当前蛋白身份:Q9NXV2
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差异标签只比较当前检索结果;所有PDB和assembly原始记录仍分别保留。
相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 3DRX X-ray crystal structure of human KCTD5 protein crystallized in high-salt buffer 提交 2008-07-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 5 PDB 声明:pentameric(5) 与蛋白数一致 |
链 A
34–234(201 aa)
片段:UNP residues 34-234
链 B
34–234(201 aa)
片段:UNP residues 34-234
链 C
34–234(201 aa)
片段:UNP residues 34-234
链 D
34–234(201 aa)
片段:UNP residues 34-234
链 E
34–234(201 aa)
片段:UNP residues 34-234
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;pH 8.5;298 K;3.2 M NaCl, 100 mM Tris-HCl, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, temperature 298K
|
分辨率 3.11 Å R-free 0.275 |
| 3DRY X-ray crystal structure of human KCTD5 protein crystallized in low-salt buffer 提交 2008-07-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 5 PDB 声明:pentameric(5) 与蛋白数一致 |
链 A
34–234(201 aa)
片段:UNP residues 34-234
链 B
34–234(201 aa)
片段:UNP residues 34-234
链 C
34–234(201 aa)
片段:UNP residues 34-234
链 D
34–234(201 aa)
片段:UNP residues 34-234
链 E
34–234(201 aa)
片段:UNP residues 34-234
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;pH 7.5;0.2 M proline, 100 mM HEPES, 7% (w/v) PEG 3350, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION
|
分辨率 3.30 Å R-free 0.308 |
| 3DRZ X-ray crystal structure of the N-terminal BTB domain of human KCTD5 protein 提交 2008-07-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 5 PDB 声明:pentameric(5) 与蛋白数一致 |
链 A
40–145(106 aa)
片段:N-terminal domain, UNP residues 40-145
链 B
40–145(106 aa)
片段:N-terminal domain, UNP residues 40-145
链 C
40–145(106 aa)
片段:N-terminal domain, UNP residues 40-145
链 D
40–145(106 aa)
片段:N-terminal domain, UNP residues 40-145
链 E
40–145(106 aa)
片段:N-terminal domain, UNP residues 40-145
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;pH 7.5;298 K;24% (w/v) PEG 3350, 100 mM MgCl2, 100 M HEPES, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, temperature 298K
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.232 |
| 8U7Z KCTD5/Cullin3/Gbeta1gamma2 Complex: Local Refinment of KCTD5(CTD)/Gbeta1gamma2 提交 2023-09-15 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 15 PDB 声明:pentadecameric(15) 与蛋白数一致 |
链 K1
1–234(234 aa)
链 K2
1–234(234 aa)
链 K3
1–234(234 aa)
链 K4
1–234(234 aa)
链 K5
1–234(234 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.97 Å |
| 8U80 KCTD5/Cullin3/Gbeta1gamma2 Complex: Local Refinment of KCTD5(BTB)/Cullin3(NTD) 提交 2023-09-15 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 10 PDB 声明:decameric(10) 与蛋白数一致 |
链 K1
1–234(234 aa)
链 K2
1–234(234 aa)
链 K3
1–234(234 aa)
链 K4
1–234(234 aa)
链 K5
1–234(234 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.60 Å |
| 8U81 KCTD5/Cullin3/Gbeta1gamma2 Complex: State A From Composite RELION Multi-body Refinement Map 提交 2023-09-15 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 20 PDB 声明:eicosameric(20) 与蛋白数一致 |
链 K1
1–233(233 aa)
链 K2
1–233(233 aa)
链 K3
1–233(233 aa)
链 K4
1–233(233 aa)
链 K5
1–233(233 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.82 Å |
| 8U82 KCTD5/Cullin3/Gbeta1gamma2 Complex: State B From Composite RELION Multi-body Refinement Map 提交 2023-09-15 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 20 PDB 声明:eicosameric(20) 与蛋白数一致 |
链 K1
1–234(234 aa)
链 K2
1–234(234 aa)
链 K3
1–234(234 aa)
链 K4
1–234(234 aa)
链 K5
1–234(234 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.84 Å |
| 8U83 KCTD5/Cullin3/Gbeta1gamma2 Complex: State C From Composite RELION Multi-body Refinement Map 提交 2023-09-15 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 20 PDB 声明:eicosameric(20) 与蛋白数一致 |
链 K1
1–234(234 aa)
链 K2
1–234(234 aa)
链 K3
1–234(234 aa)
链 K4
1–234(234 aa)
链 K5
1–234(234 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.98 Å |
| 8U84 KCTD5/Cullin3/Gbeta1gamma2 Complex: State D From Composite RELION Multi-body Refinement Map 提交 2023-09-15 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 20 PDB 声明:eicosameric(20) 与蛋白数一致 |
链 K1
1–234(234 aa)
链 K2
1–234(234 aa)
链 K3
1–234(234 aa)
链 K4
1–234(234 aa)
链 K5
1–234(234 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.88 Å |