当前蛋白身份：Q93077
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一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 6C0W Cryo-EM structure of human kinetochore protein CENP-N with the centromeric nucleosome containing CENP-A 提交 2018-01-02 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric（11） 与全部聚合物一致 |
链 C
1–130（130 aa）
链 G
1–130（130 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.00 Å |
| 6MUO CENP-A nucleosome bound by two copies of CENP-C(CD) and one copy CENP-N(NT) 提交 2018-10-23 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：tridecameric（13） 与全部聚合物一致 |
链 C
14–118（105 aa）
链 G
14–118（105 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5；10 mM HEPES, 50 mN NaCl, 1 mM EDTA, 1mM DTT
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；Blot for 8 seconds before plunging
|
分辨率 3.60 Å |
| 6MUP CENP-A nucleosome bound by two copies of CENP-C(CD) and two copies CENP-N(NT) 提交 2018-10-23 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：tetradecameric（14） 与全部聚合物一致 |
链 C
14–118（105 aa）
链 G
14–118（105 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5；10 mM HEPES, 50 mN NaCl, 1 mM EDTA, 1mM DTT
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；Blot for 8 seconds before plunging
|
分辨率 3.50 Å |
| 6UPK Structure of FACT_subnucleosome complex 1 提交 2019-10-17 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric（10） 与全部聚合物一致 |
链 C
1–130（130 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.90 Å |
| 6UPL Structure of FACT_subnucleosome complex 2 提交 2019-10-17 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric（12） 与全部聚合物一致 |
链 C
1–130（130 aa）
链 K
1–130（130 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 7.40 Å |
| 7A08 CryoEM Structure of cGAS Nucleosome complex 提交 2020-08-07 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric（11） 与全部聚合物一致 |
链 b
2–130（129 aa）
链 f
2–130（129 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.11 Å |
| 7PII Structure of the human CCAN CENP-A alpha-satellite complex 提交 2021-08-19 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric（12） 与全部聚合物一致 |
链 C
1–130（130 aa）
链 G
1–130（130 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.68 Å |
| 7R5R Structure of the human CCAN CENP-A alpha-satellite complex 提交 2022-02-11 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric（12） 与全部聚合物一致 |
链 C
1–130（130 aa）
链 G
1–130（130 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.44 Å |
| 7U46 Cryo-EM structure of CENP-A nucleosome (palindromic alpha satellite DNA) in complex with CENP-N 提交 2022-02-28 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric（11） 与全部聚合物一致 |
链 C
1–130（130 aa）
链 G
1–130（130 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.68 Å |
| 7U47 CryoEM structure of CENP-N promoted nucleosome stacks with CENP-A and palindromic alpha satellite DNA sequence 提交 2022-02-28 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：22-meric（22） 与全部聚合物一致 |
链 C
1–130（130 aa）
链 G
1–130（130 aa）
链 N
1–130（130 aa）
链 R
1–130（130 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 7.50 Å |
| 7U4D CryoEM structure of CENP-N promoted nucleosome stacks with CENP-A and 601 DNA sequence 提交 2022-02-28 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：22-meric（22） 与全部聚合物一致 |
链 C
1–130（130 aa）
链 G
1–130（130 aa）
链 N
1–130（130 aa）
链 R
1–130（130 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 8.10 Å |
| 7Y8R The nucleosome-bound human PBAF complex 提交 2022-06-24 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 25 PDB 声明：27-meric（27） 与全部聚合物一致 |
链 C
2–130（129 aa）
链 G
2–130（129 aa）
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.40 Å |
| 7YWX Structure of the human CCAN CENP-A alpha-satellite complex 提交 2022-02-14 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 25 PDB 声明：27-meric（27） 与全部聚合物一致 |
链 C
1–130（130 aa）
链 G
1–130（130 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 12.00 Å |
| 7YYH Structure of the human CCANdeltaT CENP-A alpha-satellite complex 提交 2022-02-17 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 21 PDB 声明：23-meric（23） 与全部聚合物一致 |
链 C
1–130（130 aa）
链 G
1–130（130 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 8.90 Å |
| 8OO7 CryoEM Structure INO80core Hexasome complex composite model state1 提交 2023-04-04 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：18-meric（18） 与全部聚合物一致 |
链 O
2–130（129 aa）
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 7 ALF TETRAFLUOROALUMINATE ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5；30mM HEPES, pH7.5
50mM NaCl
0.25mM CaCl2
0.25mM DTT
2mM ADP
3.3mM MgCl2
10mM NaF
2mM AlCl3
0.05% octyl-beta-glucoside
