当前蛋白身份:Q9P0K1 重新检索
本组结构的主要差异维度
构建体不同 突变/修饰不同 组装状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量指标不同

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相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
3G5C Structural and biochemical studies on the ectodomain of human ADAM22 提交 2009-02-04 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 233–736(504 aa) 片段:M, D, C and E domains
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3 CA CALCIUM ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;298 K;pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298.0K
分辨率 2.36 Å R-free 0.273
3G5C Structural and biochemical studies on the ectodomain of human ADAM22 提交 2009-02-04 Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 B 233–736(504 aa) 片段:M, D, C and E domains
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3 CA CALCIUM ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;298 K;pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298.0K
分辨率 2.36 Å R-free 0.273
5Y2Z Crystal structure of human LGI1 EPTP-ADAM22 complex 提交 2017-07-27 Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 233–729(497 aa) 片段:UNP RESIDUES 233-729
未记录 CA CALCIUM ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6;293 K;10 % PEG 8000, 0.1 M zinc acetate, 0.1 M MES-Na (pH 6.0)
分辨率 2.67 Å R-free 0.279
5Y2Z Crystal structure of human LGI1 EPTP-ADAM22 complex 提交 2017-07-27 Assembly 2 其他组合 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 C 233–729(497 aa) 片段:UNP RESIDUES 233-729
未记录 CA CALCIUM ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6;293 K;10 % PEG 8000, 0.1 M zinc acetate, 0.1 M MES-Na (pH 6.0)
分辨率 2.67 Å R-free 0.279
5Y2Z Crystal structure of human LGI1 EPTP-ADAM22 complex 提交 2017-07-27 Assembly 3 其他组合 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 E 233–729(497 aa) 片段:UNP RESIDUES 233-729
未记录 CA CALCIUM ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6;293 K;10 % PEG 8000, 0.1 M zinc acetate, 0.1 M MES-Na (pH 6.0)
分辨率 2.67 Å R-free 0.279
5Y2Z Crystal structure of human LGI1 EPTP-ADAM22 complex 提交 2017-07-27 Assembly 4 其他组合 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 G 233–729(497 aa) 片段:UNP RESIDUES 233-729
未记录 CA CALCIUM ION × 4 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6;293 K;10 % PEG 8000, 0.1 M zinc acetate, 0.1 M MES-Na (pH 6.0)
分辨率 2.67 Å R-free 0.279
5Y2Z Crystal structure of human LGI1 EPTP-ADAM22 complex 提交 2017-07-27 Assembly 5 其他组合 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 I 233–729(497 aa) 片段:UNP RESIDUES 233-729
未记录 CA CALCIUM ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6;293 K;10 % PEG 8000, 0.1 M zinc acetate, 0.1 M MES-Na (pH 6.0)
分辨率 2.67 Å R-free 0.279
5Y2Z Crystal structure of human LGI1 EPTP-ADAM22 complex 提交 2017-07-27 Assembly 6 其他组合 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 K 233–729(497 aa) 片段:UNP RESIDUES 233-729
未记录 CA CALCIUM ION × 4 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6;293 K;10 % PEG 8000, 0.1 M zinc acetate, 0.1 M MES-Na (pH 6.0)
分辨率 2.67 Å R-free 0.279
5Y31 Crystal structure of human LGI1-ADAM22 complex 提交 2017-07-27 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 233–729(497 aa) 片段:UNP RESIDUES 233-729
未记录 CA CALCIUM ION × 4 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 5 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6;293 K;10 % PEG 8000, 0.1 M zinc acetate, 0.1 M MES-Na (pH 6.0)
分辨率 7.12 Å R-free 0.316
5Y31 Crystal structure of human LGI1-ADAM22 complex 提交 2017-07-27 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 C 233–729(497 aa) 片段:UNP RESIDUES 233-729
未记录 CA CALCIUM ION × 4 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 5 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6;293 K;10 % PEG 8000, 0.1 M zinc acetate, 0.1 M MES-Na (pH 6.0)
分辨率 7.12 Å R-free 0.316
7CQF Crystal structure of PSD-95 PDZ3 fused with ADAM22 C-terminal peptide 提交 2020-08-10 Assembly 1 信息不足 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 892–906(15 aa)
未记录 CL CHLORIDE ION × 1 CHT CHOLINE ION × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;0.2 M choline chloride, 0.1 M Tris-HCl (pH 7.5), 14 % (w/v) PEG 2000 MME
分辨率 1.80 Å R-free 0.205
