当前蛋白身份:Q96LD8 重新检索
本组结构的主要差异维度
组装状态不同 实验环境不同 结构质量指标不同

差异标签只比较当前检索结果;所有PDB和assembly原始记录仍分别保留。

相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
1XT9 Crystal Structure of Den1 in complex with Nedd8 提交 2004-10-21 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 1–212(212 aa)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9;291 K;2M ammonium sulfate, 0.1M bicine, 4% tert-butanol, pH 9.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
分辨率 2.20 Å R-free 0.259
2BKQ NEDD8 protease 提交 2005-02-18 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 1–212(212 aa)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 9;NEDP1 (14MG/ML) WITH EQUAL VOLUME OF RESERVOIR SOLUTION CONTAINING 0.1M BICINE PH9.0, 30% PEG3000., pH 9.00
分辨率 2.00 Å R-free 0.250
2BKQ NEDD8 protease 提交 2005-02-18 Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 B 1–212(212 aa)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 9;NEDP1 (14MG/ML) WITH EQUAL VOLUME OF RESERVOIR SOLUTION CONTAINING 0.1M BICINE PH9.0, 30% PEG3000., pH 9.00
分辨率 2.00 Å R-free 0.250
2BKQ NEDD8 protease 提交 2005-02-18 Assembly 3 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 C 1–212(212 aa)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 9;NEDP1 (14MG/ML) WITH EQUAL VOLUME OF RESERVOIR SOLUTION CONTAINING 0.1M BICINE PH9.0, 30% PEG3000., pH 9.00
分辨率 2.00 Å R-free 0.250
2BKQ NEDD8 protease 提交 2005-02-18 Assembly 4 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 D 1–212(212 aa)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 9;NEDP1 (14MG/ML) WITH EQUAL VOLUME OF RESERVOIR SOLUTION CONTAINING 0.1M BICINE PH9.0, 30% PEG3000., pH 9.00
分辨率 2.00 Å R-free 0.250
2BKR NEDD8 NEDP1 complex 提交 2005-02-18 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 1–212(212 aa)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 4.5;CRYSTALS WERE GROWN BY SETTING-DROP METHOD BY MIXING THE NEDP1-NEDD8 COMPLEX (20MG/ML) WITH EQUAL VOLUME OF RESERVOIR SOLUTION CONTAINING 20%PEG8000, 200MM NACL, 100MM PHOSPHATE CITRATE PH4.5, pH 4.50
分辨率 1.90 Å R-free 0.209