-4-methyl-1,3,4,5-tetrahydro-2H-benzo[b][1,4]diazepin-2-one) 提交 2016-02-18 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1081–1312（232 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 3 69F (4R)-6-[3-(benzyloxy)phenyl]-4-methyl-1,3,4,5-tetrahydro-2H-1,5-benzodiazepin-2-one × 1 B3P 2-[3-(2-HYDROXY-1,1-DIHYDROXYMETHYL-ETHYLAMINO)-PROPYLAMINO]-2-HYDROXYMETHYL-PROPANE-1,3-DIOL × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 5 NA SODIUM ION × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；0.1 M Bis-Tris pH 8,
0.2 M sodium thiocyanate
19-23% PEG 3350
|
分辨率 1.52 Å R-free 0.200 |
| 5I8G CBP in complex with Cpd637 ((R)-4-methyl-6-(1-methyl-3-(1-methyl-1H-pyrazol-4-yl)-1H-indazol-5-yl)-1,3,4,5-tetrahydro-2H-benzo[b][1,4]diazepin-2-one) 提交 2016-02-18 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1081–1312（232 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 3 69E (4R)-4-methyl-6-[1-methyl-3-(1-methyl-1H-pyrazol-4-yl)-1H-indazol-5-yl]-1,3,4,5-tetrahydro-2H-1,5-benzodiazepin-2-one × 1 B3P 2-[3-(2-HYDROXY-1,1-DIHYDROXYMETHYL-ETHYLAMINO)-PROPYLAMINO]-2-HYDROXYMETHYL-PROPANE-1,3-DIOL × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 5 NA SODIUM ION × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；277 K；containing 0.1 M Bis-Tris pH 8,
0.2 M sodium thiocyanate
19-23% PEG 3350
|
分辨率 1.41 Å R-free 0.210 |
| 5J0D Crystal structure of the bromodomain of human CREBBP in complex with a benzoxazepine compound 提交 2016-03-28 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1081–1197（117 aa）
片段：UNP residues 1081-1197
|
未记录 | 6F9 7-(3,5-dimethoxyphenyl)-N-[(3S)-1-methylpiperidin-3-yl]-4-propanoyl-2,3,4,5-tetrahydro-1,4-benzoxazepine-9-carboxamide × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 7.5；277 K；25% PEG3350, 0.2 M MgCl2, 0.1M BisTris pH 7.5
|
分辨率 1.05 Å R-free 0.197 |
| 5JEM Complex of IRF-3 with CBP 提交 2016-04-18 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 C
2065–2111（47 aa）
片段：UNP residues 2065-2111
链 D
2065–2111（47 aa）
片段：UNP residues 2065-2111
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；0.1 M HEPES pH 7.5, 25% PEG 3350
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.242 |
| 5JEM Complex of IRF-3 with CBP 提交 2016-04-18 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 F
2065–2111（47 aa）
片段：UNP residues 2065-2111
链 H
2065–2111（47 aa）
片段：UNP residues 2065-2111
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；0.1 M HEPES pH 7.5, 25% PEG 3350
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.242 |
| 5KTU Crystal structure of the bromodomain of human CREBBP bound to pyrazolopiperidine scaffold 提交 2016-07-12 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1082–1197（116 aa）
片段：bromodomain (UNP residues 1082-1197)
|
未记录 | 6XB 1-(3-phenylazanyl-1,4,6,7-tetrahydropyrazolo[4,3-c]pyridin-5-yl)ethanone × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；0.2 M magnesium chloride, 0.1 M Bis-Tris pH 6.5, and 25% polyethylene glycol (PEG) 3350
|
分辨率 1.38 Å R-free 0.212 |
| 5KTU Crystal structure of the bromodomain of human CREBBP bound to pyrazolopiperidine scaffold 提交 2016-07-12 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1082–1197（116 aa）
片段：bromodomain (UNP residues 1082-1197)
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；0.2 M magnesium chloride, 0.1 M Bis-Tris pH 6.5, and 25% polyethylene glycol (PEG) 3350
|
分辨率 1.38 Å R-free 0.212 |
| 5KTW CREBBP bromodomain in complex with Cpd 44 (3-((5-acetyl-1-(cyclopropylmethyl)-4,5,6,7-tetrahydro-1H-pyrazolo[4,3-c]pyridin-3-yl)amino)-N-isopropylbenzamide) 提交 2016-07-12 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1085–1196（112 aa）
片段：bromodomain (UNP residues 1085-1196)
|
未记录 | 6XG 3-[[1-(cyclopropylmethyl)-5-ethanoyl-6,7-dihydro-4~{H}-pyrazolo[4,3-c]pyridin-3-yl]amino]-~{N}-propan-2-yl-benzamide × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；277 K；0.2 M potassium thiocyanate,
0.1 M Bis-Tris pH 5.5,
5% v/v ethylene glycol,
23% PEG 3350
|
分辨率 1.09 Å R-free 0.176 |
| 5KTW CREBBP bromodomain in complex with Cpd 44 (3-((5-acetyl-1-(cyclopropylmethyl)-4,5,6,7-tetrahydro-1H-pyrazolo[4,3-c]pyridin-3-yl)amino)-N-isopropylbenzamide) 提交 2016-07-12 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1085–1196（112 aa）
片段：bromodomain (UNP residues 1085-1196)
|
未记录 | 6XG 3-[[1-(cyclopropylmethyl)-5-ethanoyl-6,7-dihydro-4~{H}-pyrazolo[4,3-c]pyridin-3-yl]amino]-~{N}-propan-2-yl-benzamide × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；277 K；0.2 M potassium thiocyanate,
0.1 M Bis-Tris pH 5.5,
5% v/v ethylene glycol,
23% PEG 3350
|
分辨率 1.09 Å R-free 0.176 |
| 5KTW CREBBP bromodomain in complex with Cpd 44 (3-((5-acetyl-1-(cyclopropylmethyl)-4,5,6,7-tetrahydro-1H-pyrazolo[4,3-c]pyridin-3-yl)amino)-N-isopropylbenzamide) 提交 2016-07-12 | Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 C
1085–1196（112 aa）
片段：bromodomain (UNP residues 1085-1196)
|
未记录 | 6XG 3-[[1-(cyclopropylmethyl)-5-ethanoyl-6,7-dihydro-4~{H}-pyrazolo[4,3-c]pyridin-3-yl]amino]-~{N}-propan-2-yl-benzamide × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；277 K；0.2 M potassium thiocyanate,
0.1 M Bis-Tris pH 5.5,
5% v/v ethylene glycol,
23% PEG 3350
|
分辨率 1.09 Å R-free 0.176 |
| 5KTX CREBBP bromodomain in complex with Cpd59 ((S)-1-(3-((2-fluoro-4-(1-methyl-1H-pyrazol-4-yl)phenyl)amino)-1-(tetrahydrofuran-3-yl)-6,7-dihydro-1H-pyrazolo[4,3-c]pyridin-5(4H)-yl)ethanone) 提交 2016-07-12 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1085–1196（112 aa）
片段：bromodomain (UNP residues 1085-1196)
|
未记录 | 6XH 1-[3-[[2-fluoranyl-4-(1-methylpyrazol-4-yl)phenyl]amino]-1-[(3~{S})-oxolan-3-yl]-6,7-dihydro-4~{H}-pyrazolo[4,3-c]pyridin-5-yl]ethanone × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；287 K；0.2 M potassium thiocyanate,
0.1 M Bis-Tris pH 5.5,
5% v/v ethylene glycol,
23% PEG 3350
|
分辨率 1.27 Å R-free 0.172 |
| 5LPJ Crystal structure of the bromodomain of human CREBBP bound to the inhibitor XDM1 提交 2016-08-13 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1081–1197（117 aa）
片段：bromodomain, UNP residues 1081-1197
|
未记录 | XDM ~{N}-[(3-chlorophenyl)methyl]-4-ethanoyl-3-ethyl-5-methyl-1~{H}-pyrrole-2-carboxamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
EVAPORATION；pH 6.5；277 K；LiSO4, PEG 3350
|
分辨率 1.65 Å R-free 0.196 |
| 5LPL Crystal structure of the bromodomain of human CREBBP bound to the inhibitor XDM3c 提交 2016-08-13 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1081–1197（117 aa）
片段：bromodomain, UNP residues 1081-1197
|
未记录 | 71X ~{N}-[(1~{R},2~{R})-7-chloranyl-2-oxidanyl-1,2,3,4-tetrahydronaphthalen-1-yl]-4-ethanoyl-3-ethyl-5-methyl-1~{H}-pyrrole-2-carboxamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
EVAPORATION；pH 7.5；277 K；NaCl, PEG 3350
|
分辨率 1.65 Å R-free 0.210 |
| 5MME Crystal structure of CREBBP bromodomain complexd with US46C 提交 2016-12-09 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1081–1197（117 aa）
|
未记录 | 8Q6 dimethyl 5-[(5-ethanoyl-2-ethoxy-phenyl)amino]benzene-1,3-dicarboxylate × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；0.1 M Cacodylate, pH6.5, 0.2 M Calcium acetate, 18% PEG8000
|
分辨率 1.35 Å R-free 0.176 |
| 5MME Crystal structure of CREBBP bromodomain complexd with US46C 提交 2016-12-09 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1081–1197（117 aa）
|
未记录 | 8Q6 dimethyl 5-[(5-ethanoyl-2-ethoxy-phenyl)amino]benzene-1,3-dicarboxylate × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；0.1 M Cacodylate, pH6.5, 0.2 M Calcium acetate, 18% PEG8000
|
分辨率 1.35 Å R-free 0.176 |
| 5MMG Crystal structure of CREBBP bromodomain complexed with UT07C 提交 2016-12-09 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1081–1197（117 aa）
片段：bromodomain, UNP residues 1081-1197
|
未记录 | UT0 1-[4-ethoxy-3-[(1-methylsulfonylindol-6-yl)amino]phenyl]ethanone × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；0.15 M KSCN, 10% Ethylene Glycol, 20% PEG3350
|
分辨率 1.23 Å R-free 0.163 |
| 5MPK Crystal structure of CREBBP bromodomain complexed with DK19 提交 2016-12-16 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1081–1197（117 aa）
|
未记录 | 0BC ~{N}-(5-ethanoyl-2-ethoxy-phenyl)-3-(2~{H}-1,2,3,4-tetrazol-5-yl)-5-(1,3-thiazol-4-yl)benzamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；277 K；0.1 M HEPES-Na, pH7.5, 0.2 M MgCl2, 25% P3350
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.239 |
| 5MPK Crystal structure of CREBBP bromodomain complexed with DK19 提交 2016-12-16 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1081–1197（117 aa）
|
未记录 | 0BC ~{N}-(5-ethanoyl-2-ethoxy-phenyl)-3-(2~{H}-1,2,3,4-tetrazol-5-yl)-5-(1,3-thiazol-4-yl)benzamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；277 K；0.1 M HEPES-Na, pH7.5, 0.2 M MgCl2, 25% P3350
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.239 |
| 5MPN Crystal structure of CREBBP bromodomain complexed with FA26 提交 2016-12-16 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1081–1197（117 aa）
片段：bromodomain, UNP residues 1081-1197
|
未记录 | YE5 1-[4-ethoxy-3-[3-(2~{H}-1,2,3,4-tetrazol-5-yl)phenyl]phenyl]ethanone × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；0.2 M MgCl2, 0.1 M Bis-Tris, pH6.5, 5% EG, 23% PEG3350
|
分辨率 1.23 Å R-free 0.167 |
| 5MPZ Crystal structure of CREBBP bromodomain complexed with CBP007 提交 2016-12-19 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1081–1197（117 aa）
片段：bromodomain, UNP residues 1081-1197
|
未记录 | 4I8 methyl 2-oxidanylidene-3~{H}-1,3-benzoxazole-6-carboxylate × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；0.2 M MgCl2, 0.1 M Bis-Tris, pH 6.5, 5% v/v ethylene glycol, 23% PEG3350