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；wait time of 5s, blot force at 3, and a blot time of 2s with Whatman blotting paper (Cytiva, CAT No. 10311807)
|
分辨率 2.80 Å |
| 8OOA CryoEM Structure INO80core Hexasome complex Hexasome refinement state1 提交 2023-04-04 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：octameric（8） 与全部聚合物一致 |
链 O
2–130（129 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5；30mM HEPES, pH7.5
50mM NaCl
0.25mM CaCl2
0.25mM DTT
2mM ADP
3.3mM MgCl2
10mM NaF
2mM AlCl3
0.05% octyl-beta-glucoside
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；wait time of 5s, blot force at 3, and a blot time of 2s with Whatman blotting paper (Cytiva, CAT No. 10311807)
|
分辨率 3.18 Å |
| 8OOP CryoEM Structure INO80core Hexasome complex composite model state2 提交 2023-04-05 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：18-meric（18） 与全部聚合物一致 |
链 O
2–130（129 aa）
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 7 MG MAGNESIUM ION × 2 ALF TETRAFLUOROALUMINATE ION × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5；30mM HEPES, pH7.5
50mM NaCl
0.25mM CaCl2
0.25mM DTT
2mM ADP
3.3mM MgCl2
10mM NaF
2mM AlCl3
0.05% octyl-beta-glucoside
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；wait time of 5s, blot force at 3, and a blot time of 2s with Whatman blotting paper (Cytiva, CAT No. 10311807)
|
分辨率 2.70 Å |
| 8OOS CryoEM Structure INO80core Hexasome complex ATPase-hexasome refinement state 2 提交 2023-04-05 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：nonameric（9） 与全部聚合物一致 |
链 O
2–130（129 aa）
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ALF TETRAFLUOROALUMINATE ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5；30mM HEPES, pH7.5
50mM NaCl
0.25mM CaCl2
0.25mM DTT
2mM ADP
3.3mM MgCl2
10mM NaF
2mM AlCl3
0.05% octyl-beta-glucoside
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；wait time of 5s, blot force at 3, and a blot time of 2s with Whatman blotting paper (Cytiva, CAT No. 10311807)
|
分辨率 3.29 Å |
| 8OX0 Structure of apo telomeric nucleosome 提交 2023-04-28 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric（10） 与全部聚合物一致 |
链 C
1–130（130 aa）
链 G
1–130（130 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8；25 mM HEPES-KOH pH 8.0, 150 mM KCl, 1 mM MgCl2, 1% glycerol, 0.01% Igepal CA-630,1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；Blot Force: -15
Blot Time: 2.5 s
|
分辨率 2.52 Å |
| 8OX1 Structure of TRF1core in complex with telomeric nucleosome 提交 2023-04-28 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric（12） 与全部聚合物一致 |
链 C
1–130（130 aa）
链 G
1–130（130 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8；25 mM HEPES-KOH pH 8.0, 150 mM KCl, 1 mM MgCl2, 1% glycerol, 0.01% Igepal CA-630,
1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；Blot Force: -15
Blot Time: 2.5 s
|
分辨率 2.70 Å |
| 8X15 Structure of nucleosome-bound SRCAP-C in the apo state 提交 2023-11-06 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：25-meric（25） 与全部聚合物一致 |
链 A
1–130（130 aa）
链 E
1–130（130 aa）
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.20 Å |
| 8X19 Structure of nucleosome-bound SRCAP-C in the ADP-BeFx-bound state 提交 2023-11-06 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：25-meric（25） 与全部聚合物一致 |
链 A
1–130（130 aa）
链 E
1–130（130 aa）
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 7 MG MAGNESIUM ION × 1 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.20 Å |
| 8X1C Structure of nucleosome-bound SRCAP-C in the ADP-bound state 提交 2023-11-06 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：25-meric（25） 与全部聚合物一致 |
链 A
1–130（130 aa）
链 E
1–130（130 aa）
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 7 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.20 Å |
| 9EOZ Human OGG1 bound to a nucleosome core particle with 8-oxodGuo lesion at SHL6.0 提交 2024-03-16 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：11-meric（11） 与全部聚合物一致 |
链 G
2–130（129 aa）
链 L
2–130（129 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.10 Å |
| 9TAX Structure of the human inner kinetochore CCAN bound to a mono-CENP-A nucleosome 提交 2025-11-18 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 25 PDB 声明：27-meric（27） 与全部聚合物一致 |
链 e
1–130（130 aa）
链 i
1–130（130 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.50 Å |
| 9TAY Structure of the human inner kinetochore CCAN bound to a di-CENP-A nucleosome 提交 2025-11-18 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 35 PDB 声明：37-meric（37） 与全部聚合物一致 |
链 C
1–130（130 aa）
链 G
1–130（130 aa）
链 e
1–130（130 aa）
链 i
1–130（130 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 15.50 Å |