当前蛋白身份：Q9HAU4
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1ZVD Regulation of Smurf2 Ubiquitin Ligase Activity by Anchoring the E2 to the HECT domain 提交 2005-06-01 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
369–748（380 aa）
片段：HECT Domain
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非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | NA SODIUM ION × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.8；298 K；Sodium Phosphate, Potassium Phosphate, and Sodium Acetate, pH 6.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
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分辨率 2.10 Å R-free 0.248 |
| 2DJY Solution structure of Smurf2 WW3 domain-Smad7 PY peptide complex 提交 2006-04-06 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
297–333（37 aa）
片段：WW3 domain
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未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 7.2；298 K；压力 1
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分辨率未提供 |
| 2JQZ Solution Structure of the C2 domain of human Smurf2 提交 2007-06-15 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
10–140（131 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 7.2；298 K；离子强度（mmCIF原始值）0.2；压力 ambient
NMR样品组成
20 mM HEPES, 200 mM sodium chloride, 3 mM DTT, 0.03 % sodium azide, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
20 mM hepes, 200 mM sodium chloride, 3 mM DTT, 0.03 % sodium azide, 100% D2O | 100% D2O
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分辨率未提供 |
| 2KXQ Solution Structure of Smurf2 WW2 and WW3 bound to Smad7 PY motif containing peptide 提交 2010-05-11 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
250–333（84 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 7.2；298 K；离子强度（mmCIF原始值）235；压力 ambient
NMR样品组成
1.2 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] WW23, 1.2 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] S7PY, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
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分辨率未提供 |
| 2LTZ Smurf2 WW3 domain in complex with a Smad7 derived peptide 提交 2012-06-04 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
297–333（37 aa）
片段：WW3 domain (UNP residues 297-333)
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未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 7.2；285 K；压力 ambient
NMR样品组成
1 mM SMURF2WW3, 2 mM SMAD7, 20 mM [U-100% 2H] TRIS, 100 mM sodium chloride, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
1 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] SMURF2WW3, 3 mM SMAD7, 20 mM [U-100% 2H] TRIS, 100 mM sodium chloride, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
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分辨率未提供 |
| 6FX4 Disulfide between E3 HECT ligase Smurf2 and Ubiquitin G76C 提交 2018-03-08 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
631–745（115 aa）
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突变：C646A, C706N, C743S | GOL GLYCEROL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；1.36M tri-Sodium citrat pH6.5, 15% (v/v) Glycerol
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分辨率 2.50 Å R-free 0.239 |
| 6FX4 Disulfide between E3 HECT ligase Smurf2 and Ubiquitin G76C 提交 2018-03-08 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 C
631–745（115 aa）
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突变：C646A, C706N, C743S | GOL GLYCEROL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；1.36M tri-Sodium citrat pH6.5, 15% (v/v) Glycerol
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分辨率 2.50 Å R-free 0.239 |
| 7M3Q Structure of the Smurf2 HECT Domain with a High Affinity Ubiquitin Variant (UbV) 提交 2021-03-18 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
366–748（383 aa）
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未记录 | SO4 SULFATE ION × 2 NA SODIUM ION × 2 CL CHLORIDE ION × 6 DTT 2,3-DIHYDROXY-1,4-DITHIOBUTANE × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；298 K；1.5 M Ammonium Sulphate and 100 mM MES pH 6.0. Trypsin was added to the protein complex at a final concentration of 10 microgram per mL
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分辨率 2.50 Å R-free 0.235 |
| 9FSH Crystal structure of the HECT domain of Smurf 2 in complex with inhibitor 8 提交 2024-06-21 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
251–748（498 aa）
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未记录 | TJQ ethyl 5-[1,3-benzodioxol-5-ylmethyl(ethyl)carbamoyl]-2,4-dimethyl-1~{H}-pyrrole-3-carboxylate × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；1.5 M NaH2PO4/K2HPO4 pH 6.8, 100 mM NaOAc
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分辨率 2.08 Å R-free 0.259 |