当前蛋白身份：Q9NWZ3
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| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2NRU Crystal structure of IRAK-4 提交 2006-11-02 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
154–460（307 aa）
片段：Protein kinase
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | SO4 SULFATE ION × 1 T12 1-(3-HYDROXYPROPYL)-2-[(3-NITROBENZOYL)AMINO]-1H-BENZIMIDAZOL-5-YL PIVALATE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
EVAPORATION；pH 6.4；293 K；2.6 - 2.9 M ammonium sulfate, PH 6.4-7.9, EVAPORATION, temperature 293K
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.299 |
| 2NRU Crystal structure of IRAK-4 提交 2006-11-02 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
154–460（307 aa）
片段：Protein kinase
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | SO4 SULFATE ION × 1 T12 1-(3-HYDROXYPROPYL)-2-[(3-NITROBENZOYL)AMINO]-1H-BENZIMIDAZOL-5-YL PIVALATE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
EVAPORATION；pH 6.4；293 K；2.6 - 2.9 M ammonium sulfate, PH 6.4-7.9, EVAPORATION, temperature 293K
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.299 |
| 2NRU Crystal structure of IRAK-4 提交 2006-11-02 | Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 C
154–460（307 aa）
片段：Protein kinase
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | T12 1-(3-HYDROXYPROPYL)-2-[(3-NITROBENZOYL)AMINO]-1H-BENZIMIDAZOL-5-YL PIVALATE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
EVAPORATION；pH 6.4；293 K；2.6 - 2.9 M ammonium sulfate, PH 6.4-7.9, EVAPORATION, temperature 293K
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.299 |
| 2NRU Crystal structure of IRAK-4 提交 2006-11-02 | Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 D
154–460（307 aa）
片段：Protein kinase
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | T12 1-(3-HYDROXYPROPYL)-2-[(3-NITROBENZOYL)AMINO]-1H-BENZIMIDAZOL-5-YL PIVALATE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
EVAPORATION；pH 6.4；293 K；2.6 - 2.9 M ammonium sulfate, PH 6.4-7.9, EVAPORATION, temperature 293K
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.299 |
| 2NRY Crystal structure of IRAK-4 提交 2006-11-02 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
154–460（307 aa）
片段：Protein kinase
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | STU STAUROSPORINE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
EVAPORATION；pH 6.4；293 K；2.6 - 2.9 M ammonium sulfate, PH 6.4-7.9 , EVAPORATION, temperature 293K
|
分辨率 2.15 Å R-free 0.261 |
| 2NRY Crystal structure of IRAK-4 提交 2006-11-02 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
154–460（307 aa）
片段：Protein kinase
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | STU STAUROSPORINE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
EVAPORATION；pH 6.4；293 K；2.6 - 2.9 M ammonium sulfate, PH 6.4-7.9 , EVAPORATION, temperature 293K
|
分辨率 2.15 Å R-free 0.261 |
| 2NRY Crystal structure of IRAK-4 提交 2006-11-02 | Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 C
154–460（307 aa）
片段：Protein kinase
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | STU STAUROSPORINE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
EVAPORATION；pH 6.4；293 K；2.6 - 2.9 M ammonium sulfate, PH 6.4-7.9 , EVAPORATION, temperature 293K
|
分辨率 2.15 Å R-free 0.261 |
| 2NRY Crystal structure of IRAK-4 提交 2006-11-02 | Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 D
154–460（307 aa）
片段：Protein kinase
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | STU STAUROSPORINE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
EVAPORATION；pH 6.4；293 K；2.6 - 2.9 M ammonium sulfate, PH 6.4-7.9 , EVAPORATION, temperature 293K
|
分辨率 2.15 Å R-free 0.261 |
| 2O8Y Apo IRAK4 Kinase Domain 提交 2006-12-12 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
163–460（298 aa）
片段：IRAK4 kinase domain
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；1 uL protein(14.5 mg/mL in 50 mM Tris-HCl pH 7.6, 250 mM NaCl, 250 mM TCEP, and 100 mM EDTA supplemented with 2 mM ADP and 4 mM MgCl2 prior to crystallization) and 1 uL of reservoir solution (100 mM HEPES pH 7.5, 20-25% PEG 3350, 200 mM ammonium sulfate), VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.289 |
| 2O8Y Apo IRAK4 Kinase Domain 提交 2006-12-12 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
163–460（298 aa）
片段：IRAK4 kinase domain
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；1 uL protein(14.5 mg/mL in 50 mM Tris-HCl pH 7.6, 250 mM NaCl, 250 mM TCEP, and 100 mM EDTA supplemented with 2 mM ADP and 4 mM MgCl2 prior to crystallization) and 1 uL of reservoir solution (100 mM HEPES pH 7.5, 20-25% PEG 3350, 200 mM ammonium sulfate), VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.289 |
| 2OIB Crystal structure of IRAK4 kinase domain apo form 提交 2007-01-10 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
160–460（301 aa）
片段：KINASE DOMAIN
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；2.3M sodium malonate, 0.1M sodium acetate, 0.01M DTT, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.270 |
| 2OIB Crystal structure of IRAK4 kinase domain apo form 提交 2007-01-10 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
160–460（301 aa）
片段：KINASE DOMAIN
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；2.3M sodium malonate, 0.1M sodium acetate, 0.01M DTT, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.270 |
| 2OIB Crystal structure of IRAK4 kinase domain apo form 提交 2007-01-10 | Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 C
160–460（301 aa）
片段：KINASE DOMAIN
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；2.3M sodium malonate, 0.1M sodium acetate, 0.01M DTT, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.270 |
| 2OIB Crystal structure of IRAK4 kinase domain apo form 提交 2007-01-10 | Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 D
160–460（301 aa）
片段：KINASE DOMAIN
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；2.3M sodium malonate, 0.1M sodium acetate, 0.01M DTT, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.270 |
| 2OIC Crystal structure of IRAK4 kinase domain complexed with staurosporine 提交 2007-01-10 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
160–460（301 aa）
片段：kinase domain
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | STU STAUROSPORINE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；2.3M sodium malonate, 0.1M sodium acetate, 0.01M DTT, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.278 |
| 2OIC Crystal structure of IRAK4 kinase domain complexed with staurosporine 提交 2007-01-10 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
160–460（301 aa）
片段：kinase domain
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | STU STAUROSPORINE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；2.3M sodium malonate, 0.1M sodium acetate, 0.01M DTT, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.278 |
| 2OIC Crystal structure of IRAK4 kinase domain complexed with staurosporine 提交 2007-01-10 | Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 C
160–460（301 aa）
片段：kinase domain
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | STU STAUROSPORINE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；2.3M sodium malonate, 0.1M sodium acetate, 0.01M DTT, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.278 |
| 2OIC Crystal structure of IRAK4 kinase domain complexed with staurosporine 提交 2007-01-10 | Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 D
160–460（301 aa）
片段：kinase domain
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | STU STAUROSPORINE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；2.3M sodium malonate, 0.1M sodium acetate, 0.01M DTT, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.278 |
| 2OID Crystal structure of IRAK4 kinase domain complexed with AMPPNP 提交 2007-01-10 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
160–460（301 aa）
片段：kinase domain
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；2.3M sodium malonate, 0.1M sodium acetate, 0.01M DTT, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.295 |
| 2OID Crystal structure of IRAK4 kinase domain complexed with AMPPNP 提交 2007-01-10 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
160–460（301 aa）
片段：kinase domain
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；2.3M sodium malonate, 0.1M sodium acetate, 0.01M DTT, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.295 |
| 2OID Crystal structure of IRAK4 kinase domain complexed with AMPPNP 提交 2007-01-10 | Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 C
160–460（301 aa）
片段：kinase domain
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；2.3M sodium malonate, 0.1M sodium acetate, 0.01M DTT, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.295 |
| 2OID Crystal structure of IRAK4 kinase domain complexed with AMPPNP 提交 2007-01-10 | Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 D
160–460（301 aa）
片段：kinase domain
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；2.3M sodium malonate, 0.1M sodium acetate, 0.01M DTT, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.295 |
| 3MOP The ternary Death Domain complex of MyD88, IRAK4, and IRAK2 提交 2010-04-23 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：tetradecameric（14） 与蛋白数一致 |
链 G
4–106（103 aa）
片段：death domain residues 4-106
链 H
4–106（103 aa）
片段：death domain residues 4-106
链 I
4–106（103 aa）
片段：death domain residues 4-106
链 J
4–106（103 aa）
片段：death domain residues 4-106
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；100-250 mM MgCl2, 8-15 % ethanol, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 3.40 Å R-free 0.261 |
| 4RMZ Crystal Structure of IRAK-4 提交 2014-10-22 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
154–460（307 aa）
片段：UNP residues 154-460
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | T20 3-nitro-N-{1-phenyl-5-[(piperidin-1-yl)methyl]-1H-1,3-benzimidazol-2-yl}benzamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
EVAPORATION；pH 6.4；293 K；2.6 - 2.9 M ammonium sulfate, PH 6.4-7.9 , EVAPORATION, temperature 293K
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.296 |
| 4RMZ Crystal Structure of IRAK-4 提交 2014-10-22 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
154–460（307 aa）
片段：UNP residues 154-460
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | T20 3-nitro-N-{1-phenyl-5-[(piperidin-1-yl)methyl]-1H-1,3-benzimidazol-2-yl}benzamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
EVAPORATION；pH 6.4；293 K；2.6 - 2.9 M ammonium sulfate, PH 6.4-7.9 , EVAPORATION, temperature 293K
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.296 |
| 4U97 Crystal Structure of Asymmetric IRAK4 Dimer 提交 2014-08-05 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
154–460（307 aa）
链 B
154–460（307 aa）
|
突变：D311N 突变：D311N | STU STAUROSPORINE × 2 SO4 SULFATE ION × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；289 K；Set up at 10 mg/mL with staurosporine at a 2:1 molar ratio. Mixed with equal volumes 1.6-1.9 M ammonium sulfate, 100 mM
Hepes-NaOH at pH7.
|
分辨率 2.65 Å R-free 0.251 |
| 4U9A Sulphur Anomalous Crystal Structure of Asymmetric IRAK4 Dimer 提交 2014-08-05 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
154–460（307 aa）
链 B
154–460（307 aa）
|
突变：D311N 突变：D311N | STU STAUROSPORINE × 2 SO4 SULFATE ION × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；10 mg/ml IRAK4 mixed with staurosproine at a 2:1 molar excess. Protein solution mixed 1:1 with 1.6-1.9 M ammonium sulfate, 100 mM Hepes-NaOH at pH7.
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.240 |
| 4XS2 Irak4-inhibitor co-structure 提交 2015-01-21 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
160–460（301 aa）
片段：UNP residues 160-460
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 42P (1R,2S,3R,5R)-3-({5-(1,3-benzothiazol-2-yl)-6-chloro-2-[(3-methoxypropyl)amino]pyrimidin-4-yl}amino)-5-(hydroxymethyl)cyclopentane-1,2-diol × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；289 K；1.80 to 2.0 M Sodium Malonate pH 7.4, 0.2 M Sodium Acetate, 25 mM Hexamminecobalt(III)chloride, 0.05%w/v Pluronic-F-68
|
分辨率 2.73 Å R-free 0.285 |
| 4XS2 Irak4-inhibitor co-structure 提交 2015-01-21 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
160–460（301 aa）
片段：UNP residues 160-460
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 42P (1R,2S,3R,5R)-3-({5-(1,3-benzothiazol-2-yl)-6-chloro-2-[(3-methoxypropyl)amino]pyrimidin-4-yl}amino)-5-(hydroxymethyl)cyclopentane-1,2-diol × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；289 K；1.80 to 2.0 M Sodium Malonate pH 7.4, 0.2 M Sodium Acetate, 25 mM Hexamminecobalt(III)chloride, 0.05%w/v Pluronic-F-68
|
分辨率 2.73 Å R-free 0.285 |
| 4XS2 Irak4-inhibitor co-structure 提交 2015-01-21 | Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 C
160–460（301 aa）
片段：UNP residues 160-460
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 42P (1R,2S,3R,5R)-3-({5-(1,3-benzothiazol-2-yl)-6-chloro-2-[(3-methoxypropyl)amino]pyrimidin-4-yl}amino)-5-(hydroxymethyl)cyclopentane-1,2-diol × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；289 K；1.80 to 2.0 M Sodium Malonate pH 7.4, 0.2 M Sodium Acetate, 25 mM Hexamminecobalt(III)chloride, 0.05%w/v Pluronic-F-68
|
分辨率 2.73 Å R-free 0.285 |
| 4XS2 Irak4-inhibitor co-structure 提交 2015-01-21 | Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 D
160–460（301 aa）
片段：UNP residues 160-460
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 42P (1R,2S,3R,5R)-3-({5-(1,3-benzothiazol-2-yl)-6-chloro-2-[(3-methoxypropyl)amino]pyrimidin-4-yl}amino)-5-(hydroxymethyl)cyclopentane-1,2-diol × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；289 K；1.80 to 2.0 M Sodium Malonate pH 7.4, 0.2 M Sodium Acetate, 25 mM Hexamminecobalt(III)chloride, 0.05%w/v Pluronic-F-68
|
分辨率 2.73 Å R-free 0.285 |
| 4Y73 Crystal structure of IRAK4 kinase domain with inhibitor 提交 2015-02-13 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
160–460（301 aa）
片段：KINASE DOMAIN
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | XPY 5-{[(1R,2S)-2-aminocyclohexyl]amino}-N-[1-methyl-3-(trifluoromethyl)-1H-pyrazol-4-yl]pyrazolo[1,5-a]pyrimidine-3-carboxamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；291 K；0.03 M hexammine cobalt (III) chloride
0.2 M sodium acetate
0.05 w/v pluronic F-68
1.9 M sodium malonate pH 6.4
|
分辨率 2.14 Å R-free 0.217 |
| 4Y73 Crystal structure of IRAK4 kinase domain with inhibitor 提交 2015-02-13 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
160–460（301 aa）
片段：KINASE DOMAIN
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | XPY 5-{[(1R,2S)-2-aminocyclohexyl]amino}-N-[1-methyl-3-(trifluoromethyl)-1H-pyrazol-4-yl]pyrazolo[1,5-a]pyrimidine-3-carboxamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；291 K；0.03 M hexammine cobalt (III) chloride
0.2 M sodium acetate
0.05 w/v pluronic F-68
1.9 M sodium malonate pH 6.4
|
分辨率 2.14 Å R-free 0.217 |
| 4Y73 Crystal structure of IRAK4 kinase domain with inhibitor 提交 2015-02-13 | Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 C
160–460（301 aa）
片段：KINASE DOMAIN
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | XPY 5-{[(1R,2S)-2-aminocyclohexyl]amino}-N-[1-methyl-3-(trifluoromethyl)-1H-pyrazol-4-yl]pyrazolo[1,5-a]pyrimidine-3-carboxamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；291 K；0.03 M hexammine cobalt (III) chloride
0.2 M sodium acetate
0.05 w/v pluronic F-68
1.9 M sodium malonate pH 6.4
|
分辨率 2.14 Å R-free 0.217 |
| 4Y73 Crystal structure of IRAK4 kinase domain with inhibitor 提交 2015-02-13 | Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 D
160–460（301 aa）
片段：KINASE DOMAIN
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | XPY 5-{[(1R,2S)-2-aminocyclohexyl]amino}-N-[1-methyl-3-(trifluoromethyl)-1H-pyrazol-4-yl]pyrazolo[1,5-a]pyrimidine-3-carboxamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；291 K；0.03 M hexammine cobalt (III) chloride
0.2 M sodium acetate
0.05 w/v pluronic F-68
1.9 M sodium malonate pH 6.4
|
分辨率 2.14 Å R-free 0.217 |
| 4YO6 Irak4-inhibitor co-structure 提交 2015-03-11 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
160–460（301 aa）
片段：UNP residues 160-460
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 4GD N-(3-methyl-1-phenyl-1H-pyrazol-5-yl)pyrazolo[1,5-a]pyrimidine-3-carboxamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；289 K；1.80 to 2.0 M Sodium Malonate, 0.2 M Sodium Acetate, 25 mM Hexamminecobalt(III)chloride, 0.05%w/v Pluronic-F-68
|
分辨率 2.32 Å R-free 0.225 |
| 4YO6 Irak4-inhibitor co-structure 提交 2015-03-11 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
160–460（301 aa）
片段：UNP residues 160-460
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 4GD N-(3-methyl-1-phenyl-1H-pyrazol-5-yl)pyrazolo[1,5-a]pyrimidine-3-carboxamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；289 K；1.80 to 2.0 M Sodium Malonate, 0.2 M Sodium Acetate, 25 mM Hexamminecobalt(III)chloride, 0.05%w/v Pluronic-F-68
|
分辨率 2.32 Å R-free 0.225 |
| 4YO6 Irak4-inhibitor co-structure 提交 2015-03-11 | Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 C
