当前蛋白身份:Q9ULG1 重新检索
本组结构的主要差异维度
构建体不同 组装状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量指标不同

差异标签只比较当前检索结果;所有PDB和assembly原始记录仍分别保留。

相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
6HTS Cryo-EM structure of the human INO80 complex bound to nucleosome 提交 2018-10-04 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 17 PDB 声明:nonadecameric(19) 与全部聚合物一致
链 G 267–1556(1290 aa)
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.80 Å
7ZI4 Cryo-EM structure of the human INO80 complex bound to a WT nucleosome 提交 2022-04-07 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 18 PDB 声明:eicosameric(20) 与全部聚合物一致
链 G 1–1556(1556 aa)
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 8 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE;4uL of sample applied to Quantifoil R2/2 Cu 300 mesh grids. blot parameters were wait time 30 sec, blot time 0.5 sec, blot force -8
分辨率 3.20 Å
9GCG CryoEM structure of the human INO80 core- H2A.Z nucleosome complex 提交 2024-08-01 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 18 PDB 声明:20-meric(20) 与全部聚合物一致
链 G 1–1556(1556 aa)
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 7 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.43 Å
9GE5 CryoEM structure of the human INO80-Hexasome complex 提交 2024-08-07 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 16 PDB 声明:18-meric(18) 与全部聚合物一致
链 G 518–1250(733 aa)
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 7 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.35 Å
9GEV CryoEM structure of the human INO80 core-nucleosome complex state N-6 提交 2024-08-07 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 18 PDB 声明:20-meric(20) 与全部聚合物一致
链 G 1–1556(1556 aa)
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.47 Å
9GFB CryoEM structure of the human INO80 core-nucleosome complex state N-7 提交 2024-08-08 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 18 PDB 声明:20-meric(20) 与全部聚合物一致
链 G 1–1556(1556 aa)
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.55 Å