当前蛋白身份:Q9ULK4
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差异标签只比较当前检索结果;所有PDB和assembly原始记录仍分别保留。
相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 6H02 Crystal structure of human Mediator subunit MED23 提交 2018-07-06 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 A
1–1368(1368 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7;294 K;10% PEG 6000
100mM HEPES
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.240 |
| 7EMF Human Mediator (deletion of MED1-IDR) in a Tail-extended conformation 提交 2021-04-13 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 27 PDB 声明:27-meric(27) 与蛋白数一致 |
链 W
1–1368(1368 aa)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.50 Å |
| 7ENA TFIID-based PIC-Mediator holo-complex in pre-assembled state (pre-hPIC-MED) 提交 2021-04-16 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 74 PDB 声明:76-meric(76) 与全部聚合物一致 |
链 w
1–1368(1368 aa)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 16 MG MAGNESIUM ION × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.07 Å |
| 7ENC TFIID-based PIC-Mediator holo-complex in fully-assembled state (hPIC-MED) 提交 2021-04-16 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 74 PDB 声明:76-meric(76) 与全部聚合物一致 |
链 w
1–1368(1368 aa)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 16 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.13 Å |
| 7ENJ Human Mediator (deletion of MED1-IDR) in a Tail-bent conformation (MED-B) 提交 2021-04-17 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 26 PDB 声明:26-meric(26) 与蛋白数一致 |
链 W
1–1368(1368 aa)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.40 Å |
| 7LBM Structure of the human Mediator-bound transcription pre-initiation complex 提交 2021-01-08 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 54 PDB 声明:56-meric(56) 与全部聚合物一致 |
链 1
1–1368(1368 aa)
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 16 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.80 Å |
| 8GXQ PIC-Mediator in complex with +1 nucleosome (T40N) in MH-binding state 提交 2022-09-21 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 83 PDB 声明:87-meric(87) 与全部聚合物一致 |
链 w
1–1368(1368 aa)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 19 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 5.04 Å |
| 8GXS PIC-Mediator in complex with +1 nucleosome (T40N) in H-binding state 提交 2022-09-21 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 83 PDB 声明:87-meric(87) 与全部聚合物一致 |
链 w
1–1368(1368 aa)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 19 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.16 Å |
| 8T9D CryoEM structure of TR-TRAP 提交 2023-06-23 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 26 PDB 声明:26-meric(26) 与蛋白数一致 |
链 R
1–1368(1368 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.66 Å |
| 8TQW Structure of human transcriptional Mediator complex 提交 2023-08-08 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 29 PDB 声明:29-meric(29) 与蛋白数一致 |
链 W
1–1368(1368 aa)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 8.20 Å |
| 8TRH The IDRc bound human core Mediator complex 提交 2023-08-09 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 26 PDB 声明:26-meric(26) 与蛋白数一致 |
链 W
1–1368(1368 aa)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.70 Å |
| 9F6Y CryoEM structure of Human Mediator subunit MED23 complexed with phosphorylated Elk-1 transcription factor 提交 2024-05-02 | Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 A
1–1368(1368 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.98 Å |
| 9F76 CryoEM structure of human Mediator subunit Med23 提交 2024-05-03 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致 |
链 A
1–1368(1368 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5;20mM Tris/HCl, 100mM NaCl, 1mM TCEP
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;blotting time 5.6sec, blot force 2
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分辨率 3.10 Å |