当前蛋白身份：Q9ULV1
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 5BPB Crystal structure of the cysteine-rich domain of human Frizzled 4 - Crystal Form I 提交 2015-05-27 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
42–179（138 aa）
片段：UNP residues 42-179
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；294 K；1.6 M tri-sodium citrate, pH 6.5
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.223 |
| 5BPB Crystal structure of the cysteine-rich domain of human Frizzled 4 - Crystal Form I 提交 2015-05-27 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
42–179（138 aa）
片段：UNP residues 42-179
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；294 K；1.6 M tri-sodium citrate, pH 6.5
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.223 |
| 5BPB Crystal structure of the cysteine-rich domain of human Frizzled 4 - Crystal Form I 提交 2015-05-27 | Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 D
42–179（138 aa）
片段：UNP residues 42-179
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；294 K；1.6 M tri-sodium citrate, pH 6.5
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.223 |
| 5BPB Crystal structure of the cysteine-rich domain of human Frizzled 4 - Crystal Form I 提交 2015-05-27 | Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 C
42–179（138 aa）
片段：UNP residues 42-179
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；294 K；1.6 M tri-sodium citrate, pH 6.5
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.223 |
| 5BPQ Crystal structure of the cysteine-rich domain of human Frizzled 4 - Crystal Form II 提交 2015-05-28 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
42–179（138 aa）
片段：cysteine-rich domain, UNP residues 42-179
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；294 K；0.1 M HEPES, pH 7.5, 0.1 M NaCl, 1.6 M ammonium sulfate
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.243 |
| 5BPQ Crystal structure of the cysteine-rich domain of human Frizzled 4 - Crystal Form II 提交 2015-05-28 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
42–179（138 aa）
片段：cysteine-rich domain, UNP residues 42-179
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；294 K；0.1 M HEPES, pH 7.5, 0.1 M NaCl, 1.6 M ammonium sulfate
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.243 |
| 5BPQ Crystal structure of the cysteine-rich domain of human Frizzled 4 - Crystal Form II 提交 2015-05-28 | Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 C
42–179（138 aa）
片段：cysteine-rich domain, UNP residues 42-179
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；294 K；0.1 M HEPES, pH 7.5, 0.1 M NaCl, 1.6 M ammonium sulfate
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.243 |
| 5BPQ Crystal structure of the cysteine-rich domain of human Frizzled 4 - Crystal Form II 提交 2015-05-28 | Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 D
42–179（138 aa）
片段：cysteine-rich domain, UNP residues 42-179
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；294 K；0.1 M HEPES, pH 7.5, 0.1 M NaCl, 1.6 M ammonium sulfate
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.243 |
| 5BQC Crystal structure of Norrin in complex with the cysteine-rich domain of Frizzled 4 and sucrose octasulfate 提交 2015-05-28 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 B
42–179（138 aa）
片段：residues 42-179
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；294 K；0.1 M Tris, pH 8.0, 0.15 M NaCl, 8% PEG8000
|
分辨率 3.00 Å R-free 0.268 |
| 5BQE Crystal structure of Norrin in complex with the cysteine-rich domain of Frizzled 4 -Methylated form 提交 2015-05-28 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 C
42–179（138 aa）
片段：residues 42-179
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | PG0 2-(2-METHOXYETHOXY)ETHANOL × 4 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 CL CHLORIDE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；294 K；0.1 M Bicine, pH 9.0, 10% PEG6000
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分辨率 2.30 Å R-free 0.221 |
| 5CL1 Complex structure of Norrin with human Frizzled 4 提交 2015-07-16 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 C
38–160（123 aa）
片段：UNP residues 38-160
链 D
38–160（123 aa）
片段：UNP residues 38-160
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；200 mM ammonium sulfate, 100 mM sodium cacodylate trihydrate (pH 6.5), 15% w/v polyethylene glycol 8,000
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分辨率 3.80 Å R-free 0.310 |
| 5CM4 Crystal structure of human Frizzled 4 Cysteine-Rich Domain (CRD) 提交 2015-07-16 | Assembly 1 其他组合 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
40–164（125 aa）
片段：UNP residues 40-164
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；293 K；1.8 M ammonium sulfate, 0.1 M tri-Na citrate pH 5.6 and 0.2 M Na/K tartrate
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.255 |
| 5CM4 Crystal structure of human Frizzled 4 Cysteine-Rich Domain (CRD) 提交 2015-07-16 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
40–164（125 aa）
片段：UNP residues 40-164
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；293 K；1.8 M ammonium sulfate, 0.1 M tri-Na citrate pH 5.6 and 0.2 M Na/K tartrate
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.255 |
| 5UWG The crystal structure of Fz4-CRD in complex with palmitoleic acid 提交 2017-02-21 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
40–164（125 aa）
片段：Cysteine Rich Domain (UNP residues 40-164)
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未记录 | PAM PALMITOLEIC ACID × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 3.5；293 K；0.1 M citric acid pH 3.5, 28% w/v polyethylene glycol 8,000
|
分辨率 2.56 Å R-free 0.267 |
| 5UWG The crystal structure of Fz4-CRD in complex with palmitoleic acid 提交 2017-02-21 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
40–164（125 aa）
片段：Cysteine Rich Domain (UNP residues 40-164)
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 3.5；293 K；0.1 M citric acid pH 3.5, 28% w/v polyethylene glycol 8,000
|
分辨率 2.56 Å R-free 0.267 |
| 6BD4 Crystal structure of human apo-Frizzled4 receptor 提交 2017-10-21 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
178–419（242 aa）
链 A
428–517（90 aa）
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突变：M309L, C450I, C507F, S508Y 突变：M309L, C450I, C507F, S508Y | ZN ZINC ION × 1 OLC (2R)-2,3-dihydroxypropyl (9Z)-octadec-9-enoate × 4 OLA OLEIC ACID × 5 SO4 SULFATE ION × 3 UNX UNKNOWN LIGAND × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；pH 6；293 K；100 mM sodium cacodylate trihydrate (pH 6.0), 80 mM Magnesium Sulfate, 30% PEG400, 1.5-2.5% v/v (+/-)-2-Methyl-2,4-pentanediol
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.233 |
| 6NE1 Designed repeat protein in complex with Fz4 提交 2018-12-15 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
42–161（120 aa）
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未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；295 K；0.2 M ammonium chloride, pH 6.3 and 20% PEG3,350
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分辨率 3.01 Å R-free 0.293 |
| 8WM9 Fzd4/DEP complex 提交 2023-10-03 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
1–537（537 aa）
链 B
1–537（537 aa）
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未记录 | Y01 CHOLESTEROL HEMISUCCINATE × 10 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 3.53 Å |
| 8WMA Fzd4/DEP complex (local refined) 提交 2023-10-03 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–537（537 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 3.47 Å |