160–460（301 aa）
片段：UNP residues 160-460
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 4GD N-(3-methyl-1-phenyl-1H-pyrazol-5-yl)pyrazolo[1,5-a]pyrimidine-3-carboxamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；289 K；1.80 to 2.0 M Sodium Malonate, 0.2 M Sodium Acetate, 25 mM Hexamminecobalt(III)chloride, 0.05%w/v Pluronic-F-68
|
分辨率 2.32 Å R-free 0.225 |
| 4YO6 Irak4-inhibitor co-structure 提交 2015-03-11 | Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 D
160–460（301 aa）
片段：UNP residues 160-460
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 4GD N-(3-methyl-1-phenyl-1H-pyrazol-5-yl)pyrazolo[1,5-a]pyrimidine-3-carboxamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；289 K；1.80 to 2.0 M Sodium Malonate, 0.2 M Sodium Acetate, 25 mM Hexamminecobalt(III)chloride, 0.05%w/v Pluronic-F-68
|
分辨率 2.32 Å R-free 0.225 |
| 4YP8 Irak4-inhibitor co-structure 提交 2015-03-12 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
160–460（301 aa）
片段：UNP residues 160-460
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 4GF N-{1-(4-cyclopropyl-2-fluorophenyl)-3-[1-(propan-2-yl)piperidin-4-yl]-1H-pyrazol-5-yl}pyrazolo[1,5-a]pyrimidine-3-carboxamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；289 K；1.80 to 2.0 M Sodium Malonate, 0.2 M Sodium Acetate, 25 mM Hexamminecobalt(III)chloride, 0.05%w/v Pluronic-F-68
|
分辨率 2.64 Å R-free 0.219 |
| 4YP8 Irak4-inhibitor co-structure 提交 2015-03-12 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
160–460（301 aa）
片段：UNP residues 160-460
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 4GF N-{1-(4-cyclopropyl-2-fluorophenyl)-3-[1-(propan-2-yl)piperidin-4-yl]-1H-pyrazol-5-yl}pyrazolo[1,5-a]pyrimidine-3-carboxamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；289 K；1.80 to 2.0 M Sodium Malonate, 0.2 M Sodium Acetate, 25 mM Hexamminecobalt(III)chloride, 0.05%w/v Pluronic-F-68
|
分辨率 2.64 Å R-free 0.219 |
| 4YP8 Irak4-inhibitor co-structure 提交 2015-03-12 | Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 C
160–460（301 aa）
片段：UNP residues 160-460
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 4GF N-{1-(4-cyclopropyl-2-fluorophenyl)-3-[1-(propan-2-yl)piperidin-4-yl]-1H-pyrazol-5-yl}pyrazolo[1,5-a]pyrimidine-3-carboxamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；289 K；1.80 to 2.0 M Sodium Malonate, 0.2 M Sodium Acetate, 25 mM Hexamminecobalt(III)chloride, 0.05%w/v Pluronic-F-68
|
分辨率 2.64 Å R-free 0.219 |
| 4YP8 Irak4-inhibitor co-structure 提交 2015-03-12 | Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 D
160–460（301 aa）
片段：UNP residues 160-460
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 4GF N-{1-(4-cyclopropyl-2-fluorophenyl)-3-[1-(propan-2-yl)piperidin-4-yl]-1H-pyrazol-5-yl}pyrazolo[1,5-a]pyrimidine-3-carboxamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；289 K；1.80 to 2.0 M Sodium Malonate, 0.2 M Sodium Acetate, 25 mM Hexamminecobalt(III)chloride, 0.05%w/v Pluronic-F-68
|
分辨率 2.64 Å R-free 0.219 |
| 4ZTL Irak4-inhibitor co-structure 提交 2015-05-14 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
160–460（301 aa）
片段：UNP residues 160-460
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 4S1 (1R,2S,3R,5R)-3-{[5-(1,3-benzothiazol-2-yl)-2-(propylamino)pyrimidin-4-yl]amino}-5-(hydroxymethyl)cyclopentane-1,2-diol × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；289 K；1.80 to 2.0 M Sodium Malonate, 0.2 M Sodium Acetate, 25 mM Hexamminecobalt(III)chloride, 0.05%w/v Pluronic-F-68
|
分辨率 2.39 Å R-free 0.251 |
| 4ZTL Irak4-inhibitor co-structure 提交 2015-05-14 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
160–460（301 aa）
片段：UNP residues 160-460
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 4S1 (1R,2S,3R,5R)-3-{[5-(1,3-benzothiazol-2-yl)-2-(propylamino)pyrimidin-4-yl]amino}-5-(hydroxymethyl)cyclopentane-1,2-diol × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；289 K；1.80 to 2.0 M Sodium Malonate, 0.2 M Sodium Acetate, 25 mM Hexamminecobalt(III)chloride, 0.05%w/v Pluronic-F-68
|
分辨率 2.39 Å R-free 0.251 |
| 4ZTL Irak4-inhibitor co-structure 提交 2015-05-14 | Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 C
160–460（301 aa）
片段：UNP residues 160-460
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 4S1 (1R,2S,3R,5R)-3-{[5-(1,3-benzothiazol-2-yl)-2-(propylamino)pyrimidin-4-yl]amino}-5-(hydroxymethyl)cyclopentane-1,2-diol × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；289 K；1.80 to 2.0 M Sodium Malonate, 0.2 M Sodium Acetate, 25 mM Hexamminecobalt(III)chloride, 0.05%w/v Pluronic-F-68
|
分辨率 2.39 Å R-free 0.251 |
| 4ZTL Irak4-inhibitor co-structure 提交 2015-05-14 | Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 D
160–460（301 aa）
片段：UNP residues 160-460
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 4S1 (1R,2S,3R,5R)-3-{[5-(1,3-benzothiazol-2-yl)-2-(propylamino)pyrimidin-4-yl]amino}-5-(hydroxymethyl)cyclopentane-1,2-diol × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；289 K；1.80 to 2.0 M Sodium Malonate, 0.2 M Sodium Acetate, 25 mM Hexamminecobalt(III)chloride, 0.05%w/v Pluronic-F-68
|
分辨率 2.39 Å R-free 0.251 |
| 4ZTM Irak4-inhibitor co-structure 提交 2015-05-14 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
160–460（301 aa）
片段：UNP residues 160-460
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 4S2 5-(1,3-benzothiazol-2-yl)-2-(cyclopropylamino)-6-{[(1R,2S,3R,4R)-2,3-dihydroxy-4-(hydroxymethyl)cyclopentyl]amino}pyrimidin-4(3H)-one × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；289 K；1.80 to 2.0 M Sodium Malonate, 0.2 M Sodium Acetate, 25 mM Hexamminecobalt(III)chloride, 0.05%w/v Pluronic-F-68
|
分辨率 2.66 Å R-free 0.226 |
| 4ZTM Irak4-inhibitor co-structure 提交 2015-05-14 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
160–460（301 aa）
片段：UNP residues 160-460
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 4S2 5-(1,3-benzothiazol-2-yl)-2-(cyclopropylamino)-6-{[(1R,2S,3R,4R)-2,3-dihydroxy-4-(hydroxymethyl)cyclopentyl]amino}pyrimidin-4(3H)-one × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；289 K；1.80 to 2.0 M Sodium Malonate, 0.2 M Sodium Acetate, 25 mM Hexamminecobalt(III)chloride, 0.05%w/v Pluronic-F-68
|
分辨率 2.66 Å R-free 0.226 |
| 4ZTM Irak4-inhibitor co-structure 提交 2015-05-14 | Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 C
160–460（301 aa）
片段：UNP residues 160-460
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 4S2 5-(1,3-benzothiazol-2-yl)-2-(cyclopropylamino)-6-{[(1R,2S,3R,4R)-2,3-dihydroxy-4-(hydroxymethyl)cyclopentyl]amino}pyrimidin-4(3H)-one × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；289 K；1.80 to 2.0 M Sodium Malonate, 0.2 M Sodium Acetate, 25 mM Hexamminecobalt(III)chloride, 0.05%w/v Pluronic-F-68
|
分辨率 2.66 Å R-free 0.226 |
| 4ZTM Irak4-inhibitor co-structure 提交 2015-05-14 | Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 D
160–460（301 aa）
片段：UNP residues 160-460
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 4S2 5-(1,3-benzothiazol-2-yl)-2-(cyclopropylamino)-6-{[(1R,2S,3R,4R)-2,3-dihydroxy-4-(hydroxymethyl)cyclopentyl]amino}pyrimidin-4(3H)-one × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；289 K；1.80 to 2.0 M Sodium Malonate, 0.2 M Sodium Acetate, 25 mM Hexamminecobalt(III)chloride, 0.05%w/v Pluronic-F-68
|
分辨率 2.66 Å R-free 0.226 |
| 4ZTN Irak4-inhibitor co-structure 提交 2015-05-14 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
160–460（301 aa）
片段：UNP residues 160-460
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 4S3 5-(1,3-benzothiazol-2-yl)-2-(morpholin-4-yl)-6-[(3R)-piperidin-3-ylamino]pyrimidin-4(3H)-one × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；289 K；1.80 to 2.0 M Sodium Malonate, 0.2 M Sodium Acetate, 25 mM Hexamminecobalt(III)chloride, 0.05%w/v Pluronic-F-68
|
分辨率 2.23 Å R-free 0.224 |
| 4ZTN Irak4-inhibitor co-structure 提交 2015-05-14 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
160–460（301 aa）
片段：UNP residues 160-460
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 4S3 5-(1,3-benzothiazol-2-yl)-2-(morpholin-4-yl)-6-[(3R)-piperidin-3-ylamino]pyrimidin-4(3H)-one × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；289 K；1.80 to 2.0 M Sodium Malonate, 0.2 M Sodium Acetate, 25 mM Hexamminecobalt(III)chloride, 0.05%w/v Pluronic-F-68
|
分辨率 2.23 Å R-free 0.224 |
| 4ZTN Irak4-inhibitor co-structure 提交 2015-05-14 | Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 C
160–460（301 aa）
片段：UNP residues 160-460
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 4S3 5-(1,3-benzothiazol-2-yl)-2-(morpholin-4-yl)-6-[(3R)-piperidin-3-ylamino]pyrimidin-4(3H)-one × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；289 K；1.80 to 2.0 M Sodium Malonate, 0.2 M Sodium Acetate, 25 mM Hexamminecobalt(III)chloride, 0.05%w/v Pluronic-F-68
|
分辨率 2.23 Å R-free 0.224 |
| 4ZTN Irak4-inhibitor co-structure 提交 2015-05-14 | Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 D
160–460（301 aa）
片段：UNP residues 160-460
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 4S3 5-(1,3-benzothiazol-2-yl)-2-(morpholin-4-yl)-6-[(3R)-piperidin-3-ylamino]pyrimidin-4(3H)-one × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；289 K；1.80 to 2.0 M Sodium Malonate, 0.2 M Sodium Acetate, 25 mM Hexamminecobalt(III)chloride, 0.05%w/v Pluronic-F-68
|
分辨率 2.23 Å R-free 0.224 |
| 5K72 IRAK4 in complex with Compound 21 提交 2016-05-25 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
160–460（301 aa）
片段：UNP residues 160-460
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | SO4 SULFATE ION × 2 6QY ~{N}4,~{N}4-dimethyl-~{N}1-[5-(oxan-4-yl)-7~{H}-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl]cyclohexane-1,4-diamine × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；2.5 M ammonium sulfate, 0.1 M Hepes pH 7.2
|
分辨率 2.22 Å R-free 0.225 |
| 5K72 IRAK4 in complex with Compound 21 提交 2016-05-25 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
160–460（301 aa）
片段：UNP residues 160-460
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | SO4 SULFATE ION × 3 6QY ~{N}4,~{N}4-dimethyl-~{N}1-[5-(oxan-4-yl)-7~{H}-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl]cyclohexane-1,4-diamine × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；2.5 M ammonium sulfate, 0.1 M Hepes pH 7.2
|
分辨率 2.22 Å R-free 0.225 |
| 5K72 IRAK4 in complex with Compound 21 提交 2016-05-25 | Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 C
160–460（301 aa）
片段：UNP residues 160-460
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 6QY ~{N}4,~{N}4-dimethyl-~{N}1-[5-(oxan-4-yl)-7~{H}-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl]cyclohexane-1,4-diamine × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；2.5 M ammonium sulfate, 0.1 M Hepes pH 7.2
|
分辨率 2.22 Å R-free 0.225 |
| 5K72 IRAK4 in complex with Compound 21 提交 2016-05-25 | Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 D
160–460（301 aa）
片段：UNP residues 160-460
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 6QY ~{N}4,~{N}4-dimethyl-~{N}1-[5-(oxan-4-yl)-7~{H}-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl]cyclohexane-1,4-diamine × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；2.5 M ammonium sulfate, 0.1 M Hepes pH 7.2
|
分辨率 2.22 Å R-free 0.225 |
| 5K75 IRAK4 in complex with Compound 1 提交 2016-05-25 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
160–460（301 aa）
片段：UNP residues 160-460
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 6QX ~{N}1-(7,8-dihydro-6~{H}-cyclopenta[2,3]thieno[2,4-~{c}]pyrimidin-1-yl)-~{N}4,~{N}4-dimethyl-cyclohexane-1,4-diamine × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；2.5 ammonium sulfate, 0.1 M Hepes pH 7.2
|
分辨率 2.03 Å R-free 0.253 |
| 5K75 IRAK4 in complex with Compound 1 提交 2016-05-25 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
160–460（301 aa）
片段：UNP residues 160-460
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 6QX ~{N}1-(7,8-dihydro-6~{H}-cyclopenta[2,3]thieno[2,4-~{c}]pyrimidin-1-yl)-~{N}4,~{N}4-dimethyl-cyclohexane-1,4-diamine × 1 SO4 SULFATE ION × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；2.5 ammonium sulfate, 0.1 M Hepes pH 7.2
|
分辨率 2.03 Å R-free 0.253 |
| 5K75 IRAK4 in complex with Compound 1 提交 2016-05-25 | Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 C
160–460（301 aa）
片段：UNP residues 160-460
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 6QX ~{N}1-(7,8-dihydro-6~{H}-cyclopenta[2,3]thieno[2,4-~{c}]pyrimidin-1-yl)-~{N}4,~{N}4-dimethyl-cyclohexane-1,4-diamine × 1 SO4 SULFATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；2.5 ammonium sulfate, 0.1 M Hepes pH 7.2
|
分辨率 2.03 Å R-free 0.253 |
| 5K75 IRAK4 in complex with Compound 1 提交 2016-05-25 | Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 D
160–460（301 aa）
片段：UNP residues 160-460
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 6QX ~{N}1-(7,8-dihydro-6~{H}-cyclopenta[2,3]thieno[2,4-~{c}]pyrimidin-1-yl)-~{N}4,~{N}4-dimethyl-cyclohexane-1,4-diamine × 1 SO4 SULFATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；2.5 ammonium sulfate, 0.1 M Hepes pH 7.2
|
分辨率 2.03 Å R-free 0.253 |
| 5K76 IRAK4 in complex with Compound 28 提交 2016-05-25 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
160–460（301 aa）
片段：UNP residues 160-460
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 6R1 ~{N}-(4-morpholin-4-ylcyclohexyl)-5-(oxan-4-yl)-7~{H}-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-amine × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.2；293 K；2.5 M ammonium sulfate, 0.1 M Hepes
|
分辨率 2.74 Å R-free 0.246 |
| 5K76 IRAK4 in complex with Compound 28 提交 2016-05-25 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
160–460（301 aa）
片段：UNP residues 160-460
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 6R1 ~{N}-(4-morpholin-4-ylcyclohexyl)-5-(oxan-4-yl)-7~{H}-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-amine × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.2；293 K；2.5 M ammonium sulfate, 0.1 M Hepes
|
分辨率 2.74 Å R-free 0.246 |
| 5K7G IRAK4 in complex with AZ3862 提交 2016-05-26 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
160–460（301 aa）
片段：UNP residues 160-460
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | SO4 SULFATE ION × 2 6R0 (3~{a}~{S},7~{a}~{R})-1-methyl-5-[4-[[5-(oxan-4-yl)-7~{H}-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl]amino]cyclohexyl]-3,3~{a},4,6,7,7~{a}-hexahydropyrrolo[3,2-c]pyridin-2-one × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.2；293 K；2.5 M ammonium sulfate, 0.1 M Hepes
|
分辨率 2.23 Å R-free 0.227 |
| 5K7G IRAK4 in complex with AZ3862 提交 2016-05-26 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
160–460（301 aa）
片段：UNP residues 160-460
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | SO4 SULFATE ION × 2 6R0 (3~{a}~{S},7~{a}~{R})-1-methyl-5-[4-[[5-(oxan-4-yl)-7~{H}-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl]amino]cyclohexyl]-3,3~{a},4,6,7,7~{a}-hexahydropyrrolo[3,2-c]pyridin-2-one × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.2；293 K；2.5 M ammonium sulfate, 0.1 M Hepes
|
分辨率 2.23 Å R-free 0.227 |
| 5K7G IRAK4 in complex with AZ3862 提交 2016-05-26 | Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 C
160–460（301 aa）
片段：UNP residues 160-460
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 6R0 (3~{a}~{S},7~{a}~{R})-1-methyl-5-[4-[[5-(oxan-4-yl)-7~{H}-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl]amino]cyclohexyl]-3,3~{a},4,6,7,7~{a}-hexahydropyrrolo[3,2-c]pyridin-2-one × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.2；293 K；2.5 M ammonium sulfate, 0.1 M Hepes
|
分辨率 2.23 Å R-free 0.227 |
| 5K7G IRAK4 in complex with AZ3862 提交 2016-05-26 | Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 D
160–460（301 aa）
片段：UNP residues 160-460
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | SO4 SULFATE ION × 1 6R0 (3~{a}~{S},7~{a}~{R})-1-methyl-5-[4-[[5-(oxan-4-yl)-7~{H}-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl]amino]cyclohexyl]-3,3~{a},4,6,7,7~{a}-hexahydropyrrolo[3,2-c]pyridin-2-one × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.2；293 K；2.5 M ammonium sulfate, 0.1 M Hepes
|
分辨率 2.23 Å R-free 0.227 |
| 5K7I IRAK4 in complex with AZ3864 提交 2016-05-26 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
160–460（301 aa）
片段：UNP residues 160-460
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 6QZ (3~{a}~{R},7~{a}~{S})-1-methyl-5-[4-[[5-(oxan-4-yl)-7~{H}-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl]amino]cyclohexyl]-3,3~{a},4,6,7,7~{a}-hexahydropyrrolo[3,2-c]pyridin-2-one × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.2；293 K；2.5 M ammonium sulfate, 0.1 M Hepes
|
分辨率 2.31 Å R-free 0.257 |
| 5K7I IRAK4 in complex with AZ3864 提交 2016-05-26 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
160–460（301 aa）
片段：UNP residues 160-460
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 6QZ (3~{a}~{R},7~{a}~{S})-1-methyl-5-[4-[[5-(oxan-4-yl)-7~{H}-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl]amino]cyclohexyl]-3,3~{a},4,6,7,7~{a}-hexahydropyrrolo[3,2-c]pyridin-2-one × 1 SO4 SULFATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.2；293 K；2.5 M ammonium sulfate, 0.1 M Hepes
