当前蛋白身份:Q9UPT6 重新检索
本组结构的主要差异维度
构建体不同 突变/修饰不同 组装状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量指标不同

差异标签只比较当前检索结果;所有PDB和assembly原始记录仍分别保留。

相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
4PXJ Crystallographic structure of the LZII fragment (anti-parallel orientation) from JIP3 提交 2014-03-24 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 433–486(54 aa) 片段:Leucine zipper II fragment
链 B 433–486(54 aa) 片段:Leucine zipper II fragment
未记录 SO4 SULFATE ION × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 4 GAI GUANIDINE × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION;pH 5.5;291 K;1.6 M SAM, 0.1 M citrate pH 5.5, 2 % PEG 400, VAPOR DIFFUSION, temperature 291K
分辨率 2.06 Å R-free 0.205
4PXJ Crystallographic structure of the LZII fragment (anti-parallel orientation) from JIP3 提交 2014-03-24 Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 C 433–486(54 aa) 片段:Leucine zipper II fragment
未记录 SO4 SULFATE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION;pH 5.5;291 K;1.6 M SAM, 0.1 M citrate pH 5.5, 2 % PEG 400, VAPOR DIFFUSION, temperature 291K
分辨率 2.06 Å R-free 0.205
8PR2 Cytoplasmic dynein-1 heavy chain bound to JIP3-LZI 提交 2023-07-12 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric(6) 与蛋白数一致
链 B 1–560(560 aa)
链 C 1–560(560 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
8PR3 Cytoplasmic dynein-1 heavy chain bound to JIP3-RH1 提交 2023-07-12 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 9 PDB 声明:nonameric(9) 与蛋白数一致
链 B 1–560(560 aa)
链 C 1–560(560 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
8PR4 Dynactin pointed end bound to JIP3 提交 2023-07-12 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric(6) 与蛋白数一致
链 X 1–560(560 aa)
链 x 1–560(560 aa)
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
8PTK Composite structure of Dynein-Dynactin-JIP3-LIS1 提交 2023-07-14 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 53 PDB 声明:53-meric(53) 与蛋白数一致
链 X 1–560(560 aa)
链 x 1–560(560 aa)
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 16 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 6 ZN ZINC ION × 3 MG MAGNESIUM ION × 6 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 10.00 Å