当前蛋白身份：Q9BYX4
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2RQB Solution structure of MDA5 CTD 提交 2009-03-17 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
896–1025（130 aa）
片段：UNP residues 896-1025
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未记录 | ZN ZINC ION × 1 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 7；298 K；离子强度（mmCIF原始值）0.25；压力 ambient
NMR样品组成
1mM [U-100% 13C; U-100% 15N] MDA5, 20mM Bis-Tris-2, 250mM sodium chloride-3, 10mM DTT-4, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
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分辨率未提供 |
| 3B6E Crystal structure of human DECH-box RNA Helicase MDA5 (Melanoma differentiation-associated protein 5), DECH-domain 提交 2007-10-29 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
277–490（214 aa）
片段：DECH domain: Residues 277-490
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未记录 | NA SODIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；298 K；1.2M Sodium citrate, 0.1M Tris-HCl, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
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分辨率 1.60 Å R-free 0.204 |
| 3GA3 Crystal structure of the C-terminal domain of human MDA5 提交 2009-02-16 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
893–1017（125 aa）
片段：C-terminal domain, residues 893-1017
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未记录 | ZN ZINC ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
EVAPORATION；pH 8.5；277 K；0.1 M Tris, 14 to 18% ethanol, pH 8.5, EVAPORATION, temperature 277K
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分辨率 1.45 Å R-free 0.204 |
| 4GL2 Structural Basis for dsRNA duplex backbone recognition by MDA5 提交 2012-08-13 | Assembly 1 蛋白–RNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：trimeric（3） 与全部聚合物一致 |
链 A
306–1017（712 aa）
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未记录 | ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 ZN ZINC ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
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分辨率 3.56 Å R-free 0.320 |
| 4GL2 Structural Basis for dsRNA duplex backbone recognition by MDA5 提交 2012-08-13 | Assembly 2 蛋白–RNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：trimeric（3） 与全部聚合物一致 |
链 B
306–1017（712 aa）
|
未记录 | ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 ZN ZINC ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 3.56 Å R-free 0.320 |
| 7DNI MDA5 CARDs-MAVS CARD polyUb complex 提交 2020-12-09 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric（16） 与蛋白数一致 |
链 A
1–208（208 aa）
链 B
1–208（208 aa）
链 C
1–208（208 aa）
链 D
1–208（208 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
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分辨率 3.20 Å |
| 7DNJ K63-polyUb MDA5CARDs complex 提交 2020-12-09 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric（12） 与蛋白数一致 |
链 A
1–208（208 aa）
链 B
1–208（208 aa）
链 C
1–208（208 aa）
链 D
1–208（208 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 OTHER
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分辨率 3.30 Å |
| 7JL0 Cryo-EM structure of MDA5-dsRNA in complex with TRIM65 PSpry domain (Monomer) 提交 2020-07-29 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric（4） 与全部聚合物一致 |
链 A
287–1025（739 aa）
片段：UNP residues 287-1025
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未记录 | ZN ZINC ION × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ALF TETRAFLUOROALUMINATE ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 4.30 Å |
| 7JL2 Cryo-EM structure of MDA5-dsRNA filament in complex with TRIM65 PSpry domain (Trimer) 提交 2020-07-29 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：octameric（8） 与全部聚合物一致 |
链 A
287–1025（739 aa）
片段：UNP residues 287-1025
链 C
287–1025（739 aa）
片段：UNP residues 287-1025
链 E
287–1025（739 aa）
片段：UNP residues 287-1025
|
未记录 | ZN ZINC ION × 3 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 3 ALF TETRAFLUOROALUMINATE ION × 3 MG MAGNESIUM ION × 3 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.30 Å |
| 9LOV LGP2:MDA5:dsRNA filament 提交 2025-01-23 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：pentameric（5） 与全部聚合物一致 |
链 B
287–1025（739 aa）
链 C
287–1025（739 aa）
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未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 3 ZN ZINC ION × 3 MG MAGNESIUM ION × 3 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 3.07 Å |