|
分辨率 1.40 Å R-free 0.176 |
| 5MQE Crystal structure of CREBBP bromodomain complexed with CBP006 提交 2016-12-20 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1081–1197（117 aa）
片段：bromodomain, UNP residues 1081-1197
|
未记录 | PKU 4-bromanyl-~{N}-methyl-1~{H}-pyrrole-2-carboxamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；0.2 M potassium thiocyanate, 0.1 M Bis-Tris, pH 5.5, 5% v/v ethylene glycol, 23% PEG3350
|
分辨率 1.65 Å R-free 0.225 |
| 5MQE Crystal structure of CREBBP bromodomain complexed with CBP006 提交 2016-12-20 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1081–1197（117 aa）
片段：bromodomain, UNP residues 1081-1197
|
未记录 | PKU 4-bromanyl-~{N}-methyl-1~{H}-pyrrole-2-carboxamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；0.2 M potassium thiocyanate, 0.1 M Bis-Tris, pH 5.5, 5% v/v ethylene glycol, 23% PEG3350
|
分辨率 1.65 Å R-free 0.225 |
| 5MQG Crystal structure of CREBBP bromodomain complexed with CBP015 提交 2016-12-20 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1081–1197（117 aa）
|
未记录 | F31 1-(4-azanyl-3-methoxy-phenyl)ethanone × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；0.2 M potassium thiocyanate, 0.1 M Bis-Tris, pH 5.5, 5% v/v ethylene glycol, 23% PEG3350
|
分辨率 1.35 Å R-free 0.191 |
| 5MQG Crystal structure of CREBBP bromodomain complexed with CBP015 提交 2016-12-20 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1081–1197（117 aa）
|
未记录 | F31 1-(4-azanyl-3-methoxy-phenyl)ethanone × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；0.2 M potassium thiocyanate, 0.1 M Bis-Tris, pH 5.5, 5% v/v ethylene glycol, 23% PEG3350
|
分辨率 1.35 Å R-free 0.191 |
| 5MQK Crystal structure of CREBBP bromodomain complexed with CBP019 提交 2016-12-20 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1081–1197（117 aa）
片段：bromodomain, UNP residues 1081-1197
|
未记录 | QPR 1-(1-methylindol-3-yl)ethanone × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；0.15 M KSCN, 20% PEG3350, 10% EG
|
分辨率 1.53 Å R-free 0.210 |
| 5MQK Crystal structure of CREBBP bromodomain complexed with CBP019 提交 2016-12-20 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1081–1197（117 aa）
片段：bromodomain, UNP residues 1081-1197
|
未记录 | QPR 1-(1-methylindol-3-yl)ethanone × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；0.15 M KSCN, 20% PEG3350, 10% EG
|
分辨率 1.53 Å R-free 0.210 |
| 5NLK Crystal structure of CREBBP bromodomain complexd with US13A 提交 2017-04-04 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1081–1197（117 aa）
|
未记录 | 92E ~{N}-[3-acetamido-5-[(5-ethanoyl-2-ethoxy-phenyl)carbamoyl]phenyl]furan-2-carboxamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；0.1 M Buffer System 3, pH8.5, 37.50% v/v MPD_P1K_P3350, 0.09 M NPS
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.216 |
| 5NRW Crystal structure of the human bromodomain of CREBBP bound to the inhibitor XDM4 提交 2017-04-25 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1081–1197（117 aa）
片段：bromodomain, UNP residues 1081-1197
|
未记录 | 96N 4-ethanoyl-3-ethyl-5-methyl-~{N}-(naphthalen-1-ylmethyl)-1~{H}-pyrrole-2-carboxamide × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
EVAPORATION；pH 6.5；277 K；LiSO4, PEG 3350, ethylene glycol
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.260 |
| 5NU3 Crystal structure of the human bromodomain of CREBBP bound to the inhibitor XDM-CBP 提交 2017-04-28 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1081–1197（117 aa）
片段：bromodomain
|
未记录 | 99E ~{N}-[[2,8-bis(oxidanyl)naphthalen-1-yl]methyl]-4-ethanoyl-3-ethyl-5-methyl-1~{H}-pyrrole-2-carboxamide × 1 BU3 (R,R)-2,3-BUTANEDIOL × 4 SO4 SULFATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
EVAPORATION；pH 6.5；277 K；LiSO4, PEG 3350, ethylene glycol
|
分辨率 1.75 Å R-free 0.200 |
| 5OWK Crystal structure of CREBBP bromodomain complexed with DSPB2A002 提交 2017-09-01 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1081–1197（117 aa）
|
未记录 | 7MX ethyl 4-chloranyl-1-methyl-6-oxidanylidene-pyridine-3-carboxylate × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；0.1 M MES, pH6.5, 0.1 M MgCl2, 20% PEG6K, 10% EG
|
分辨率 1.25 Å R-free 0.176 |
| 5SVH Crystal structure of the KIX domain of CBP in complex with a MLL/c-Myb chimera 提交 2016-08-06 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
587–673（87 aa）
片段：UNP residues 587-673
|
未记录 | GOL GLYCEROL × 2 CL CHLORIDE ION × 7 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；0.1 M potassium sulfate
2.3M Ammonium sulphate
|
分辨率 2.05 Å R-free 0.242 |
| 5SVH Crystal structure of the KIX domain of CBP in complex with a MLL/c-Myb chimera 提交 2016-08-06 | Assembly 2 信息不足 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric（12） 与蛋白数一致 |
链 A
587–673（87 aa）
片段：UNP residues 587-673
|
未记录 | GOL GLYCEROL × 12 CL CHLORIDE ION × 42 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；0.1 M potassium sulfate
2.3M Ammonium sulphate
|
分辨率 2.05 Å R-free 0.242 |
| 5SVH Crystal structure of the KIX domain of CBP in complex with a MLL/c-Myb chimera 提交 2016-08-06 | Assembly 3 信息不足 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
587–673（87 aa）
片段：UNP residues 587-673
|
未记录 | GOL GLYCEROL × 4 CL CHLORIDE ION × 14 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；0.1 M potassium sulfate
2.3M Ammonium sulphate
|
分辨率 2.05 Å R-free 0.242 |
| 5TB6 Structure of bromodomain of CREBBP with a pyrazolo[4,3-c]pyridin fragment 提交 2016-09-11 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1081–1197（117 aa）
|
未记录 | 77X 1-(3-phenyl-1,4,6,7-tetrahydropyrazolo[4,3-c]pyridin-5-yl)propan-1-one × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；277 K；0.15M KSCN
15% PEG 3350
5% EtGly
|
分辨率 1.79 Å R-free 0.243 |
| 5W0E CREBBP bromodomain in complex with Cpd19 (3-(7-(difluoromethyl)-6-(1-methyl-1H-pyrazol-4-yl)-3,4-dihydroquinolin-1(2H)-yl)-N-methyl-1-(tetrahydro-2H-pyran-4-yl)-1,4,6,7-tetrahydro-5H-pyrazolo[4,3-c]pyridine-5-carboxamide) 提交 2017-05-30 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1082–1197（116 aa）
片段：Bromodomain, UNP residues 1082-1197
|
未记录 | 9U4 3-[7-(difluoromethyl)-6-(1-methyl-1H-pyrazol-4-yl)-3,4-dihydroquinolin-1(2H)-yl]-N-methyl-1-(oxan-4-yl)-1,4,6,7-tetrahydro-5H-pyrazolo[4,3-c]pyridine-5-carboxamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 6.5；277 K；0.2M MgCl2, 0.1M Bis-Tris pH6.5, 22% PEG3350
|
分辨率 1.41 Å R-free 0.260 |
| 5W0F CREBBP Bromodomain in complex with Cpd3 ((S)-1-(3-(6-(1-methyl-1H-pyrazol-4-yl)-3,4-dihydroquinolin-1(2H)-yl)-1-(tetrahydrofuran-3-yl)-1,4,6,7-tetrahydro-5H-pyrazolo[4,3-c]pyridin-5-yl)ethan-1-one) 提交 2017-05-30 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1082–1197（116 aa）
片段：Bromodomain, UNP residues 1082-1197
|
未记录 | 9U7 1-{3-[6-(1-methyl-1H-pyrazol-4-yl)-3,4-dihydroquinolin-1(2H)-yl]-1-[(3S)-oxolan-3-yl]-1,4,6,7-tetrahydro-5H-pyrazolo[4,3-c]pyridin-5-yl}ethan-1-one × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 6.5；277 K；0.2 M Li2SO4, 0.1M Bis-Tris pH 6.5, 19% PEG3350
|
分辨率 1.60 Å R-free 0.206 |
| 5W0L CREBBP Bromodomain in complex with Cpd10 (1-(3-(7-(difluoromethyl)-6-(1-methyl-1H-pyrazol-4-yl)-3,4-dihydroquinolin-1(2H)-yl)-1-(tetrahydro-2H-pyran-4-yl)-1,4,6,7-tetrahydro-5H-pyrazolo[4,3-c]pyridin-5-yl)ethan-1-one) 提交 2017-05-31 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1082–1197（116 aa）
片段：Bromodomain, UNP residues 1082-1197
|
未记录 | 9UD 1-{3-[7-(difluoromethyl)-6-(1-methyl-1H-pyrazol-4-yl)-3,4-dihydroquinolin-1(2H)-yl]-1-(oxan-4-yl)-1,4,6,7-tetrahydro-5H-pyrazolo[4,3-c]pyridin-5-yl}ethan-1-one × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 6.5；277 K；100 mM Bis-Tris pH 5.5, 200-300 mM KSCN, 21-25% PEG 3350
|
分辨率 1.55 Å R-free 0.229 |
| 5W0L CREBBP Bromodomain in complex with Cpd10 (1-(3-(7-(difluoromethyl)-6-(1-methyl-1H-pyrazol-4-yl)-3,4-dihydroquinolin-1(2H)-yl)-1-(tetrahydro-2H-pyran-4-yl)-1,4,6,7-tetrahydro-5H-pyrazolo[4,3-c]pyridin-5-yl)ethan-1-one) 提交 2017-05-31 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1082–1197（116 aa）
片段：Bromodomain, UNP residues 1082-1197
|
未记录 | 9UD 1-{3-[7-(difluoromethyl)-6-(1-methyl-1H-pyrazol-4-yl)-3,4-dihydroquinolin-1(2H)-yl]-1-(oxan-4-yl)-1,4,6,7-tetrahydro-5H-pyrazolo[4,3-c]pyridin-5-yl}ethan-1-one × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 6.5；277 K；100 mM Bis-Tris pH 5.5, 200-300 mM KSCN, 21-25% PEG 3350
|
分辨率 1.55 Å R-free 0.229 |
| 5W0Q CREBBP Bromodomain in complex with Cpd17 (N,2,7-trimethyl-2,3-dihydro-4H-benzo[b][1,4]oxazine-4-carboxamide) 提交 2017-05-31 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1082–1197（116 aa）
片段：Bromodomain, UNP residues 1082-1197
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 3 9UG (2R)-N,2,7-trimethyl-2,3-dihydro-4H-1,4-benzoxazine-4-carboxamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 6.5；277 K；0.1M Bis-Tris pH 6.5, 0.2M Li2SO4, 25% PEG3350
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.213 |
| 5XXH Crystal Structure Analysis of the CBP 提交 2017-07-04 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1081–1197（117 aa）
片段：UNP RESIDUES 1081-1197
|
未记录 | E0D (3S)-1-[2-(3-ethanoylindol-1-yl)ethanoyl]piperidine-3-carboxylic acid × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；277 K；30% PEG 3350, 0.2M MgCl2, 0.1M Tris HCl, PH 8.5
|
分辨率 1.62 Å R-free 0.208 |
| 6ALB CREBBP bromodomain in complex with Cpd 30 (1-(3-(3-(1-methyl-1H-pyrazol-4-yl)isoquinolin-8-yl)-1-(tetrahydro-2H-pyran-4-yl)-1,4,6,7-tetrahydro-5H-pyrazolo[4,3-c]pyridin-5-yl)ethan-1-one) 提交 2017-08-07 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1081–1312（232 aa）
