当前蛋白身份:Q9WXS1
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1VLW Crystal structure of 2-dehydro-3-deoxyphosphogluconate aldolase/4-hydroxy-2-oxoglutarate aldolase (TM0066) from Thermotoga maritima at 2.30 A resolution 提交 2004-08-18 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致 |
链 A
1–205(205 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION,SITTING DROP,NANODROP;pH 7.5;277 K;22.5% PEG-1000, 0.1M Tris pH 7.5 , VAPOR DIFFUSION,SITTING DROP,NANODROP, temperature 277K
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.221 |
| 1VLW Crystal structure of 2-dehydro-3-deoxyphosphogluconate aldolase/4-hydroxy-2-oxoglutarate aldolase (TM0066) from Thermotoga maritima at 2.30 A resolution 提交 2004-08-18 | Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致 |
链 B
1–205(205 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION,SITTING DROP,NANODROP;pH 7.5;277 K;22.5% PEG-1000, 0.1M Tris pH 7.5 , VAPOR DIFFUSION,SITTING DROP,NANODROP, temperature 277K
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.221 |
| 1VLW Crystal structure of 2-dehydro-3-deoxyphosphogluconate aldolase/4-hydroxy-2-oxoglutarate aldolase (TM0066) from Thermotoga maritima at 2.30 A resolution 提交 2004-08-18 | Assembly 3 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致 |
链 C
1–205(205 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION,SITTING DROP,NANODROP;pH 7.5;277 K;22.5% PEG-1000, 0.1M Tris pH 7.5 , VAPOR DIFFUSION,SITTING DROP,NANODROP, temperature 277K
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.221 |
| 1VLW Crystal structure of 2-dehydro-3-deoxyphosphogluconate aldolase/4-hydroxy-2-oxoglutarate aldolase (TM0066) from Thermotoga maritima at 2.30 A resolution 提交 2004-08-18 | Assembly 4 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致 |
链 A
1–205(205 aa)
链 B
1–205(205 aa)
链 C
1–205(205 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION,SITTING DROP,NANODROP;pH 7.5;277 K;22.5% PEG-1000, 0.1M Tris pH 7.5 , VAPOR DIFFUSION,SITTING DROP,NANODROP, temperature 277K
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.221 |
| 1WA3 Mechanism of the Class I KDPG aldolase 提交 2004-10-22 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致 |
链 A
1–205(205 aa)
链 B
1–205(205 aa)
链 C
1–205(205 aa)
|
未记录 | PYR PYRUVIC ACID × 3 SO4 SULFATE ION × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 4.6;0.075M SODIUM ACETATE, 0.1M AMMONIUM SULPHATE, 28%W/V PEG4000, pH 4.60
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.239 |
| 1WA3 Mechanism of the Class I KDPG aldolase 提交 2004-10-22 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致 |
链 D
1–205(205 aa)
链 E
1–205(205 aa)
链 F
1–205(205 aa)
|
未记录 | PYR PYRUVIC ACID × 3 SO4 SULFATE ION × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 4.6;0.075M SODIUM ACETATE, 0.1M AMMONIUM SULPHATE, 28%W/V PEG4000, pH 4.60
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.239 |
| 5KP9 Structure of Nanoparticle Released from Enveloped Protein Nanoparticle 提交 2016-07-02 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体;蛋白 × 60 PDB 声明:60-meric(60) 与蛋白数一致 |
链 B
2–205(204 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5;Phosphate-buffered saline
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;11 second blot, 0 mm offset
|
分辨率 5.70 Å |
| 5KP9 Structure of Nanoparticle Released from Enveloped Protein Nanoparticle 提交 2016-07-02 | Assembly 2 信息不足 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致 |
链 B
2–205(204 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5;Phosphate-buffered saline
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;11 second blot, 0 mm offset
|
分辨率 5.70 Å |
| 5KP9 Structure of Nanoparticle Released from Enveloped Protein Nanoparticle 提交 2016-07-02 | Assembly 3 信息不足 同源多聚体;蛋白 × 5 PDB 声明:pentameric(5) 与蛋白数一致 |
链 B
2–205(204 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5;Phosphate-buffered saline
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;11 second blot, 0 mm offset
|
分辨率 5.70 Å |
| 5KP9 Structure of Nanoparticle Released from Enveloped Protein Nanoparticle 提交 2016-07-02 | Assembly 4 信息不足 同源多聚体;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric(6) 与蛋白数一致 |
链 B
2–205(204 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5;Phosphate-buffered saline
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;11 second blot, 0 mm offset
|
分辨率 5.70 Å |
| 5KP9 Structure of Nanoparticle Released from Enveloped Protein Nanoparticle 提交 2016-07-02 | Assembly 5 信息不足 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致 |
链 B
2–205(204 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5;Phosphate-buffered saline
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;11 second blot, 0 mm offset
|
分辨率 5.70 Å |
| 7B3Y Structure of a nanoparticle for a COVID-19 vaccine candidate 提交 2020-12-01 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体;蛋白 × 60 PDB 声明:60-meric(60) 与蛋白数一致 |
链 B
1–205(205 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5;PBS
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.70 Å |
| 8A8N Structure of self-assembling engineered protein nanocage (EPN) fused with hepatitis A pX protein 提交 2022-06-23 | Assembly 1 信息不足 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致 |
链 A
2–205(204 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7;PBS
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;Blot time 4-5 s.
