当前蛋白身份:Q96LD8
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1XT9 Crystal Structure of Den1 in complex with Nedd8 提交 2004-10-21 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 A
1–212(212 aa)
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9;291 K;2M ammonium sulfate, 0.1M bicine, 4% tert-butanol, pH 9.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
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分辨率 2.20 Å R-free 0.259 |
| 2BKQ NEDD8 protease 提交 2005-02-18 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致 |
链 A
1–212(212 aa)
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 9;NEDP1 (14MG/ML) WITH EQUAL VOLUME OF RESERVOIR SOLUTION CONTAINING 0.1M BICINE PH9.0, 30% PEG3000., pH 9.00
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分辨率 2.00 Å R-free 0.250 |
| 2BKQ NEDD8 protease 提交 2005-02-18 | Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致 |
链 B
1–212(212 aa)
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 9;NEDP1 (14MG/ML) WITH EQUAL VOLUME OF RESERVOIR SOLUTION CONTAINING 0.1M BICINE PH9.0, 30% PEG3000., pH 9.00
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分辨率 2.00 Å R-free 0.250 |
| 2BKQ NEDD8 protease 提交 2005-02-18 | Assembly 3 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致 |
链 C
1–212(212 aa)
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 9;NEDP1 (14MG/ML) WITH EQUAL VOLUME OF RESERVOIR SOLUTION CONTAINING 0.1M BICINE PH9.0, 30% PEG3000., pH 9.00
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分辨率 2.00 Å R-free 0.250 |
| 2BKQ NEDD8 protease 提交 2005-02-18 | Assembly 4 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致 |
链 D
1–212(212 aa)
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 9;NEDP1 (14MG/ML) WITH EQUAL VOLUME OF RESERVOIR SOLUTION CONTAINING 0.1M BICINE PH9.0, 30% PEG3000., pH 9.00
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分辨率 2.00 Å R-free 0.250 |
| 2BKR NEDD8 NEDP1 complex 提交 2005-02-18 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 A
1–212(212 aa)
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 4.5;CRYSTALS WERE GROWN BY SETTING-DROP METHOD BY MIXING THE NEDP1-NEDD8 COMPLEX (20MG/ML) WITH EQUAL VOLUME OF RESERVOIR SOLUTION CONTAINING 20%PEG8000, 200MM NACL, 100MM PHOSPHATE CITRATE PH4.5, pH 4.50
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分辨率 1.90 Å R-free 0.209 |