当前蛋白身份：Q9UQE7
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相关结构差异明细
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| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 6WG3 Cryo-EM structure of human Cohesin-NIPBL-DNA complex 提交 2020-04-04 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：heptameric（7） 与全部聚合物一致 |
链 B
1–1217（1217 aa）
|
未记录 | ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 5.30 Å |
| 6WG4 Crystal structure of human SMC1-SMC3 hinge domain heterodimer in south-open conformation 提交 2020-04-04 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
493–685（193 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；293.15 K；2% 1,4-dioxane, 0.1 Tris pH 8.0, 15% polyethylene glycol 3350
|
分辨率 2.31 Å R-free 0.235 |
| 6WG6 Crystal structure of human SMC1-SMC3 hinge domain heterodimer in north-open conformation 提交 2020-04-04 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：trimeric（3） 与全部聚合物一致 |
链 B
466–713（248 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4；293.15 K；0.1 M sodium acetate pH 4.0, 15% polyethylene glycol 400
|
分辨率 3.54 Å R-free 0.288 |
| 6WG6 Crystal structure of human SMC1-SMC3 hinge domain heterodimer in north-open conformation 提交 2020-04-04 | Assembly 2 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：trimeric（3） 与全部聚合物一致 |
链 D
466–713（248 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4；293.15 K；0.1 M sodium acetate pH 4.0, 15% polyethylene glycol 400
|
分辨率 3.54 Å R-free 0.288 |
| 6WG6 Crystal structure of human SMC1-SMC3 hinge domain heterodimer in north-open conformation 提交 2020-04-04 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 F
466–713（248 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4；293.15 K；0.1 M sodium acetate pH 4.0, 15% polyethylene glycol 400
|
分辨率 3.54 Å R-free 0.288 |
| 6WG6 Crystal structure of human SMC1-SMC3 hinge domain heterodimer in north-open conformation 提交 2020-04-04 | Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 H
466–713（248 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4；293.15 K；0.1 M sodium acetate pH 4.0, 15% polyethylene glycol 400
|
分辨率 3.54 Å R-free 0.288 |
| 6WG6 Crystal structure of human SMC1-SMC3 hinge domain heterodimer in north-open conformation 提交 2020-04-04 | Assembly 5 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 J
466–713（248 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4；293.15 K；0.1 M sodium acetate pH 4.0, 15% polyethylene glycol 400
|
分辨率 3.54 Å R-free 0.288 |
| 6WG6 Crystal structure of human SMC1-SMC3 hinge domain heterodimer in north-open conformation 提交 2020-04-04 | Assembly 6 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 L
466–713（248 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4；293.15 K；0.1 M sodium acetate pH 4.0, 15% polyethylene glycol 400
|
分辨率 3.54 Å R-free 0.288 |
| 6WGE Cryo-EM structure of human Cohesin-NIPBL-DNA complex without STAG1 提交 2020-04-05 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：hexameric（6） 与全部聚合物一致 |
链 B
1–1217（1217 aa）
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突变：E1144Q | ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.90 Å |
| 7W1M Cryo-EM structure of human cohesin-CTCF-DNA complex 提交 2021-11-19 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：octameric（8） 与全部聚合物一致 |
链 B
1–1217（1217 aa）
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 2 ZN ZINC ION × 11 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 6.50 Å |
| 8P0A Human Cohesin ATPase module 提交 2023-05-10 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 B
1–211（211 aa）
链 B
979–1217（239 aa）
|
未记录 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8.2
cryo-EM缓冲液
pH 8.2
cryo-EM缓冲液
pH 8.2
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.67 Å |
| 8ROH Human cohesin SMC3-HD(EQ)/RAD21-N complex - Apo conformation 提交 2024-01-11 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–219（219 aa）
链 A
971–1217（247 aa）
|
突变：E1144Q 突变：E1144Q | SO4 SULFATE ION × 3 GOL GLYCEROL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.21M NaSO4 ; 0.1M Bis-tris propane pH 7; 16% w/v PEG3350
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.255 |
| 8ROI Human cohesin SMC3-HD(EQ)/RAD21-N complex - ADP-bound conformation 提交 2024-01-11 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–211（211 aa）
链 A
979–1217（239 aa）
|
突变：E1144Q 突变：E1144Q | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.1 M Na/K phosphate pH 7.5; 0.1 M HEPES pH 7.5; 15% v/v PEG Smear High; 10% v/v ethylene glycol
|
分辨率 2.45 Å R-free 0.239 |
| 8ROJ Human cohesin SMC3-HD/RAD21-N complex - ADP-Mg-bound conformation 提交 2024-01-11 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–211（211 aa）
链 A
979–1217（239 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.075 M magnesium chloride; 0.075 M Sodium citrate tribasic dehydrate; 0.1 M Bis-Tris pH 6.0; 18% v/v PEG Smear Broad
|
分辨率 3.00 Å R-free 0.264 |
| 8ROK Human cohesin SMC3-HD(EQ)/RAD21-N complex - ATP-Mg-bound conformation - Form 1 提交 2024-01-11 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–211（211 aa）
链 A
979–1217（239 aa）
|
突变：E1144Q 突变：E1144Q | AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.3 M NaCl; 0.05 M L-Arginine; 0.1 M Tris pH7.5; 22.5 % v/v PEG Smear Broad; 0.05 M L-Glutamic acid monosodium salt hydrate
|
分辨率 2.25 Å R-free 0.253 |
| 8ROK Human cohesin SMC3-HD(EQ)/RAD21-N complex - ATP-Mg-bound conformation - Form 1 提交 2024-01-11 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 C
1–211（211 aa）
链 C
979–1217（239 aa）
|
突变：E1144Q 突变：E1144Q | AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.3 M NaCl; 0.05 M L-Arginine; 0.1 M Tris pH7.5; 22.5 % v/v PEG Smear Broad; 0.05 M L-Glutamic acid monosodium salt hydrate
|
分辨率 2.25 Å R-free 0.253 |
| 8ROL Human cohesin SMC3-HD(EQ)/RAD21-N complex - ATP-Mg-bound conformation - Form 2 提交 2024-01-11 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–211（211 aa）
链 A
979–1217（239 aa）
|
突变：E1144Q 突变：E1144Q | MG MAGNESIUM ION × 1 AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.1 M Sodium chloride; 0.1 M Bicine pH 9.0; 20% w/v PEG 550 MME
|
分辨率 3.11 Å R-free 0.238 |