|
分辨率 6.70 Å |
| 8E01 Structure of engineered nano-cage fusion protein 提交 2022-08-08 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 60 PDB 声明:60-meric(60) 与蛋白数一致 |
链 A
1–205(205 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8.1;Tris, 100 mM NaCl, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.40 Å |
| 8E01 Structure of engineered nano-cage fusion protein 提交 2022-08-08 | Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致 |
链 A
1–205(205 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8.1;Tris, 100 mM NaCl, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.40 Å |
| 8E01 Structure of engineered nano-cage fusion protein 提交 2022-08-08 | Assembly 3 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 5 PDB 声明:pentameric(5) 与蛋白数一致 |
链 A
1–205(205 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8.1;Tris, 100 mM NaCl, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.40 Å |
| 8E01 Structure of engineered nano-cage fusion protein 提交 2022-08-08 | Assembly 4 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric(6) 与蛋白数一致 |
链 A
1–205(205 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8.1;Tris, 100 mM NaCl, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.40 Å |
| 8E01 Structure of engineered nano-cage fusion protein 提交 2022-08-08 | Assembly 5 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致 |
链 A
1–205(205 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8.1;Tris, 100 mM NaCl, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.40 Å |
| 8JGA Cryo-EM structure of Mi3 fused with FKBP 提交 2023-05-20 | Assembly 1 信息不足 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致 |
链 A
1–205(205 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.68 Å |
| 8JGC Cryo-EM structure of Mi3 fused with LOV2 提交 2023-05-20 | Assembly 1 信息不足 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致 |
链 A
1–205(205 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.44 Å |
| 8SZZ CryoEM Structure of Computationally Designed Nanocage O32-ZL4 提交 2023-05-30 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 48 PDB 声明:48-meric(48) 与蛋白数一致 |
链 I
1–205(205 aa)
链 J
1–205(205 aa)
链 K
1–205(205 aa)
链 L
1–205(205 aa)
链 M
1–205(205 aa)
链 N
1–205(205 aa)
链 O
1–205(205 aa)
链 U
1–205(205 aa)
链 Y
1–205(205 aa)
链 Z
1–205(205 aa)
链 a
1–205(205 aa)
链 b
1–205(205 aa)
链 c
1–205(205 aa)
链 d
1–205(205 aa)
链 e
1–205(205 aa)
链 f
1–205(205 aa)
链 g
1–205(205 aa)
链 h
1–205(205 aa)
链 i
1–205(205 aa)
链 j
1–205(205 aa)
链 k
1–205(205 aa)
链 l
1–205(205 aa)
链 m
1–205(205 aa)
链 n
1–205(205 aa)
|
未记录 | NA SODIUM ION × 24 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5;25 mM Tris/HCl pH 7.5, 150 mM NaCl
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.90 Å |
| 8TVB Ghanaian virus fusion glycoprotein (GhV F) 提交 2023-08-17 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致 |
链 A
2–205(204 aa)
链 B
2–205(204 aa)
链 C
2–205(204 aa)
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 12 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.90 Å |
| 8TYC Lassa GPC (strain Josiah) bound to rabbit polyclonal base-targeting antibody Base-1 提交 2023-08-24 | Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric(8) 与蛋白数一致 |
