当前蛋白身份:Q96B97
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2BZ8 N-terminal Sh3 domain of CIN85 bound to Cbl-b peptide 提交 2005-08-12 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致 |
链 A
1–58(58 aa)
片段:N-TERMINAL SH3 DOMAIN RESIDUES 1-58
链 B
1–58(58 aa)
片段:N-TERMINAL SH3 DOMAIN RESIDUES 1-58
|
未记录 | NA SODIUM ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 7.5;0.8 M NA CITRATE, 0.1 M BIS-TRIS PH 7.5, 0.2 M NACL
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分辨率 2.00 Å R-free 0.271 |
| 2K6D CIN85 Sh3-C domain in complex with ubiquitin 提交 2008-07-07 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 A
267–328(62 aa)
片段:CIN85 SH3-C domain
|
未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 6.4;298 K;离子强度(mmCIF原始值)0.150;压力 ambient
NMR样品组成
0.1 mM CIN85, 0.1 mM [U-100% 15N] ubiquitin, 50 mM sodium phosphate, 2 mM DTT, 5 mM DSS, 150 mM sodium chloride, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
0.1 mM [U-100% 15N] CIN85, 0.1 mM ubiquitiny, 50 mM sodium phosphate, 2 mM DTT, 5 mM DSS, 150 mM sodium chloride, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
1.0 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] CIN85, 50 mM sodium phosphate, 2 mM DTT, 5 mM DSS, 150 mM sodium chloride, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
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分辨率未提供 |
| 2K9G Solution structure of the third SH3 domain of the Cin85 adapter protein 提交 2008-10-10 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致 |
链 A
262–333(72 aa)
片段:SH3 domain C, UNP residues 262-333
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未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 6.4;298 K;离子强度(mmCIF原始值)140;压力 ambient
NMR样品组成
1mM Cin85 SH3-C, 20mM sodium phosphate, 100mM sodium chloride, 1mM DTT, 1mM EDTA, 0.02% sodium azide, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
1mM [U-98% 13C; U-98% 15N] Cin85 SH3-C, 20mM sodium phosphate, 100mM sodium chloride, 1mM DTT, 1mM EDTA, 0.02% sodium azide, 100% D2O | 100% D2O
NMR样品组成
1mM [U-99% 15N] Cin85 SH3-C, 20mM sodium phosphate, 100mM sodium chloride, 1mM DTT, 1mM EDTA, 0.02% sodium azide, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
1mM [U-99% 13C; U-99% 15N] Cin85 SH3-C, 20mM sodium phosphate, 100mM sodium chloride, 1mM DTT, 1mM EDTA, 0.02% sodium azide, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
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分辨率未提供 |
| 2N64 NMR Structure of the C-terminal Coiled-Coil Domain of CIN85 提交 2015-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致 |
链 A
594–665(72 aa)
片段:Coiled coil domain residues 594-665
链 B
594–665(72 aa)
片段:Coiled coil domain residues 594-665
链 C
594–665(72 aa)
片段:Coiled coil domain residues 594-665
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未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 6.9;305 K;压力 ambient
NMR样品组成
1-3 mM [U-13C; U-15N; U-2H] CIN85 CC-domain, 95% H2O/5% D2O | 95% H2O/5% D2O
NMR样品组成
1-3 mM [U-13C; U-15N; U-2H] CIN85 CC-domain, 1-3 mM [U-2H] CIN85 CC-domain, 95% H2O/5% D2O | 95% H2O/5% D2O
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分辨率未提供 |
| 2O2O Solution structure of domain B from human CIN85 PROTEIN 提交 2006-11-30 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致 |
链 A
92–168(77 aa)
片段:CIN85_B
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未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 6.3;298 K;离子强度(mmCIF原始值)20mM PO4, 100mM NACL, 1mM EDTA, 2mM DTT, 0.01% NAN3;压力 AMBIENT
NMR样品组成
1MM CIN85_B U-15N PHOSPHATE BUFFER; 1MM CIN85_B U-15N,13C; 20MM PHOSPHATE BUFFER; 1MM CIN85_B U-15N,13C; 20MM PHOSPHATE BUFFER
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分辨率未提供 |
| 2YDL Crystal structure of SH3C from CIN85 提交 2011-03-22 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致 |
链 A
270–328(59 aa)
片段:SH3 C, RESIDUES 270-328
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
0.1M CITRATE PH 5.5, 2.0 M AMMONIUM SULPHATE
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分辨率 2.05 Å R-free 0.252 |
| 5ABS CRYSTAL STRUCTURE OF THE C-TERMINAL COILED-COIL DOMAIN OF CIN85 IN SPACE GROUP P321 提交 2015-08-07 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致 |
链 A
599–662(64 aa)
片段:COILED-COIL DOMAIN, RESIDUES 599-662
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非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | ZN ZINC ION × 12 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7;298 K;0.05M ZN ACETATE, 20% PEG3350, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, TEMPERATURE 298K, pH 7
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分辨率 1.74 Å R-free 0.283 |