当前蛋白身份：Q96QZ7
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| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1WBP SRPK1 bound to 9mer docking motif peptide 提交 2004-11-04 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
1382–1390（9 aa）
片段：RESIDUES 1382-1390
|
未记录 | ACT ACETATE ION × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 7；100MM SODIUM CITRATE PH5.6, 200MM AMMONIUM ACETATE, 15%PEG3350, 5MM PEPTIDE, 5MM ADP, 10MM MGCL2, pH 7.00
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.247 |
| 2KPK MAGI-1 PDZ1 提交 2009-10-16 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
455–580（126 aa）
片段：UNP residues 455-580
|
未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 6.8；295 K；压力 ambient
NMR样品组成
0.2-0.6mM MAGI-1 PDZ1-1, 0.02-0.10mM sodium phosphate-2, 50mM sodium chloride-3, 2mM DTT-4, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
0.2-0.6mM [U-15N] MAGI-1 PDZ1-5, 0.02-0.10mM sodium phosphate-6, 50mM sodium chloride-7, 2mM DTT-8, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
0.2-0.6mM [U-100% 13C; U-100% 15N] MAGI-1 PDZ1-9, 0.02-0.10mM sodium phosphate-10, 50mM sodium chloride-11, 2mM DTT-12, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
|
分辨率未提供 |
| 2KPL MAGI-1 PDZ1 / E6CT 提交 2009-10-16 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
455–580（126 aa）
片段：UNP residues 455-580
|
未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 6.8；295 K；压力 ambient
NMR样品组成
0.2-0.6mM MAGI-1 PDZ1-1, 0.02-0.10mM sodium phosphate-2, 50mM sodium chloride-3, 2mM DTT-4, 0.6-1.8mM E6CT-5, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
0.2-0.6mM [U-15N] MAGI-1 PDZ1-6, 0.02-0.10mM sodium phosphate-7, 50mM sodium chloride-8, 2mM DTT-9, 0.6-1.8mM E6CT-10, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
0.2-0.6mM [U-100% 13C; U-100% 15N] MAGI-1 PDZ1-11, 0.02-0.10mM sodium phosphate-12, 50mM sodium chloride-13, 2mM DTT-14, 0.6-1.8mM E6CT-15, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
|
分辨率未提供 |
| 2Q9V Crystal structure of the C890S mutant of the 4th PDZ domain of human membrane associated guanylate kinase 提交 2007-06-14 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
839–922（84 aa）
片段：4th PDZ Domain
|
突变：C890S | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；277 K；1:2 Protein:Well solution ratio, 20% PEG 3350, 10% Ethylene glycol, 200 mM Sodium acetate, 100 mM BTP pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.233 |
| 2R4H Crystal structure of a C1190S mutant of the 6th PDZ domain of human membrane associated guanylate kinase 提交 2007-08-31 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1149–1233（85 aa）
片段：6th PDZ domain: Residues 1149-1233
|
突变：C1190S | HIS HISTIDINE × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；277 K；20% PEG 3350, 0.1M Citrate pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.05 Å R-free 0.258 |
| 2R4H Crystal structure of a C1190S mutant of the 6th PDZ domain of human membrane associated guanylate kinase 提交 2007-08-31 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1149–1233（85 aa）
片段：6th PDZ domain: Residues 1149-1233
|
突变：C1190S | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；277 K；20% PEG 3350, 0.1M Citrate pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.05 Å R-free 0.258 |
| 2R4H Crystal structure of a C1190S mutant of the 6th PDZ domain of human membrane associated guanylate kinase 提交 2007-08-31 | Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 C
1149–1233（85 aa）
片段：6th PDZ domain: Residues 1149-1233
|
突变：C1190S | HIS HISTIDINE × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；277 K；20% PEG 3350, 0.1M Citrate pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.05 Å R-free 0.258 |
| 2YSD Solution structure of the first WW domain from the human membrane-associated guanylate kinase, WW and PDZ domain-containing protein 1. MAGI-1 提交 2007-04-03 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
295–338（44 aa）
片段：WW domain
|
未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 7；296 K；离子强度（mmCIF原始值）120mM；压力 ambient
NMR样品组成
1.2mM sample U-15N, 13C; 20mM d-Tris-HCl; 100mM NaCl; 1mM d-DTT; 0.02% NaN3; 90% H2O, 10% D2O | 90% H2O/10% D2O
|
分辨率未提供 |
| 2YSE Solution structure of the second WW domain from the human membrane-associated guanylate kinase, WW and PDZ domain-containing protein 1. MAGI-1 提交 2007-04-03 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
355–401（47 aa）
片段：WW domain
|
未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 7；296 K；离子强度（mmCIF原始值）120mM；压力 ambient
NMR样品组成
1.0mM sample U-15N, 13C; 20mM d-Tris-HCl; 100mM NaCl; 1mM d-DTT; 0.02% NaN3; 90% H2O, 10% D2O | 90% H2O/10% D2O
|
分辨率未提供 |
| 2ZAJ Solution structure of the short-isoform of the second WW domain from the human membrane-associated guanylate kinase, WW and PDZ domain-containing protein 1 (MAGI-1) 提交 2007-10-05 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
355–390（36 aa）
片段：WW 2 domain
|
未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 7；298 K；离子强度（mmCIF原始值）120mM；压力 ambient
NMR样品组成
0.7mM sample U-15N,13C; 20mM d-Tris-HCl; 100mM NaCl; 1mM d-DTT; 0.02% NaN3; 90% H2O, 10% D2O | 90% H2O/10% D2O
|
分辨率未提供 |
| 3BPU Crystal structure of the 3rd PDZ domain of human membrane associated guanylate kinase, C677S and C709S double mutant 提交 2007-12-19 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
640–721（82 aa）
片段：3rd PDZ domain: Residues 640-721
|