链 a
2–205(204 aa)
链 b
2–205(204 aa)
链 c
2–205(204 aa)
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 6 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.30 Å |
| 8TYE Lassa GPC (strain Josiah) bound to rabbit polyclonal fusion-peptide-targeting antibody FP-1 提交 2023-08-25 | Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric(8) 与蛋白数一致 |
链 a
2–205(204 aa)
链 b
2–205(204 aa)
链 c
2–205(204 aa)
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 14 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.80 Å |
| 9FO3 Structure of a gp140 SpyTag-SpyCatcher mi3 nanoparticle including mi3 density only. 提交 2024-06-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 60 PDB 声明:60-meric(60) 与蛋白数一致 |
链 0
1–205(205 aa)
链 1
1–205(205 aa)
链 2
1–205(205 aa)
链 3
1–205(205 aa)
链 4
1–205(205 aa)
链 5
1–205(205 aa)
链 6
1–205(205 aa)
链 7
1–205(205 aa)
链 A
1–205(205 aa)
链 B
1–205(205 aa)
链 C
1–205(205 aa)
链 D
1–205(205 aa)
链 E
1–205(205 aa)
链 F
1–205(205 aa)
链 G
1–205(205 aa)
链 H
1–205(205 aa)
链 I
1–205(205 aa)
链 J
1–205(205 aa)
链 K
1–205(205 aa)
链 L
1–205(205 aa)
链 M
1–205(205 aa)
链 N
1–205(205 aa)
链 O
1–205(205 aa)
链 P
1–205(205 aa)
链 Q
1–205(205 aa)
链 R
1–205(205 aa)
链 S
1–205(205 aa)
链 T
1–205(205 aa)
链 U
1–205(205 aa)
链 V
1–205(205 aa)
链 W
1–205(205 aa)
链 X
1–205(205 aa)
链 Y
1–205(205 aa)
链 Z
1–205(205 aa)
链 a
1–205(205 aa)
链 b
1–205(205 aa)
链 c
1–205(205 aa)
链 d
1–205(205 aa)
链 e
1–205(205 aa)
链 f
1–205(205 aa)
链 g
1–205(205 aa)
链 h
1–205(205 aa)
链 i
1–205(205 aa)
链 j
1–205(205 aa)
链 k
1–205(205 aa)
链 l
1–205(205 aa)
链 m
1–205(205 aa)
链 n
1–205(205 aa)
链 o
1–205(205 aa)
链 p
1–205(205 aa)
链 q
1–205(205 aa)
链 r
1–205(205 aa)
链 s
1–205(205 aa)
链 t
1–205(205 aa)
链 u
1–205(205 aa)
链 v
1–205(205 aa)
链 w
1–205(205 aa)
链 x
1–205(205 aa)
链 y
1–205(205 aa)
链 z
1–205(205 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 5.30 Å |
| 9UAQ CryoEM structure of GFP-like protein from Aequorea coerulescens with Trimbody 提交 2025-04-01 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 9 PDB 声明:nonameric(9) 与蛋白数一致 |
链 A
2–205(204 aa)
链 B
2–205(204 aa)
链 C
2–205(204 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.29 Å |
| 9UBR CryoEM structure of human Galectin-10 with iTrimbody 提交 2025-04-03 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 18 PDB 声明:octadecameric(18) 与蛋白数一致 |
链 A
2–205(204 aa)
链 B
2–205(204 aa)
链 C
2–205(204 aa)
链 D
2–205(204 aa)
链 E
2–205(204 aa)
链 F
2–205(204 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.62 Å |
| 9UCL CryoEM structure of IgV domain of human Nectin-4 with Trimbody 提交 2025-04-04 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 9 PDB 声明:nonameric(9) 与蛋白数一致 |
链 A
2–205(204 aa)
链 B
2–205(204 aa)
链 C
2–205(204 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.43 Å |
| 9XOU CryoEM structure of LacY with Trimbody 提交 2025-11-15 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 9 PDB 声明:nonameric(9) 与蛋白数一致 |
链 A
2–205(204 aa)
链 B
2–205(204 aa)
链 C
2–205(204 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.50 Å |