当前蛋白身份:Q96EQ8
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 5DKA A C2HC zinc finger is essential for the activity of the RING ubiquitin ligase RNF125 提交 2015-09-03 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致 |
链 A
1–232(232 aa)
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突变:129 stop mutant | ZN ZINC ION × 3 CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
EVAPORATION;273 K;0.1 M HEPES, 10% PEG 8K
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分辨率 1.55 Å R-free 0.239 |
| 5DKA A C2HC zinc finger is essential for the activity of the RING ubiquitin ligase RNF125 提交 2015-09-03 | Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致 |
链 B
1–232(232 aa)
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突变:129 stop mutant | ZN ZINC ION × 3 CL CHLORIDE ION × 3 MG MAGNESIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
EVAPORATION;273 K;0.1 M HEPES, 10% PEG 8K
|
分辨率 1.55 Å R-free 0.239 |
| 8GBQ Structure of RNF125 in complex with UbcH5b 提交 2023-02-27 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 B
32–127(96 aa)
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未记录 | GOL GLYCEROL × 1 ZN ZINC ION × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 9.5;289 K;0.1 M CHES 9.5
20% PEG 8000
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分辨率 1.74 Å R-free 0.201 |
| 8GCB Structure of RNF125 in complex with a UbcH5b~Ub conjugate 提交 2023-03-01 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 B
32–127(96 aa)
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未记录 | ZN ZINC ION × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
MICROBATCH;pH 9;289 K;0.1 M BICINE pH 9.0, 20% PEG 6000
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分辨率 2.39 Å R-free 0.271 |