当前蛋白身份:Q9NXV2 重新检索
本组结构的主要差异维度
构建体不同 突变/修饰不同 组装状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量指标不同

差异标签只比较当前检索结果;所有PDB和assembly原始记录仍分别保留。

相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
3DRX X-ray crystal structure of human KCTD5 protein crystallized in high-salt buffer 提交 2008-07-11 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 5 PDB 声明:pentameric(5) 与蛋白数一致
链 A 34–234(201 aa) 片段:UNP residues 34-234
链 B 34–234(201 aa) 片段:UNP residues 34-234
链 C 34–234(201 aa) 片段:UNP residues 34-234
链 D 34–234(201 aa) 片段:UNP residues 34-234
链 E 34–234(201 aa) 片段:UNP residues 34-234
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION;pH 8.5;298 K;3.2 M NaCl, 100 mM Tris-HCl, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, temperature 298K
分辨率 3.11 Å R-free 0.275
3DRY X-ray crystal structure of human KCTD5 protein crystallized in low-salt buffer 提交 2008-07-11 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 5 PDB 声明:pentameric(5) 与蛋白数一致
链 A 34–234(201 aa) 片段:UNP residues 34-234
链 B 34–234(201 aa) 片段:UNP residues 34-234
链 C 34–234(201 aa) 片段:UNP residues 34-234
链 D 34–234(201 aa) 片段:UNP residues 34-234
链 E 34–234(201 aa) 片段:UNP residues 34-234
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION;pH 7.5;0.2 M proline, 100 mM HEPES, 7% (w/v) PEG 3350, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION
分辨率 3.30 Å R-free 0.308
3DRZ X-ray crystal structure of the N-terminal BTB domain of human KCTD5 protein 提交 2008-07-11 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 5 PDB 声明:pentameric(5) 与蛋白数一致
链 A 40–145(106 aa) 片段:N-terminal domain, UNP residues 40-145
链 B 40–145(106 aa) 片段:N-terminal domain, UNP residues 40-145
链 C 40–145(106 aa) 片段:N-terminal domain, UNP residues 40-145
链 D 40–145(106 aa) 片段:N-terminal domain, UNP residues 40-145
链 E 40–145(106 aa) 片段:N-terminal domain, UNP residues 40-145
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION;pH 7.5;298 K;24% (w/v) PEG 3350, 100 mM MgCl2, 100 M HEPES, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, temperature 298K
分辨率 1.90 Å R-free 0.232
8U7Z KCTD5/Cullin3/Gbeta1gamma2 Complex: Local Refinment of KCTD5(CTD)/Gbeta1gamma2 提交 2023-09-15 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 15 PDB 声明:pentadecameric(15) 与蛋白数一致
链 K1 1–234(234 aa)
链 K2 1–234(234 aa)
链 K3 1–234(234 aa)
链 K4 1–234(234 aa)
链 K5 1–234(234 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.97 Å
8U80 KCTD5/Cullin3/Gbeta1gamma2 Complex: Local Refinment of KCTD5(BTB)/Cullin3(NTD) 提交 2023-09-15 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 10 PDB 声明:decameric(10) 与蛋白数一致
链 K1 1–234(234 aa)
链 K2 1–234(234 aa)
链 K3 1–234(234 aa)
链 K4 1–234(234 aa)
链 K5 1–234(234 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
8U81 KCTD5/Cullin3/Gbeta1gamma2 Complex: State A From Composite RELION Multi-body Refinement Map 提交 2023-09-15 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 20 PDB 声明:eicosameric(20) 与蛋白数一致
链 K1 1–233(233 aa)
链 K2 1–233(233 aa)
链 K3 1–233(233 aa)
链 K4 1–233(233 aa)
链 K5 1–233(233 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.82 Å
8U82 KCTD5/Cullin3/Gbeta1gamma2 Complex: State B From Composite RELION Multi-body Refinement Map 提交 2023-09-15 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 20 PDB 声明:eicosameric(20) 与蛋白数一致
链 K1 1–234(234 aa)
链 K2 1–234(234 aa)
链 K3 1–234(234 aa)
链 K4 1–234(234 aa)
链 K5 1–234(234 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.84 Å
8U83 KCTD5/Cullin3/Gbeta1gamma2 Complex: State C From Composite RELION Multi-body Refinement Map 提交 2023-09-15 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 20 PDB 声明:eicosameric(20) 与蛋白数一致
链 K1 1–234(234 aa)
链 K2 1–234(234 aa)
链 K3 1–234(234 aa)
链 K4 1–234(234 aa)
链 K5 1–234(234 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.98 Å
8U84 KCTD5/Cullin3/Gbeta1gamma2 Complex: State D From Composite RELION Multi-body Refinement Map 提交 2023-09-15 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 20 PDB 声明:eicosameric(20) 与蛋白数一致
链 K1 1–234(234 aa)
链 K2 1–234(234 aa)
链 K3 1–234(234 aa)
链 K4 1–234(234 aa)
链 K5 1–234(234 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.88 Å