当前蛋白身份:Q96BP3
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2A2N Crystal Structure of the peptidylprolyl isomerase domain of Human PPWD1 提交 2005-06-22 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致 |
链 A
473–646(174 aa)
片段:peptidylprolyl isomerase domain, RESIDUES 482-646
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5.7;298 K;1.7M NH4SO4, 0.1M sodium cacodylate pH 5.7, 0.2M sodium acetate, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
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分辨率 1.65 Å R-free 0.245 |
| 2A2N Crystal Structure of the peptidylprolyl isomerase domain of Human PPWD1 提交 2005-06-22 | Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致 |
链 B
473–646(174 aa)
片段:peptidylprolyl isomerase domain, RESIDUES 482-646
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5.7;298 K;1.7M NH4SO4, 0.1M sodium cacodylate pH 5.7, 0.2M sodium acetate, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.65 Å R-free 0.245 |
| 2A2N Crystal Structure of the peptidylprolyl isomerase domain of Human PPWD1 提交 2005-06-22 | Assembly 3 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致 |
链 C
473–646(174 aa)
片段:peptidylprolyl isomerase domain, RESIDUES 482-646
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未记录 | GOL GLYCEROL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5.7;298 K;1.7M NH4SO4, 0.1M sodium cacodylate pH 5.7, 0.2M sodium acetate, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.65 Å R-free 0.245 |
| 5YZG The Cryo-EM Structure of Human Catalytic Step I Spliceosome (C complex) at 4.1 angstrom resolution 提交 2017-12-14 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 51 PDB 声明:55-meric(55) 与全部聚合物一致 |
链 2
1–646(646 aa)
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未记录 | IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 7 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ZN ZINC ION × 7 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 4.10 Å |
| 7A5P Human C Complex Spliceosome - Medium-resolution PERIPHERY 提交 2020-08-21 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 44 PDB 声明:48-meric(48) 与全部聚合物一致 |
链 z
1–646(646 aa)
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未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 5.00 Å |
| 8I0W The cryo-EM structure of human C complex 提交 2023-01-11 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 53 PDB 声明:58-meric(58) 与全部聚合物一致 |
链 3
1–646(646 aa)
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未记录 | IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 5 ZN ZINC ION × 7 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 3.40 Å |
| 9FMD Integrative model of the human post-catalytic spliceosome (P-complex) 提交 2024-06-05 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 58 PDB 声明:63-meric(63) 与全部聚合物一致 |
链 w
1–646(646 aa)
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未记录 | MG MAGNESIUM ION × 6 K POTASSIUM ION × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 6 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 3.30 Å |