突变：C677S, C709S | ZN ZINC ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.2；293 K；0.05M Zn acetate pH 6.2, 30% PEG 3350, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
|
分辨率 1.60 Å R-free 0.251 |
| 5N7D MAGI-1 complexed with a RSK1 peptide 提交 2017-02-20 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
455–558（104 aa）
|
未记录 | GOL GLYCEROL × 3 CA CALCIUM ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5；296 K；8% PEG 400, 100 mM acetate buffer
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.227 |
| 5N7D MAGI-1 complexed with a RSK1 peptide 提交 2017-02-20 | Assembly 2 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
455–558（104 aa）
|
未记录 | GOL GLYCEROL × 2 CA CALCIUM ION × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5；296 K；8% PEG 400, 100 mM acetate buffer
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.227 |
| 5N7F MAGI-1 complexed with a pRSK1 peptide 提交 2017-02-20 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
454–558（105 aa）
|
未记录 | GOL GLYCEROL × 3 CA CALCIUM ION × 5 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；296 K；14% PEG 8000, 200 mM MgCl2, 100 mM TRIS
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.240 |
| 5N7F MAGI-1 complexed with a pRSK1 peptide 提交 2017-02-20 | Assembly 2 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
454–558（105 aa）
|
未记录 | GOL GLYCEROL × 3 CA CALCIUM ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；296 K；14% PEG 8000, 200 mM MgCl2, 100 mM TRIS
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.240 |
| 5N7G MAGI-1 complexed with a synthetic pRSK1 peptide 提交 2017-02-20 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
455–558（104 aa）
|
未记录 | GOL GLYCEROL × 3 CA CALCIUM ION × 6 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；296 K；14% PEG 8000, 200 mM MgCl2, 100 mM TRIS
|
分辨率 2.95 Å R-free 0.264 |
| 5N7G MAGI-1 complexed with a synthetic pRSK1 peptide 提交 2017-02-20 | Assembly 2 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
455–558（104 aa）
|
未记录 | GOL GLYCEROL × 2 CA CALCIUM ION × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；296 K；14% PEG 8000, 200 mM MgCl2, 100 mM TRIS
|
分辨率 2.95 Å R-free 0.264 |
| 6TWU MAGI1_2 complexed with a phosphomimetic 16E6 peptide 提交 2020-01-13 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
458–558（101 aa）
|
未记录 | GOL GLYCEROL × 2 CIT CITRIC ACID × 1 CA CALCIUM ION × 5 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；296 K；22% PEG3000, 100mM Na-citrate (pH5.5), 100mM Na-citrate
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.255 |
| 6TWU MAGI1_2 complexed with a phosphomimetic 16E6 peptide 提交 2020-01-13 | Assembly 2 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
458–558（101 aa）
|
未记录 | GOL GLYCEROL × 1 CIT CITRIC ACID × 2 CA CALCIUM ION × 6 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；296 K；22% PEG3000, 100mM Na-citrate (pH5.5), 100mM Na-citrate
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.255 |
| 6TWX MAGI1_2 complexed with a phosphorylated 16E6 peptide 提交 2020-01-13 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
455–558（104 aa）
|
未记录 | GOL GLYCEROL × 1 CIT CITRIC ACID × 1 CA CALCIUM ION × 5 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；296 K；22% PEG3000, 100mM Na-citrate (5.5), 100mM Na-citrate
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.259 |
| 6TWX MAGI1_2 complexed with a phosphorylated 16E6 peptide 提交 2020-01-13 | Assembly 2 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
455–558（104 aa）
|
未记录 | GOL GLYCEROL × 1 CIT CITRIC ACID × 2 CA CALCIUM ION × 6 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；296 K；22% PEG3000, 100mM Na-citrate (5.5), 100mM Na-citrate
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.259 |
| 6TWY MAGI1_2 complexed with a phosphomimetic RSK1 peptide 提交 2020-01-13 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
458–558（101 aa）
|
未记录 | GOL GLYCEROL × 2 CIT CITRIC ACID × 1 CA CALCIUM ION × 5 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；296 K；22% PEG3000, 100mM Na-citrate (pH 5.5), 100mM Na-citrate
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.250 |
| 6TWY MAGI1_2 complexed with a phosphomimetic RSK1 peptide 提交 2020-01-13 | Assembly 2 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
458–558（101 aa）
|
未记录 | GOL GLYCEROL × 1 CIT CITRIC ACID × 2 CA CALCIUM ION × 6 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；296 K；22% PEG3000, 100mM Na-citrate (pH 5.5), 100mM Na-citrate
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.250 |
| 7P71 The PDZ domain of MAGI1_2 complexed with the PDZ-binding motif of HPV35-E6 提交 2021-07-19 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
455–558（104 aa）
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 4 GOL GLYCEROL × 3 CIT CITRIC ACID × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；20-25% polyethylene glycol 3000, 100 mM sodium citrate buffered at pH 5.5 and 100 mM trisodium-citrate
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.281 |
| 7P71 The PDZ domain of MAGI1_2 complexed with the PDZ-binding motif of HPV35-E6 提交 2021-07-19 | Assembly 2 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
455–558（104 aa）
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 4 GOL GLYCEROL × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；20-25% polyethylene glycol 3000, 100 mM sodium citrate buffered at pH 5.5 and 100 mM trisodium-citrate
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.281 |