当前蛋白身份：Q9SN73
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| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 6EKB Crystal structure of the BSD2 homolog of Arabidopsis thaliana 提交 2017-09-26 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
57–136（80 aa）
|
突变：K56M | ZN ZINC ION × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；291 K；20 % PEG 10,000, 8 % ethylene glycol and 0.1 M HEPES-NaOH pH 7.5
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.216 |
| 6EKC Crystal structure of the BSD2 homolog of Arabidopsis thaliana bound to the octameric assembly of RbcL from Thermosynechococcus elongatus 提交 2017-09-26 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric（16） 与蛋白数一致 |
链 B1
57–136（80 aa）
片段：mature protein, residues 53-136
链 B2
57–136（80 aa）
片段：mature protein, residues 53-136
链 B3
57–136（80 aa）
片段：mature protein, residues 53-136
链 B4
57–136（80 aa）
片段：mature protein, residues 53-136
链 B5
57–136（80 aa）
片段：mature protein, residues 53-136
链 B6
57–136（80 aa）
片段：mature protein, residues 53-136
链 B7
57–136（80 aa）
片段：mature protein, residues 53-136
链 B8
57–136（80 aa）
片段：mature protein, residues 53-136
|
突变：K56M 突变：K56M 突变：K56M 突变：K56M 突变：K56M 突变：K56M 突变：K56M 突变：K56M | ZN ZINC ION × 16 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；291 K；21 % PEG 3350 and 0.12M DL-malic acid pH 7.0
|
分辨率 2.63 Å R-free 0.274 |
| 6EKC Crystal structure of the BSD2 homolog of Arabidopsis thaliana bound to the octameric assembly of RbcL from Thermosynechococcus elongatus 提交 2017-09-26 | Assembly 10 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric（16） 与蛋白数一致 |
链 T1
57–136（80 aa）
片段：mature protein, residues 53-136
链 T2
57–136（80 aa）
片段：mature protein, residues 53-136
链 T3
57–136（80 aa）
片段：mature protein, residues 53-136
链 T4
57–136（80 aa）
片段：mature protein, residues 53-136
链 T5
57–136（80 aa）
片段：mature protein, residues 53-136
链 T6
57–136（80 aa）
片段：mature protein, residues 53-136
链 T7
57–136（80 aa）
片段：mature protein, residues 53-136
链 T8
57–136（80 aa）
片段：mature protein, residues 53-136
|
突变：K56M 突变：K56M 突变：K56M 突变：K56M 突变：K56M 突变：K56M 突变：K56M 突变：K56M | ZN ZINC ION × 16 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；291 K；21 % PEG 3350 and 0.12M DL-malic acid pH 7.0
|
分辨率 2.63 Å R-free 0.274 |
| 6EKC Crystal structure of the BSD2 homolog of Arabidopsis thaliana bound to the octameric assembly of RbcL from Thermosynechococcus elongatus 提交 2017-09-26 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric（16） 与蛋白数一致 |
链 D1
57–136（80 aa）
片段：mature protein, residues 53-136
链 D2
57–136（80 aa）
片段：mature protein, residues 53-136
链 D3
57–136（80 aa）
片段：mature protein, residues 53-136
链 D4
57–136（80 aa）
片段：mature protein, residues 53-136
链 D5
57–136（80 aa）
片段：mature protein, residues 53-136
链 D6
57–136（80 aa）
片段：mature protein, residues 53-136
链 D7
57–136（80 aa）
片段：mature protein, residues 53-136
链 D8
57–136（80 aa）
片段：mature protein, residues 53-136
|
突变：K56M 突变：K56M 突变：K56M 突变：K56M 突变：K56M 突变：K56M 突变：K56M 突变：K56M | ZN ZINC ION × 16 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；291 K；21 % PEG 3350 and 0.12M DL-malic acid pH 7.0
|
分辨率 2.63 Å R-free 0.274 |
| 6EKC Crystal structure of the BSD2 homolog of Arabidopsis thaliana bound to the octameric assembly of RbcL from Thermosynechococcus elongatus 提交 2017-09-26 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric（16） 与蛋白数一致 |
链 F1
57–136（80 aa）
片段：mature protein, residues 53-136
链 F2
57–136（80 aa）
片段：mature protein, residues 53-136
链 F3
57–136（80 aa）
片段：mature protein, residues 53-136
链 F4
57–136（80 aa）
片段：mature protein, residues 53-136
