当前蛋白身份:Q9BXH1 重新检索
本组结构的主要差异维度
构建体不同 突变/修饰不同 组装状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量指标不同

差异标签只比较当前检索结果;所有PDB和assembly原始记录仍分别保留。

相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
2M04 Solution structure of BCL-xL in complex with PUMA BH3 peptide 提交 2012-10-19 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 B 130–154(25 aa)
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 7;298.1 K;离子强度(mmCIF原始值)50;压力 ambient
NMR样品组成 0.9 mM [U-100% 13C; U-100% 15N; U-95% 2H; Ile,Leu,Val C1H3] BCL-xL, 0.9 mM PUMA BH3, 92% H2O/8% D2O | 92% H2O/8% D2O
NMR样品组成 0.9 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] BCL-xL, 0.9 mM PUMA BH3, 92% H2O/8% D2O | 92% H2O/8% D2O
分辨率未提供
4HNJ Crystallographic structure of BCL-xL domain-swapped dimer in complex with PUMA BH3 peptide at 2.9A resolution 提交 2012-10-19 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 C 130–154(25 aa) 片段:BH3 domain peptide
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 4.6;291 K;0.2 M CaCl2, 0.1 M NaOAc, 20% V/V isopropanol, pH 4.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
分辨率 2.90 Å R-free 0.254
5UUL Human Bfl-1 in complex with PUMA BH3 提交 2017-02-17 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 B 132–154(23 aa) 片段:UNP residues 132-154
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7;298 K;1.8 M ammonium sulfate, 0.1 M MES pH 7.0
分辨率 1.33 Å R-free 0.155
6QFM Structure of human Mcl-1 in complex with PUMA BH3 peptide 提交 2019-01-10 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 B 127–149(23 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 3 CL CHLORIDE ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7;293 K;100 mM imidazole buffer pH 7.0, 50 mM zinc acetate and 20-25% polyethylene glycol (PEG) 3350
分辨率 2.00 Å R-free 0.261
6QG8 Structure of human Bcl-2 in complex with PUMA BH3 peptide 提交 2019-01-10 Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 B 127–149(23 aa)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 5.5;284 K;from 0.2M MgCl2, 25% PegMME 2k, 0.1M Na Acetate buffer pH 5.5
分辨率 1.90 Å R-free 0.216
6TQP Structural insight into tanapoxvirus mediated inhibition of apoptosis 提交 2019-12-17 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 B 130–155(26 aa)
未记录 NA SODIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;0.1 M Potassium thiocyanate, 30% PEG 2000MME
分辨率 1.85 Å R-free 0.218
7DVD The crystal structure of p53 DNA binding domain and PUMA complex 提交 2021-01-13 Assembly 5 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 E 136–150(15 aa)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7;293.15 K;0.1 M Tris (pH 7.0) 20% (w/w) PEG-200 MME
分辨率 2.59 Å R-free 0.318
7P0S ORF virus encoded Bcl-2 homolog ORFV125 in complex with Puma BH3 peptide 提交 2021-06-30 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致
链 C 130–155(26 aa)
链 U 130–155(26 aa)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;0.2 M Magnesium acetate, 25% PEG 3350
分辨率 2.50 Å R-free 0.286
7P9W Epstein-Barr virus encoded apoptosis regulator BHRF1 in complex with Puma BH3 提交 2021-07-28 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 B 130–155(26 aa)
未记录 PO4 PHOSPHATE ION × 3 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 6 NH4 AMMONIUM ION × 1 PDO 1,3-PROPANDIOL × 2 MG MAGNESIUM ION × 5 CL CHLORIDE ION × 6 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;0.4 M Ammonium phosphate monobasic
分辨率 2.00 Å R-free 0.257
7QTX Kaposi sarcoma associated herpes virus (KSHV) encoded apoptosis inhibitor, KsBcl-2 in complex with Puma BH3 提交 2022-01-17 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 B 130–155(26 aa)
未记录 BR BROMIDE ION × 3 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293 K;0.2 M sodium bromide, 0.1 M Bis-tris propane pH 6.5, 20% PEG 3350
分辨率 2.12 Å R-free 0.257