当前蛋白身份:Q96EQ8 重新检索
本组结构的主要差异维度
构建体不同 突变/修饰不同 组装状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量指标不同

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相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
5DKA A C2HC zinc finger is essential for the activity of the RING ubiquitin ligase RNF125 提交 2015-09-03 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 1–232(232 aa)
突变:129 stop mutant ZN ZINC ION × 3 CL CHLORIDE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 EVAPORATION;273 K;0.1 M HEPES, 10% PEG 8K
分辨率 1.55 Å R-free 0.239
5DKA A C2HC zinc finger is essential for the activity of the RING ubiquitin ligase RNF125 提交 2015-09-03 Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 B 1–232(232 aa)
突变:129 stop mutant ZN ZINC ION × 3 CL CHLORIDE ION × 3 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 EVAPORATION;273 K;0.1 M HEPES, 10% PEG 8K
分辨率 1.55 Å R-free 0.239
8GBQ Structure of RNF125 in complex with UbcH5b 提交 2023-02-27 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 B 32–127(96 aa)
未记录 GOL GLYCEROL × 1 ZN ZINC ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 9.5;289 K;0.1 M CHES 9.5 20% PEG 8000
分辨率 1.74 Å R-free 0.201
8GCB Structure of RNF125 in complex with a UbcH5b~Ub conjugate 提交 2023-03-01 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 B 32–127(96 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 MICROBATCH;pH 9;289 K;0.1 M BICINE pH 9.0, 20% PEG 6000
分辨率 2.39 Å R-free 0.271