当前蛋白身份：Q96BN8
重新检索
差异标签只比较当前检索结果；所有PDB和assembly原始记录仍分别保留。
相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 3ZNV Crystal structure of the OTU domain of OTULIN at 1.3 Angstroms. 提交 2013-02-18 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
80–352（273 aa）
片段：OTU DOMAIN, RESIDUES 80-352
|
未记录 | GOL GLYCEROL × 4 CA CALCIUM ION × 1 CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 6.5；100 MM MES/IMIDAZOLE PH 6.5, 30 MM MGCL2, 30 MM CACL2, 10% PEG 4000, 20% GLYCEROL
|
分辨率 1.30 Å R-free 0.154 |
| 3ZNX Crystal structure of the OTU domain of OTULIN D336A mutant 提交 2013-02-18 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
80–352（273 aa）
片段：OTU DOMAIN, RESIDUES 80-352
|
突变：YES | CA CALCIUM ION × 1 CL CHLORIDE ION × 1 GOL GLYCEROL × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 6.5；100 MM MES/IMIDAZOLE PH 6.5, 30 MM MGCL2, 30 MM CACL2, 10% PEG 4,000, 20% GLYCEROL
|
分辨率 1.35 Å R-free 0.159 |
| 3ZNZ Crystal structure of OTULIN OTU domain (C129A) in complex with Met1- di ubiquitin 提交 2013-02-18 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
80–352（273 aa）
片段：OTU DOMAIN, RESIDUES 80-352
|
突变：YES | SO4 SULFATE ION × 7 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 6.5；100 MM BIS-TRIS, 2M (NH4)2SO4, PH 6.5
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.222 |
| 4KSJ Crystal structure of the OTU domain of Gumby/Fam105B at 1.6 angstrom 提交 2013-05-17 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
79–352（274 aa）
片段：OTU domain (unp residues 79-352)
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | BME BETA-MERCAPTOETHANOL × 1 GOL GLYCEROL × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；100mM MES, 200mM MgCl2, 19% PEG3350, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
|
分辨率 1.60 Å R-free 0.215 |
| 4KSK Gumby/Fam105B in complex with ubiquitin 提交 2013-05-17 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
55–352（298 aa）
片段：OTU domain (unp residues 55-352)
|
突变：C129S | SO4 SULFATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；298 K；100 mM Bis Tris, 200 mM AmSO4, 20% PEG3350, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.268 |
| 4KSK Gumby/Fam105B in complex with ubiquitin 提交 2013-05-17 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
55–352（298 aa）
片段：OTU domain (unp residues 55-352)
|
突变：C129S | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；298 K；100 mM Bis Tris, 200 mM AmSO4, 20% PEG3350, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.268 |
| 4KSL Gumby/Fam105B in complex with linear di-ubiquitin 提交 2013-05-17 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
79–352（274 aa）
片段：OTU domain (unp residues 79-352)
|
突变：C129A | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 5.5；298 K；100mM acetate, 100mM CaCl2, 100 mM glycine, 2.5M sodium formate, 24% PEG3350 , pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.83 Å R-free 0.254 |
| 4KSL Gumby/Fam105B in complex with linear di-ubiquitin 提交 2013-05-17 | Assembly 10 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 S
79–352（274 aa）
片段：OTU domain (unp residues 79-352)
|
突变：C129A | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 5.5；298 K；100mM acetate, 100mM CaCl2, 100 mM glycine, 2.5M sodium formate, 24% PEG3350 , pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.83 Å R-free 0.254 |
| 4KSL Gumby/Fam105B in complex with linear di-ubiquitin 提交 2013-05-17 | Assembly 11 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 U
79–352（274 aa）
片段：OTU domain (unp residues 79-352)
|
突变：C129A | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 5.5；298 K；100mM acetate, 100mM CaCl2, 100 mM glycine, 2.5M sodium formate, 24% PEG3350 , pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.83 Å R-free 0.254 |
| 4KSL Gumby/Fam105B in complex with linear di-ubiquitin 提交 2013-05-17 | Assembly 12 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 W
79–352（274 aa）
片段：OTU domain (unp residues 79-352)
|
突变：C129A | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 5.5；298 K；100mM acetate, 100mM CaCl2, 100 mM glycine, 2.5M sodium formate, 24% PEG3350 , pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.83 Å R-free 0.254 |
| 4KSL Gumby/Fam105B in complex with linear di-ubiquitin 提交 2013-05-17 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
79–352（274 aa）
片段：OTU domain (unp residues 79-352)
|
突变：C129A | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 5.5；298 K；100mM acetate, 100mM CaCl2, 100 mM glycine, 2.5M sodium formate, 24% PEG3350 , pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.83 Å R-free 0.254 |
| 4KSL Gumby/Fam105B in complex with linear di-ubiquitin 提交 2013-05-17 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 E
79–352（274 aa）
片段：OTU domain (unp residues 79-352)
|
突变：C129A | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 5.5；298 K；100mM acetate, 100mM CaCl2, 100 mM glycine, 2.5M sodium formate, 24% PEG3350 , pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.83 Å R-free 0.254 |
| 4KSL Gumby/Fam105B in complex with linear di-ubiquitin 提交 2013-05-17 | Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 G
79–352（274 aa）
片段：OTU domain (unp residues 79-352)
|
突变：C129A | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 5.5；298 K；100mM acetate, 100mM CaCl2, 100 mM glycine, 2.5M sodium formate, 24% PEG3350 , pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.83 Å R-free 0.254 |