|
分辨率 2.31 Å R-free 0.257 |
| 5KX7 Irak4-inhibitor co-structure 提交 2016-07-20 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
160–460（301 aa）
片段：kinase domain (UNP residues 160-460)
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；289 K；1.80 to 2.0 M Sodium Malonate, 0.2 M Sodium Acetate, 25 mM Hexamminecobalt(III)chloride, 0.05%w/v Pluronic-F-68
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.250 |
| 5KX7 Irak4-inhibitor co-structure 提交 2016-07-20 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
160–460（301 aa）
片段：kinase domain (UNP residues 160-460)
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 6YD ~{N}-(3-aminocarbonyl-1-methyl-pyrazol-4-yl)-6-(1-methylpyrazol-4-yl)pyridine-2-carboxamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；289 K；1.80 to 2.0 M Sodium Malonate, 0.2 M Sodium Acetate, 25 mM Hexamminecobalt(III)chloride, 0.05%w/v Pluronic-F-68
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.250 |
| 5KX8 Irak4-inhibitor co-structure 提交 2016-07-20 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
160–460（301 aa）
片段：kinase domain (UNP residues 160-460)
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 6YE ~{N}-(3-aminocarbonyl-1-methyl-pyrazol-4-yl)-5-piperazin-1-yl-pyrazolo[1,5-a]pyrimidine-3-carboxamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；289 K；1.80 to 2.0 M Sodium Malonate, 0.2 M Sodium Acetate, 25 mM Hexamminecobalt(III)chloride, 0.05%w/v Pluronic-F-68
|
分辨率 2.67 Å R-free 0.233 |
| 5KX8 Irak4-inhibitor co-structure 提交 2016-07-20 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
160–460（301 aa）
片段：kinase domain (UNP residues 160-460)
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 6YE ~{N}-(3-aminocarbonyl-1-methyl-pyrazol-4-yl)-5-piperazin-1-yl-pyrazolo[1,5-a]pyrimidine-3-carboxamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；289 K；1.80 to 2.0 M Sodium Malonate, 0.2 M Sodium Acetate, 25 mM Hexamminecobalt(III)chloride, 0.05%w/v Pluronic-F-68
|
分辨率 2.67 Å R-free 0.233 |
| 5KX8 Irak4-inhibitor co-structure 提交 2016-07-20 | Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 C
160–460（301 aa）
片段：kinase domain (UNP residues 160-460)
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 6YE ~{N}-(3-aminocarbonyl-1-methyl-pyrazol-4-yl)-5-piperazin-1-yl-pyrazolo[1,5-a]pyrimidine-3-carboxamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；289 K；1.80 to 2.0 M Sodium Malonate, 0.2 M Sodium Acetate, 25 mM Hexamminecobalt(III)chloride, 0.05%w/v Pluronic-F-68
|
分辨率 2.67 Å R-free 0.233 |
| 5KX8 Irak4-inhibitor co-structure 提交 2016-07-20 | Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 D
160–460（301 aa）
片段：kinase domain (UNP residues 160-460)
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 6YE ~{N}-(3-aminocarbonyl-1-methyl-pyrazol-4-yl)-5-piperazin-1-yl-pyrazolo[1,5-a]pyrimidine-3-carboxamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；289 K；1.80 to 2.0 M Sodium Malonate, 0.2 M Sodium Acetate, 25 mM Hexamminecobalt(III)chloride, 0.05%w/v Pluronic-F-68
|
分辨率 2.67 Å R-free 0.233 |
| 5T1S Irak4 kinase - compound 1 co-structure 提交 2016-08-22 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
160–460（301 aa）
片段：UNP residues 160-460
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 76Q 5-[3-(3,5-dimethylphenyl)-4-[4-(methylamino)butyl]quinolin-6-yl]pyridin-3-ol × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；289 K；.80 to 2.0 M Sodium Malonate 0.2 M Sodium Acetate 25 mM Hexamminecobalt(III)chloride 0.05%w/v Pluronic-F-68
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.223 |
| 5T1S Irak4 kinase - compound 1 co-structure 提交 2016-08-22 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
160–460（301 aa）
片段：UNP residues 160-460
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 76Q 5-[3-(3,5-dimethylphenyl)-4-[4-(methylamino)butyl]quinolin-6-yl]pyridin-3-ol × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；289 K；.80 to 2.0 M Sodium Malonate 0.2 M Sodium Acetate 25 mM Hexamminecobalt(III)chloride 0.05%w/v Pluronic-F-68
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.223 |
| 5T1S Irak4 kinase - compound 1 co-structure 提交 2016-08-22 | Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 C
160–460（301 aa）
片段：UNP residues 160-460
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 76Q 5-[3-(3,5-dimethylphenyl)-4-[4-(methylamino)butyl]quinolin-6-yl]pyridin-3-ol × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；289 K；.80 to 2.0 M Sodium Malonate 0.2 M Sodium Acetate 25 mM Hexamminecobalt(III)chloride 0.05%w/v Pluronic-F-68
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.223 |
| 5T1S Irak4 kinase - compound 1 co-structure 提交 2016-08-22 | Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 D
160–460（301 aa）
片段：UNP residues 160-460
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 76Q 5-[3-(3,5-dimethylphenyl)-4-[4-(methylamino)butyl]quinolin-6-yl]pyridin-3-ol × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；289 K；.80 to 2.0 M Sodium Malonate 0.2 M Sodium Acetate 25 mM Hexamminecobalt(III)chloride 0.05%w/v Pluronic-F-68
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.223 |
| 5T1T Irak4 kinase - compound 1 co-structure 提交 2016-08-22 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
160–460（301 aa）
片段：UNP residues 160-460
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 76P ~{N},~{N}-dimethyl-4-(6-nitroquinazolin-4-yl)oxy-cyclohexan-1-amine × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；289 K；1.80 to 2.0 M Sodium Malonate 0.2 M Sodium Acetate 25 mM Hexamminecobalt(III)chloride 0.05%w/v Pluronic-F-68
|
分辨率 2.34 Å R-free 0.228 |
| 5T1T Irak4 kinase - compound 1 co-structure 提交 2016-08-22 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
160–460（301 aa）
片段：UNP residues 160-460
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 76P ~{N},~{N}-dimethyl-4-(6-nitroquinazolin-4-yl)oxy-cyclohexan-1-amine × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；289 K；1.80 to 2.0 M Sodium Malonate 0.2 M Sodium Acetate 25 mM Hexamminecobalt(III)chloride 0.05%w/v Pluronic-F-68
|
分辨率 2.34 Å R-free 0.228 |
| 5T1T Irak4 kinase - compound 1 co-structure 提交 2016-08-22 | Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 C
160–460（301 aa）
片段：UNP residues 160-460
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 76P ~{N},~{N}-dimethyl-4-(6-nitroquinazolin-4-yl)oxy-cyclohexan-1-amine × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；289 K；1.80 to 2.0 M Sodium Malonate 0.2 M Sodium Acetate 25 mM Hexamminecobalt(III)chloride 0.05%w/v Pluronic-F-68
|
分辨率 2.34 Å R-free 0.228 |
| 5T1T Irak4 kinase - compound 1 co-structure 提交 2016-08-22 | Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 D
160–460（301 aa）
片段：UNP residues 160-460
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 76P ~{N},~{N}-dimethyl-4-(6-nitroquinazolin-4-yl)oxy-cyclohexan-1-amine × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；289 K；1.80 to 2.0 M Sodium Malonate 0.2 M Sodium Acetate 25 mM Hexamminecobalt(III)chloride 0.05%w/v Pluronic-F-68
|
分辨率 2.34 Å R-free 0.228 |
| 5UIQ Crystal structure of IRAK4 in complex with compound 9 提交 2017-01-14 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
154–460（307 aa）
片段：UNP residues 154-460
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 8BV 2-[(propan-2-yl)oxy]benzamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；1.6-1.8 M Ammonium Citrate, pH 7.0
|
分辨率 2.64 Å R-free 0.226 |
| 5UIQ Crystal structure of IRAK4 in complex with compound 9 提交 2017-01-14 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
154–460（307 aa）
片段：UNP residues 154-460
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 8BV 2-[(propan-2-yl)oxy]benzamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；1.6-1.8 M Ammonium Citrate, pH 7.0
|
分辨率 2.64 Å R-free 0.226 |
| 5UIQ Crystal structure of IRAK4 in complex with compound 9 提交 2017-01-14 | Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 C
154–460（307 aa）
片段：UNP residues 154-460
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 8BV 2-[(propan-2-yl)oxy]benzamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；1.6-1.8 M Ammonium Citrate, pH 7.0
|
分辨率 2.64 Å R-free 0.226 |
| 5UIQ Crystal structure of IRAK4 in complex with compound 9 提交 2017-01-14 | Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 D
154–460（307 aa）
片段：UNP residues 154-460
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 8BV 2-[(propan-2-yl)oxy]benzamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；1.6-1.8 M Ammonium Citrate, pH 7.0
|
分辨率 2.64 Å R-free 0.226 |
| 5UIR Crystal structure of IRAK4 in complex with compound 11 提交 2017-01-14 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
154–460（307 aa）
片段：UNP residues 154-460
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 8BY 5-(4-cyanophenyl)-3-[(propan-2-yl)oxy]naphthalene-2-carboxamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；1.6-1.8M Ammonium Citrate, pH 7.0
|
分辨率 2.64 Å R-free 0.277 |
| 5UIR Crystal structure of IRAK4 in complex with compound 11 提交 2017-01-14 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
154–460（307 aa）
片段：UNP residues 154-460
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 8BY 5-(4-cyanophenyl)-3-[(propan-2-yl)oxy]naphthalene-2-carboxamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；1.6-1.8M Ammonium Citrate, pH 7.0
|
分辨率 2.64 Å R-free 0.277 |
| 5UIS Crystal structure of IRAK4 in complex with compound 12 提交 2017-01-14 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
154–460（307 aa）
片段：UNP residues 154-460
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 8C1 4-{[(3R)-piperidin-3-yl]oxy}-6-[(propan-2-yl)oxy]quinoline-7-carboxamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；1.6-1.6M Ammonium Citrate, pH 7.0
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.250 |
| 5UIS Crystal structure of IRAK4 in complex with compound 12 提交 2017-01-14 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
154–460（307 aa）
片段：UNP residues 154-460
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 8C1 4-{[(3R)-piperidin-3-yl]oxy}-6-[(propan-2-yl)oxy]quinoline-7-carboxamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；1.6-1.6M Ammonium Citrate, pH 7.0
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.250 |
| 5UIS Crystal structure of IRAK4 in complex with compound 12 提交 2017-01-14 | Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 C
154–460（307 aa）
片段：UNP residues 154-460
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 8C1 4-{[(3R)-piperidin-3-yl]oxy}-6-[(propan-2-yl)oxy]quinoline-7-carboxamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；1.6-1.6M Ammonium Citrate, pH 7.0
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.250 |
| 5UIS Crystal structure of IRAK4 in complex with compound 12 提交 2017-01-14 | Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 D
154–460（307 aa）
片段：UNP residues 154-460
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 8C1 4-{[(3R)-piperidin-3-yl]oxy}-6-[(propan-2-yl)oxy]quinoline-7-carboxamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；1.6-1.6M Ammonium Citrate, pH 7.0
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.250 |
| 5UIT Crystal structure of IRAK4 in complex with compound 14 提交 2017-01-14 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
154–460（307 aa）
片段：UNP residues 154-460
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 8CD 1-{[(2S)-5-oxopyrrolidin-2-yl]methoxy}-7-[(propan-2-yl)oxy]isoquinoline-6-carboxamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；1.6-1.8 M Ammonium Citrate, pH7.0
|
分辨率 1.84 Å R-free 0.218 |
| 5UIT Crystal structure of IRAK4 in complex with compound 14 提交 2017-01-14 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
154–460（307 aa）
片段：UNP residues 154-460
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 8CD 1-{[(2S)-5-oxopyrrolidin-2-yl]methoxy}-7-[(propan-2-yl)oxy]isoquinoline-6-carboxamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；1.6-1.8 M Ammonium Citrate, pH7.0
|
分辨率 1.84 Å R-free 0.218 |
| 5UIU Crystal structure of IRAK4 in complex with compound 30 提交 2017-01-14 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
154–460（307 aa）
片段：UNP residues 154-460
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 8CG 1-{[(2S,3S,4S)-3-ethyl-4-fluoro-5-oxopyrrolidin-2-yl]methoxy}-7-methoxyisoquinoline-6-carboxamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；1.6-1.8M Ammonium Citrate, pH7.0
|
分辨率 2.02 Å R-free 0.204 |
| 5UIU Crystal structure of IRAK4 in complex with compound 30 提交 2017-01-14 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
154–460（307 aa）
片段：UNP residues 154-460
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 8CG 1-{[(2S,3S,4S)-3-ethyl-4-fluoro-5-oxopyrrolidin-2-yl]methoxy}-7-methoxyisoquinoline-6-carboxamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；1.6-1.8M Ammonium Citrate, pH7.0
|
分辨率 2.02 Å R-free 0.204 |
| 5W84 CRYSTAL STRUCTURE OF IRAK-4 WITH A 4,6-DIAMINONICOTINAMIDE INHIBITOR (COMPOUND NUMBER 4) 提交 2017-06-21 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
36–336（301 aa）
片段：UNP RESIDUES 154-460
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 9YY 4-(benzylamino)-6-[(2-oxo-2,3-dihydro-1H-indol-5-yl)amino]pyridine-3-carboxamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；Null
|
分辨率 2.90 Å R-free 0.248 |
| 5W84 CRYSTAL STRUCTURE OF IRAK-4 WITH A 4,6-DIAMINONICOTINAMIDE INHIBITOR (COMPOUND NUMBER 4) 提交 2017-06-21 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
36–336（301 aa）
片段：UNP RESIDUES 154-460
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 9YY 4-(benzylamino)-6-[(2-oxo-2,3-dihydro-1H-indol-5-yl)amino]pyridine-3-carboxamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；Null
|
分辨率 2.90 Å R-free 0.248 |
| 5W85 CRYSTAL STRUCTURE OF IRAK-4 WITH A 4,6-DIAMINONICOTINAMIDE INHIBITOR (COMPOUND NUMBER 9) 提交 2017-06-21 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
36–336（301 aa）
片段：UNP RESIDUES 154-460
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 9YS 6-[(1,3-benzothiazol-6-yl)amino]-4-{[(2S)-1-hydroxy-3-phenylpropan-2-yl]amino}-N-methylpyridine-3-carboxamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；Null
|
分辨率 2.25 Å R-free 0.251 |
| 5W85 CRYSTAL STRUCTURE OF IRAK-4 WITH A 4,6-DIAMINONICOTINAMIDE INHIBITOR (COMPOUND NUMBER 9) 提交 2017-06-21 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
36–336（301 aa）
片段：UNP RESIDUES 154-460
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 9YS 6-[(1,3-benzothiazol-6-yl)amino]-4-{[(2S)-1-hydroxy-3-phenylpropan-2-yl]amino}-N-methylpyridine-3-carboxamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；Null
|
分辨率 2.25 Å R-free 0.251 |
| 6EG9 IRAK4 in complex with Ponatinib 提交 2018-08-19 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
154–460（307 aa）
片段：Protein kinase domain residues 154-460
链 B
154–460（307 aa）
片段：Protein kinase domain residues 154-460
|
未记录 | 0LI 3-(imidazo[1,2-b]pyridazin-3-ylethynyl)-4-methyl-N-{4-[(4-methylpiperazin-1-yl)methyl]-3-(trifluoromethyl)phenyl}benzam ide × 2 SO4 SULFATE ION × 2 CO COBALT (II) ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 8；289 K；0.1M Tris-Hcl pH 8.0
1.5M-1.6M ammonium sulfate
20mM Cobalt chloride
|
分辨率 2.41 Å R-free 0.249 |
| 6EG9 IRAK4 in complex with Ponatinib 提交 2018-08-19 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
154–460（307 aa）
片段：Protein kinase domain residues 154-460
链 B
154–460（307 aa）
片段：Protein kinase domain residues 154-460
|
未记录 | 0LI 3-(imidazo[1,2-b]pyridazin-3-ylethynyl)-4-methyl-N-{4-[(4-methylpiperazin-1-yl)methyl]-3-(trifluoromethyl)phenyl}benzam ide × 4 SO4 SULFATE ION × 4 CO COBALT (II) ION × 8 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 8；289 K；0.1M Tris-Hcl pH 8.0
1.5M-1.6M ammonium sulfate
20mM Cobalt chloride
|
分辨率 2.41 Å R-free 0.249 |
| 6EGA IRAK4 in complex with a type II inhibitor 提交 2018-08-19 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
154–460（307 aa）
片段：Protein kinase domain residues 154-460
链 B
154–460（307 aa）
片段：Protein kinase domain residues 154-460
|
未记录 | J8A 3-{2-[(cyclopropanecarbonyl)amino][1,3]thiazolo[5,4-b]pyridin-5-yl}-N-{4-[(piperazin-1-yl)methyl]-3-(trifluoromethyl)phenyl}benzamide × 2 SO4 SULFATE ION × 2 CO COBALT (II) ION × 6 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 8；289 K；0.1M Tris-Hcl pH 8.0
1.5M-1.6M ammonium sulfate
20mM Cobalt chloride
|
分辨率 2.51 Å R-free 0.267 |
| 6EGA IRAK4 in complex with a type II inhibitor 提交 2018-08-19 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
154–460（307 aa）
片段：Protein kinase domain residues 154-460
链 B
154–460（307 aa）
片段：Protein kinase domain residues 154-460
|
未记录 | J8A 3-{2-[(cyclopropanecarbonyl)amino][1,3]thiazolo[5,4-b]pyridin-5-yl}-N-{4-[(piperazin-1-yl)methyl]-3-(trifluoromethyl)phenyl}benzamide × 4 SO4 SULFATE ION × 4 CO COBALT (II) ION × 12 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 8；289 K；0.1M Tris-Hcl pH 8.0
