当前蛋白身份:Q96B97 重新检索
本组结构的主要差异维度
构建体不同 突变/修饰不同 组装状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量指标不同

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相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
2BZ8 N-terminal Sh3 domain of CIN85 bound to Cbl-b peptide 提交 2005-08-12 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 A 1–58(58 aa) 片段:N-TERMINAL SH3 DOMAIN RESIDUES 1-58
链 B 1–58(58 aa) 片段:N-TERMINAL SH3 DOMAIN RESIDUES 1-58
未记录 NA SODIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7.5;0.8 M NA CITRATE, 0.1 M BIS-TRIS PH 7.5, 0.2 M NACL
分辨率 2.00 Å R-free 0.271
2K6D CIN85 Sh3-C domain in complex with ubiquitin 提交 2008-07-07 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 267–328(62 aa) 片段:CIN85 SH3-C domain
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 6.4;298 K;离子强度(mmCIF原始值)0.150;压力 ambient
NMR样品组成 0.1 mM CIN85, 0.1 mM [U-100% 15N] ubiquitin, 50 mM sodium phosphate, 2 mM DTT, 5 mM DSS, 150 mM sodium chloride, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 0.1 mM [U-100% 15N] CIN85, 0.1 mM ubiquitiny, 50 mM sodium phosphate, 2 mM DTT, 5 mM DSS, 150 mM sodium chloride, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 1.0 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] CIN85, 50 mM sodium phosphate, 2 mM DTT, 5 mM DSS, 150 mM sodium chloride, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
分辨率未提供
2K9G Solution structure of the third SH3 domain of the Cin85 adapter protein 提交 2008-10-10 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 262–333(72 aa) 片段:SH3 domain C, UNP residues 262-333
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 6.4;298 K;离子强度(mmCIF原始值)140;压力 ambient
NMR样品组成 1mM Cin85 SH3-C, 20mM sodium phosphate, 100mM sodium chloride, 1mM DTT, 1mM EDTA, 0.02% sodium azide, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 1mM [U-98% 13C; U-98% 15N] Cin85 SH3-C, 20mM sodium phosphate, 100mM sodium chloride, 1mM DTT, 1mM EDTA, 0.02% sodium azide, 100% D2O | 100% D2O
NMR样品组成 1mM [U-99% 15N] Cin85 SH3-C, 20mM sodium phosphate, 100mM sodium chloride, 1mM DTT, 1mM EDTA, 0.02% sodium azide, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 1mM [U-99% 13C; U-99% 15N] Cin85 SH3-C, 20mM sodium phosphate, 100mM sodium chloride, 1mM DTT, 1mM EDTA, 0.02% sodium azide, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
分辨率未提供
2N64 NMR Structure of the C-terminal Coiled-Coil Domain of CIN85 提交 2015-08-11 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 A 594–665(72 aa) 片段:Coiled coil domain residues 594-665
链 B 594–665(72 aa) 片段:Coiled coil domain residues 594-665
链 C 594–665(72 aa) 片段:Coiled coil domain residues 594-665
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 6.9;305 K;压力 ambient
NMR样品组成 1-3 mM [U-13C; U-15N; U-2H] CIN85 CC-domain, 95% H2O/5% D2O | 95% H2O/5% D2O
NMR样品组成 1-3 mM [U-13C; U-15N; U-2H] CIN85 CC-domain, 1-3 mM [U-2H] CIN85 CC-domain, 95% H2O/5% D2O | 95% H2O/5% D2O
分辨率未提供
2O2O Solution structure of domain B from human CIN85 PROTEIN 提交 2006-11-30 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 92–168(77 aa) 片段:CIN85_B
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 6.3;298 K;离子强度(mmCIF原始值)20mM PO4, 100mM NACL, 1mM EDTA, 2mM DTT, 0.01% NAN3;压力 AMBIENT
NMR样品组成 1MM CIN85_B U-15N PHOSPHATE BUFFER; 1MM CIN85_B U-15N,13C; 20MM PHOSPHATE BUFFER; 1MM CIN85_B U-15N,13C; 20MM PHOSPHATE BUFFER
分辨率未提供
2YDL Crystal structure of SH3C from CIN85 提交 2011-03-22 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 270–328(59 aa) 片段:SH3 C, RESIDUES 270-328
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 0.1M CITRATE PH 5.5, 2.0 M AMMONIUM SULPHATE
分辨率 2.05 Å R-free 0.252
5ABS CRYSTAL STRUCTURE OF THE C-TERMINAL COILED-COIL DOMAIN OF CIN85 IN SPACE GROUP P321 提交 2015-08-07 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 A 599–662(64 aa) 片段:COILED-COIL DOMAIN, RESIDUES 599-662
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) ZN ZINC ION × 12 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7;298 K;0.05M ZN ACETATE, 20% PEG3350, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, TEMPERATURE 298K, pH 7
分辨率 1.74 Å R-free 0.283