当前蛋白身份:Q96BP3 重新检索
本组结构的主要差异维度
构建体不同 突变/修饰不同 组装状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量指标不同

差异标签只比较当前检索结果;所有PDB和assembly原始记录仍分别保留。

相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
2A2N Crystal Structure of the peptidylprolyl isomerase domain of Human PPWD1 提交 2005-06-22 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 473–646(174 aa) 片段:peptidylprolyl isomerase domain, RESIDUES 482-646
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5.7;298 K;1.7M NH4SO4, 0.1M sodium cacodylate pH 5.7, 0.2M sodium acetate, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 1.65 Å R-free 0.245
2A2N Crystal Structure of the peptidylprolyl isomerase domain of Human PPWD1 提交 2005-06-22 Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 B 473–646(174 aa) 片段:peptidylprolyl isomerase domain, RESIDUES 482-646
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5.7;298 K;1.7M NH4SO4, 0.1M sodium cacodylate pH 5.7, 0.2M sodium acetate, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 1.65 Å R-free 0.245
2A2N Crystal Structure of the peptidylprolyl isomerase domain of Human PPWD1 提交 2005-06-22 Assembly 3 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 C 473–646(174 aa) 片段:peptidylprolyl isomerase domain, RESIDUES 482-646
未记录 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5.7;298 K;1.7M NH4SO4, 0.1M sodium cacodylate pH 5.7, 0.2M sodium acetate, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 1.65 Å R-free 0.245
5YZG The Cryo-EM Structure of Human Catalytic Step I Spliceosome (C complex) at 4.1 angstrom resolution 提交 2017-12-14 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 51 PDB 声明:55-meric(55) 与全部聚合物一致
链 2 1–646(646 aa)
未记录 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 7 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ZN ZINC ION × 7 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.10 Å
7A5P Human C Complex Spliceosome - Medium-resolution PERIPHERY 提交 2020-08-21 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 44 PDB 声明:48-meric(48) 与全部聚合物一致
链 z 1–646(646 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.00 Å
8I0W The cryo-EM structure of human C complex 提交 2023-01-11 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 53 PDB 声明:58-meric(58) 与全部聚合物一致
链 3 1–646(646 aa)
未记录 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 5 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
9FMD Integrative model of the human post-catalytic spliceosome (P-complex) 提交 2024-06-05 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 58 PDB 声明:63-meric(63) 与全部聚合物一致
链 w 1–646(646 aa)
未记录 MG MAGNESIUM ION × 6 K POTASSIUM ION × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 6 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å