1.5M-1.6M ammonium sulfate
20mM Cobalt chloride
|
分辨率 2.51 Å R-free 0.267 |
| 6EGD Crystal structure of the unphosphorylated IRAK4 kinase domain Bound to a type I inhibitor 提交 2018-08-19 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
164–460（297 aa）
片段：Protein kinase domain residues 164-460
链 D
164–460（297 aa）
片段：Protein kinase domain residues 164-460
|
未记录 | J87 N-[2-methoxy-4-(morpholin-4-yl)phenyl]-2-(pyridin-3-yl)-1,3-thiazole-5-carboxamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277.15 K；150 mM DL-Malic acid and 20% PEG3350
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.230 |
| 6EGE Crystal structure of the unphosphorylated IRAK4 kinase domain Bound to a type I inhibitor 提交 2018-08-19 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
164–460（297 aa）
片段：Protein kinase domain residues 164-460
链 D
164–460（297 aa）
片段：Protein kinase domain residues 164-460
|
未记录 | DL1 N-[2-methoxy-4-(morpholin-4-yl)phenyl]-6-(1H-pyrazol-5-yl)pyridine-2-carboxamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277.15 K；150 mM DL-Malic acid and 20% PEG3350
|
分辨率 1.40 Å R-free 0.201 |
| 6EGF Crystal structure of the inactive unphosphorylated IRAK4 kinase domain bound to AMP-PNP 提交 2018-08-19 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
164–460（297 aa）
片段：Protein kinase domain residues 164-460
|
未记录 | ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 SO4 SULFATE ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293.15 K；1.6-1.9 M ammonium sulfate, 100 mM Hepes-NaOH at pH7
|
分辨率 2.61 Å R-free 0.229 |
| 6F3D IRAK4 IN COMPLEX WITH inhibitor 提交 2017-11-28 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
40–334（295 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | SO4 SULFATE ION × 1 CJT 4-[4-[[4-(dimethylamino)cyclohexyl]amino]-7~{H}-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-5-yl]cyclohexane-1-carboxamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；293 K；50 mM Hepes pH 7.5, 0.02% octylglucoside, 10% glycerol, 0.3 M NaCl, 1 mM TCEP
|
分辨率 2.38 Å R-free 0.227 |
| 6F3D IRAK4 IN COMPLEX WITH inhibitor 提交 2017-11-28 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
40–334（295 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | SO4 SULFATE ION × 1 CJT 4-[4-[[4-(dimethylamino)cyclohexyl]amino]-7~{H}-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-5-yl]cyclohexane-1-carboxamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；293 K；50 mM Hepes pH 7.5, 0.02% octylglucoside, 10% glycerol, 0.3 M NaCl, 1 mM TCEP
|
分辨率 2.38 Å R-free 0.227 |
| 6F3E IRAK4 IN COMPLEX WITH inhibitor 提交 2017-11-28 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
164–458（295 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | SO4 SULFATE ION × 1 CJQ 2-[(3~{R})-12-(4-morpholin-4-ylcyclohexyl)oxy-7-thia-9,11-diazatricyclo[6.4.0.0^{2,6}]dodeca-1(8),2(6),9,11-tetraen-3-yl]ethanamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；293 K；50 mM Hepes pH 7.5, 0.02% octylglucoside, 10% glycerol, 0.3 M NaCl, 1 mM TCEP
|
分辨率 2.67 Å R-free 0.254 |
| 6F3E IRAK4 IN COMPLEX WITH inhibitor 提交 2017-11-28 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
164–458（295 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | CJQ 2-[(3~{R})-12-(4-morpholin-4-ylcyclohexyl)oxy-7-thia-9,11-diazatricyclo[6.4.0.0^{2,6}]dodeca-1(8),2(6),9,11-tetraen-3-yl]ethanamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；293 K；50 mM Hepes pH 7.5, 0.02% octylglucoside, 10% glycerol, 0.3 M NaCl, 1 mM TCEP
|
分辨率 2.67 Å R-free 0.254 |
| 6F3G IRAK4 IN COMPLEX WITH inhibitor 提交 2017-11-28 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
164–458（295 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | CJN ~{N}4,~{N}4-dimethyl-~{N}1-(5-propan-2-ylpyrrolo[3,2-d]pyrimidin-4-yl)cyclohexane-1,4-diamine × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；293 K；50 mM Hepes pH 7.5, 0.02% octylglucoside, 10% glycerol, 0.3 M NaCl, 1 mM TCEP
|
分辨率 2.37 Å R-free 0.314 |
| 6F3G IRAK4 IN COMPLEX WITH inhibitor 提交 2017-11-28 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
40–334（295 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | CJN ~{N}4,~{N}4-dimethyl-~{N}1-(5-propan-2-ylpyrrolo[3,2-d]pyrimidin-4-yl)cyclohexane-1,4-diamine × 1 SO4 SULFATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；293 K；50 mM Hepes pH 7.5, 0.02% octylglucoside, 10% glycerol, 0.3 M NaCl, 1 mM TCEP
|
分辨率 2.37 Å R-free 0.314 |
| 6F3I IRAK4 IN COMPLEX WITH inhibitor 提交 2017-11-28 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
30–336（307 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | CKN (3~{R})-3-[4-[[4-(4-ethanoylpiperazin-1-yl)cyclohexyl]amino]pyrrolo[2,1-f][1,2,4]triazin-5-yl]butanamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；293 K；50 mM Hepes pH 7.5, 0.02% octylglucoside, 10% glycerol, 0.3 M NaCl, 1 mM TCEP
|
分辨率 2.14 Å R-free 0.270 |
| 6F3I IRAK4 IN COMPLEX WITH inhibitor 提交 2017-11-28 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
30–336（307 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | CKN (3~{R})-3-[4-[[4-(4-ethanoylpiperazin-1-yl)cyclohexyl]amino]pyrrolo[2,1-f][1,2,4]triazin-5-yl]butanamide × 1 SO4 SULFATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；293 K；50 mM Hepes pH 7.5, 0.02% octylglucoside, 10% glycerol, 0.3 M NaCl, 1 mM TCEP
|
分辨率 2.14 Å R-free 0.270 |
| 6LXY IRAK4 in complex with inhibitor 提交 2020-02-12 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
160–460（301 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | EXF N-[(2R)-2-fluoranyl-3-methyl-3-oxidanyl-butyl]-6-[(6-fluoranylpyrazolo[1,5-a]pyrimidin-5-yl)amino]-4-(propan-2-ylamino)pyridine-3-carboxamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；293 K；Ammonium sulphate
|
分辨率 2.19 Å R-free 0.231 |
| 6LXY IRAK4 in complex with inhibitor 提交 2020-02-12 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
160–460（301 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | EXF N-[(2R)-2-fluoranyl-3-methyl-3-oxidanyl-butyl]-6-[(6-fluoranylpyrazolo[1,5-a]pyrimidin-5-yl)amino]-4-(propan-2-ylamino)pyridine-3-carboxamide × 1 SO4 SULFATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；293 K；Ammonium sulphate
|
分辨率 2.19 Å R-free 0.231 |
| 6LXY IRAK4 in complex with inhibitor 提交 2020-02-12 | Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 D
160–460（301 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | EXF N-[(2R)-2-fluoranyl-3-methyl-3-oxidanyl-butyl]-6-[(6-fluoranylpyrazolo[1,5-a]pyrimidin-5-yl)amino]-4-(propan-2-ylamino)pyridine-3-carboxamide × 1 SO4 SULFATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；293 K；Ammonium sulphate
|
分辨率 2.19 Å R-free 0.231 |
| 6LXY IRAK4 in complex with inhibitor 提交 2020-02-12 | Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 E
160–460（301 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | EXF N-[(2R)-2-fluoranyl-3-methyl-3-oxidanyl-butyl]-6-[(6-fluoranylpyrazolo[1,5-a]pyrimidin-5-yl)amino]-4-(propan-2-ylamino)pyridine-3-carboxamide × 1 SO4 SULFATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；293 K；Ammonium sulphate
|
分辨率 2.19 Å R-free 0.231 |
| 6MOM Crystal structure of human Interleukin-1 receptor associated Kinase 4 (IRAK 4, CID 100300) in complex with compound NCC00371481 (BSI 107591) 提交 2018-10-04 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
160–460（301 aa）
片段：UNP residues 160-460
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | JX4 6-[7-methoxy-6-(1-methyl-1H-pyrazol-4-yl)imidazo[1,2-a]pyridin-3-yl]-N-[(3R)-pyrrolidin-3-yl]pyridin-2-amine × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；289 K；9.5 mg/ml IRAK4 (CID100300, Batch BOS047020B) in 20 mM Tris-HCl, pH 8.0, 1 mM DTT, with 1 mM BSI107659 (NCGC00371481) in DMSO, crystallization condition: Microlytic screen MCSG1, E10: 0.2 M ammonium tartrate dibasic, 20% PEG3350, cryoprotectant: 20% ethylene glycol with 1 mM compound, tray 286446 e10, puck: xvc2-1
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.207 |
| 6MOM Crystal structure of human Interleukin-1 receptor associated Kinase 4 (IRAK 4, CID 100300) in complex with compound NCC00371481 (BSI 107591) 提交 2018-10-04 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
160–460（301 aa）
片段：UNP residues 160-460
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | JX4 6-[7-methoxy-6-(1-methyl-1H-pyrazol-4-yl)imidazo[1,2-a]pyridin-3-yl]-N-[(3R)-pyrrolidin-3-yl]pyridin-2-amine × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；289 K；9.5 mg/ml IRAK4 (CID100300, Batch BOS047020B) in 20 mM Tris-HCl, pH 8.0, 1 mM DTT, with 1 mM BSI107659 (NCGC00371481) in DMSO, crystallization condition: Microlytic screen MCSG1, E10: 0.2 M ammonium tartrate dibasic, 20% PEG3350, cryoprotectant: 20% ethylene glycol with 1 mM compound, tray 286446 e10, puck: xvc2-1
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.207 |
| 6MOM Crystal structure of human Interleukin-1 receptor associated Kinase 4 (IRAK 4, CID 100300) in complex with compound NCC00371481 (BSI 107591) 提交 2018-10-04 | Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 C
160–460（301 aa）
片段：UNP residues 160-460
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | JX4 6-[7-methoxy-6-(1-methyl-1H-pyrazol-4-yl)imidazo[1,2-a]pyridin-3-yl]-N-[(3R)-pyrrolidin-3-yl]pyridin-2-amine × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；289 K；9.5 mg/ml IRAK4 (CID100300, Batch BOS047020B) in 20 mM Tris-HCl, pH 8.0, 1 mM DTT, with 1 mM BSI107659 (NCGC00371481) in DMSO, crystallization condition: Microlytic screen MCSG1, E10: 0.2 M ammonium tartrate dibasic, 20% PEG3350, cryoprotectant: 20% ethylene glycol with 1 mM compound, tray 286446 e10, puck: xvc2-1
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.207 |
| 6MOM Crystal structure of human Interleukin-1 receptor associated Kinase 4 (IRAK 4, CID 100300) in complex with compound NCC00371481 (BSI 107591) 提交 2018-10-04 | Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 D
160–460（301 aa）
片段：UNP residues 160-460
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | JX4 6-[7-methoxy-6-(1-methyl-1H-pyrazol-4-yl)imidazo[1,2-a]pyridin-3-yl]-N-[(3R)-pyrrolidin-3-yl]pyridin-2-amine × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；289 K；9.5 mg/ml IRAK4 (CID100300, Batch BOS047020B) in 20 mM Tris-HCl, pH 8.0, 1 mM DTT, with 1 mM BSI107659 (NCGC00371481) in DMSO, crystallization condition: Microlytic screen MCSG1, E10: 0.2 M ammonium tartrate dibasic, 20% PEG3350, cryoprotectant: 20% ethylene glycol with 1 mM compound, tray 286446 e10, puck: xvc2-1
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.207 |
| 6N8G IRAK4 bound to benzoxazole compound 提交 2018-11-29 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
40–336（297 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | KFD N-[2-(morpholin-4-yl)-6-(piperidin-1-yl)-1,3-benzoxazol-5-yl]-6-(1H-pyrrolo[2,3-b]pyridin-5-yl)pyridine-2-carboxamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；296 K；1.6-1.7 M Sodium Malonate, pH 7.0, 100-150 mM Sodium acetate, 10 mM DTT
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.220 |
| 6N8G IRAK4 bound to benzoxazole compound 提交 2018-11-29 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
40–336（297 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | KFD N-[2-(morpholin-4-yl)-6-(piperidin-1-yl)-1,3-benzoxazol-5-yl]-6-(1H-pyrrolo[2,3-b]pyridin-5-yl)pyridine-2-carboxamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；296 K；1.6-1.7 M Sodium Malonate, pH 7.0, 100-150 mM Sodium acetate, 10 mM DTT
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.220 |
| 6N8G IRAK4 bound to benzoxazole compound 提交 2018-11-29 | Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 C
40–336（297 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | KFD N-[2-(morpholin-4-yl)-6-(piperidin-1-yl)-1,3-benzoxazol-5-yl]-6-(1H-pyrrolo[2,3-b]pyridin-5-yl)pyridine-2-carboxamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；296 K；1.6-1.7 M Sodium Malonate, pH 7.0, 100-150 mM Sodium acetate, 10 mM DTT
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.220 |
| 6N8G IRAK4 bound to benzoxazole compound 提交 2018-11-29 | Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 D
40–336（297 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | KFD N-[2-(morpholin-4-yl)-6-(piperidin-1-yl)-1,3-benzoxazol-5-yl]-6-(1H-pyrrolo[2,3-b]pyridin-5-yl)pyridine-2-carboxamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；296 K；1.6-1.7 M Sodium Malonate, pH 7.0, 100-150 mM Sodium acetate, 10 mM DTT
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.220 |
| 6O8U Crystal structure of IRAK4 in complex with compound 23 提交 2019-03-12 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
160–460（301 aa）
片段：residues 160-460
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | LS7 N-[2,2-dimethyl-6-(morpholin-4-yl)-2,3-dihydro-1-benzofuran-5-yl]pyrazolo[1,5-a]pyrimidine-3-carboxamide × 1 SO4 SULFATE ION × 1 GOL GLYCEROL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；292 K；2.3M-2.7M ammonium sulfate, 0.1M HEPES Na pH 7.0-7.3
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.255 |
| 6O8U Crystal structure of IRAK4 in complex with compound 23 提交 2019-03-12 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
160–460（301 aa）
片段：residues 160-460
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | LS7 N-[2,2-dimethyl-6-(morpholin-4-yl)-2,3-dihydro-1-benzofuran-5-yl]pyrazolo[1,5-a]pyrimidine-3-carboxamide × 1 SO4 SULFATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；292 K；2.3M-2.7M ammonium sulfate, 0.1M HEPES Na pH 7.0-7.3
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.255 |
| 6O8U Crystal structure of IRAK4 in complex with compound 23 提交 2019-03-12 | Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 C
160–460（301 aa）
片段：residues 160-460
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | LS7 N-[2,2-dimethyl-6-(morpholin-4-yl)-2,3-dihydro-1-benzofuran-5-yl]pyrazolo[1,5-a]pyrimidine-3-carboxamide × 1 SO4 SULFATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；292 K；2.3M-2.7M ammonium sulfate, 0.1M HEPES Na pH 7.0-7.3
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.255 |
| 6O8U Crystal structure of IRAK4 in complex with compound 23 提交 2019-03-12 | Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 D
160–460（301 aa）
片段：residues 160-460
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | LS7 N-[2,2-dimethyl-6-(morpholin-4-yl)-2,3-dihydro-1-benzofuran-5-yl]pyrazolo[1,5-a]pyrimidine-3-carboxamide × 1 SO4 SULFATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；292 K；2.3M-2.7M ammonium sulfate, 0.1M HEPES Na pH 7.0-7.3
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.255 |
| 6O94 Structure of the IRAK4 kinase domain with compound 17 提交 2019-03-13 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
160–460（301 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | CA CALCIUM ION × 1 LRS N-{5-[4-(hydroxymethyl)piperidin-1-yl]-1-methyl-2-(morpholin-4-yl)-1H-benzimidazol-6-yl}pyrazolo[1,5-a]pyrimidine-3-carboxamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；277 K；2.6-2.9 M Ammonium Sulfate, Hepes
|
分辨率 1.98 Å R-free 0.215 |
| 6O94 Structure of the IRAK4 kinase domain with compound 17 提交 2019-03-13 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
160–460（301 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | CA CALCIUM ION × 1 LRS N-{5-[4-(hydroxymethyl)piperidin-1-yl]-1-methyl-2-(morpholin-4-yl)-1H-benzimidazol-6-yl}pyrazolo[1,5-a]pyrimidine-3-carboxamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；277 K；2.6-2.9 M Ammonium Sulfate, Hepes
|
分辨率 1.98 Å R-free 0.215 |
| 6O94 Structure of the IRAK4 kinase domain with compound 17 提交 2019-03-13 | Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 C
160–460（301 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | LRS N-{5-[4-(hydroxymethyl)piperidin-1-yl]-1-methyl-2-(morpholin-4-yl)-1H-benzimidazol-6-yl}pyrazolo[1,5-a]pyrimidine-3-carboxamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；277 K；2.6-2.9 M Ammonium Sulfate, Hepes
|
分辨率 1.98 Å R-free 0.215 |
| 6O94 Structure of the IRAK4 kinase domain with compound 17 提交 2019-03-13 | Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 D
160–460（301 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | LRS N-{5-[4-(hydroxymethyl)piperidin-1-yl]-1-methyl-2-(morpholin-4-yl)-1H-benzimidazol-6-yl}pyrazolo[1,5-a]pyrimidine-3-carboxamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；277 K；2.6-2.9 M Ammonium Sulfate, Hepes
|
分辨率 1.98 Å R-free 0.215 |
| 6O95 Structure of the IRAK4 kinase domain with compound 41 提交 2019-03-13 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
160–460（301 aa）
片段：residues 160-460
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | SO4 SULFATE ION × 1 LSV N-[(2R)-2-(hydroxymethyl)-2-methyl-6-(morpholin-4-yl)-2,3-dihydro-1-benzofuran-5-yl]pyrazolo[1,5-a]pyrimidine-3-carboxamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；2.6-2.9 M Ammonium Sulfate, Hepes
|
分辨率 1.77 Å R-free 0.217 |