链 F5
57–136（80 aa）
片段：mature protein, residues 53-136
链 F6
57–136（80 aa）
片段：mature protein, residues 53-136
链 F7
57–136（80 aa）
片段：mature protein, residues 53-136
链 F8
57–136（80 aa）
片段：mature protein, residues 53-136
|
突变：K56M 突变：K56M 突变：K56M 突变：K56M 突变：K56M 突变：K56M 突变：K56M 突变：K56M | ZN ZINC ION × 16 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；291 K；21 % PEG 3350 and 0.12M DL-malic acid pH 7.0
|
分辨率 2.63 Å R-free 0.274 |
| 6EKC Crystal structure of the BSD2 homolog of Arabidopsis thaliana bound to the octameric assembly of RbcL from Thermosynechococcus elongatus 提交 2017-09-26 | Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric（16） 与蛋白数一致 |
链 H1
57–136（80 aa）
片段：mature protein, residues 53-136
链 H2
57–136（80 aa）
片段：mature protein, residues 53-136
链 H3
57–136（80 aa）
片段：mature protein, residues 53-136
链 H4
57–136（80 aa）
片段：mature protein, residues 53-136
链 H5
57–136（80 aa）
片段：mature protein, residues 53-136
链 H6
57–136（80 aa）
片段：mature protein, residues 53-136
链 H7
57–136（80 aa）
片段：mature protein, residues 53-136
链 H8
57–136（80 aa）
片段：mature protein, residues 53-136
|
突变：K56M 突变：K56M 突变：K56M 突变：K56M 突变：K56M 突变：K56M 突变：K56M 突变：K56M | ZN ZINC ION × 16 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；291 K；21 % PEG 3350 and 0.12M DL-malic acid pH 7.0
|
分辨率 2.63 Å R-free 0.274 |
| 6EKC Crystal structure of the BSD2 homolog of Arabidopsis thaliana bound to the octameric assembly of RbcL from Thermosynechococcus elongatus 提交 2017-09-26 | Assembly 5 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric（16） 与蛋白数一致 |
链 J1
57–136（80 aa）
片段：mature protein, residues 53-136
链 J2
57–136（80 aa）
片段：mature protein, residues 53-136
链 J3
57–136（80 aa）
片段：mature protein, residues 53-136
链 J4
57–136（80 aa）
片段：mature protein, residues 53-136
链 J5
57–136（80 aa）
片段：mature protein, residues 53-136
链 J6
57–136（80 aa）
片段：mature protein, residues 53-136
链 J7
57–136（80 aa）
片段：mature protein, residues 53-136
链 J8
57–136（80 aa）
片段：mature protein, residues 53-136
|
突变：K56M 突变：K56M 突变：K56M 突变：K56M 突变：K56M 突变：K56M 突变：K56M 突变：K56M | ZN ZINC ION × 16 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；291 K；21 % PEG 3350 and 0.12M DL-malic acid pH 7.0
|
分辨率 2.63 Å R-free 0.274 |
| 6EKC Crystal structure of the BSD2 homolog of Arabidopsis thaliana bound to the octameric assembly of RbcL from Thermosynechococcus elongatus 提交 2017-09-26 | Assembly 6 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric（16） 与蛋白数一致 |
链 L1
57–136（80 aa）
片段：mature protein, residues 53-136
链 L2
57–136（80 aa）
片段：mature protein, residues 53-136
链 L3
57–136（80 aa）
片段：mature protein, residues 53-136
链 L4
57–136（80 aa）
片段：mature protein, residues 53-136
链 L5
57–136（80 aa）
片段：mature protein, residues 53-136
链 L6
57–136（80 aa）
片段：mature protein, residues 53-136
链 L7
57–136（80 aa）
片段：mature protein, residues 53-136
链 L8
57–136（80 aa）
片段：mature protein, residues 53-136
|
突变：K56M 突变：K56M 突变：K56M 突变：K56M 突变：K56M 突变：K56M 突变：K56M 突变：K56M | ZN ZINC ION × 16 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；291 K；21 % PEG 3350 and 0.12M DL-malic acid pH 7.0
|
分辨率 2.63 Å R-free 0.274 |
| 6EKC Crystal structure of the BSD2 homolog of Arabidopsis thaliana bound to the octameric assembly of RbcL from Thermosynechococcus elongatus 提交 2017-09-26 | Assembly 7 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric（16） 与蛋白数一致 |
链 N1
57–136（80 aa）
片段：mature protein, residues 53-136
链 N2
57–136（80 aa）
片段：mature protein, residues 53-136
链 N3
57–136（80 aa）
片段：mature protein, residues 53-136
链 N4
57–136（80 aa）
片段：mature protein, residues 53-136