片段：Bromodomain (UNP residue 1081-1312)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 3 B3P 2-[3-(2-HYDROXY-1,1-DIHYDROXYMETHYL-ETHYLAMINO)-PROPYLAMINO]-2-HYDROXYMETHYL-PROPANE-1,3-DIOL × 1 BKJ 1-{3-[3-(1-methyl-1H-pyrazol-4-yl)isoquinolin-8-yl]-1-(oxan-4-yl)-1,4,6,7-tetrahydro-5H-pyrazolo[4,3-c]pyridin-5-yl}ethan-1-one × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 6.5；277 K；0.2 M Li2SO4, 0.1M Bis-Tris pH 6.5, 19% PEG3350
|
分辨率 2.05 Å R-free 0.242 |
| 6ALC CREBBP bromodomain in complex with Cpd 4 (1-(1-(cyclopropylmethyl)-3-(1H-indol-4-yl)-1,4,6,7-tetrahydro-5H-pyrazolo[4,3-c]pyridin-5-yl)ethan-1-one) 提交 2017-08-07 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1085–1196（112 aa）
片段：Bromodomain (UNP residues 1085-1196)
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 6.5；277 K；0.2 M Li2SO4, 0.1M Bis-Tris pH 6.5, 19% PEG3350
|
分辨率 1.39 Å R-free 0.212 |
| 6ALC CREBBP bromodomain in complex with Cpd 4 (1-(1-(cyclopropylmethyl)-3-(1H-indol-4-yl)-1,4,6,7-tetrahydro-5H-pyrazolo[4,3-c]pyridin-5-yl)ethan-1-one) 提交 2017-08-07 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1085–1196（112 aa）
片段：Bromodomain (UNP residues 1085-1196)
|
未记录 | BKD 1-[1-(cyclopropylmethyl)-3-(1H-indol-4-yl)-1,4,6,7-tetrahydro-5H-pyrazolo[4,3-c]pyridin-5-yl]ethan-1-one × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 6.5；277 K；0.2 M Li2SO4, 0.1M Bis-Tris pH 6.5, 19% PEG3350
|
分辨率 1.39 Å R-free 0.212 |
| 6AXQ CREBBP bromodomain in complex with Cpd6 (methyl 1H-indole-3-carboxylate) 提交 2017-09-07 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1085–1196（112 aa）
片段：bromodomain (UNP residues 1085-1196)
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 2 C2Y methyl 1H-indole-3-carboxylate × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 8.2；289 K；3.545 M Formate, 100 mM Tris-HCl pH 8.2, 10% glycerol
|
分辨率 1.30 Å R-free 0.216 |
| 6AXQ CREBBP bromodomain in complex with Cpd6 (methyl 1H-indole-3-carboxylate) 提交 2017-09-07 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1085–1196（112 aa）
片段：bromodomain (UNP residues 1085-1196)
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 C2Y methyl 1H-indole-3-carboxylate × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 8.2；289 K；3.545 M Formate, 100 mM Tris-HCl pH 8.2, 10% glycerol
|
分辨率 1.30 Å R-free 0.216 |
| 6AXQ CREBBP bromodomain in complex with Cpd6 (methyl 1H-indole-3-carboxylate) 提交 2017-09-07 | Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 C
1085–1196（112 aa）
片段：bromodomain (UNP residues 1085-1196)
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 2 C2Y methyl 1H-indole-3-carboxylate × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 8.2；289 K；3.545 M Formate, 100 mM Tris-HCl pH 8.2, 10% glycerol
|
分辨率 1.30 Å R-free 0.216 |
| 6AXQ CREBBP bromodomain in complex with Cpd6 (methyl 1H-indole-3-carboxylate) 提交 2017-09-07 | Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 D
1085–1196（112 aa）
片段：bromodomain (UNP residues 1085-1196)
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 C2Y methyl 1H-indole-3-carboxylate × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 8.2；289 K；3.545 M Formate, 100 mM Tris-HCl pH 8.2, 10% glycerol
|
分辨率 1.30 Å R-free 0.216 |
| 6AY3 CREBBP bromodomain in complex with Cpd16 (5-(7-(difluoromethyl)-6-(1-methyl-1H-pyrazol-4-yl)-3,4-dihydroquinolin-1(2H)-yl)-N-methyl-1H-indole-3-carboxamide) 提交 2017-09-07 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1083–1197（115 aa）
片段：Bromodomain (UNP residue 1083-1197)
|
未记录 | C3J 5-[7-(difluoromethyl)-6-(1-methyl-1H-pyrazol-4-yl)-3,4-dihydroquinolin-1(2H)-yl]-N-methyl-1H-indole-3-carboxamide × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 NA SODIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 6.5；277 K；0.2M MgCl2, 0.1M Bis-Tris pH6.5, 22% PEG3350
|
分辨率 1.39 Å R-free 0.237 |
| 6AY3 CREBBP bromodomain in complex with Cpd16 (5-(7-(difluoromethyl)-6-(1-methyl-1H-pyrazol-4-yl)-3,4-dihydroquinolin-1(2H)-yl)-N-methyl-1H-indole-3-carboxamide) 提交 2017-09-07 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1083–1197（115 aa）
片段：Bromodomain (UNP residue 1083-1197)
|
未记录 | C3J 5-[7-(difluoromethyl)-6-(1-methyl-1H-pyrazol-4-yl)-3,4-dihydroquinolin-1(2H)-yl]-N-methyl-1H-indole-3-carboxamide × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 6.5；277 K；0.2M MgCl2, 0.1M Bis-Tris pH6.5, 22% PEG3350
|
分辨率 1.39 Å R-free 0.237 |
| 6AY5 CREBBP bromodomain in complex with Cpd17 (5-(7-(difluoromethyl)-6-(1-methyl-1H-pyrazol-4-yl)-3,4-dihydroquinolin-1(2H)-yl)-3-methylbenzo[d]thiazol-2(3H)-one) 提交 2017-09-07 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1083–1197（115 aa）
片段：Bromodomain (UNP residue 1083-1197)
|
未记录 | C3V 5-[7-(difluoromethyl)-6-(1-methyl-1H-pyrazol-4-yl)-3,4-dihydroquinolin-1(2H)-yl]-3-methyl-1,3-benzothiazol-2(3H)-one × 1 SO4 SULFATE ION × 2 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 GOL GLYCEROL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 6.5；277 K；0.2M MgCl2, 0.1M Bis-Tris pH6.5, 22% PEG3350
|
分辨率 1.44 Å R-free 0.184 |
| 6DMK A multiconformer ligand model of an isoxazolyl-benzimidazole ligand bound to the bromodomain of human CREBBP 提交 2018-06-05 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1045–1157（113 aa）
|
未记录 | NO3 NITRATE ION × 1 2LL 5-(3,5-dimethyl-1,2-oxazol-4-yl)-1-[2-(morpholin-4-yl)ethyl]-2-(2-phenylethyl)-1H-benzimidazole × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；277 K；0.20M NaNO3, 20.0% PEG 3350, 10.0% EtGly, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
|
分辨率 1.66 Å R-free 0.234 |
| 6ES7 Structure and dynamics conspire in the evolution of affinity between intrinsically disordered proteins 提交 2017-10-19 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
2061–2109（49 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 6.5；298 K；离子强度（mmCIF原始值）na；压力 1
NMR样品组成
100 % 13C/15N CID, 100 % 13C/15N NCBD, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
|
分辨率未提供 |
| 6FQO Crystal structure of CREBBP bromodomain complexd with DT29 提交 2018-02-14 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1081–1197（117 aa）
|
未记录 | E2T ~{N}-[3-(2,5-dimethyl-3-oxidanylidene-1,2-oxazol-4-yl)-5-(5-ethanoyl-2-ethoxy-phenyl)phenyl]furan-2-carboxamide × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；0.15 M KSCN, 20% PEG3350, 10% EG
|
分辨率 1.35 Å R-free 0.194 |
| 6FQO Crystal structure of CREBBP bromodomain complexd with DT29 提交 2018-02-14 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1081–1197（117 aa）
|
未记录 | E2T ~{N}-[3-(2,5-dimethyl-3-oxidanylidene-1,2-oxazol-4-yl)-5-(5-ethanoyl-2-ethoxy-phenyl)phenyl]furan-2-carboxamide × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；0.15 M KSCN, 20% PEG3350, 10% EG
|
分辨率 1.35 Å R-free 0.194 |
| 6FQT Crystal structure of CREBBP bromodomain complexd with DR46 提交 2018-02-14 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1081–1197（117 aa）
|
未记录 | AY2 ~{N}-[3-(5-ethanoyl-2-ethoxy-phenyl)-5-(1-methylpyrazol-3-yl)phenyl]furan-2-carboxamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；0.1 M Hepes, pH7.5, 0.2 M LiSO4, 25% PEG3350
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.255 |
| 6FQU Crystal structure of CREBBP bromodomain complexd with DR09 提交 2018-02-14 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1081–1197（117 aa）
|
未记录 | E3B 1-[3-[3-[3,3-bis(fluoranyl)piperidin-1-yl]phenyl]-4-ethoxy-phenyl]ethanone × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；0.15 M KSCN, 20% PEG3350, 10% EG
|
分辨率 1.43 Å R-free 0.190 |
| 6FR0 Crystal structure of CREBBP bromodomain complexd with PB08 提交 2018-02-15 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1081–1197（117 aa）
|
未记录 | E3H ~{N}-[3-(5-ethanoyl-2-ethoxy-phenyl)-5-(2-ethyl-5-methyl-3-oxidanylidene-1,2-oxazol-4-yl)phenyl]furan-2-carboxamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；0.1 M Hepes, pH7.5, 0.2 M LiSO4, 25% PEG3350
|
分辨率 1.50 Å R-free 0.202 |
| 6FR0 Crystal structure of CREBBP bromodomain complexd with PB08 提交 2018-02-15 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1081–1197（117 aa）
|
未记录 | E3H ~{N}-[3-(5-ethanoyl-2-ethoxy-phenyl)-5-(2-ethyl-5-methyl-3-oxidanylidene-1,2-oxazol-4-yl)phenyl]furan-2-carboxamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；0.1 M Hepes, pH7.5, 0.2 M LiSO4, 25% PEG3350
|
分辨率 1.50 Å R-free 0.202 |
| 6FRF Crystal structure of CREBBP bromodomain complexd with PA10 提交 2018-02-15 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1081–1197（117 aa）
|
未记录 | E3T ~{N}-[3-(3,5-dimethyl-1,2-oxazol-4-yl)-5-(5-ethanoyl-2-ethoxy-phenyl)phenyl]furan-2-carboxamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；0.1 M Sodium Citrate, pH 5.6, 1.3 M Ammonium Sulfate
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.228 |
| 6FRF Crystal structure of CREBBP bromodomain complexd with PA10 提交 2018-02-15 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1081–1197（117 aa）
|
未记录 | E3T ~{N}-[3-(3,5-dimethyl-1,2-oxazol-4-yl)-5-(5-ethanoyl-2-ethoxy-phenyl)phenyl]furan-2-carboxamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；0.1 M Sodium Citrate, pH 5.6, 1.3 M Ammonium Sulfate
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.228 |
| 6FRF Crystal structure of CREBBP bromodomain complexd with PA10 提交 2018-02-15 | Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 C
1081–1197（117 aa）
|
未记录 | E3T ~{N}-[3-(3,5-dimethyl-1,2-oxazol-4-yl)-5-(5-ethanoyl-2-ethoxy-phenyl)phenyl]furan-2-carboxamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；0.1 M Sodium Citrate, pH 5.6, 1.3 M Ammonium Sulfate