| 6O95 Structure of the IRAK4 kinase domain with compound 41 提交 2019-03-13 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
160–460（301 aa）
片段：residues 160-460
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | LSV N-[(2R)-2-(hydroxymethyl)-2-methyl-6-(morpholin-4-yl)-2,3-dihydro-1-benzofuran-5-yl]pyrazolo[1,5-a]pyrimidine-3-carboxamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；2.6-2.9 M Ammonium Sulfate, Hepes
|
分辨率 1.77 Å R-free 0.217 |
| 6O95 Structure of the IRAK4 kinase domain with compound 41 提交 2019-03-13 | Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 C
160–460（301 aa）
片段：residues 160-460
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | LSV N-[(2R)-2-(hydroxymethyl)-2-methyl-6-(morpholin-4-yl)-2,3-dihydro-1-benzofuran-5-yl]pyrazolo[1,5-a]pyrimidine-3-carboxamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；2.6-2.9 M Ammonium Sulfate, Hepes
|
分辨率 1.77 Å R-free 0.217 |
| 6O95 Structure of the IRAK4 kinase domain with compound 41 提交 2019-03-13 | Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 D
160–460（301 aa）
片段：residues 160-460
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | SO4 SULFATE ION × 2 LSV N-[(2R)-2-(hydroxymethyl)-2-methyl-6-(morpholin-4-yl)-2,3-dihydro-1-benzofuran-5-yl]pyrazolo[1,5-a]pyrimidine-3-carboxamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；2.6-2.9 M Ammonium Sulfate, Hepes
|
分辨率 1.77 Å R-free 0.217 |
| 6O9D Structure of the IRAK4 kinase domain with compound 5 提交 2019-03-13 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
36–336（301 aa）
片段：residues 36-336
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | LTY N-{7-[4-(aminomethyl)piperidin-1-yl]quinolin-6-yl}pyrazolo[1,5-a]pyrimidine-3-carboxamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；277 K；2.6-2.9 M Ammonium Sulfate, Hepes
|
分辨率 2.51 Å R-free 0.239 |
| 6O9D Structure of the IRAK4 kinase domain with compound 5 提交 2019-03-13 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
36–336（301 aa）
片段：residues 36-336
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | LTY N-{7-[4-(aminomethyl)piperidin-1-yl]quinolin-6-yl}pyrazolo[1,5-a]pyrimidine-3-carboxamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；277 K；2.6-2.9 M Ammonium Sulfate, Hepes
|
分辨率 2.51 Å R-free 0.239 |
| 6O9D Structure of the IRAK4 kinase domain with compound 5 提交 2019-03-13 | Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 C
36–336（301 aa）
片段：residues 36-336
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | LTY N-{7-[4-(aminomethyl)piperidin-1-yl]quinolin-6-yl}pyrazolo[1,5-a]pyrimidine-3-carboxamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；277 K；2.6-2.9 M Ammonium Sulfate, Hepes
|
分辨率 2.51 Å R-free 0.239 |
| 6O9D Structure of the IRAK4 kinase domain with compound 5 提交 2019-03-13 | Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 D
36–336（301 aa）
片段：residues 36-336
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | LTY N-{7-[4-(aminomethyl)piperidin-1-yl]quinolin-6-yl}pyrazolo[1,5-a]pyrimidine-3-carboxamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；277 K；2.6-2.9 M Ammonium Sulfate, Hepes
|
分辨率 2.51 Å R-free 0.239 |
| 6RFI IRAK4 IN COMPLEX WITH inhibitor 提交 2019-04-15 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
154–460（307 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | SO4 SULFATE ION × 1 K1H methyl 4-[4-[(6-cyanoquinazolin-4-yl)amino]cyclohexyl]piperazine-1-carboxylate × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；pH7.5
|
分辨率 2.31 Å R-free 0.236 |
| 6RFI IRAK4 IN COMPLEX WITH inhibitor 提交 2019-04-15 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
154–460（307 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | SO4 SULFATE ION × 1 K1H methyl 4-[4-[(6-cyanoquinazolin-4-yl)amino]cyclohexyl]piperazine-1-carboxylate × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；pH7.5
|
分辨率 2.31 Å R-free 0.236 |
| 6RFJ IRAK4 IN COMPLEX WITH inhibitor 提交 2019-04-15 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
154–460（307 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | K1E methyl 4-[4-[[6-(cyanomethyl)-2-[(1-methylpyrazol-4-yl)amino]pyrido[3,2-d]pyrimidin-4-yl]amino]cyclohexyl]piperazine-1-carboxylate × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；pH7.5
|
分辨率 2.61 Å R-free 0.254 |
| 6RFJ IRAK4 IN COMPLEX WITH inhibitor 提交 2019-04-15 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
154–460（307 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | K1E methyl 4-[4-[[6-(cyanomethyl)-2-[(1-methylpyrazol-4-yl)amino]pyrido[3,2-d]pyrimidin-4-yl]amino]cyclohexyl]piperazine-1-carboxylate × 1 SO4 SULFATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；pH7.5
|
分辨率 2.61 Å R-free 0.254 |
| 6THW IRAK4 in complex with inhibitor 提交 2019-11-21 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
30–336（307 aa）
|
未记录 | NBK 7-fluoranyl-4-(1-methylcyclopropyl)oxy-~{N}-[1-(1-methylpiperidin-4-yl)pyrazol-4-yl]-6-(2-methylpyrimidin-5-yl)pyrido[3,2-d]pyrimidin-2-amine × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；AMS 0.1 M Hepes &
Protein Buffer: 25 mM HEPES pH 7.5, 1 mM EDTA, 1 mM TCEP, 5% Glycerol, 150 mM NaCl
|
分辨率 2.44 Å R-free 0.271 |
| 6THW IRAK4 in complex with inhibitor 提交 2019-11-21 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
30–336（307 aa）
|
未记录 | NBK 7-fluoranyl-4-(1-methylcyclopropyl)oxy-~{N}-[1-(1-methylpiperidin-4-yl)pyrazol-4-yl]-6-(2-methylpyrimidin-5-yl)pyrido[3,2-d]pyrimidin-2-amine × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；AMS 0.1 M Hepes &
Protein Buffer: 25 mM HEPES pH 7.5, 1 mM EDTA, 1 mM TCEP, 5% Glycerol, 150 mM NaCl
|
分辨率 2.44 Å R-free 0.271 |
| 6THX IRAK4 in complex with inhibitor 提交 2019-11-21 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
30–336（307 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | N9Z 2-[4-[(1-methylcyclopropyl)amino]-2-[(1-methylpyrazol-4-yl)amino]pyrido[3,2-d]pyrimidin-6-yl]ethanenitrile × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；25 mM HEPES pH 7.5, 1 mM EDTA, 1 mM TCEP, 5% Glycerol, 150 mM NaCl
|
分辨率 1.99 Å R-free 0.254 |
| 6THX IRAK4 in complex with inhibitor 提交 2019-11-21 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
30–336（307 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | N9Z 2-[4-[(1-methylcyclopropyl)amino]-2-[(1-methylpyrazol-4-yl)amino]pyrido[3,2-d]pyrimidin-6-yl]ethanenitrile × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；25 mM HEPES pH 7.5, 1 mM EDTA, 1 mM TCEP, 5% Glycerol, 150 mM NaCl
|
分辨率 1.99 Å R-free 0.254 |
| 6THZ IRAK4 IN COMPLEX WITH inhibitor 提交 2019-11-21 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
30–336（307 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | NB5 7-fluoranyl-~{N}-[1-(2-methyl-2-azaspiro[3.3]heptan-6-yl)pyrazol-4-yl]-4-(1-methylcyclopropyl)oxy-6-(2-methylpyrimidin-5-yl)pyrido[3,2-d]pyrimidin-2-amine × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；22% PEG8K, 0.2 M NaAc 0.1 M Mes pH 6.4
Protein Buffer: 25 mM HEPES pH 7.5, 1 mM EDTA, 1 mM TCEP, 5% Glycerol, 150 mM NaCl
|
分辨率 2.38 Å R-free 0.274 |
| 6THZ IRAK4 IN COMPLEX WITH inhibitor 提交 2019-11-21 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
30–336（307 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | NB5 7-fluoranyl-~{N}-[1-(2-methyl-2-azaspiro[3.3]heptan-6-yl)pyrazol-4-yl]-4-(1-methylcyclopropyl)oxy-6-(2-methylpyrimidin-5-yl)pyrido[3,2-d]pyrimidin-2-amine × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；22% PEG8K, 0.2 M NaAc 0.1 M Mes pH 6.4
Protein Buffer: 25 mM HEPES pH 7.5, 1 mM EDTA, 1 mM TCEP, 5% Glycerol, 150 mM NaCl
|
分辨率 2.38 Å R-free 0.274 |
| 6TI8 IRAK4 IN COMPLEX WITH inhibitor 提交 2019-11-22 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
30–336（307 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | NBW ~{N},~{N}-dimethyl-4-(1-methylcyclopropyl)oxy-2-[[1-(1-methylpiperidin-4-yl)pyrazol-4-yl]amino]pyrido[3,2-d]pyrimidine-6-carboxamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；2.7 M AMS 0.1 M Hepes pH 7.1-7.7
Protein Buffer: 25 mM HEPES pH 7.5, 1 mM EDTA, 1 mM TCEP, 5% Glycerol, 150 mM NaCl
|
分辨率 2.32 Å R-free 0.281 |
| 6TI8 IRAK4 IN COMPLEX WITH inhibitor 提交 2019-11-22 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
30–336（307 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | NBW ~{N},~{N}-dimethyl-4-(1-methylcyclopropyl)oxy-2-[[1-(1-methylpiperidin-4-yl)pyrazol-4-yl]amino]pyrido[3,2-d]pyrimidine-6-carboxamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；2.7 M AMS 0.1 M Hepes pH 7.1-7.7
Protein Buffer: 25 mM HEPES pH 7.5, 1 mM EDTA, 1 mM TCEP, 5% Glycerol, 150 mM NaCl
|
分辨率 2.32 Å R-free 0.281 |
| 6TI8 IRAK4 IN COMPLEX WITH inhibitor 提交 2019-11-22 | Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 C
30–336（307 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | NBW ~{N},~{N}-dimethyl-4-(1-methylcyclopropyl)oxy-2-[[1-(1-methylpiperidin-4-yl)pyrazol-4-yl]amino]pyrido[3,2-d]pyrimidine-6-carboxamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；2.7 M AMS 0.1 M Hepes pH 7.1-7.7
Protein Buffer: 25 mM HEPES pH 7.5, 1 mM EDTA, 1 mM TCEP, 5% Glycerol, 150 mM NaCl
|
分辨率 2.32 Å R-free 0.281 |
| 6TI8 IRAK4 IN COMPLEX WITH inhibitor 提交 2019-11-22 | Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 D
30–336（307 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | NBW ~{N},~{N}-dimethyl-4-(1-methylcyclopropyl)oxy-2-[[1-(1-methylpiperidin-4-yl)pyrazol-4-yl]amino]pyrido[3,2-d]pyrimidine-6-carboxamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；2.7 M AMS 0.1 M Hepes pH 7.1-7.7
Protein Buffer: 25 mM HEPES pH 7.5, 1 mM EDTA, 1 mM TCEP, 5% Glycerol, 150 mM NaCl
|
分辨率 2.32 Å R-free 0.281 |
| 6TIA IRAK4 IN COMPLEX WITH inhibitor 提交 2019-11-22 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
30–336（307 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | ND2 4-(1-methylcyclopropyl)oxy-~{N}-[1-(1-methylpiperidin-4-yl)pyrazol-4-yl]-6-(1-methylpyrazol-4-yl)pyrido[3,2-d]pyrimidin-2-amine × 5 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；2.7 M AMS 0.1 M Hepes pH 7.1-7.7
Protein Buffer: 50mM HEPES pH 7.5, 300 mM NaCl, 0,02% OG, 1 mM TCEP, 10% Glycerol
|
分辨率 2.52 Å R-free 0.261 |
| 6TIA IRAK4 IN COMPLEX WITH inhibitor 提交 2019-11-22 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
30–336（307 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | ND2 4-(1-methylcyclopropyl)oxy-~{N}-[1-(1-methylpiperidin-4-yl)pyrazol-4-yl]-6-(1-methylpyrazol-4-yl)pyrido[3,2-d]pyrimidin-2-amine × 5 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；2.7 M AMS 0.1 M Hepes pH 7.1-7.7
Protein Buffer: 50mM HEPES pH 7.5, 300 mM NaCl, 0,02% OG, 1 mM TCEP, 10% Glycerol
|
分辨率 2.52 Å R-free 0.261 |
| 6UYA Crystal structure of Compound 19 bound to IRAK4 提交 2019-11-12 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
36–336（301 aa）
链 B
36–336（301 aa）
链 C
36–336（301 aa）
链 D
36–336（301 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | QL7 N-{2-[(2R)-2-fluoro-3-hydroxy-3-methylbutyl]-6-(morpholin-4-yl)-1-oxo-2,3-dihydro-1H-isoindol-5-yl}pyrazolo[1,5-a]pyrimidine-3-carboxamide × 4 SO4 SULFATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；292 K；2.3M-2.7M ammonium sulfate, 0.1M HEPES Na pH 7.0-7.3
|
分辨率 1.74 Å R-free 0.207 |
| 6VQL CRYSTAL STRUCTURE OF INTERLEUKIN-1 RECEPTOR-ASSOCIATED KINASE 4 (IRAK4-WT) COMPLEX WITH A NICOTINAMIDE INHIBITOR 提交 2020-02-05 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
36–336（301 aa）
片段：KINASE DOMAIN
链 B
36–336（301 aa）
片段：KINASE DOMAIN
链 C
36–336（301 aa）
片段：KINASE DOMAIN
链 D
36–336（301 aa）
片段：KINASE DOMAIN
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | R7S 6-[(1,3-benzothiazol-6-yl)amino]-4-(cyclopropylamino)-N-[(2R)-2-fluoro-3-hydroxy-3-methylbutyl]pyridine-3-carboxamide × 4 SO4 SULFATE ION × 10 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；NULL
|
分辨率 2.07 Å R-free 0.279 |
| 7C2V Crystal Structure of IRAK4 kinase in complex with the inhibitor CA-4948 提交 2020-05-09 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
162–460（299 aa）
链 B
162–460（299 aa）
链 C
162–460（299 aa）
链 D
162–460（299 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | FJ0 2-(2-methylpyridin-4-yl)-N-[2-morpholin-4-yl-5-[(3R)-3-oxidanylpyrrolidin-1-yl]-[1,3]oxazolo[4,5-b]pyridin-6-yl]-1,3-oxazole-4-carboxamide × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.4；298 K；0.1 M sodium acetate pH 5.4, 2.3 M sodium malonate
|
分辨率 2.44 Å R-free 0.253 |
| 7C2W Crystal Structure of IRAK4 kinase in complex with a small molecule inhibitor 提交 2020-05-09 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
163–458（296 aa）
链 B
163–458（296 aa）
链 C
163–458（296 aa）
链 D
163–458（296 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | FJ9 N-(2-morpholin-4-yl-1,3-benzoxazol-6-yl)-6-pyridin-4-yl-pyridine-2-carboxamide × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.4；298 K；0.1 M sodium acetate pH 5.4, 2.3 M sodium malonate
|
分辨率 3.20 Å R-free 0.355 |
| 7QG1 IRAK4 in complex with inhibitor 提交 2021-12-07 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
154–460（307 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | B8I methyl 4-[4-[[6-(cyanomethyl)-2-[(1-methylpyrazol-4-yl)amino]-5-oxidanylidene-pyrido[4,3-d]pyrimidin-4-yl]amino]cyclohexyl]piperazine-1-carboxylate × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
EVAPORATION；298 K；Ammonium sulfate 0.1 M Hepes pH 6.8-7.4
|
分辨率 2.07 Å R-free 0.285 |
| 7QG1 IRAK4 in complex with inhibitor 提交 2021-12-07 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
154–460（307 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | B8I methyl 4-[4-[[6-(cyanomethyl)-2-[(1-methylpyrazol-4-yl)amino]-5-oxidanylidene-pyrido[4,3-d]pyrimidin-4-yl]amino]cyclohexyl]piperazine-1-carboxylate × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
EVAPORATION；298 K；Ammonium sulfate 0.1 M Hepes pH 6.8-7.4
|
分辨率 2.07 Å R-free 0.285 |
| 7QG2 IRAK4 in complex with inhibitor 提交 2021-12-07 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
30–336（307 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | B6I 6-methyl-4-[(1-methylcyclopropyl)amino]-2-[[1-(1-methylpiperidin-4-yl)pyrazol-4-yl]amino]pyrido[4,3-d]pyrimidin-5-one × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
EVAPORATION；298 K；2.5 M AMS, 0.1 M Hepes pH 7.67
|
分辨率 3.03 Å R-free 0.274 |
| 7QG2 IRAK4 in complex with inhibitor 提交 2021-12-07 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
30–336（307 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | B6I 6-methyl-4-[(1-methylcyclopropyl)amino]-2-[[1-(1-methylpiperidin-4-yl)pyrazol-4-yl]amino]pyrido[4,3-d]pyrimidin-5-one × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
EVAPORATION；298 K；2.5 M AMS, 0.1 M Hepes pH 7.67
|
分辨率 3.03 Å R-free 0.274 |
| 7QG2 IRAK4 in complex with inhibitor 提交 2021-12-07 | Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 C
30–336（307 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | B6I 6-methyl-4-[(1-methylcyclopropyl)amino]-2-[[1-(1-methylpiperidin-4-yl)pyrazol-4-yl]amino]pyrido[4,3-d]pyrimidin-5-one × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
EVAPORATION；298 K；2.5 M AMS, 0.1 M Hepes pH 7.67
|
分辨率 3.03 Å R-free 0.274 |
| 7QG2 IRAK4 in complex with inhibitor 提交 2021-12-07 | Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 D
30–336（307 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | B6I 6-methyl-4-[(1-methylcyclopropyl)amino]-2-[[1-(1-methylpiperidin-4-yl)pyrazol-4-yl]amino]pyrido[4,3-d]pyrimidin-5-one × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
EVAPORATION；298 K；2.5 M AMS, 0.1 M Hepes pH 7.67
|
分辨率 3.03 Å R-free 0.274 |
| 7QG3 IRAK4 in complex with inhibitor 提交 2021-12-07 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
154–460（307 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | B4U 6-[(2~{S})-2-fluoranylpropyl]-4-[(1-methylcyclopropyl)amino]-2-[[1-(1-methylpiperidin-4-yl)pyrazol-4-yl]amino]pyrido[4,3-d]pyrimidin-5-one × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
EVAPORATION；298 K；2.7 M AMS 0.1 M Hepes pH 7.1-7.7
|
分辨率 2.11 Å R-free 0.304 |
| 7QG3 IRAK4 in complex with inhibitor 提交 2021-12-07 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
154–460（307 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | B4U 6-[(2~{S})-2-fluoranylpropyl]-4-[(1-methylcyclopropyl)amino]-2-[[1-(1-methylpiperidin-4-yl)pyrazol-4-yl]amino]pyrido[4,3-d]pyrimidin-5-one × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
EVAPORATION；298 K；2.7 M AMS 0.1 M Hepes pH 7.1-7.7
|
分辨率 2.11 Å R-free 0.304 |
| 7QG5 IRAK4 in complex with inhibitor 提交 2021-12-07 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
30–336（307 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | B7R 4-[(1-methylcyclopropyl)amino]-2-[[1-(1-methylpiperidin-4-yl)pyrazol-4-yl]amino]-6-pyrimidin-5-yl-pyrido[4,3-d]pyrimidin-5-one × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
EVAPORATION；298 K；2.5 M AMS 0.1 M Hepes pH 7.45
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.275 |
| 7QG5 IRAK4 in complex with inhibitor 提交 2021-12-07 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