| 4KSL Gumby/Fam105B in complex with linear di-ubiquitin 提交 2013-05-17 | Assembly 5 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 I
79–352（274 aa）
片段：OTU domain (unp residues 79-352)
|
突变：C129A | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 5.5；298 K；100mM acetate, 100mM CaCl2, 100 mM glycine, 2.5M sodium formate, 24% PEG3350 , pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.83 Å R-free 0.254 |
| 4KSL Gumby/Fam105B in complex with linear di-ubiquitin 提交 2013-05-17 | Assembly 6 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 K
79–352（274 aa）
片段：OTU domain (unp residues 79-352)
|
突变：C129A | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 5.5；298 K；100mM acetate, 100mM CaCl2, 100 mM glycine, 2.5M sodium formate, 24% PEG3350 , pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.83 Å R-free 0.254 |
| 4KSL Gumby/Fam105B in complex with linear di-ubiquitin 提交 2013-05-17 | Assembly 7 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 M
79–352（274 aa）
片段：OTU domain (unp residues 79-352)
|
突变：C129A | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 5.5；298 K；100mM acetate, 100mM CaCl2, 100 mM glycine, 2.5M sodium formate, 24% PEG3350 , pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.83 Å R-free 0.254 |
| 4KSL Gumby/Fam105B in complex with linear di-ubiquitin 提交 2013-05-17 | Assembly 8 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 O
79–352（274 aa）
片段：OTU domain (unp residues 79-352)
|
突变：C129A | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 5.5；298 K；100mM acetate, 100mM CaCl2, 100 mM glycine, 2.5M sodium formate, 24% PEG3350 , pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.83 Å R-free 0.254 |
| 4KSL Gumby/Fam105B in complex with linear di-ubiquitin 提交 2013-05-17 | Assembly 9 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 Q
79–352（274 aa）
片段：OTU domain (unp residues 79-352)
|
突变：C129A | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 5.5；298 K；100mM acetate, 100mM CaCl2, 100 mM glycine, 2.5M sodium formate, 24% PEG3350 , pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.83 Å R-free 0.254 |
| 4OYK Structure of HOIP PUB domain bound to OTULIN PIM 提交 2014-02-12 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 C
49–67（19 aa）
|
未记录 | CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.4；295 K；32% PEG 6000, 1M LiCl, 100 mM Tris pH 8.4
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.237 |
| 4OYK Structure of HOIP PUB domain bound to OTULIN PIM 提交 2014-02-12 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 D
49–67（19 aa）
|
未记录 | CL CHLORIDE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.4；295 K；32% PEG 6000, 1M LiCl, 100 mM Tris pH 8.4
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.237 |
| 4P0B Crystal structure of HOIP PUB domain in complex with OTULIN PIM 提交 2014-02-20 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
52–61（10 aa）
片段：UNP Residues 52-61
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；0,1M Tris, 20% 2-methyl-2,4-pentanediol, 15% Polyethyleneglycol 3350, pH 7.5
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.270 |
| 4P0B Crystal structure of HOIP PUB domain in complex with OTULIN PIM 提交 2014-02-20 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 D
52–61（10 aa）
片段：UNP Residues 52-61
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；0,1M Tris, 20% 2-methyl-2,4-pentanediol, 15% Polyethyleneglycol 3350, pH 7.5
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.270 |
| 5OE7 Structure of OTULIN bound to the Met1-linked diubiquitin activity probe 提交 2017-07-07 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
80–350（271 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；298 K；1.9-2.1 M Ammonium sulphate, 100 mM bis-tris
|
分辨率 2.95 Å R-free 0.309 |
| 6I9C Structure of the OTU domain of OTULIN G281R mutant 提交 2018-11-22 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
80–345（266 aa）
|
突变：G281R | GOL GLYCEROL × 4 CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.4；277 K；100 mM HEPES pH 7.4, 18 % (w/v) PEG 6,000, 1M LiCl
|
分辨率 1.77 Å R-free 0.179 |
| 6SAK Structure of the OTULINcat C129A - SNX27 PDZ domain complex. 提交 2019-07-17 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
80–352（273 aa）
|
突变：C129A | GOL GLYCEROL × 5 SO4 SULFATE ION × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.8；291 K；19% (w/v) PEG 3,350, 200 mM Li2(SO4), 100 mM Bis-Tris pH 6.8
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.253 |
| 6SAK Structure of the OTULINcat C129A - SNX27 PDZ domain complex. 提交 2019-07-17 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
80–352（273 aa）
|
突变：C129A | GOL GLYCEROL × 4 SO4 SULFATE ION × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.8；291 K；19% (w/v) PEG 3,350, 200 mM Li2(SO4), 100 mM Bis-Tris pH 6.8
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.253 |
| 9LZX Crystal structure of the OTU domain of OTULIN in complex with 11B6 提交 2025-02-22 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
80–345（266 aa）
|
未记录 | A1EMF 3-phenyl-5-prop-2-enylsulfanyl-4~{H}-1,2,4-triazole × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；PEG 3350,MES,magnesium chloride
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.251 |