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.228 |
| 6FRF Crystal structure of CREBBP bromodomain complexd with PA10 提交 2018-02-15 | Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 D
1081–1197（117 aa）
|
未记录 | E3T ~{N}-[3-(3,5-dimethyl-1,2-oxazol-4-yl)-5-(5-ethanoyl-2-ethoxy-phenyl)phenyl]furan-2-carboxamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；0.1 M Sodium Citrate, pH 5.6, 1.3 M Ammonium Sulfate
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.228 |
| 6QST Structure of CREBBP bromodomain with compound 2 bound 提交 2019-02-22 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1081–1197（117 aa）
|
未记录 | JGK ~{N}-[3-(3-azanyl-5-methyl-1,2-oxazol-4-yl)-5-(5-ethanoyl-2-ethoxy-phenyl)phenyl]furan-2-carboxamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；0.1 M Bis-Tris propane pH 7.5, 0.02 M Sodium/potassium phosphate, 20% w/v PEG 3350
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.219 |
| 6QST Structure of CREBBP bromodomain with compound 2 bound 提交 2019-02-22 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1081–1197（117 aa）
|
未记录 | JGK ~{N}-[3-(3-azanyl-5-methyl-1,2-oxazol-4-yl)-5-(5-ethanoyl-2-ethoxy-phenyl)phenyl]furan-2-carboxamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；0.1 M Bis-Tris propane pH 7.5, 0.02 M Sodium/potassium phosphate, 20% w/v PEG 3350
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.219 |
| 6QST Structure of CREBBP bromodomain with compound 2 bound 提交 2019-02-22 | Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 C
1081–1197（117 aa）
|
未记录 | JGK ~{N}-[3-(3-azanyl-5-methyl-1,2-oxazol-4-yl)-5-(5-ethanoyl-2-ethoxy-phenyl)phenyl]furan-2-carboxamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；0.1 M Bis-Tris propane pH 7.5, 0.02 M Sodium/potassium phosphate, 20% w/v PEG 3350
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.219 |
| 6QST Structure of CREBBP bromodomain with compound 2 bound 提交 2019-02-22 | Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 D
1081–1197（117 aa）
|
未记录 | JGK ~{N}-[3-(3-azanyl-5-methyl-1,2-oxazol-4-yl)-5-(5-ethanoyl-2-ethoxy-phenyl)phenyl]furan-2-carboxamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；0.1 M Bis-Tris propane pH 7.5, 0.02 M Sodium/potassium phosphate, 20% w/v PEG 3350
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.219 |
| 6SQC Crystal structure of complex between nuclear coactivator binding domain of CBP and [1040-1086]ACTR containing alpha-methylated Leu1055 and Leu1076 提交 2019-09-03 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
2061–2112（52 aa）
|
未记录 | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 ZN ZINC ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；298 K；20% PEG6000, 100 mM Tris pH 8 and 10 mM ZnCl2
|
分辨率 2.28 Å R-free 0.274 |
| 6SQE Crystal structure of CREBBP bromodomain complexed with KD341 提交 2019-09-03 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1081–1197（117 aa）
|
未记录 | LSZ ~{N}-[3-[(5-ethanoyl-2-ethoxy-phenyl)carbamoyl]-5-(1-methylpyrazol-3-yl)phenyl]-5-[(4-methylpiperazin-1-yl)methyl]furan-2-carboxamide × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277.15 K；0.2M MgCl2, 25% PEG 3350, 0.1M BisTris pH 5.5
|
分辨率 1.51 Å R-free 0.191 |
| 6SQF Crystal structure of CREBBP bromodomain complexed with LB32A 提交 2019-09-03 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1081–1197（117 aa）
|
未记录 | LTW ~{N}-[3-[[5-ethanoyl-2-[2-(2-oxa-6-azaspiro[3.3]heptan-6-yl)ethoxy]phenyl]carbamoyl]-5-(1-methylpyrazol-3-yl)phenyl]furan-2-carboxamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277.15 K；0.1M MES pH 6.5, 12% PEG 20000
|
分辨率 2.01 Å R-free 0.215 |
| 6SQM Crystal structure of CREBBP bromodomain complexed with LA36 提交 2019-09-04 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1081–1197（117 aa）
|
未记录 | LU5 ~{N}-[3-acetamido-5-[(3-methylcinnolin-5-yl)carbamoyl]phenyl]furan-2-carboxamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277.15 K；8% Ethylene glycol, 0.1M HEPES pH 7.5, 10% PEG 8000
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.269 |
| 6SQM Crystal structure of CREBBP bromodomain complexed with LA36 提交 2019-09-04 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1081–1197（117 aa）
|
未记录 | LU5 ~{N}-[3-acetamido-5-[(3-methylcinnolin-5-yl)carbamoyl]phenyl]furan-2-carboxamide × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277.15 K；8% Ethylene glycol, 0.1M HEPES pH 7.5, 10% PEG 8000
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.269 |
| 6SQM Crystal structure of CREBBP bromodomain complexed with LA36 提交 2019-09-04 | Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 C
1081–1197（117 aa）
|
未记录 | LU5 ~{N}-[3-acetamido-5-[(3-methylcinnolin-5-yl)carbamoyl]phenyl]furan-2-carboxamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277.15 K；8% Ethylene glycol, 0.1M HEPES pH 7.5, 10% PEG 8000
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.269 |
| 6SXX Crystal structure of the bromodomain of human CREBBP in complex with ACA007 提交 2019-09-26 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1081–1197（117 aa）
|
未记录 | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 LXQ (3~{R})-1-ethanoylpyrrolidine-3-carboxylic acid × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；25% PEG3350, 0.2 M Potassium thiocyanate, 5% EtGly
|
分辨率 2.01 Å R-free 0.253 |
| 6SXX Crystal structure of the bromodomain of human CREBBP in complex with ACA007 提交 2019-09-26 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1081–1197（117 aa）
|
未记录 | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 LXQ (3~{R})-1-ethanoylpyrrolidine-3-carboxylic acid × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；25% PEG3350, 0.2 M Potassium thiocyanate, 5% EtGly
|
分辨率 2.01 Å R-free 0.253 |
| 6YIJ Crystal structure of the CREBBP bromodomain in complex with a benzo-diazepine ligand 提交 2020-04-01 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1081–1197（117 aa）
|
未记录 | OSN (4~{R})-6-[(~{E})-5-(7-methoxy-3,4-dihydro-2~{H}-quinolin-1-yl)pent-1-enyl]-4-methyl-1,3,4,5-tetrahydro-1,5-benzodiazepin-2-one × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.3；277 K；20% ethylene glycol
21% PEG6K
0.1M tris pH 8.3
0.125M lithium chloride
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.269 |
| 6YIJ Crystal structure of the CREBBP bromodomain in complex with a benzo-diazepine ligand 提交 2020-04-01 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1081–1197（117 aa）
|
未记录 | OSN (4~{R})-6-[(~{E})-5-(7-methoxy-3,4-dihydro-2~{H}-quinolin-1-yl)pent-1-enyl]-4-methyl-1,3,4,5-tetrahydro-1,5-benzodiazepin-2-one × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.3；277 K；20% ethylene glycol
21% PEG6K
0.1M tris pH 8.3
0.125M lithium chloride
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.269 |
| 6YIJ Crystal structure of the CREBBP bromodomain in complex with a benzo-diazepine ligand 提交 2020-04-01 | Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 C
1081–1197（117 aa）
|
未记录 | OSN (4~{R})-6-[(~{E})-5-(7-methoxy-3,4-dihydro-2~{H}-quinolin-1-yl)pent-1-enyl]-4-methyl-1,3,4,5-tetrahydro-1,5-benzodiazepin-2-one × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.3；277 K；20% ethylene glycol
21% PEG6K
0.1M tris pH 8.3
0.125M lithium chloride
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.269 |
| 6YIJ Crystal structure of the CREBBP bromodomain in complex with a benzo-diazepine ligand 提交 2020-04-01 | Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 D
1081–1197（117 aa）
|
未记录 | OSN (4~{R})-6-[(~{E})-5-(7-methoxy-3,4-dihydro-2~{H}-quinolin-1-yl)pent-1-enyl]-4-methyl-1,3,4,5-tetrahydro-1,5-benzodiazepin-2-one × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.3；277 K；20% ethylene glycol
21% PEG6K
0.1M tris pH 8.3
0.125M lithium chloride
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.269 |
| 6YIJ Crystal structure of the CREBBP bromodomain in complex with a benzo-diazepine ligand 提交 2020-04-01 | Assembly 5 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 E
1081–1197（117 aa）
|
未记录 | OSN (4~{R})-6-[(~{E})-5-(7-methoxy-3,4-dihydro-2~{H}-quinolin-1-yl)pent-1-enyl]-4-methyl-1,3,4,5-tetrahydro-1,5-benzodiazepin-2-one × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.3；277 K；20% ethylene glycol
21% PEG6K
0.1M tris pH 8.3
0.125M lithium chloride
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.269 |
| 6YIJ Crystal structure of the CREBBP bromodomain in complex with a benzo-diazepine ligand 提交 2020-04-01 | Assembly 6 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 F
1081–1197（117 aa）
|
未记录 | OSN (4~{R})-6-[(~{E})-5-(7-methoxy-3,4-dihydro-2~{H}-quinolin-1-yl)pent-1-enyl]-4-methyl-1,3,4,5-tetrahydro-1,5-benzodiazepin-2-one × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.3；277 K；20% ethylene glycol
21% PEG6K
0.1M tris pH 8.3
0.125M lithium chloride
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.269 |
| 6YIJ Crystal structure of the CREBBP bromodomain in complex with a benzo-diazepine ligand 提交 2020-04-01 | Assembly 7 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 G
1081–1197（117 aa）
|
未记录 | OSN (4~{R})-6-[(~{E})-5-(7-methoxy-3,4-dihydro-2~{H}-quinolin-1-yl)pent-1-enyl]-4-methyl-1,3,4,5-tetrahydro-1,5-benzodiazepin-2-one × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.3；277 K；20% ethylene glycol
21% PEG6K
0.1M tris pH 8.3
0.125M lithium chloride
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.269 |
| 6YIK Crystal structure of the CREBBP bromodomain in complex with a tetrahydroquinoxaline ligand 提交 2020-04-01 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1081–1197（117 aa）