30–336（307 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | B7R 4-[(1-methylcyclopropyl)amino]-2-[[1-(1-methylpiperidin-4-yl)pyrazol-4-yl]amino]-6-pyrimidin-5-yl-pyrido[4,3-d]pyrimidin-5-one × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
EVAPORATION；298 K；2.5 M AMS 0.1 M Hepes pH 7.45
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.275 |
| 8ATB Discovery of IRAK4 Inhibitor 16 提交 2022-08-22 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 AAA
165–460（296 aa）
|
突变：K400A E401A E402A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | O0H ~{N}-[6-ethoxy-2-[2-(4-methylpiperazin-1-yl)-2-oxidanylidene-ethyl]indazol-5-yl]-6-(trifluoromethyl)pyridine-2-carboxamide × 1 GOL GLYCEROL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.9；293 K；0.1M sodium acetate buffer, 2.13-2.145M sodium malonate
|
分辨率 2.35 Å R-free 0.260 |
| 8ATB Discovery of IRAK4 Inhibitor 16 提交 2022-08-22 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 BBB
165–460（296 aa）
|
突变：K400A E401A E402A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | O0H ~{N}-[6-ethoxy-2-[2-(4-methylpiperazin-1-yl)-2-oxidanylidene-ethyl]indazol-5-yl]-6-(trifluoromethyl)pyridine-2-carboxamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.9；293 K；0.1M sodium acetate buffer, 2.13-2.145M sodium malonate
|
分辨率 2.35 Å R-free 0.260 |
| 8ATL Discovery of IRAK4 Inhibitor 23 提交 2022-08-23 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 AAA
165–460（296 aa）
|
突变：K400A E401A E402A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | O6X ~{N}-[6-methoxy-2-(2-morpholin-4-yl-2-oxidanylidene-ethyl)indazol-5-yl]-6-[(1~{R})-2,2,2-tris(fluoranyl)-1-oxidanyl-ethyl]pyridine-2-carboxamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.9；293 K；0.1M sodium acetate buffer pH 4.9, 2.13-2.145M sodium malonate
|
分辨率 2.46 Å R-free 0.243 |
| 8ATL Discovery of IRAK4 Inhibitor 23 提交 2022-08-23 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 BBB
165–460（296 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | O6X ~{N}-[6-methoxy-2-(2-morpholin-4-yl-2-oxidanylidene-ethyl)indazol-5-yl]-6-[(1~{R})-2,2,2-tris(fluoranyl)-1-oxidanyl-ethyl]pyridine-2-carboxamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.9；293 K；0.1M sodium acetate buffer pH 4.9, 2.13-2.145M sodium malonate
|
分辨率 2.46 Å R-free 0.243 |
| 8ATN Discovery of IRAK4 Inhibitor 38 提交 2022-08-23 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 AAA
165–460（296 aa）
|
突变：K400A E401A E402A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | O06 ~{N}-[3-methyl-2-(3-methyl-3-oxidanyl-butyl)-6-(2-oxidanylpropan-2-yl)benzimidazol-5-yl]-6-(trifluoromethyl)pyridine-2-carboxamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.9；293 K；0.1M sodium acetate buffer pH 4.9, 1.5-1.7M ammonium citrate, 0.02M hexaaminecobalt(III)chloride
|
分辨率 2.17 Å R-free 0.306 |
| 8ATN Discovery of IRAK4 Inhibitor 38 提交 2022-08-23 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 BBB
165–460（296 aa）
|
突变：K400A E401A E402A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | O06 ~{N}-[3-methyl-2-(3-methyl-3-oxidanyl-butyl)-6-(2-oxidanylpropan-2-yl)benzimidazol-5-yl]-6-(trifluoromethyl)pyridine-2-carboxamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.9；293 K；0.1M sodium acetate buffer pH 4.9, 1.5-1.7M ammonium citrate, 0.02M hexaaminecobalt(III)chloride
|
分辨率 2.17 Å R-free 0.306 |
| 8BR5 Discovery of IRAK4 Inhibitor 41 提交 2022-11-22 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 AAA
162–460（299 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | R73 ~{N}-[2,3-dimethyl-6-(1~{H}-pyrazol-5-yl)benzimidazol-5-yl]-6-(trifluoromethyl)pyridine-2-carboxamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；none
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.254 |
| 8BR5 Discovery of IRAK4 Inhibitor 41 提交 2022-11-22 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 BBB
162–460（299 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | R73 ~{N}-[2,3-dimethyl-6-(1~{H}-pyrazol-5-yl)benzimidazol-5-yl]-6-(trifluoromethyl)pyridine-2-carboxamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；none
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.254 |
| 8BR5 Discovery of IRAK4 Inhibitor 41 提交 2022-11-22 | Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 CCC
162–460（299 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | R73 ~{N}-[2,3-dimethyl-6-(1~{H}-pyrazol-5-yl)benzimidazol-5-yl]-6-(trifluoromethyl)pyridine-2-carboxamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；none
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.254 |
| 8BR5 Discovery of IRAK4 Inhibitor 41 提交 2022-11-22 | Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 DDD
162–460（299 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | R73 ~{N}-[2,3-dimethyl-6-(1~{H}-pyrazol-5-yl)benzimidazol-5-yl]-6-(trifluoromethyl)pyridine-2-carboxamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；none
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.254 |
| 8BR6 Discovery of IRAK4 Inhibitor 40 提交 2022-11-22 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 AAA
165–460（296 aa）
|
突变：K400A, E401A, E402A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | R6I ~{N}-[6-methoxy-2-(2-methylsulfonylethyl)-1,3-dihydroindazol-5-yl]-6-(2-oxidanylpropan-2-yl)pyridine-2-carboxamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1M sodium acetate buffer pH 4.9, 2.13-2.145M sodium malonate
|
分辨率 2.17 Å R-free 0.251 |
| 8BR6 Discovery of IRAK4 Inhibitor 40 提交 2022-11-22 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 BBB
165–460（296 aa）
|
突变：K400A, E401A, E402A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | R6I ~{N}-[6-methoxy-2-(2-methylsulfonylethyl)-1,3-dihydroindazol-5-yl]-6-(2-oxidanylpropan-2-yl)pyridine-2-carboxamide × 1 ACT ACETATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1M sodium acetate buffer pH 4.9, 2.13-2.145M sodium malonate
|
分辨率 2.17 Å R-free 0.251 |
| 8BR7 Discovery of IRAK4 Inhibitors BAY1834845 and BAY1830839 提交 2022-11-22 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 AAA
165–460（296 aa）
|
突变：K400A, E401A, E402A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | R6R N-{2-[2-(4-benzoylpiperazin-1-yl)-2-oxoethyl]-2H-indazol-5-yl}-3-nitrobenzamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1M sodium acetate buffer at pH 4.9, 1.5-1.7M ammonium citrate and 0.02M hexaaminecobalt(III)chloride
|
分辨率 2.12 Å R-free 0.288 |
| 8BR7 Discovery of IRAK4 Inhibitors BAY1834845 and BAY1830839 提交 2022-11-22 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 BBB
165–460（296 aa）
|
突变：K400A, E401A, E402A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | R6R N-{2-[2-(4-benzoylpiperazin-1-yl)-2-oxoethyl]-2H-indazol-5-yl}-3-nitrobenzamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1M sodium acetate buffer at pH 4.9, 1.5-1.7M ammonium citrate and 0.02M hexaaminecobalt(III)chloride
|
分辨率 2.12 Å R-free 0.288 |
| 8DKS IRAK4 IN COMPLEX WITH COMPOUND #3 提交 2022-07-06 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–460（460 aa）
片段：KINASE DOMAIN
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | SO9 (1S,2S,3R,4R)-3-({2-[3-(pyrrolidine-1-carbonyl)anilino]thieno[3,2-d]pyrimidin-4-yl}amino)bicyclo[2.2.1]hept-5-ene-2-carboxamide × 1 BME BETA-MERCAPTOETHANOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；The purified protein was used in crystallisation trials employing
both, a standard screen with approximately 1200 different conditions,
as well as crystallisation conditions identified using literature
data. Conditions initially obtained have been optimised using standard
strategies, systematically varying parameters critically influencing
crystallisation, such as temperature, protein concentration,
drop ratio, and others. These conditions were also refined by systematically
varying pH or precipitant concentrations.
|
分辨率 2.45 Å R-free 0.267 |
| 8DKS IRAK4 IN COMPLEX WITH COMPOUND #3 提交 2022-07-06 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1–460（460 aa）
片段：KINASE DOMAIN
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | SO9 (1S,2S,3R,4R)-3-({2-[3-(pyrrolidine-1-carbonyl)anilino]thieno[3,2-d]pyrimidin-4-yl}amino)bicyclo[2.2.1]hept-5-ene-2-carboxamide × 1 BME BETA-MERCAPTOETHANOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；The purified protein was used in crystallisation trials employing
both, a standard screen with approximately 1200 different conditions,
as well as crystallisation conditions identified using literature
data. Conditions initially obtained have been optimised using standard
strategies, systematically varying parameters critically influencing
crystallisation, such as temperature, protein concentration,
drop ratio, and others. These conditions were also refined by systematically
varying pH or precipitant concentrations.
|
分辨率 2.45 Å R-free 0.267 |
| 8SCE Crystal structure of IRAK4-HSA complexed with N-[(2R)-2-FLUORO-3-HYDROXY-3-METHYLBUTYL]-6-[(5-FLUOROPYRI-YL)AMINO]-4-[(PROPAN-2-YL)AMINO]PYRIDINE-3-CARBOXAMIDE 提交 2023-04-05 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
36–336（301 aa）
片段：KINASE DOMAIN
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | ZVD N-[(2R)-2-fluoro-3-hydroxy-3-methylbutyl]-6-[(5-fluoropyrimidin-4-yl)amino]-4-[(propan-2-yl)amino]pyridine-3-carboxamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；Crystallization conditions: 2.6 to 2.9 M ammonium sulphate in 25 mM HEPES pH 6.4 to 7.5 at 293K
|
分辨率 1.89 Å R-free 0.228 |
| 8SCE Crystal structure of IRAK4-HSA complexed with N-[(2R)-2-FLUORO-3-HYDROXY-3-METHYLBUTYL]-6-[(5-FLUOROPYRI-YL)AMINO]-4-[(PROPAN-2-YL)AMINO]PYRIDINE-3-CARBOXAMIDE 提交 2023-04-05 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
36–336（301 aa）
片段：KINASE DOMAIN
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | ZVD N-[(2R)-2-fluoro-3-hydroxy-3-methylbutyl]-6-[(5-fluoropyrimidin-4-yl)amino]-4-[(propan-2-yl)amino]pyridine-3-carboxamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；Crystallization conditions: 2.6 to 2.9 M ammonium sulphate in 25 mM HEPES pH 6.4 to 7.5 at 293K
|
分辨率 1.89 Å R-free 0.228 |
| 8SCE Crystal structure of IRAK4-HSA complexed with N-[(2R)-2-FLUORO-3-HYDROXY-3-METHYLBUTYL]-6-[(5-FLUOROPYRI-YL)AMINO]-4-[(PROPAN-2-YL)AMINO]PYRIDINE-3-CARBOXAMIDE 提交 2023-04-05 | Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 D
36–336（301 aa）
片段：KINASE DOMAIN
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | ZVD N-[(2R)-2-fluoro-3-hydroxy-3-methylbutyl]-6-[(5-fluoropyrimidin-4-yl)amino]-4-[(propan-2-yl)amino]pyridine-3-carboxamide × 1 SO4 SULFATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；Crystallization conditions: 2.6 to 2.9 M ammonium sulphate in 25 mM HEPES pH 6.4 to 7.5 at 293K
|
分辨率 1.89 Å R-free 0.228 |
| 8SCE Crystal structure of IRAK4-HSA complexed with N-[(2R)-2-FLUORO-3-HYDROXY-3-METHYLBUTYL]-6-[(5-FLUOROPYRI-YL)AMINO]-4-[(PROPAN-2-YL)AMINO]PYRIDINE-3-CARBOXAMIDE 提交 2023-04-05 | Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 E
36–336（301 aa）
片段：KINASE DOMAIN
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | ZVD N-[(2R)-2-fluoro-3-hydroxy-3-methylbutyl]-6-[(5-fluoropyrimidin-4-yl)amino]-4-[(propan-2-yl)amino]pyridine-3-carboxamide × 1 SO4 SULFATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；Crystallization conditions: 2.6 to 2.9 M ammonium sulphate in 25 mM HEPES pH 6.4 to 7.5 at 293K
|
分辨率 1.89 Å R-free 0.228 |
| 8SCV Crystal structure of IRAK4-HSA complexed with BMS-986126; 6-((5-CYANO-2-PYRIMIDINYL)AMINO)-N-((2R)-2-FLUORO-3-HYDROXHYLBUTYL)-4-(ISOPROPYLAMINO)NICOTINAMIDE 提交 2023-04-05 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
36–336（301 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | ZVG 6-[(5-cyanopyrimidin-2-yl)amino]-N-[(2R)-2-fluoro-3-hydroxy-3-methylbutyl]-4-[(propan-2-yl)amino]pyridine-3-carboxamide × 1 SO4 SULFATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；2.6 to 2.9 M ammonium sulphate in 25 mM HEPES pH 6.4 to 7.5 at 293K
|
分辨率 2.69 Å R-free 0.261 |
| 8SCV Crystal structure of IRAK4-HSA complexed with BMS-986126; 6-((5-CYANO-2-PYRIMIDINYL)AMINO)-N-((2R)-2-FLUORO-3-HYDROXHYLBUTYL)-4-(ISOPROPYLAMINO)NICOTINAMIDE 提交 2023-04-05 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
36–336（301 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | ZVG 6-[(5-cyanopyrimidin-2-yl)amino]-N-[(2R)-2-fluoro-3-hydroxy-3-methylbutyl]-4-[(propan-2-yl)amino]pyridine-3-carboxamide × 1 SO4 SULFATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；2.6 to 2.9 M ammonium sulphate in 25 mM HEPES pH 6.4 to 7.5 at 293K
|
分辨率 2.69 Å R-free 0.261 |
| 8SCW Crystal structure of IRAK4-HSA complexed with BMS-986147; 6-{5-CYANO-1H-PYRAZOLO[3,4-B]PYRIDIN-1-YL}-N-[(2R)-2-FLUORROXY-3-METHYLBUTYL]-4-[(PROPAN-2-YL)AMINO]PYRIDINE-3-CARBOXAMIDE 提交 2023-04-05 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
36–336（301 aa）
片段：KINASE DOMAIN
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | SO4 SULFATE ION × 1 ZVA (6M)-6-(5-cyano-1H-pyrazolo[3,4-b]pyridin-1-yl)-N-[(2R)-2-fluoro-3-hydroxy-3-methylbutyl]-4-[(propan-2-yl)amino]pyridine-3-carboxamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；2.6 to 2.9 M ammonium sulphate in 25 mM HEPES pH 6.4 to 7.5 at 293K
|
分辨率 2.76 Å R-free 0.238 |
| 8SCW Crystal structure of IRAK4-HSA complexed with BMS-986147; 6-{5-CYANO-1H-PYRAZOLO[3,4-B]PYRIDIN-1-YL}-N-[(2R)-2-FLUORROXY-3-METHYLBUTYL]-4-[(PROPAN-2-YL)AMINO]PYRIDINE-3-CARBOXAMIDE 提交 2023-04-05 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
36–336（301 aa）
片段：KINASE DOMAIN
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | SO4 SULFATE ION × 2 ZVA (6M)-6-(5-cyano-1H-pyrazolo[3,4-b]pyridin-1-yl)-N-[(2R)-2-fluoro-3-hydroxy-3-methylbutyl]-4-[(propan-2-yl)amino]pyridine-3-carboxamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；2.6 to 2.9 M ammonium sulphate in 25 mM HEPES pH 6.4 to 7.5 at 293K
|
分辨率 2.76 Å R-free 0.238 |
| 8SCW Crystal structure of IRAK4-HSA complexed with BMS-986147; 6-{5-CYANO-1H-PYRAZOLO[3,4-B]PYRIDIN-1-YL}-N-[(2R)-2-FLUORROXY-3-METHYLBUTYL]-4-[(PROPAN-2-YL)AMINO]PYRIDINE-3-CARBOXAMIDE 提交 2023-04-05 | Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 C
36–336（301 aa）
片段：KINASE DOMAIN
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | SO4 SULFATE ION × 3 ZVA (6M)-6-(5-cyano-1H-pyrazolo[3,4-b]pyridin-1-yl)-N-[(2R)-2-fluoro-3-hydroxy-3-methylbutyl]-4-[(propan-2-yl)amino]pyridine-3-carboxamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；2.6 to 2.9 M ammonium sulphate in 25 mM HEPES pH 6.4 to 7.5 at 293K
|
分辨率 2.76 Å R-free 0.238 |
| 8SCW Crystal structure of IRAK4-HSA complexed with BMS-986147; 6-{5-CYANO-1H-PYRAZOLO[3,4-B]PYRIDIN-1-YL}-N-[(2R)-2-FLUORROXY-3-METHYLBUTYL]-4-[(PROPAN-2-YL)AMINO]PYRIDINE-3-CARBOXAMIDE 提交 2023-04-05 | Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 D
36–336（301 aa）
片段：KINASE DOMAIN
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | SO4 SULFATE ION × 2 ZVA (6M)-6-(5-cyano-1H-pyrazolo[3,4-b]pyridin-1-yl)-N-[(2R)-2-fluoro-3-hydroxy-3-methylbutyl]-4-[(propan-2-yl)amino]pyridine-3-carboxamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；2.6 to 2.9 M ammonium sulphate in 25 mM HEPES pH 6.4 to 7.5 at 293K
|
分辨率 2.76 Å R-free 0.238 |
| 8TVM IRAK4 in complex with compound 24 提交 2023-08-18 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
154–460（307 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | VDC N-{1-[(1R,2R)-2-fluorocyclopropyl]-2-oxo-1,2-dihydropyridin-3-yl}-2-[(1R,4r)-1-methyl-2-oxabicyclo[2.1.1]hexan-4-yl]-6-[(propan-2-yl)oxy]-2H-pyrazolo[3,4-b]pyridine-5-carboxamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；Sodium Malonate
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.246 |
| 8TVM IRAK4 in complex with compound 24 提交 2023-08-18 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
154–460（307 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | VDC N-{1-[(1R,2R)-2-fluorocyclopropyl]-2-oxo-1,2-dihydropyridin-3-yl}-2-[(1R,4r)-1-methyl-2-oxabicyclo[2.1.1]hexan-4-yl]-6-[(propan-2-yl)oxy]-2H-pyrazolo[3,4-b]pyridine-5-carboxamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；Sodium Malonate
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.246 |
| 8TVM IRAK4 in complex with compound 24 提交 2023-08-18 | Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 C
154–460（307 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | VDC N-{1-[(1R,2R)-2-fluorocyclopropyl]-2-oxo-1,2-dihydropyridin-3-yl}-2-[(1R,4r)-1-methyl-2-oxabicyclo[2.1.1]hexan-4-yl]-6-[(propan-2-yl)oxy]-2H-pyrazolo[3,4-b]pyridine-5-carboxamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；Sodium Malonate
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.246 |
| 8TVM IRAK4 in complex with compound 24 提交 2023-08-18 | Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 D
154–460（307 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | VDC N-{1-[(1R,2R)-2-fluorocyclopropyl]-2-oxo-1,2-dihydropyridin-3-yl}-2-[(1R,4r)-1-methyl-2-oxabicyclo[2.1.1]hexan-4-yl]-6-[(propan-2-yl)oxy]-2H-pyrazolo[3,4-b]pyridine-5-carboxamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；Sodium Malonate