链 N5
57–136（80 aa）
片段：mature protein, residues 53-136
链 N6
57–136（80 aa）
片段：mature protein, residues 53-136
链 N7
57–136（80 aa）
片段：mature protein, residues 53-136
链 N8
57–136（80 aa）
片段：mature protein, residues 53-136
|
突变：K56M 突变：K56M 突变：K56M 突变：K56M 突变：K56M 突变：K56M 突变：K56M 突变：K56M | ZN ZINC ION × 16 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；291 K；21 % PEG 3350 and 0.12M DL-malic acid pH 7.0
|
分辨率 2.63 Å R-free 0.274 |
| 6EKC Crystal structure of the BSD2 homolog of Arabidopsis thaliana bound to the octameric assembly of RbcL from Thermosynechococcus elongatus 提交 2017-09-26 | Assembly 8 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric（16） 与蛋白数一致 |
链 P1
57–136（80 aa）
片段：mature protein, residues 53-136
链 P2
57–136（80 aa）
片段：mature protein, residues 53-136
链 P3
57–136（80 aa）
片段：mature protein, residues 53-136
链 P4
57–136（80 aa）
片段：mature protein, residues 53-136
链 P5
57–136（80 aa）
片段：mature protein, residues 53-136
链 P6
57–136（80 aa）
片段：mature protein, residues 53-136
链 P7
57–136（80 aa）
片段：mature protein, residues 53-136
链 P8
57–136（80 aa）
片段：mature protein, residues 53-136
|
突变：K56M 突变：K56M 突变：K56M 突变：K56M 突变：K56M 突变：K56M 突变：K56M 突变：K56M | ZN ZINC ION × 16 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；291 K；21 % PEG 3350 and 0.12M DL-malic acid pH 7.0
|
分辨率 2.63 Å R-free 0.274 |
| 6EKC Crystal structure of the BSD2 homolog of Arabidopsis thaliana bound to the octameric assembly of RbcL from Thermosynechococcus elongatus 提交 2017-09-26 | Assembly 9 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric（16） 与蛋白数一致 |
链 R1
57–136（80 aa）
片段：mature protein, residues 53-136
链 R2
57–136（80 aa）
片段：mature protein, residues 53-136
链 R3
57–136（80 aa）
片段：mature protein, residues 53-136
链 R4
57–136（80 aa）
片段：mature protein, residues 53-136
链 R5
57–136（80 aa）
片段：mature protein, residues 53-136
链 R6
57–136（80 aa）
片段：mature protein, residues 53-136
链 R7
57–136（80 aa）
片段：mature protein, residues 53-136
链 R8
57–136（80 aa）
片段：mature protein, residues 53-136
|
突变：K56M 突变：K56M 突变：K56M 突变：K56M 突变：K56M 突变：K56M 突变：K56M 突变：K56M | ZN ZINC ION × 16 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；291 K；21 % PEG 3350 and 0.12M DL-malic acid pH 7.0
|
分辨率 2.63 Å R-free 0.274 |
| 8ILB The complexes of RbcL, AtRaf1 and AtBSD2 (LFB) 提交 2023-03-03 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：octadecameric（18） 与蛋白数一致 |
链 F
57–136（80 aa）
链 G
57–136（80 aa）
链 H
57–136（80 aa）
链 I
57–136（80 aa）
链 O
57–136（80 aa）
链 P
57–136（80 aa）
链 Q
57–136（80 aa）
链 R
57–136（80 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.00 Å |
| 8ILM The cryo-EM structure of eight Rubisco large subunits (RbcL), two Arabidopsis thaliana Rubisco accumulation factors 1 (AtRaf1), and seven Arabidopsis thaliana Bundle Sheath Defective 2 (AtBSD2) 提交 2023-03-03 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 19 PDB 声明：nonadecameric（19） 与蛋白数一致 |
链 C
57–136（80 aa）
链 L
57–136（80 aa）
链 M
57–136（80 aa）
链 N
57–136（80 aa）
链 O
57–136（80 aa）
链 P
57–136（80 aa）
链 Q
57–136（80 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.30 Å |
| 9CI2 Anthoceros agrestis Rubisco octamer core complexed with small subunits and Arabidopsis thaliana BSD2 提交 2024-07-02 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：16-meric（16） 与蛋白数一致 |
链 1
1–136（136 aa）
链 2
1–136（136 aa）
链 3
1–136（136 aa）
链 4
1–136（136 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 4 CAP 2-CARBOXYARABINITOL-1,5-DIPHOSPHATE × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8；20 mM Tris pH 8.0
50 mM NaCl
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.90 Å |