|
未记录 | OSQ (3~{R})-~{N}-[3-(3,4-dihydro-2~{H}-quinolin-1-yl)-2,2-bis(fluoranyl)propyl]-3-methyl-2-oxidanylidene-3,4-dihydro-1~{H}-quinoxaline-5-carboxamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；277 K；21% PEG3350
15% ethylene glycol
0.25M sodium formate
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.184 |
| 6YIK Crystal structure of the CREBBP bromodomain in complex with a tetrahydroquinoxaline ligand 提交 2020-04-01 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1081–1197（117 aa）
|
未记录 | OSQ (3~{R})-~{N}-[3-(3,4-dihydro-2~{H}-quinolin-1-yl)-2,2-bis(fluoranyl)propyl]-3-methyl-2-oxidanylidene-3,4-dihydro-1~{H}-quinoxaline-5-carboxamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；277 K；21% PEG3350
15% ethylene glycol
0.25M sodium formate
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.184 |
| 6YIK Crystal structure of the CREBBP bromodomain in complex with a tetrahydroquinoxaline ligand 提交 2020-04-01 | Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 C
1081–1197（117 aa）
|
未记录 | OSQ (3~{R})-~{N}-[3-(3,4-dihydro-2~{H}-quinolin-1-yl)-2,2-bis(fluoranyl)propyl]-3-methyl-2-oxidanylidene-3,4-dihydro-1~{H}-quinoxaline-5-carboxamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；277 K；21% PEG3350
15% ethylene glycol
0.25M sodium formate
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.184 |
| 6YIL Crystal structure of the CREBBP bromodomain in complex with a tetrahydroquinoxaline ligand 提交 2020-04-01 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1081–1197（117 aa）
|
未记录 | OSQ (3~{R})-~{N}-[3-(3,4-dihydro-2~{H}-quinolin-1-yl)-2,2-bis(fluoranyl)propyl]-3-methyl-2-oxidanylidene-3,4-dihydro-1~{H}-quinoxaline-5-carboxamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；277 K；20% PEG3350
10% ethylene glycol
0.2M sodium acetate
|
分辨率 1.22 Å R-free 0.151 |
| 6YIM Crystal structure of the CREBBP bromodomain in complex with a benzo-diazepine ligand 提交 2020-04-01 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1081–1197（117 aa）
|
未记录 | OS8 (4~{R})-~{N}-[3-(7-methoxy-3,4-dihydro-2~{H}-quinolin-1-yl)propyl]-4-methyl-2-oxidanylidene-1,3,4,5-tetrahydro-1,5-benzodiazepine-6-carboxamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；277 K；20% PEG3350
10% ethylene glycol
0.2M sodium fluoride
|
分辨率 1.23 Å R-free 0.167 |
| 7CO1 Crystal structure of SMAD2 in complex with wild-type CBP 提交 2020-08-03 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 B
1951–1973（23 aa）
链 D
1951–1973（23 aa）
链 F
1951–1973（23 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.2；293 K；1 M sodium phosphate monobasic monohydrate-potassium phosphate dibasic
|
分辨率 3.30 Å R-free 0.283 |
| 7EVJ Crystal structure of CBP bromodomain liganded with 9c 提交 2021-05-21 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1081–1197（117 aa）
片段：UNP RESIDUES 1081-1197
|
未记录 | JE9 3-acetyl-1-((3-(1-cyclopropyl-1H-pyrazol-4-yl)-2-fluoro-5-(hydroxymethyl)phenyl)carbamoyl)indolizin-7-yl dimethylcarbamate × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 1 GOL GLYCEROL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.6；277 K；0.2 M NH4H2PO4, 20% PEG 3350, pH 4.6, and 20% Gly
|
分辨率 2.57 Å R-free 0.209 |
| 7JFL Crystal structure of human phosphorylated IRF-3 bound to CBP 提交 2020-07-17 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 C
2065–2111（47 aa）
链 D
2065–2111（47 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；277 K；0.1 M sodium acetate pH 5.0, 0.2 M MgCl2, 5% PEG 3350
|
分辨率 1.68 Å R-free 0.223 |
| 7JFM Crystal structure of mouse phosphorylated IRF-3 bound to CBP 提交 2020-07-17 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 C
2065–2111（47 aa）
链 D
2065–2111（47 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；277 K；0.2 M ammonium citrate tribasic at pH 7.0, 12% PEG 3350
|
分辨率 2.23 Å R-free 0.252 |
| 7JUO CBP bromodomain complexed with YF2-23 提交 2020-08-20 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1082–1197（116 aa）
|
未记录 | YF2 N-{1-[1,1-di(pyridin-2-yl)ethyl]-6-(1-methyl-7-oxo-6,7-dihydro-1H-pyrrolo[2,3-c]pyridin-3-yl)-1H-indol-4-yl}ethanesulfonamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.4；277 K；0.2 M lithium citrate tribasic tetrahydrate, 17-19% PEG 3350, pH 8.4
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.276 |
| 7JUO CBP bromodomain complexed with YF2-23 提交 2020-08-20 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 D
1082–1197（116 aa）
|
未记录 | YF2 N-{1-[1,1-di(pyridin-2-yl)ethyl]-6-(1-methyl-7-oxo-6,7-dihydro-1H-pyrrolo[2,3-c]pyridin-3-yl)-1H-indol-4-yl}ethanesulfonamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.4；277 K；0.2 M lithium citrate tribasic tetrahydrate, 17-19% PEG 3350, pH 8.4
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.276 |
| 7JUO CBP bromodomain complexed with YF2-23 提交 2020-08-20 | Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 C
1082–1197（116 aa）
|
未记录 | YF2 N-{1-[1,1-di(pyridin-2-yl)ethyl]-6-(1-methyl-7-oxo-6,7-dihydro-1H-pyrrolo[2,3-c]pyridin-3-yl)-1H-indol-4-yl}ethanesulfonamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.4；277 K；0.2 M lithium citrate tribasic tetrahydrate, 17-19% PEG 3350, pH 8.4
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.276 |
| 7JUO CBP bromodomain complexed with YF2-23 提交 2020-08-20 | Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1082–1197（116 aa）
|
未记录 | YF2 N-{1-[1,1-di(pyridin-2-yl)ethyl]-6-(1-methyl-7-oxo-6,7-dihydro-1H-pyrrolo[2,3-c]pyridin-3-yl)-1H-indol-4-yl}ethanesulfonamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.4；277 K；0.2 M lithium citrate tribasic tetrahydrate, 17-19% PEG 3350, pH 8.4
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.276 |
| 7JUO CBP bromodomain complexed with YF2-23 提交 2020-08-20 | Assembly 5 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 F
1082–1197（116 aa）
|
未记录 | YF2 N-{1-[1,1-di(pyridin-2-yl)ethyl]-6-(1-methyl-7-oxo-6,7-dihydro-1H-pyrrolo[2,3-c]pyridin-3-yl)-1H-indol-4-yl}ethanesulfonamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.4；277 K；0.2 M lithium citrate tribasic tetrahydrate, 17-19% PEG 3350, pH 8.4
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.276 |
| 7JUO CBP bromodomain complexed with YF2-23 提交 2020-08-20 | Assembly 6 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 G
1082–1197（116 aa）
|
未记录 | YF2 N-{1-[1,1-di(pyridin-2-yl)ethyl]-6-(1-methyl-7-oxo-6,7-dihydro-1H-pyrrolo[2,3-c]pyridin-3-yl)-1H-indol-4-yl}ethanesulfonamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.4；277 K；0.2 M lithium citrate tribasic tetrahydrate, 17-19% PEG 3350, pH 8.4
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.276 |
| 7JUO CBP bromodomain complexed with YF2-23 提交 2020-08-20 | Assembly 7 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 H
1082–1197（116 aa）
|
未记录 | YF2 N-{1-[1,1-di(pyridin-2-yl)ethyl]-6-(1-methyl-7-oxo-6,7-dihydro-1H-pyrrolo[2,3-c]pyridin-3-yl)-1H-indol-4-yl}ethanesulfonamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.4；277 K；0.2 M lithium citrate tribasic tetrahydrate, 17-19% PEG 3350, pH 8.4
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.276 |
| 7JUO CBP bromodomain complexed with YF2-23 提交 2020-08-20 | Assembly 8 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 E
1082–1197（116 aa）
|
未记录 | YF2 N-{1-[1,1-di(pyridin-2-yl)ethyl]-6-(1-methyl-7-oxo-6,7-dihydro-1H-pyrrolo[2,3-c]pyridin-3-yl)-1H-indol-4-yl}ethanesulfonamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.4；277 K；0.2 M lithium citrate tribasic tetrahydrate, 17-19% PEG 3350, pH 8.4
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.276 |
| 7RLE Crystal structure of PPAR gamma in complex with CREB-binding protein and agonist GW1929 提交 2021-07-23 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 B
57–80（24 aa）
片段：Residues 57-80
链 D
57–80（24 aa）
片段：Residues 57-80
|
未记录 | EDK (2~{S})-3-[4-[2-[methyl(pyridin-2-yl)amino]ethoxy]phenyl]-2-[[2-(phenylcarbonyl)phenyl]amino]propanoic acid × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；1M sodium citrate tribasic dihydrate, 0.1M sodium cacodylate, pH 6.5
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.275 |
| 7TB3 cryo-EM structure of MBP-KIX-apoferritin 提交 2021-12-21 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 24 PDB 声明：24-meric（24） 与蛋白数一致 |
链 A
549–630（82 aa）
链 B
549–630（82 aa）
链 C
549–630（82 aa）
链 D
549–630（82 aa）
链 E
549–630（82 aa）
链 F
549–630（82 aa）
链 G
549–630（82 aa）
链 H
549–630（82 aa）
链 I
549–630（82 aa）
链 J
549–630（82 aa）
链 K
549–630（82 aa）
链 L
549–630（82 aa）
链 M
549–630（82 aa）
链 N
549–630（82 aa）
链 O
549–630（82 aa）
链 P
549–630（82 aa）
链 Q
549–630（82 aa）
链 R
549–630（82 aa）
链 S
549–630（82 aa）
链 T
549–630（82 aa）
链 U
549–630（82 aa）
链 V
549–630（82 aa）
链 W
549–630（82 aa）
链 X
549–630（82 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.57 Å |
| 7TBH cryo-EM structure of MBP-KIX-apoferritin complex with peptide 7 提交 2021-12-22 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：48-meric（48） 与蛋白数一致 |
链 A
549–630（82 aa）
链 B
549–630（82 aa）
链 C
549–630（82 aa）
链 D
549–630（82 aa）
链 E
549–630（82 aa）
链 F
549–630（82 aa）
链 G
549–630（82 aa）
链 H
549–630（82 aa）
链 I
549–630（82 aa）
链 J
549–630（82 aa）
链 K
549–630（82 aa）
链 L
549–630（82 aa）
链 M
549–630（82 aa）
链 N
549–630（82 aa）
链 O
549–630（82 aa）
链 P
549–630（82 aa）
链 Q
549–630（82 aa）
链 R
549–630（82 aa）
链 S
549–630（82 aa）
链 T
549–630（82 aa）
链 U
549–630（82 aa）
链 V
549–630（82 aa）
链 W
549–630（82 aa）
链 X
549–630（82 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.30 Å |
| 7WX2 CBP-BrD complexed with NEO2734 提交 2022-02-14 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1081–1197（117 aa）