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.246 |
| 8TVN IRAK4 in complex with compound 23 提交 2023-08-18 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
154–460（307 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | VE9 N-{1-[(1R,2S)-2-fluorocyclopropyl]-2-oxo-1,2-dihydropyridin-3-yl}-2-[(1R,4r)-1-methyl-2-oxabicyclo[2.1.1]hexan-4-yl]-6-[(propan-2-yl)oxy]-2H-pyrazolo[3,4-b]pyridine-5-carboxamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；Sodium Malonate
|
分辨率 1.95 Å R-free 0.242 |
| 8TVN IRAK4 in complex with compound 23 提交 2023-08-18 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
154–460（307 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | VE9 N-{1-[(1R,2S)-2-fluorocyclopropyl]-2-oxo-1,2-dihydropyridin-3-yl}-2-[(1R,4r)-1-methyl-2-oxabicyclo[2.1.1]hexan-4-yl]-6-[(propan-2-yl)oxy]-2H-pyrazolo[3,4-b]pyridine-5-carboxamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；Sodium Malonate
|
分辨率 1.95 Å R-free 0.242 |
| 8TVN IRAK4 in complex with compound 23 提交 2023-08-18 | Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 C
154–460（307 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | VE9 N-{1-[(1R,2S)-2-fluorocyclopropyl]-2-oxo-1,2-dihydropyridin-3-yl}-2-[(1R,4r)-1-methyl-2-oxabicyclo[2.1.1]hexan-4-yl]-6-[(propan-2-yl)oxy]-2H-pyrazolo[3,4-b]pyridine-5-carboxamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；Sodium Malonate
|
分辨率 1.95 Å R-free 0.242 |
| 8TVN IRAK4 in complex with compound 23 提交 2023-08-18 | Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 D
154–460（307 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | VE9 N-{1-[(1R,2S)-2-fluorocyclopropyl]-2-oxo-1,2-dihydropyridin-3-yl}-2-[(1R,4r)-1-methyl-2-oxabicyclo[2.1.1]hexan-4-yl]-6-[(propan-2-yl)oxy]-2H-pyrazolo[3,4-b]pyridine-5-carboxamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；Sodium Malonate
|
分辨率 1.95 Å R-free 0.242 |
| 8TX0 IRAK4 in complex with compound 提交 2023-08-21 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
154–460（307 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | VEU ~{N}-(1-cyclopropyl-2-oxidanylidene-pyridin-3-yl)-2-(1-methyl-2-oxabicyclo[2.1.1]hexan-4-yl)-7-propan-2-yloxy-imidazo[1,2-a]pyrimidine-6-carboxamide × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；sodium malonate
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.238 |
| 8TX0 IRAK4 in complex with compound 提交 2023-08-21 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
154–460（307 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | VEU ~{N}-(1-cyclopropyl-2-oxidanylidene-pyridin-3-yl)-2-(1-methyl-2-oxabicyclo[2.1.1]hexan-4-yl)-7-propan-2-yloxy-imidazo[1,2-a]pyrimidine-6-carboxamide × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 NA SODIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；sodium malonate
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.238 |
| 8UCB IRAK4 in complex with compound 8 提交 2023-09-26 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
154–460（307 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | X1T 6-(difluoromethyl)-N-[(4R)-7-ethoxy-2-{[(3R)-oxolan-3-yl]methyl}imidazo[1,2-a]pyridin-6-yl]pyridine-2-carboxamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；293 K；sodium malonate
|
分辨率 1.85 Å R-free 0.243 |
| 8UCB IRAK4 in complex with compound 8 提交 2023-09-26 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
154–460（307 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | X1T 6-(difluoromethyl)-N-[(4R)-7-ethoxy-2-{[(3R)-oxolan-3-yl]methyl}imidazo[1,2-a]pyridin-6-yl]pyridine-2-carboxamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；293 K；sodium malonate
|
分辨率 1.85 Å R-free 0.243 |
| 8UCB IRAK4 in complex with compound 8 提交 2023-09-26 | Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 C
154–460（307 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | X1T 6-(difluoromethyl)-N-[(4R)-7-ethoxy-2-{[(3R)-oxolan-3-yl]methyl}imidazo[1,2-a]pyridin-6-yl]pyridine-2-carboxamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；293 K；sodium malonate
|
分辨率 1.85 Å R-free 0.243 |
| 8UCB IRAK4 in complex with compound 8 提交 2023-09-26 | Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 D
154–460（307 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | X1T 6-(difluoromethyl)-N-[(4R)-7-ethoxy-2-{[(3R)-oxolan-3-yl]methyl}imidazo[1,2-a]pyridin-6-yl]pyridine-2-carboxamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；293 K；sodium malonate
|
分辨率 1.85 Å R-free 0.243 |
| 8UCC IRAK4 in complex with compound 20 提交 2023-09-26 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
154–460（307 aa）
片段：kinase domain
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | WFQ (4S)-2-[(1R,4s)-1-methyl-2-oxabicyclo[2.1.1]hexan-4-yl]-N-[(8S)-6-methylpyrazolo[1,5-a]pyrimidin-3-yl]-7-[(propan-2-yl)oxy]imidazo[1,2-a]pyrimidine-6-carboxamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；293 K；sodium malonate
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.240 |
| 8UCC IRAK4 in complex with compound 20 提交 2023-09-26 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
154–460（307 aa）
片段：kinase domain
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | WFQ (4S)-2-[(1R,4s)-1-methyl-2-oxabicyclo[2.1.1]hexan-4-yl]-N-[(8S)-6-methylpyrazolo[1,5-a]pyrimidin-3-yl]-7-[(propan-2-yl)oxy]imidazo[1,2-a]pyrimidine-6-carboxamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；293 K；sodium malonate
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.240 |
| 8V1O Crystal structure of IRAK4 kinase domain with compound 4 提交 2023-11-21 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
160–460（301 aa）
片段：kinase domain
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | Y9T N-[2-(3-hydroxy-3-methylbutyl)-6-(2-hydroxypropan-2-yl)-2H-indazol-5-yl]-6-(trifluoromethyl)pyridine-2-carboxamide × 1 GOL GLYCEROL × 2 SO4 SULFATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.9；291 K；0.2M Ammonium sulfate, 0.1M MES, pH6.9, 30% w/v PEG5000 MME
|
分辨率 2.92 Å R-free 0.266 |
| 8V1O Crystal structure of IRAK4 kinase domain with compound 4 提交 2023-11-21 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
160–460（301 aa）
片段：kinase domain
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | Y9T N-[2-(3-hydroxy-3-methylbutyl)-6-(2-hydroxypropan-2-yl)-2H-indazol-5-yl]-6-(trifluoromethyl)pyridine-2-carboxamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.9；291 K；0.2M Ammonium sulfate, 0.1M MES, pH6.9, 30% w/v PEG5000 MME
|
分辨率 2.92 Å R-free 0.266 |
| 8V1O Crystal structure of IRAK4 kinase domain with compound 4 提交 2023-11-21 | Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 C
160–460（301 aa）
片段：kinase domain
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | Y9T N-[2-(3-hydroxy-3-methylbutyl)-6-(2-hydroxypropan-2-yl)-2H-indazol-5-yl]-6-(trifluoromethyl)pyridine-2-carboxamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.9；291 K；0.2M Ammonium sulfate, 0.1M MES, pH6.9, 30% w/v PEG5000 MME
|
分辨率 2.92 Å R-free 0.266 |
| 8V1O Crystal structure of IRAK4 kinase domain with compound 4 提交 2023-11-21 | Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 D
160–460（301 aa）
片段：kinase domain
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | Y9T N-[2-(3-hydroxy-3-methylbutyl)-6-(2-hydroxypropan-2-yl)-2H-indazol-5-yl]-6-(trifluoromethyl)pyridine-2-carboxamide × 1 CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.9；291 K；0.2M Ammonium sulfate, 0.1M MES, pH6.9, 30% w/v PEG5000 MME
|
分辨率 2.92 Å R-free 0.266 |
| 8V2F Crystal structure of IRAK4 kinase domain with compound 9 提交 2023-11-22 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
160–460（301 aa）
片段：kinase domain
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | YJU N-{2-[(1r,4r)-4-(hydroxymethyl)cyclohexyl]-6-(2-hydroxypropan-2-yl)-2H-indazol-5-yl}-6-(trifluoromethyl)pyridine-2-carboxamide × 1 CL CHLORIDE ION × 1 GOL GLYCEROL × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；291 K；1.8M ammonium citrate,
1.75mM compound (1.8% DMSO)
|
分辨率 2.09 Å R-free 0.208 |
| 8V2F Crystal structure of IRAK4 kinase domain with compound 9 提交 2023-11-22 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
160–460（301 aa）
片段：kinase domain
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | YJU N-{2-[(1r,4r)-4-(hydroxymethyl)cyclohexyl]-6-(2-hydroxypropan-2-yl)-2H-indazol-5-yl}-6-(trifluoromethyl)pyridine-2-carboxamide × 1 CL CHLORIDE ION × 1 GOL GLYCEROL × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；291 K；1.8M ammonium citrate,
1.75mM compound (1.8% DMSO)
|
分辨率 2.09 Å R-free 0.208 |
| 8V2F Crystal structure of IRAK4 kinase domain with compound 9 提交 2023-11-22 | Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 C
160–460（301 aa）
片段：kinase domain
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | YJU N-{2-[(1r,4r)-4-(hydroxymethyl)cyclohexyl]-6-(2-hydroxypropan-2-yl)-2H-indazol-5-yl}-6-(trifluoromethyl)pyridine-2-carboxamide × 1 CL CHLORIDE ION × 1 GOL GLYCEROL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；291 K；1.8M ammonium citrate,
1.75mM compound (1.8% DMSO)
|
分辨率 2.09 Å R-free 0.208 |
| 8V2F Crystal structure of IRAK4 kinase domain with compound 9 提交 2023-11-22 | Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 D
160–460（301 aa）
片段：kinase domain
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | YJU N-{2-[(1r,4r)-4-(hydroxymethyl)cyclohexyl]-6-(2-hydroxypropan-2-yl)-2H-indazol-5-yl}-6-(trifluoromethyl)pyridine-2-carboxamide × 1 GOL GLYCEROL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；291 K；1.8M ammonium citrate,
1.75mM compound (1.8% DMSO)
|
分辨率 2.09 Å R-free 0.208 |
| 8V2L Crystal structure of IRAK4 kinase domain with compound 8 提交 2023-11-22 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
160–460（301 aa）
片段：kinase domain
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | YK0 N-{2-[4-(hydroxymethyl)phenyl]-6-(2-hydroxypropan-2-yl)-2H-indazol-5-yl}-6-(trifluoromethyl)pyridine-2-carboxamide × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.7；293 K；0.1M MES, pH6.7, 0.2M Ammonium sulfate, 25% w/v PEG5000 MME
|
分辨率 2.43 Å R-free 0.302 |
| 8V2L Crystal structure of IRAK4 kinase domain with compound 8 提交 2023-11-22 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
160–460（301 aa）
片段：kinase domain
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | YK0 N-{2-[4-(hydroxymethyl)phenyl]-6-(2-hydroxypropan-2-yl)-2H-indazol-5-yl}-6-(trifluoromethyl)pyridine-2-carboxamide × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.7；293 K；0.1M MES, pH6.7, 0.2M Ammonium sulfate, 25% w/v PEG5000 MME
|
分辨率 2.43 Å R-free 0.302 |
| 8V2L Crystal structure of IRAK4 kinase domain with compound 8 提交 2023-11-22 | Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 C
160–460（301 aa）
片段：kinase domain
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | YK0 N-{2-[4-(hydroxymethyl)phenyl]-6-(2-hydroxypropan-2-yl)-2H-indazol-5-yl}-6-(trifluoromethyl)pyridine-2-carboxamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.7；293 K；0.1M MES, pH6.7, 0.2M Ammonium sulfate, 25% w/v PEG5000 MME
|
分辨率 2.43 Å R-free 0.302 |
| 8V2L Crystal structure of IRAK4 kinase domain with compound 8 提交 2023-11-22 | Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 D
160–460（301 aa）
片段：kinase domain
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | YK0 N-{2-[4-(hydroxymethyl)phenyl]-6-(2-hydroxypropan-2-yl)-2H-indazol-5-yl}-6-(trifluoromethyl)pyridine-2-carboxamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.7；293 K；0.1M MES, pH6.7, 0.2M Ammonium sulfate, 25% w/v PEG5000 MME
|
分辨率 2.43 Å R-free 0.302 |
| 8W3W Crystal structure of IRAK4 in complex with compound 4 提交 2024-02-22 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
154–460（307 aa）
片段：UNP residues 154-460
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | A1AFO 7-methoxy-1-{[(2S)-5-oxopyrrolidin-2-yl]methoxy}isoquinoline-6-carboxamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；295 K；ammonium citrate tribasic
|
分辨率 1.98 Å R-free 0.213 |
| 8W3W Crystal structure of IRAK4 in complex with compound 4 提交 2024-02-22 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
154–460（307 aa）
片段：UNP residues 154-460
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | A1AFO 7-methoxy-1-{[(2S)-5-oxopyrrolidin-2-yl]methoxy}isoquinoline-6-carboxamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；295 K；ammonium citrate tribasic
|
分辨率 1.98 Å R-free 0.213 |
| 8W3W Crystal structure of IRAK4 in complex with compound 4 提交 2024-02-22 | Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 C
154–460（307 aa）
片段：UNP residues 154-460
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | A1AFO 7-methoxy-1-{[(2S)-5-oxopyrrolidin-2-yl]methoxy}isoquinoline-6-carboxamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；295 K；ammonium citrate tribasic
|
分辨率 1.98 Å R-free 0.213 |
| 8W3W Crystal structure of IRAK4 in complex with compound 4 提交 2024-02-22 | Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 D
154–460（307 aa）
片段：UNP residues 154-460
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | A1AFO 7-methoxy-1-{[(2S)-5-oxopyrrolidin-2-yl]methoxy}isoquinoline-6-carboxamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；295 K；ammonium citrate tribasic
|
分辨率 1.98 Å R-free 0.213 |
| 8W3X Crystal structure of IRAK4 in complex with compound 6 提交 2024-02-22 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
154–460（307 aa）
片段：UNP residues 154-460
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | A1AFH 7-ethoxy-1-{[(2S)-5-oxopyrrolidin-2-yl]methoxy}isoquinoline-6-carboxamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；AMMONIUM CITRATE
|
分辨率 1.76 Å R-free 0.212 |
| 8W3X Crystal structure of IRAK4 in complex with compound 6 提交 2024-02-22 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
154–460（307 aa）
片段：UNP residues 154-460
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | A1AFH 7-ethoxy-1-{[(2S)-5-oxopyrrolidin-2-yl]methoxy}isoquinoline-6-carboxamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；AMMONIUM CITRATE
|
分辨率 1.76 Å R-free 0.212 |
| 8W3X Crystal structure of IRAK4 in complex with compound 6 提交 2024-02-22 | Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 C
154–460（307 aa）
片段：UNP residues 154-460
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | A1AFH 7-ethoxy-1-{[(2S)-5-oxopyrrolidin-2-yl]methoxy}isoquinoline-6-carboxamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；AMMONIUM CITRATE
|
分辨率 1.76 Å R-free 0.212 |
| 8W3X Crystal structure of IRAK4 in complex with compound 6 提交 2024-02-22 | Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 D
154–460（307 aa）
片段：UNP residues 154-460
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | A1AFH 7-ethoxy-1-{[(2S)-5-oxopyrrolidin-2-yl]methoxy}isoquinoline-6-carboxamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；AMMONIUM CITRATE
|
分辨率 1.76 Å R-free 0.212 |
| 8WTF The Crystal Structure of IRAK4 from Biortus 提交 2023-10-18 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
164–460（297 aa）
|
未记录 | 8CG 1-{[(2S,3S,4S)-3-ethyl-4-fluoro-5-oxopyrrolidin-2-yl]methoxy}-7-methoxyisoquinoline-6-carboxamide × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 SO4 SULFATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.2M Ammonium sulfate,0.1M BisTris,5.5,25% w/vPEG 3350
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.236 |
| 9NA2 IRAK4 in Complex with Compound 9 提交 2025-02-11 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
160–460（301 aa）
片段：kinase domain
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | A1BW0 (6P)-6-[(8R)-3-cyanopyrrolo[1,2-b]pyridazin-7-yl]-N-[(2R)-2-fluoro-3-hydroxy-3-methylbutyl]-4-(methylamino)pyridine-3-carboxamide × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293.15 K；2.15 M ammonium sulfate, 100 mM Hepes-NaOH at pH 7.0
|
分辨率 1.99 Å R-free 0.246 |
| 9NA2 IRAK4 in Complex with Compound 9 提交 2025-02-11 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
160–460（301 aa）
片段：kinase domain
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | A1BW0 (6P)-6-[(8R)-3-cyanopyrrolo[1,2-b]pyridazin-7-yl]-N-[(2R)-2-fluoro-3-hydroxy-3-methylbutyl]-4-(methylamino)pyridine-3-carboxamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293.15 K；2.15 M ammonium sulfate, 100 mM Hepes-NaOH at pH 7.0
|
分辨率 1.99 Å R-free 0.246 |
| 9NA3 IRAK4 in Complex with Compound 15 提交 2025-02-11 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
160–460（301 aa）
片段：kinase domain
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | A1BWX (6P)-6-[(8R)-3-cyanopyrrolo[1,2-b]pyridazin-7-yl]-N-[(2S)-2-fluoro-3-hydroxy-3-methylbutyl]-4-[(4-hydroxybicyclo[2.2.2]octan-1-yl)amino]pyridine-3-carboxamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293.15 K；2.15 M ammonium sulfate, 100 mM Hepes-NaOH at pH 7.0
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.277 |
| 9NA3 IRAK4 in Complex with Compound 15 提交 2025-02-11 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 H0A0
160–460（301 aa）
片段：kinase domain