8HPY Crystal structure of human LGI1-ADAM22 complex 提交 2022-12-13 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 233–718(486 aa)
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 6 CA CALCIUM ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;2.5M sodium chloride, 0.1M HEPES pH=7.5, 2% (w/v) Benzamidine
分辨率 5.87 Å R-free 0.343
8HPY Crystal structure of human LGI1-ADAM22 complex 提交 2022-12-13 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 B 233–718(486 aa)
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 6 CA CALCIUM ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;2.5M sodium chloride, 0.1M HEPES pH=7.5, 2% (w/v) Benzamidine
分辨率 5.87 Å R-free 0.343
8HQ1 Crystal Structure Of Human Lgi1-Adam22 Complex In Space Group C2 提交 2022-12-13 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 233–718(486 aa)
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 6 CA CALCIUM ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.2;293 K;2M SODIUM CHLORIDE, 0.1M POTASSIUM/SODIUM PHOSPHATE pH=6.2
分辨率 4.17 Å R-free 0.314
8HQ1 Crystal Structure Of Human Lgi1-Adam22 Complex In Space Group C2 提交 2022-12-13 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 B 233–718(486 aa)
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 6 CA CALCIUM ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.2;293 K;2M SODIUM CHLORIDE, 0.1M POTASSIUM/SODIUM PHOSPHATE pH=6.2
分辨率 4.17 Å R-free 0.314
8HQ1 Crystal Structure Of Human Lgi1-Adam22 Complex In Space Group C2 提交 2022-12-13 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 C 233–718(486 aa)
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 6 CA CALCIUM ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.2;293 K;2M SODIUM CHLORIDE, 0.1M POTASSIUM/SODIUM PHOSPHATE pH=6.2
分辨率 4.17 Å R-free 0.314
8HQ2 Crystal structure of human ADAM22 in complex with human LGI1 mutant 提交 2022-12-13 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 233–718(486 aa)
未记录 CA CALCIUM ION × 4 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 6 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;7.5% PEG 4000, 0.2M MAGNESIUM CHLORIDE, 0.1M HEPES PH=7.5
分辨率 2.93 Å R-free 0.291
8HQ2 Crystal structure of human ADAM22 in complex with human LGI1 mutant 提交 2022-12-13 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 B 233–718(486 aa)
未记录 CA CALCIUM ION × 4 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 6 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;7.5% PEG 4000, 0.2M MAGNESIUM CHLORIDE, 0.1M HEPES PH=7.5
分辨率 2.93 Å R-free 0.291
8Y6B Structure of human LGI1-ADAM22 complex in space group P212121 提交 2024-02-02 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 233–718(486 aa)
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 6 CA CALCIUM ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7;293 K;0.8M sodium/potassium tartrate, 0.1M Tris pH=7.0, 0.2M lithium sulfate.
分辨率 3.49 Å R-free 0.277
8Y6B Structure of human LGI1-ADAM22 complex in space group P212121 提交 2024-02-02 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 B 233–718(486 aa)
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 6 CA CALCIUM ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7;293 K;0.8M sodium/potassium tartrate, 0.1M Tris pH=7.0, 0.2M lithium sulfate.
分辨率 3.49 Å R-free 0.277
8Y6B Structure of human LGI1-ADAM22 complex in space group P212121 提交 2024-02-02 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 C 233–718(486 aa)
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 6 CA CALCIUM ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7;293 K;0.8M sodium/potassium tartrate, 0.1M Tris pH=7.0, 0.2M lithium sulfate.
分辨率 3.49 Å R-free 0.277
9KZC Cryo-EM structure of the LGI1 LRR-LGI1 EPTP-ADAM22 ECD complex 提交 2024-12-10 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 A 233–718(486 aa) 片段:UNP RESIDUES 233-729
未记录 CA CALCIUM ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.78 Å
9KZT Cryo-EM structure of the 3:3 LGI1-ADAM22 complex 提交 2024-12-11 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric(6) 与蛋白数一致
链 A 233–729(497 aa) 片段:UNP RESIDUES 233-729
链 C 233–729(497 aa) 片段:UNP RESIDUES 233-729
链 E 233–729(497 aa) 片段:UNP RESIDUES 233-729
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.79 Å