片段：bromodomain
|
未记录 | 7OW 1,3-dimethyl-5-[2-(oxan-4-yl)-3-[2-(trifluoromethyloxy)ethyl]benzimidazol-5-yl]pyridin-2-one × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
EVAPORATION；pH 8.5；289 K；PEG3350, NaNO3, ethylene glycol
|
分辨率 1.24 Å R-free 0.200 |
| 7XH6 Crystal structure of CBP bromodomain liganded with CCS1477 提交 2022-04-07 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1081–1197（117 aa）
片段：UNP RESIDUES 1081-1197
|
未记录 | GOL GLYCEROL × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 JHL (6S)-1-[3,4-bis(fluoranyl)phenyl]-6-[5-(3,5-dimethyl-1,2-oxazol-4-yl)-1-(4-methoxycyclohexyl)benzimidazol-2-yl]piperidin-2-one × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；0.1M HEPES pH 7.5, 2% v/v Tacsimate pH 7.0, 20% w/v Polyethylene glycol 3350
|
分辨率 1.75 Å R-free 0.227 |
| 7XH6 Crystal structure of CBP bromodomain liganded with CCS1477 提交 2022-04-07 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1081–1197（117 aa）
片段：UNP RESIDUES 1081-1197
|
未记录 | JHL (6S)-1-[3,4-bis(fluoranyl)phenyl]-6-[5-(3,5-dimethyl-1,2-oxazol-4-yl)-1-(4-methoxycyclohexyl)benzimidazol-2-yl]piperidin-2-one × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；0.1M HEPES pH 7.5, 2% v/v Tacsimate pH 7.0, 20% w/v Polyethylene glycol 3350
|
分辨率 1.75 Å R-free 0.227 |
| 7XHE Crystal structure of CBP bromodomain liganded with CCS151 提交 2022-04-08 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1081–1197（117 aa）
片段：UNP RESIDUES 1081-1197
|
未记录 | JHF (6S)-6-[5-(3,5-dimethyl-1,2-oxazol-4-yl)-1-[(3R)-1-methylsulfonylpyrrolidin-3-yl]benzimidazol-2-yl]-1-(3-fluoranyl-4-methoxy-phenyl)piperidin-2-one × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；0.2M Sodium malonate pH 7.0, 20% w/v Polyethylene glycol 3350
|
分辨率 1.59 Å R-free 0.231 |
| 7XHE Crystal structure of CBP bromodomain liganded with CCS151 提交 2022-04-08 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1081–1197（117 aa）
片段：UNP RESIDUES 1081-1197
|
未记录 | JHF (6S)-6-[5-(3,5-dimethyl-1,2-oxazol-4-yl)-1-[(3R)-1-methylsulfonylpyrrolidin-3-yl]benzimidazol-2-yl]-1-(3-fluoranyl-4-methoxy-phenyl)piperidin-2-one × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；0.2M Sodium malonate pH 7.0, 20% w/v Polyethylene glycol 3350
|
分辨率 1.59 Å R-free 0.231 |
| 7XI0 Crystal structure of CBP bromodomain liganded with CCS150 提交 2022-04-11 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1081–1197（117 aa）
片段：UNP RESIDUES 1081-1197
|
未记录 | EL0 (6S)-1-(3-chloranyl-4-methoxy-phenyl)-6-[5-(3,5-dimethyl-1,2-oxazol-4-yl)-1-[(3R)-1-methylsulfonylpyrrolidin-3-yl]benzimidazol-2-yl]piperidin-2-one × 1 GOL GLYCEROL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；0.2M NaAc, 20% w/v Polyethylene glycol, 3350 PH 7.3
|
分辨率 1.62 Å R-free 0.224 |
| 7XI0 Crystal structure of CBP bromodomain liganded with CCS150 提交 2022-04-11 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1081–1197（117 aa）
片段：UNP RESIDUES 1081-1197
|
未记录 | EL0 (6S)-1-(3-chloranyl-4-methoxy-phenyl)-6-[5-(3,5-dimethyl-1,2-oxazol-4-yl)-1-[(3R)-1-methylsulfonylpyrrolidin-3-yl]benzimidazol-2-yl]piperidin-2-one × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；0.2M NaAc, 20% w/v Polyethylene glycol, 3350 PH 7.3
|
分辨率 1.62 Å R-free 0.224 |
| 7XIJ Crystal structure of CBP bromodomain liganded with Y08175 提交 2022-04-13 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1043–1159（117 aa）
|
未记录 | EJ3 3-[(1-ethanoyl-5-methoxy-indol-3-yl)carbonylamino]-4-fluoranyl-5-(1-methylpyrazol-4-yl)benzoic acid × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 GOL GLYCEROL × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；0.2M MgCl2 0.1M TrsHCl 30% PEG4000 PH7.5
|
分辨率 1.82 Å R-free 0.221 |
| 7XM7 Crystal Structure of the CBP in complex with the Y08188 提交 2022-04-25 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1081–1197（117 aa）
|
未记录 | GAY 3-ethanoyl-~{N}-[2-fluoranyl-3-(1-methylpyrazol-4-yl)phenyl]-7-methoxy-indolizine-1-carboxamide × 1 GOL GLYCEROL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；20% PEG3350 0.2M NH4NO3 PH6.2
|
分辨率 2.36 Å R-free 0.257 |
| 7XM7 Crystal Structure of the CBP in complex with the Y08188 提交 2022-04-25 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1081–1197（117 aa）
|
未记录 | GAY 3-ethanoyl-~{N}-[2-fluoranyl-3-(1-methylpyrazol-4-yl)phenyl]-7-methoxy-indolizine-1-carboxamide × 1 NO3 NITRATE ION × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；20% PEG3350 0.2M NH4NO3 PH6.2
|
分辨率 2.36 Å R-free 0.257 |
| 7XM7 Crystal Structure of the CBP in complex with the Y08188 提交 2022-04-25 | Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 C
1081–1197（117 aa）
|
未记录 | NO3 NITRATE ION × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；20% PEG3350 0.2M NH4NO3 PH6.2
|
分辨率 2.36 Å R-free 0.257 |
| 7XM7 Crystal Structure of the CBP in complex with the Y08188 提交 2022-04-25 | Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 D
1081–1197（117 aa）
|
未记录 | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；20% PEG3350 0.2M NH4NO3 PH6.2
|
分辨率 2.36 Å R-free 0.257 |
| 7XNE Crystal structure of CBP bromodomain liganded with Y08284 提交 2022-04-28 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1081–1197（117 aa）
片段：UNP RESIDUES 1081-1197
链 B
1081–1197（117 aa）
片段：UNP RESIDUES 1081-1197
|
未记录 | GHF N-[3-(1-cyclopropylpyrazol-4-yl)-2-fluoranyl-5-[(1S)-1-oxidanylethyl]phenyl]-3-ethanoyl-7-methoxy-indolizine-1-carboxamide × 2 GOL GLYCEROL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；0.2 M Magnesium acetate tetrahydrate, 0.1 M Sodium cacodylate trihydrate pH 6.5, 20% w/v Polyethylene glycol 8,000
|
分辨率 2.17 Å R-free 0.259 |
| 7XNG Crystal structure of CBP bromodomain liganded with Y08092(31g) 提交 2022-04-28 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1081–1197（117 aa）
片段：UNP RESIDUES 1081-1197
链 B
1081–1197（117 aa）
片段：UNP RESIDUES 1081-1197
|
未记录 | GI5 3-[(1-ethanoylindol-3-yl)carbonylamino]-5-[[(2S)-oxan-2-yl]oxymethyl]benzoic acid × 2 GOL GLYCEROL × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；20% PEG3350 0.2M KSCN 0.1M HEPES PH8.5
|
分辨率 2.35 Å R-free 0.242 |
| 8FUP Bromodomain of CBP liganded with BMS-536924 and CCS-1477 提交 2023-01-18 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1082–1197（116 aa）
片段：bromodomain
|
未记录 | N6I (3M)-4-{[(2S)-2-(3-chlorophenyl)-2-hydroxyethyl]amino}-3-[4-methyl-6-(morpholin-4-yl)-1H-benzimidazol-2-yl]pyridin-2(1H)-one × 1 JHL (6S)-1-[3,4-bis(fluoranyl)phenyl]-6-[5-(3,5-dimethyl-1,2-oxazol-4-yl)-1-(4-methoxycyclohexyl)benzimidazol-2-yl]piperidin-2-one × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；292 K；0.2 M Ammonium sulfate, 30% w/v Polyethylene glycol 8000
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.212 |
| 8FUP Bromodomain of CBP liganded with BMS-536924 and CCS-1477 提交 2023-01-18 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1082–1197（116 aa）
片段：bromodomain
|
未记录 | JHL (6S)-1-[3,4-bis(fluoranyl)phenyl]-6-[5-(3,5-dimethyl-1,2-oxazol-4-yl)-1-(4-methoxycyclohexyl)benzimidazol-2-yl]piperidin-2-one × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；292 K；0.2 M Ammonium sulfate, 30% w/v Polyethylene glycol 8000
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.212 |
| 8FV2 Bromodomain of CBP liganded with CCS-1477 提交 2023-01-18 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1082–1197（116 aa）
片段：bromodomain
|
未记录 | PO4 PHOSPHATE ION × 3 JHL (6S)-1-[3,4-bis(fluoranyl)phenyl]-6-[5-(3,5-dimethyl-1,2-oxazol-4-yl)-1-(4-methoxycyclohexyl)benzimidazol-2-yl]piperidin-2-one × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.2；293 K；0.056M Sodium phosphate monobasic monohydrate, 1.344M Potassium phosphate dibasic
|
分辨率 1.87 Å R-free 0.226 |
| 8FV2 Bromodomain of CBP liganded with CCS-1477 提交 2023-01-18 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1082–1197（116 aa）
片段：bromodomain
|
未记录 | PO4 PHOSPHATE ION × 2 JHL (6S)-1-[3,4-bis(fluoranyl)phenyl]-6-[5-(3,5-dimethyl-1,2-oxazol-4-yl)-1-(4-methoxycyclohexyl)benzimidazol-2-yl]piperidin-2-one × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.2；293 K；0.056M Sodium phosphate monobasic monohydrate, 1.344M Potassium phosphate dibasic
|
分辨率 1.87 Å R-free 0.226 |
| 8FV2 Bromodomain of CBP liganded with CCS-1477 提交 2023-01-18 | Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 C
1082–1197（116 aa）
片段：bromodomain
|
未记录 | JHL (6S)-1-[3,4-bis(fluoranyl)phenyl]-6-[5-(3,5-dimethyl-1,2-oxazol-4-yl)-1-(4-methoxycyclohexyl)benzimidazol-2-yl]piperidin-2-one × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.2；293 K；0.056M Sodium phosphate monobasic monohydrate, 1.344M Potassium phosphate dibasic
|
分辨率 1.87 Å R-free 0.226 |
| 8FV2 Bromodomain of CBP liganded with CCS-1477 提交 2023-01-18 | Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 D
1082–1197（116 aa）
片段：bromodomain
|
未记录 | JHL (6S)-1-[3,4-bis(fluoranyl)phenyl]-6-[5-(3,5-dimethyl-1,2-oxazol-4-yl)-1-(4-methoxycyclohexyl)benzimidazol-2-yl]piperidin-2-one × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.2；293 K；0.056M Sodium phosphate monobasic monohydrate, 1.344M Potassium phosphate dibasic
|
分辨率 1.87 Å R-free 0.226 |
| 8FXA Bromodomain of CBP liganded with iCBP4 提交 2023-01-24 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1082–1197（116 aa）
片段：bromodomain
|
未记录 | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 YJY (6S)-1-[3,5-bis(trifluoromethyl)phenyl]-6-{(5M)-5-(3,5-dimethyl-1,2-oxazol-4-yl)-1-[(1s,4R)-4-methoxycyclohexyl]-1H-benzimidazol-2-yl}piperidin-2-one × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；291 K；0.2 M Magnesium chloride hexahydrate, 0.1 M BIS-TRIS pH 5.5, 25% w/v Polyethylene glycol 3350