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | A1BWX (6P)-6-[(8R)-3-cyanopyrrolo[1,2-b]pyridazin-7-yl]-N-[(2S)-2-fluoro-3-hydroxy-3-methylbutyl]-4-[(4-hydroxybicyclo[2.2.2]octan-1-yl)amino]pyridine-3-carboxamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293.15 K；2.15 M ammonium sulfate, 100 mM Hepes-NaOH at pH 7.0
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.277 |
| 9NA4 IRAK4 in Complex with Compound 18 提交 2025-02-11 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
160–460（301 aa）
片段：kinase domain
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | A1BW1 methyl {[(1S,3s)-3-{[(2P)-2-[(8R)-3-cyanopyrrolo[1,2-b]pyridazin-7-yl]-5-{[(2S)-2-fluoro-3-hydroxy-3-methylbutyl]carbamoyl}pyridin-4-yl]amino}cyclobutyl]methyl}carbamate × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293.15 K；30% PEG 8000, 0.2 M calcium acetate, 0.1 M MES pH 6.0
|
分辨率 2.33 Å R-free 0.273 |
| 9NA4 IRAK4 in Complex with Compound 18 提交 2025-02-11 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
160–460（301 aa）
片段：kinase domain
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | A1BW1 methyl {[(1S,3s)-3-{[(2P)-2-[(8R)-3-cyanopyrrolo[1,2-b]pyridazin-7-yl]-5-{[(2S)-2-fluoro-3-hydroxy-3-methylbutyl]carbamoyl}pyridin-4-yl]amino}cyclobutyl]methyl}carbamate × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293.15 K；30% PEG 8000, 0.2 M calcium acetate, 0.1 M MES pH 6.0
|
分辨率 2.33 Å R-free 0.273 |
| 9NA4 IRAK4 in Complex with Compound 18 提交 2025-02-11 | Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 C
160–460（301 aa）
片段：kinase domain
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | A1BW1 methyl {[(1S,3s)-3-{[(2P)-2-[(8R)-3-cyanopyrrolo[1,2-b]pyridazin-7-yl]-5-{[(2S)-2-fluoro-3-hydroxy-3-methylbutyl]carbamoyl}pyridin-4-yl]amino}cyclobutyl]methyl}carbamate × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293.15 K；30% PEG 8000, 0.2 M calcium acetate, 0.1 M MES pH 6.0
|
分辨率 2.33 Å R-free 0.273 |
| 9NA4 IRAK4 in Complex with Compound 18 提交 2025-02-11 | Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 D
160–460（301 aa）
片段：kinase domain
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | A1BW1 methyl {[(1S,3s)-3-{[(2P)-2-[(8R)-3-cyanopyrrolo[1,2-b]pyridazin-7-yl]-5-{[(2S)-2-fluoro-3-hydroxy-3-methylbutyl]carbamoyl}pyridin-4-yl]amino}cyclobutyl]methyl}carbamate × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293.15 K；30% PEG 8000, 0.2 M calcium acetate, 0.1 M MES pH 6.0
|
分辨率 2.33 Å R-free 0.273 |
| 9NA5 IRAK4 in Complex with Compound 24 提交 2025-02-11 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
160–460（301 aa）
片段：kinase domain
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | A1BWY (6P)-6-[(8R)-3-cyanopyrrolo[1,2-b]pyridazin-7-yl]-4-({(1s,4S)-4-[1-(difluoromethyl)-1H-pyrazol-4-yl]cyclohexyl}amino)-N-[(2S)-2-fluoro-3-hydroxy-3-methylbutyl]pyridine-3-carboxamide × 1 SO4 SULFATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293.15 K；2.15 M ammonium sulfate, 100 mM Hepes-NaOH at pH 7.0
|
分辨率 1.73 Å R-free 0.227 |
| 9NA5 IRAK4 in Complex with Compound 24 提交 2025-02-11 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
160–460（301 aa）
片段：kinase domain
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | A1BWY (6P)-6-[(8R)-3-cyanopyrrolo[1,2-b]pyridazin-7-yl]-4-({(1s,4S)-4-[1-(difluoromethyl)-1H-pyrazol-4-yl]cyclohexyl}amino)-N-[(2S)-2-fluoro-3-hydroxy-3-methylbutyl]pyridine-3-carboxamide × 1 SO4 SULFATE ION × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293.15 K；2.15 M ammonium sulfate, 100 mM Hepes-NaOH at pH 7.0
|
分辨率 1.73 Å R-free 0.227 |
| 9NA5 IRAK4 in Complex with Compound 24 提交 2025-02-11 | Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 C
160–460（301 aa）
片段：kinase domain
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | A1BWY (6P)-6-[(8R)-3-cyanopyrrolo[1,2-b]pyridazin-7-yl]-4-({(1s,4S)-4-[1-(difluoromethyl)-1H-pyrazol-4-yl]cyclohexyl}amino)-N-[(2S)-2-fluoro-3-hydroxy-3-methylbutyl]pyridine-3-carboxamide × 1 SO4 SULFATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293.15 K；2.15 M ammonium sulfate, 100 mM Hepes-NaOH at pH 7.0
|
分辨率 1.73 Å R-free 0.227 |
| 9NA5 IRAK4 in Complex with Compound 24 提交 2025-02-11 | Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 D
160–460（301 aa）
片段：kinase domain
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | A1BWY (6P)-6-[(8R)-3-cyanopyrrolo[1,2-b]pyridazin-7-yl]-4-({(1s,4S)-4-[1-(difluoromethyl)-1H-pyrazol-4-yl]cyclohexyl}amino)-N-[(2S)-2-fluoro-3-hydroxy-3-methylbutyl]pyridine-3-carboxamide × 1 SO4 SULFATE ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293.15 K；2.15 M ammonium sulfate, 100 mM Hepes-NaOH at pH 7.0
|
分辨率 1.73 Å R-free 0.227 |
| 9NA6 IRAK4 in Complex with Compound 34 提交 2025-02-11 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
160–460（301 aa）
片段：kinase domain
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | A1BWZ (6P)-4-{[(1S)-1-cyanoethyl]amino}-6-[(8S)-3-cyanopyrrolo[1,2-b]pyridazin-7-yl]-N-[(2S)-2-fluoro-3-hydroxy-3-methylbutyl]pyridine-3-carboxamide × 1 SO4 SULFATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293.15 K；2.15 M ammonium sulfate, 100 mM Hepes-NaOH at pH 7.0
|
分辨率 2.14 Å R-free 0.246 |
| 9NA6 IRAK4 in Complex with Compound 34 提交 2025-02-11 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
160–460（301 aa）
片段：kinase domain
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | A1BWZ (6P)-4-{[(1S)-1-cyanoethyl]amino}-6-[(8S)-3-cyanopyrrolo[1,2-b]pyridazin-7-yl]-N-[(2S)-2-fluoro-3-hydroxy-3-methylbutyl]pyridine-3-carboxamide × 1 SO4 SULFATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293.15 K；2.15 M ammonium sulfate, 100 mM Hepes-NaOH at pH 7.0
|
分辨率 2.14 Å R-free 0.246 |
| 9NA6 IRAK4 in Complex with Compound 34 提交 2025-02-11 | Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 C
160–460（301 aa）
片段：kinase domain
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | A1BWZ (6P)-4-{[(1S)-1-cyanoethyl]amino}-6-[(8S)-3-cyanopyrrolo[1,2-b]pyridazin-7-yl]-N-[(2S)-2-fluoro-3-hydroxy-3-methylbutyl]pyridine-3-carboxamide × 1 SO4 SULFATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293.15 K；2.15 M ammonium sulfate, 100 mM Hepes-NaOH at pH 7.0
|
分辨率 2.14 Å R-free 0.246 |
| 9NA6 IRAK4 in Complex with Compound 34 提交 2025-02-11 | Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 D
160–460（301 aa）
片段：kinase domain
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | A1BWZ (6P)-4-{[(1S)-1-cyanoethyl]amino}-6-[(8S)-3-cyanopyrrolo[1,2-b]pyridazin-7-yl]-N-[(2S)-2-fluoro-3-hydroxy-3-methylbutyl]pyridine-3-carboxamide × 1 SO4 SULFATE ION × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293.15 K；2.15 M ammonium sulfate, 100 mM Hepes-NaOH at pH 7.0
|
分辨率 2.14 Å R-free 0.246 |
| 9PSS IRAK4 in Complex with Compound 3 提交 2025-07-26 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
160–460（301 aa）
片段：kinase domain
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | A1CKP (7P,8S)-7-{(5M)-5-[1-(oxan-4-yl)-1H-1,2,3-triazol-4-yl]-4-[(propan-2-yl)amino]pyridin-2-yl}pyrrolo[1,2-b]pyridazine-3-carbonitrile × 1 SO4 SULFATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；293.15 K；100 mM sodium acetate, 2.0M ammonium sulfate
|
分辨率 1.93 Å R-free 0.283 |
| 9PSS IRAK4 in Complex with Compound 3 提交 2025-07-26 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
160–460（301 aa）
片段：kinase domain
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | A1CKP (7P,8S)-7-{(5M)-5-[1-(oxan-4-yl)-1H-1,2,3-triazol-4-yl]-4-[(propan-2-yl)amino]pyridin-2-yl}pyrrolo[1,2-b]pyridazine-3-carbonitrile × 1 SO4 SULFATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；293.15 K；100 mM sodium acetate, 2.0M ammonium sulfate
|
分辨率 1.93 Å R-free 0.283 |
| 9PST IRAK4 in Complex with Compound 5 提交 2025-07-26 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
160–460（301 aa）
片段：kinase domain
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | A1CKQ N-[(1R,4r)-4-(5-{(6P)-6-[(8R)-3-cyanopyrrolo[1,2-b]pyridazin-7-yl]-4-[(propan-2-yl)amino]pyridin-3-yl}-1,3,4-thiadiazol-2-yl)cyclohexyl]acetamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；293.15 K；100 mM sodium acetate, 2.0M ammonium sulfate
|
分辨率 2.12 Å R-free 0.269 |
| 9PST IRAK4 in Complex with Compound 5 提交 2025-07-26 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
160–460（301 aa）
片段：kinase domain
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | A1CKQ N-[(1R,4r)-4-(5-{(6P)-6-[(8R)-3-cyanopyrrolo[1,2-b]pyridazin-7-yl]-4-[(propan-2-yl)amino]pyridin-3-yl}-1,3,4-thiadiazol-2-yl)cyclohexyl]acetamide × 1 SO4 SULFATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；293.15 K；100 mM sodium acetate, 2.0M ammonium sulfate
|
分辨率 2.12 Å R-free 0.269 |
| 9PST IRAK4 in Complex with Compound 5 提交 2025-07-26 | Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 C
160–460（301 aa）
片段：kinase domain
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | A1CKQ N-[(1R,4r)-4-(5-{(6P)-6-[(8R)-3-cyanopyrrolo[1,2-b]pyridazin-7-yl]-4-[(propan-2-yl)amino]pyridin-3-yl}-1,3,4-thiadiazol-2-yl)cyclohexyl]acetamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；293.15 K；100 mM sodium acetate, 2.0M ammonium sulfate
|
分辨率 2.12 Å R-free 0.269 |
| 9PST IRAK4 in Complex with Compound 5 提交 2025-07-26 | Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 D
160–460（301 aa）
片段：kinase domain
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | A1CKQ N-[(1R,4r)-4-(5-{(6P)-6-[(8R)-3-cyanopyrrolo[1,2-b]pyridazin-7-yl]-4-[(propan-2-yl)amino]pyridin-3-yl}-1,3,4-thiadiazol-2-yl)cyclohexyl]acetamide × 1 SO4 SULFATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；293.15 K；100 mM sodium acetate, 2.0M ammonium sulfate
|
分辨率 2.12 Å R-free 0.269 |
| 9PSU IRAK4 in Complex with Compound 12 提交 2025-07-26 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
160–460（301 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | A1CKS N-[(1R,5S,8R)-3-(5-{(6P)-6-[(8S)-3-cyanopyrrolo[1,2-b]pyridazin-7-yl]-4-[(propan-2-yl)amino]pyridin-3-yl}-1,3,4-thiadiazol-2-yl)-3-azabicyclo[3.2.1]octan-8-yl]acetamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；293.15 K；100 mM sodium acetate, 2.0M ammonium sulfate
|
分辨率 2.43 Å R-free 0.295 |
| 9PSU IRAK4 in Complex with Compound 12 提交 2025-07-26 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
160–460（301 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | A1CKS N-[(1R,5S,8R)-3-(5-{(6P)-6-[(8S)-3-cyanopyrrolo[1,2-b]pyridazin-7-yl]-4-[(propan-2-yl)amino]pyridin-3-yl}-1,3,4-thiadiazol-2-yl)-3-azabicyclo[3.2.1]octan-8-yl]acetamide × 1 SO4 SULFATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；293.15 K；100 mM sodium acetate, 2.0M ammonium sulfate
|
分辨率 2.43 Å R-free 0.295 |
| 9PSU IRAK4 in Complex with Compound 12 提交 2025-07-26 | Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 C
160–460（301 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | A1CKS N-[(1R,5S,8R)-3-(5-{(6P)-6-[(8S)-3-cyanopyrrolo[1,2-b]pyridazin-7-yl]-4-[(propan-2-yl)amino]pyridin-3-yl}-1,3,4-thiadiazol-2-yl)-3-azabicyclo[3.2.1]octan-8-yl]acetamide × 1 SO4 SULFATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；293.15 K；100 mM sodium acetate, 2.0M ammonium sulfate
|
分辨率 2.43 Å R-free 0.295 |
| 9PSU IRAK4 in Complex with Compound 12 提交 2025-07-26 | Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 D
160–460（301 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | A1CKS N-[(1R,5S,8R)-3-(5-{(6P)-6-[(8S)-3-cyanopyrrolo[1,2-b]pyridazin-7-yl]-4-[(propan-2-yl)amino]pyridin-3-yl}-1,3,4-thiadiazol-2-yl)-3-azabicyclo[3.2.1]octan-8-yl]acetamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；293.15 K；100 mM sodium acetate, 2.0M ammonium sulfate
|
分辨率 2.43 Å R-free 0.295 |
| 9R9G IRAK4 in complex with inhibitor 提交 2025-05-20 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
30–336（307 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | Y9T N-[2-(3-hydroxy-3-methylbutyl)-6-(2-hydroxypropan-2-yl)-2H-indazol-5-yl]-6-(trifluoromethyl)pyridine-2-carboxamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；2.2 M NaMalonate 0.1 M NaAcetate pH 5
|
分辨率 1.88 Å R-free 0.228 |
| 9R9G IRAK4 in complex with inhibitor 提交 2025-05-20 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
30–336（307 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | Y9T N-[2-(3-hydroxy-3-methylbutyl)-6-(2-hydroxypropan-2-yl)-2H-indazol-5-yl]-6-(trifluoromethyl)pyridine-2-carboxamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；2.2 M NaMalonate 0.1 M NaAcetate pH 5
|
分辨率 1.88 Å R-free 0.228 |
| 9R9G IRAK4 in complex with inhibitor 提交 2025-05-20 | Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 C
30–336（307 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | Y9T N-[2-(3-hydroxy-3-methylbutyl)-6-(2-hydroxypropan-2-yl)-2H-indazol-5-yl]-6-(trifluoromethyl)pyridine-2-carboxamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；2.2 M NaMalonate 0.1 M NaAcetate pH 5
|
分辨率 1.88 Å R-free 0.228 |
| 9R9G IRAK4 in complex with inhibitor 提交 2025-05-20 | Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 D
30–336（307 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | Y9T N-[2-(3-hydroxy-3-methylbutyl)-6-(2-hydroxypropan-2-yl)-2H-indazol-5-yl]-6-(trifluoromethyl)pyridine-2-carboxamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；2.2 M NaMalonate 0.1 M NaAcetate pH 5
|
分辨率 1.88 Å R-free 0.228 |
| 9R9J IRAK4 in complex with inhibitor 提交 2025-05-20 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
30–336（307 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | A1JDR ~{N}-[2-(3-methyl-3-oxidanyl-butyl)-6-(2-oxidanylpropan-2-yl)indazol-5-yl]-1-(2-methylpyridin-4-yl)pyrazole-3-carboxamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；2.5 M AMS 0.1 M Hepes pH 6.9-7.7
|
分辨率 2.39 Å R-free 0.263 |
| 9R9J IRAK4 in complex with inhibitor 提交 2025-05-20 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
30–336（307 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | A1JDR ~{N}-[2-(3-methyl-3-oxidanyl-butyl)-6-(2-oxidanylpropan-2-yl)indazol-5-yl]-1-(2-methylpyridin-4-yl)pyrazole-3-carboxamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；2.5 M AMS 0.1 M Hepes pH 6.9-7.7
|
分辨率 2.39 Å R-free 0.263 |
| 9R9J IRAK4 in complex with inhibitor 提交 2025-05-20 | Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 C
30–336（307 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | A1JDR ~{N}-[2-(3-methyl-3-oxidanyl-butyl)-6-(2-oxidanylpropan-2-yl)indazol-5-yl]-1-(2-methylpyridin-4-yl)pyrazole-3-carboxamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；2.5 M AMS 0.1 M Hepes pH 6.9-7.7
|
分辨率 2.39 Å R-free 0.263 |
| 9R9J IRAK4 in complex with inhibitor 提交 2025-05-20 | Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 D
30–336（307 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | A1JDR ~{N}-[2-(3-methyl-3-oxidanyl-butyl)-6-(2-oxidanylpropan-2-yl)indazol-5-yl]-1-(2-methylpyridin-4-yl)pyrazole-3-carboxamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；2.5 M AMS 0.1 M Hepes pH 6.9-7.7
|
分辨率 2.39 Å R-free 0.263 |
| 9R9K IRAK4 in complex with inhibitor 提交 2025-05-20 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
30–336（307 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | A1JDQ ~{N}-[3-aminocarbonyl-1-(oxan-4-yl)pyrazol-4-yl]-2-(2-methylpyridin-4-yl)-1,3-oxazole-4-carboxamide × 1 SO4 SULFATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
EVAPORATION；298 K；HEPES 0.1M pH 7.1, (NH4)2SO4 2.3M
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分辨率 1.87 Å R-free 0.242 |
| 9R9K IRAK4 in complex with inhibitor 提交 2025-05-20 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
30–336（307 aa）
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非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | A1JDQ ~{N}-[3-aminocarbonyl-1-(oxan-4-yl)pyrazol-4-yl]-2-(2-methylpyridin-4-yl)-1,3-oxazole-4-carboxamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
EVAPORATION；298 K；HEPES 0.1M pH 7.1, (NH4)2SO4 2.3M
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分辨率 1.87 Å R-free 0.242 |
| 9R9K IRAK4 in complex with inhibitor 提交 2025-05-20 | Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 C
30–336（307 aa）
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非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | A1JDQ ~{N}-[3-aminocarbonyl-1-(oxan-4-yl)pyrazol-4-yl]-2-(2-methylpyridin-4-yl)-1,3-oxazole-4-carboxamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
EVAPORATION；298 K；HEPES 0.1M pH 7.1, (NH4)2SO4 2.3M
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分辨率 1.87 Å R-free 0.242 |
| 9R9K IRAK4 in complex with inhibitor 提交 2025-05-20 | Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 D
30–336（307 aa）
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非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | A1JDQ ~{N}-[3-aminocarbonyl-1-(oxan-4-yl)pyrazol-4-yl]-2-(2-methylpyridin-4-yl)-1,3-oxazole-4-carboxamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
EVAPORATION；298 K；HEPES 0.1M pH 7.1, (NH4)2SO4 2.3M
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分辨率 1.87 Å R-free 0.242 |