|
分辨率 1.65 Å R-free 0.180 |
| 8FXA Bromodomain of CBP liganded with iCBP4 提交 2023-01-24 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1082–1197（116 aa）
片段：bromodomain
|
未记录 | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 YJY (6S)-1-[3,5-bis(trifluoromethyl)phenyl]-6-{(5M)-5-(3,5-dimethyl-1,2-oxazol-4-yl)-1-[(1s,4R)-4-methoxycyclohexyl]-1H-benzimidazol-2-yl}piperidin-2-one × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；291 K；0.2 M Magnesium chloride hexahydrate, 0.1 M BIS-TRIS pH 5.5, 25% w/v Polyethylene glycol 3350
|
分辨率 1.65 Å R-free 0.180 |
| 8FXE Bromodomain of CBP liganded with iCBP6 提交 2023-01-24 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1081–1197（117 aa）
片段：UNP residues 1081-1197
|
未记录 | YID (6S)-1-(3-tert-butylphenyl)-6-{(5P)-5-(3,5-dimethyl-1,2-oxazol-4-yl)-1-[(1s,4R)-4-methoxycyclohexyl]-1H-benzimidazol-2-yl}piperidin-2-one × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；292 K；0.2 M Sodium chloride, 0.1 M Tris pH 8.5, 25% w/v Polyethylene glycol 3350
|
分辨率 1.55 Å R-free 0.186 |
| 8FXN Bromodomain of CBP liganded with iCBP7 提交 2023-01-25 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1082–1197（116 aa）
片段：bromodomain
|
未记录 | YN0 tert-butyl {(1R,4s)-4-[(5M)-2-[(2S)-1-(3-tert-butylphenyl)-6-oxopiperidin-2-yl]-5-(3,5-dimethyl-1,2-oxazol-4-yl)-1H-benzimidazol-1-yl]cyclohexyl}carbamate × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；292 K；0.03M Sodium nitrate, 0.03 Sodium phosphate dibasic, 0.03M Ammonium sulfate, 0.1 M Imidazole, 0.1 M MES pH 6.5, 20% v/v PEG 500 MME; 10% w/v PEG 20000
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.242 |
| 8FXO Bromodomain of CBP liganded with iCBP8 提交 2023-01-25 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1082–1197（116 aa）
片段：bromodomain
|
未记录 | YN5 (6S)-1-(2,3-dihydro-1,4-benzodioxin-6-yl)-6-{(5M)-5-(3,5-dimethyl-1,2-oxazol-4-yl)-1-[(1s,4R)-4-methoxycyclohexyl]-1H-benzimidazol-2-yl}piperidin-2-one × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；292 K；0.2 M Sodium acetate trihydrate, 0.1 M TRIS hydrochloride pH 8.5, 30% w/v Polyethylene glycol 4000
|
分辨率 1.74 Å R-free 0.205 |
| 8G6T Bromodomain of CBP liganded with inhibitor iCBP2 提交 2023-02-15 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1082–1197（116 aa）
|
未记录 | YRI (6S)-1-(3,4-dibromophenyl)-6-{(5M)-5-(3,5-dimethyl-1,2-oxazol-4-yl)-1-[(1s,4R)-4-methoxycyclohexyl]-1H-benzimidazol-2-yl}piperidin-2-one × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；292 K；0.01 M Nickel(II) chloride hexahydrate, 0.1 M Tris pH 8.5, 20% w/v Polyethylene glycol monomethyl ether 2,000
|
分辨率 1.75 Å R-free 0.222 |
| 8G6T Bromodomain of CBP liganded with inhibitor iCBP2 提交 2023-02-15 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1082–1197（116 aa）
|
未记录 | YRI (6S)-1-(3,4-dibromophenyl)-6-{(5M)-5-(3,5-dimethyl-1,2-oxazol-4-yl)-1-[(1s,4R)-4-methoxycyclohexyl]-1H-benzimidazol-2-yl}piperidin-2-one × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；292 K；0.01 M Nickel(II) chloride hexahydrate, 0.1 M Tris pH 8.5, 20% w/v Polyethylene glycol monomethyl ether 2,000
|
分辨率 1.75 Å R-free 0.222 |
| 8G6T Bromodomain of CBP liganded with inhibitor iCBP2 提交 2023-02-15 | Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 C
1082–1197（116 aa）
|
未记录 | YRI (6S)-1-(3,4-dibromophenyl)-6-{(5M)-5-(3,5-dimethyl-1,2-oxazol-4-yl)-1-[(1s,4R)-4-methoxycyclohexyl]-1H-benzimidazol-2-yl}piperidin-2-one × 1 NI NICKEL (II) ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；292 K；0.01 M Nickel(II) chloride hexahydrate, 0.1 M Tris pH 8.5, 20% w/v Polyethylene glycol monomethyl ether 2,000
|
分辨率 1.75 Å R-free 0.222 |
| 8G6T Bromodomain of CBP liganded with inhibitor iCBP2 提交 2023-02-15 | Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 D
1082–1197（116 aa）
|
未记录 | YRI (6S)-1-(3,4-dibromophenyl)-6-{(5M)-5-(3,5-dimethyl-1,2-oxazol-4-yl)-1-[(1s,4R)-4-methoxycyclohexyl]-1H-benzimidazol-2-yl}piperidin-2-one × 1 NI NICKEL (II) ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；292 K；0.01 M Nickel(II) chloride hexahydrate, 0.1 M Tris pH 8.5, 20% w/v Polyethylene glycol monomethyl ether 2,000
|
分辨率 1.75 Å R-free 0.222 |
| 8GA2 Bromodomain of CBP liganded with inhibitor iCBP5 提交 2023-02-22 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1082–1197（116 aa）
片段：Bromodomain, residues 1082-1197
|
未记录 | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 YVK (6S)-6-{(5M)-5-(3,5-dimethyl-1,2-oxazol-4-yl)-1-[(1s,4R)-4-methoxycyclohexyl]-1H-benzimidazol-2-yl}-1-phenylpiperidin-2-one × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；292 K；0.2 M Magnesium chloride hexahydrate; 0.1 M TRIS hydrochloride pH 8.5; 30% w/v Polyethylene glycol 4,000
|
分辨率 1.85 Å R-free 0.225 |
| 8GA2 Bromodomain of CBP liganded with inhibitor iCBP5 提交 2023-02-22 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 D
1082–1197（116 aa）
片段：Bromodomain, residues 1082-1197
|
未记录 | YVK (6S)-6-{(5M)-5-(3,5-dimethyl-1,2-oxazol-4-yl)-1-[(1s,4R)-4-methoxycyclohexyl]-1H-benzimidazol-2-yl}-1-phenylpiperidin-2-one × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；292 K；0.2 M Magnesium chloride hexahydrate; 0.1 M TRIS hydrochloride pH 8.5; 30% w/v Polyethylene glycol 4,000
|
分辨率 1.85 Å R-free 0.225 |
| 8GA2 Bromodomain of CBP liganded with inhibitor iCBP5 提交 2023-02-22 | Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 C
1082–1197（116 aa）
片段：Bromodomain, residues 1082-1197
|
未记录 | YVK (6S)-6-{(5M)-5-(3,5-dimethyl-1,2-oxazol-4-yl)-1-[(1s,4R)-4-methoxycyclohexyl]-1H-benzimidazol-2-yl}-1-phenylpiperidin-2-one × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；292 K；0.2 M Magnesium chloride hexahydrate; 0.1 M TRIS hydrochloride pH 8.5; 30% w/v Polyethylene glycol 4,000
|
分辨率 1.85 Å R-free 0.225 |
| 8GA2 Bromodomain of CBP liganded with inhibitor iCBP5 提交 2023-02-22 | Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1082–1197（116 aa）
片段：Bromodomain, residues 1082-1197
|
未记录 | YVK (6S)-6-{(5M)-5-(3,5-dimethyl-1,2-oxazol-4-yl)-1-[(1s,4R)-4-methoxycyclohexyl]-1H-benzimidazol-2-yl}-1-phenylpiperidin-2-one × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；292 K；0.2 M Magnesium chloride hexahydrate; 0.1 M TRIS hydrochloride pH 8.5; 30% w/v Polyethylene glycol 4,000
|
分辨率 1.85 Å R-free 0.225 |
| 8HAL Cryo-EM structure of the CBP catalytic core bound to the H4K12acK16ac nucleosome, class 1 提交 2022-10-26 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric（11） 与全部聚合物一致 |
链 K
1084–1873（790 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.40 Å |
| 8HAM Cryo-EM structure of the CBP catalytic core bound to the H4K12acK16ac nucleosome, class 2 提交 2022-10-26 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric（11） 与全部聚合物一致 |
链 K
1084–1873（790 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.50 Å |
| 8HAN Cryo-EM structure of the CBP catalytic core bound to the H4K12acK16ac nucleosome, class 3 提交 2022-10-26 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric（11） 与全部聚合物一致 |
链 K
1084–1873（790 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.20 Å |
| 9GEJ Crystal structure of CREBBP bromodomain in complex with (2R,13S,E)-2-methyl-1,2,3,5,10,11,13,14,20,21,24,25-dodecahydro-19H,23H-16,18-etheno-9,13-methano-7,28-(metheno)[1,4]diazepino[2,3-k]pyrido[1,2-s][1,4]dioxa[7,19]diazacyclodocosine-4,8-dione 提交 2024-08-07 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1081–1197（117 aa）
|
未记录 | A1IKJ 2R,13S,E)-2-methyl-1,2,3,5,10,11,13,14,20,21,24,25-dodecahydro-19H,23H-16,18-etheno-9,13-methano-7,28-(metheno)[1,4]diazepino[2,3-k]pyrido[1,2-s][1,4]dioxa[7,19]diazacyclodocosine-4,8-dione × 1 SO4 SULFATE ION × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；0.3 M LiSO4, 0.1 M Tris pH 8, PEG 3350
|
分辨率 1.84 Å R-free 0.220 |
| 9GEJ Crystal structure of CREBBP bromodomain in complex with (2R,13S,E)-2-methyl-1,2,3,5,10,11,13,14,20,21,24,25-dodecahydro-19H,23H-16,18-etheno-9,13-methano-7,28-(metheno)[1,4]diazepino[2,3-k]pyrido[1,2-s][1,4]dioxa[7,19]diazacyclodocosine-4,8-dione 提交 2024-08-07 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1081–1197（117 aa）
|
未记录 | A1IKJ 2R,13S,E)-2-methyl-1,2,3,5,10,11,13,14,20,21,24,25-dodecahydro-19H,23H-16,18-etheno-9,13-methano-7,28-(metheno)[1,4]diazepino[2,3-k]pyrido[1,2-s][1,4]dioxa[7,19]diazacyclodocosine-4,8-dione × 1 SO4 SULFATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；0.3 M LiSO4, 0.1 M Tris pH 8, PEG 3350
|
分辨率 1.84 Å R-free 0.220 |
| 9GEJ Crystal structure of CREBBP bromodomain in complex with (2R,13S,E)-2-methyl-1,2,3,5,10,11,13,14,20,21,24,25-dodecahydro-19H,23H-16,18-etheno-9,13-methano-7,28-(metheno)[1,4]diazepino[2,3-k]pyrido[1,2-s][1,4]dioxa[7,19]diazacyclodocosine-4,8-dione 提交 2024-08-07 | Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 C
1081–1197（117 aa）
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；0.3 M LiSO4, 0.1 M Tris pH 8, PEG 3350
|
分辨率 1.84 Å R-free 0.220 |
| 9GEJ Crystal structure of CREBBP bromodomain in complex with (2R,13S,E)-2-methyl-1,2,3,5,10,11,13,14,20,21,24,25-dodecahydro-19H,23H-16,18-etheno-9,13-methano-7,28-(metheno)[1,4]diazepino[2,3-k]pyrido[1,2-s][1,4]dioxa[7,19]diazacyclodocosine-4,8-dione 提交 2024-08-07 | Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 D
1081–1197（117 aa）
|
未记录 | A1IKJ 2R,13S,E)-2-methyl-1,2,3,5,10,11,13,14,20,21,24,25-dodecahydro-19H,23H-16,18-etheno-9,13-methano-7,28-(metheno)[1,4]diazepino[2,3-k]pyrido[1,2-s][1,4]dioxa[7,19]diazacyclodocosine-4,8-dione × 1 SO4 SULFATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；0.3 M LiSO4, 0.1 M Tris pH 8, PEG 3350
|
分辨率 1.84 Å R-free 0.220 |
| 9GEJ Crystal structure of CREBBP bromodomain in complex with (2R,13S,E)-2-methyl-1,2,3,5,10,11,13,14,20,21,24,25-dodecahydro-19H,23H-16,18-etheno-9,13-methano-7,28-(metheno)[1,4]diazepino[2,3-k]pyrido[1,2-s][1,4]dioxa[7,19]diazacyclodocosine-4,8-dione 提交 2024-08-07 | Assembly 5 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 E
1081–1197（117 aa）
|
未记录 | A1IKJ 2R,13S,E)-2-methyl-1,2,3,5,10,11,13,14,20,21,24,25-dodecahydro-19H,23H-16,18-etheno-9,13-methano-7,28-(metheno)[1,4]diazepino[2,3-k]pyrido[1,2-s][1,4]dioxa[7,19]diazacyclodocosine-4,8-dione × 1 SO4 SULFATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；0.3 M LiSO4, 0.1 M Tris pH 8, PEG 3350
|
分辨率 1.84 Å R-free 0.220 |
| 9GEJ Crystal structure of CREBBP bromodomain in complex with (2R,13S,E)-2-methyl-1,2,3,5,10,11,13,14,20,21,24,25-dodecahydro-19H,23H-16,18-etheno-9,13-methano-7,28-(metheno)[1,4]diazepino[2,3-k]pyrido[1,2-s][1,4]dioxa[7,19]diazacyclodocosine-4,8-dione 提交 2024-08-07 | Assembly 6 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 F
1081–1197（117 aa）
|
未记录 | A1IKJ 2R,13S,E)-2-methyl-1,2,3,5,10,11,13,14,20,21,24,25-dodecahydro-19H,23H-16,18-etheno-9,13-methano-7,28-(metheno)[1,4]diazepino[2,3-k]pyrido[1,2-s][1,4]dioxa[7,19]diazacyclodocosine-4,8-dione × 1 SO4 SULFATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；0.3 M LiSO4, 0.1 M Tris pH 8, PEG 3350
|
分辨率 1.84 Å R-free 0.220 |
| 9GEJ Crystal structure of CREBBP bromodomain in complex with (2R,13S,E)-2-methyl-1,2,3,5,10,11,13,14,20,21,24,25-dodecahydro-19H,23H-16,18-etheno-9,13-methano-7,28-(metheno)[1,4]diazepino[2,3-k]pyrido[1,2-s][1,4]dioxa[7,19]diazacyclodocosine-4,8-dione 提交 2024-08-07 | Assembly 7 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 G
1081–1197（117 aa）
|
未记录 | A1IKJ 2R,13S,E)-2-methyl-1,2,3,5,10,11,13,14,20,21,24,25-dodecahydro-19H,23H-16,18-etheno-9,13-methano-7,28-(metheno)[1,4]diazepino[2,3-k]pyrido[1,2-s][1,4]dioxa[7,19]diazacyclodocosine-4,8-dione × 2 SO4 SULFATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；0.3 M LiSO4, 0.1 M Tris pH 8, PEG 3350
|
分辨率 1.84 Å R-free 0.220 |
| 9GET Crystal structure of CREBBP bromodomain in complex with (R,E)-6-(5-(7-methoxy-3,4-dihydroquinolin-1(2H)-yl)pent-1-en-1-yl)-4-methyl-8-(morpholine-4-carbonyl)-1,3,4,5-tetrahydro-2H-benzo[b][1,4]diazepin-2-one 提交 2024-08-07 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1081–1197（117 aa）
|
未记录 | A1IKM (4~{R})-6-[(~{E})-5-(7-methoxy-3,4-dihydro-2~{H}-quinolin-1-yl)pent-1-enyl]-4-methyl-8-morpholin-4-ylcarbonyl-1,3,4,5-tetrahydro-1,5-benzodiazepin-2-one × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；0.1 M HEPES pH 7.5, 25% PEG 3,350
|
分辨率 1.29 Å R-free 0.167 |
| 9GEU Crystal structure of CREBBP bromodomain in complex with (R,E)-2-methyl-1,2,3,5,10,11,17,18,21,22-decahydro-4H,16H,20H-13,15-etheno-7,25-(metheno)[1,4]diazepino[2,3-h]pyrido[1,2-p][1]oxa[4,16]diazacyclononadecine-4,8(9H)-dione 提交 2024-08-07 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1081–1197（117 aa）
|
未记录 | BU3 (R,R)-2,3-BUTANEDIOL × 2 A1IKL (R,E)-2-methyl-1,2,3,5,10,11,17,18,21,22-decahydro-4H,16H,20H-13,15-etheno-7,25-(metheno)[1,4]diazepino[2,3-h]pyrido[1,2-p][1]oxa[4,16]diazacyclononadecine-4,8(9H)-dione × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 3.5；277 K；0.1M citric acid, PEG 3350
|
分辨率 1.56 Å R-free 0.197 |
| 9GEU Crystal structure of CREBBP bromodomain in complex with (R,E)-2-methyl-1,2,3,5,10,11,17,18,21,22-decahydro-4H,16H,20H-13,15-etheno-7,25-(metheno)[1,4]diazepino[2,3-h]pyrido[1,2-p][1]oxa[4,16]diazacyclononadecine-4,8(9H)-dione 提交 2024-08-07 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1081–1197（117 aa）
|
未记录 | BU3 (R,R)-2,3-BUTANEDIOL × 1 A1IKL (R,E)-2-methyl-1,2,3,5,10,11,17,18,21,22-decahydro-4H,16H,20H-13,15-etheno-7,25-(metheno)[1,4]diazepino[2,3-h]pyrido[1,2-p][1]oxa[4,16]diazacyclononadecine-4,8(9H)-dione × 1 CIT CITRIC ACID × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 3.5；277 K；0.1M citric acid, PEG 3350
|
分辨率 1.56 Å R-free 0.197 |
| 9GEW Crystal structure of CREBBP bromodomain in complex with (R,E)-6-(5-(6-methoxy-2,3-dihydro-4H-benzo[b][1,4]oxazin-4-yl)pent-1-en-1-yl)-4-methyl-1,3,4,5-tetrahydro-2H-benzo[b][1,4]diazepin-2-one 提交 2024-08-07 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1081–1197（117 aa）
|
未记录 | A1IKI (4~{R})-6-[(~{E})-5-(6-methoxy-2,3-dihydro-1,4-benzoxazin-4-yl)pent-1-enyl]-4-methyl-1,3,4,5-tetrahydro-1,5-benzodiazepin-2-one × 1 BU3 (R,R)-2,3-BUTANEDIOL × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；5% Tacsimate pH 7, 0.1 M Hepes pH 7, 10% PEG monomethyl ether 5000
|
分辨率 1.47 Å R-free 0.198 |
| 9GEY Crystal structure of CREBBP bromodomain in complex with (R,E)-2-methyl-1,2,3,5,9,10,11,12,18,19,22,23-dodecahydro-17H,21H-14,16-etheno-7,26-(metheno)[1,4]diazepino[2,3-l]pyrido[2,1-d][1]oxa[5,17]diazacycloicosine-4,8-dione 提交 2024-08-07 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1081–1197（117 aa）
|
未记录 | A1IKK (R,E)-2-methyl-1,2,3,5,9,10,11,12,18,19,22,23-dodecahydro-17H,21H-14,16-etheno-7,26-(metheno)[1,4]diazepino[2,3-l]pyrido[2,1-d][1]oxa[5,17]diazacycloicosine-4,8-dione × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；0.2 M Ammonium acetate, 0.1 M Tris pH 8.5, 25% PEG 3,350
|
分辨率 1.56 Å R-free 0.211 |
| 9GEY Crystal structure of CREBBP bromodomain in complex with (R,E)-2-methyl-1,2,3,5,9,10,11,12,18,19,22,23-dodecahydro-17H,21H-14,16-etheno-7,26-(metheno)[1,4]diazepino[2,3-l]pyrido[2,1-d][1]oxa[5,17]diazacycloicosine-4,8-dione 提交 2024-08-07 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1081–1197（117 aa）
|
未记录 | A1IKK (R,E)-2-methyl-1,2,3,5,9,10,11,12,18,19,22,23-dodecahydro-17H,21H-14,16-etheno-7,26-(metheno)[1,4]diazepino[2,3-l]pyrido[2,1-d][1]oxa[5,17]diazacycloicosine-4,8-dione × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；0.2 M Ammonium acetate, 0.1 M Tris pH 8.5, 25% PEG 3,350
|
分辨率 1.56 Å R-free 0.211 |
| 9H02 Crystal structure of human CREBBP histone acetyltransferase domain in complex with a bisubstrate inhibitor, Lys-CoA 提交 2024-10-07 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1322–1555（234 aa）
链 A
1618–1700（83 aa）
|
突变：Y1503F 突变：Y1503F | 01K [(2R,3S,4R,5R)-5-(6-amino-9H-purin-9-yl)-4-hydroxy-3-(phosphonooxy)tetrahydrofuran-2-yl]methyl (3R,20R)-20-carbamoyl-3-hydroxy-2,2-dimethyl-4,8,14,22-tetraoxo-12-thia-5,9,15,21-tetraazatricos-1-yl dihydrogen diphosphate × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 6 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；291 K；0.1M (NH4)2SO4, 0.1 Na3 cit 5.6pH, 30% w/v PEG 4000
|
分辨率 2.03 Å R-free 0.224 |
| 9H0K Crystal structure of human CREBBP histone acetyltransferase domain in complex with Propionyl- Coenzyme A 提交 2024-10-08 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1322–1555（234 aa）
链 A
1618–1700（83 aa）
|
突变：Y1503F 突变：Y1503F | 1VU propionyl Coenzyme A × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；292 K；0.1M Na3 cit , 2.4M (NH4)2SO4
|
分辨率 1.75 Å R-free 0.240 |
| 9H0K Crystal structure of human CREBBP histone acetyltransferase domain in complex with Propionyl- Coenzyme A 提交 2024-10-08 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1322–1555（234 aa）
链 B
1618–1700（83 aa）
|
突变：Y1503F 突变：Y1503F | 1VU propionyl Coenzyme A × 1 SO4 SULFATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；292 K；0.1M Na3 cit , 2.4M (NH4)2SO4
|
分辨率 1.75 Å R-free 0.240 |
| 9IWL X-ray structure of human PPARalpha ligand binding domain-intrinsic fatty acid (E. coli origin)-CBP coactivator peptide co-crystals obtained by cross-seeding 提交 2024-07-25 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
62–80（19 aa）
|
未记录 | PLM PALMITIC ACID × 1 GOL GLYCEROL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；277 K；0.1M Tris (pH 8.5), 30% PEG 4000, 0.2M Sodium acetate trihydrate
|
分辨率 2.09 Å R-free 0.236 |
| 9J6O Crystal Structure of bromodomain of human CBP in complex with the inhibitor CZL-046 提交 2024-08-16 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1081–1197（117 aa）
片段：UNP RESIDUES 1081-1197
|
未记录 | A1L3S (3~{S},5~{S})-1-[3,4-bis(fluoranyl)phenyl]-5-[5-(3,5-dimethyl-1,2-oxazol-4-yl)-1-(4-methoxycyclohexyl)benzimidazol-2-yl]-3-fluoranyl-pyrrolidin-2-one × 1 CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；0.2 M Potassium sulfate, 20% w/v Polyethylene glycol 3,350
|
分辨率 2.67 Å R-free 0.290 |
| 9JUU X-ray crystal structure of Y16515 in CBP 提交 2024-10-08 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1081–1197（117 aa）
|
未记录 | A1EDN (5~{S})-1-(3-chloranyl-4-methoxy-phenyl)-5-[4-(3-methyl-1,2-benzoxazol-5-yl)-1-[(2~{R})-2-morpholin-4-ylpropyl]imidazol-2-yl]pyrrolidin-2-one × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 GOL GLYCEROL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；277 K；0.2 M Sodium citrate tribasic dihydrate, 0.1 M Sodium cacodylate trihydrate pH 6.5, 30% v/v 2-Propanol
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分辨率 1.48 Å R-free 0.219 |
| 9JUY X-ray crystal structure of Y16513 in CBP 提交 2024-10-08 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1081–1197（117 aa）
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未记录 | A1EDO (5~{S})-1-(3-chloranyl-4-methoxy-phenyl)-5-[4-(3-methyl-1,2-benzoxazol-5-yl)-1-[(2~{S})-2-morpholin-4-ylpropyl]imidazol-2-yl]pyrrolidin-2-one × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；0.2 M Sodium citrate tribasic dihydrate, 20% w/v Polyethylene glycol 3,350
|
分辨率 1.42 Å R-free 0.227 |