当前蛋白身份:Q9WXS1 重新检索
本组结构的主要差异维度
构建体不同 组装状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量指标不同

差异标签只比较当前检索结果;所有PDB和assembly原始记录仍分别保留。

相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
1VLW Crystal structure of 2-dehydro-3-deoxyphosphogluconate aldolase/4-hydroxy-2-oxoglutarate aldolase (TM0066) from Thermotoga maritima at 2.30 A resolution 提交 2004-08-18 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 1–205(205 aa)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION,SITTING DROP,NANODROP;pH 7.5;277 K;22.5% PEG-1000, 0.1M Tris pH 7.5 , VAPOR DIFFUSION,SITTING DROP,NANODROP, temperature 277K
分辨率 2.30 Å R-free 0.221
1VLW Crystal structure of 2-dehydro-3-deoxyphosphogluconate aldolase/4-hydroxy-2-oxoglutarate aldolase (TM0066) from Thermotoga maritima at 2.30 A resolution 提交 2004-08-18 Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 B 1–205(205 aa)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION,SITTING DROP,NANODROP;pH 7.5;277 K;22.5% PEG-1000, 0.1M Tris pH 7.5 , VAPOR DIFFUSION,SITTING DROP,NANODROP, temperature 277K
分辨率 2.30 Å R-free 0.221
1VLW Crystal structure of 2-dehydro-3-deoxyphosphogluconate aldolase/4-hydroxy-2-oxoglutarate aldolase (TM0066) from Thermotoga maritima at 2.30 A resolution 提交 2004-08-18 Assembly 3 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 C 1–205(205 aa)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION,SITTING DROP,NANODROP;pH 7.5;277 K;22.5% PEG-1000, 0.1M Tris pH 7.5 , VAPOR DIFFUSION,SITTING DROP,NANODROP, temperature 277K
分辨率 2.30 Å R-free 0.221
1VLW Crystal structure of 2-dehydro-3-deoxyphosphogluconate aldolase/4-hydroxy-2-oxoglutarate aldolase (TM0066) from Thermotoga maritima at 2.30 A resolution 提交 2004-08-18 Assembly 4 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 A 1–205(205 aa)
链 B 1–205(205 aa)
链 C 1–205(205 aa)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION,SITTING DROP,NANODROP;pH 7.5;277 K;22.5% PEG-1000, 0.1M Tris pH 7.5 , VAPOR DIFFUSION,SITTING DROP,NANODROP, temperature 277K
分辨率 2.30 Å R-free 0.221
1WA3 Mechanism of the Class I KDPG aldolase 提交 2004-10-22 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 A 1–205(205 aa)
链 B 1–205(205 aa)
链 C 1–205(205 aa)
未记录 PYR PYRUVIC ACID × 3 SO4 SULFATE ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 4.6;0.075M SODIUM ACETATE, 0.1M AMMONIUM SULPHATE, 28%W/V PEG4000, pH 4.60
分辨率 1.90 Å R-free 0.239
1WA3 Mechanism of the Class I KDPG aldolase 提交 2004-10-22 Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 D 1–205(205 aa)
链 E 1–205(205 aa)
链 F 1–205(205 aa)
未记录 PYR PYRUVIC ACID × 3 SO4 SULFATE ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 4.6;0.075M SODIUM ACETATE, 0.1M AMMONIUM SULPHATE, 28%W/V PEG4000, pH 4.60
分辨率 1.90 Å R-free 0.239
5KP9 Structure of Nanoparticle Released from Enveloped Protein Nanoparticle 提交 2016-07-02 Assembly 1 信息不足 同源多聚体;蛋白 × 60 PDB 声明:60-meric(60) 与蛋白数一致
链 B 2–205(204 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5;Phosphate-buffered saline
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE;11 second blot, 0 mm offset
分辨率 5.70 Å
5KP9 Structure of Nanoparticle Released from Enveloped Protein Nanoparticle 提交 2016-07-02 Assembly 2 信息不足 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 B 2–205(204 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5;Phosphate-buffered saline
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE;11 second blot, 0 mm offset
分辨率 5.70 Å
5KP9 Structure of Nanoparticle Released from Enveloped Protein Nanoparticle 提交 2016-07-02 Assembly 3 信息不足 同源多聚体;蛋白 × 5 PDB 声明:pentameric(5) 与蛋白数一致
链 B 2–205(204 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5;Phosphate-buffered saline
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE;11 second blot, 0 mm offset
分辨率 5.70 Å
5KP9 Structure of Nanoparticle Released from Enveloped Protein Nanoparticle 提交 2016-07-02 Assembly 4 信息不足 同源多聚体;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric(6) 与蛋白数一致
链 B 2–205(204 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5;Phosphate-buffered saline
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE;11 second blot, 0 mm offset
分辨率 5.70 Å
5KP9 Structure of Nanoparticle Released from Enveloped Protein Nanoparticle 提交 2016-07-02 Assembly 5 信息不足 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 B 2–205(204 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5;Phosphate-buffered saline
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE;11 second blot, 0 mm offset
分辨率 5.70 Å
7B3Y Structure of a nanoparticle for a COVID-19 vaccine candidate 提交 2020-12-01 Assembly 1 信息不足 同源多聚体;蛋白 × 60 PDB 声明:60-meric(60) 与蛋白数一致
链 B 1–205(205 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5;PBS
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
8A8N Structure of self-assembling engineered protein nanocage (EPN) fused with hepatitis A pX protein 提交 2022-06-23 Assembly 1 信息不足 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 2–205(204 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7;PBS
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE;Blot time 4-5 s.
分辨率 6.70 Å
8E01 Structure of engineered nano-cage fusion protein 提交 2022-08-08 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 60 PDB 声明:60-meric(60) 与蛋白数一致
链 A 1–205(205 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8.1;Tris, 100 mM NaCl, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
8E01 Structure of engineered nano-cage fusion protein 提交 2022-08-08 Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 1–205(205 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8.1;Tris, 100 mM NaCl, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
8E01 Structure of engineered nano-cage fusion protein 提交 2022-08-08 Assembly 3 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 5 PDB 声明:pentameric(5) 与蛋白数一致
链 A 1–205(205 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8.1;Tris, 100 mM NaCl, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
8E01 Structure of engineered nano-cage fusion protein 提交 2022-08-08 Assembly 4 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric(6) 与蛋白数一致
链 A 1–205(205 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8.1;Tris, 100 mM NaCl, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
8E01 Structure of engineered nano-cage fusion protein 提交 2022-08-08 Assembly 5 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 1–205(205 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8.1;Tris, 100 mM NaCl, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
8JGA Cryo-EM structure of Mi3 fused with FKBP 提交 2023-05-20 Assembly 1 信息不足 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 1–205(205 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.68 Å
8JGC Cryo-EM structure of Mi3 fused with LOV2 提交 2023-05-20 Assembly 1 信息不足 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 1–205(205 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.44 Å
8SZZ CryoEM Structure of Computationally Designed Nanocage O32-ZL4 提交 2023-05-30 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 48 PDB 声明:48-meric(48) 与蛋白数一致
链 I 1–205(205 aa)
链 J 1–205(205 aa)
链 K 1–205(205 aa)
链 L 1–205(205 aa)
链 M 1–205(205 aa)
链 N 1–205(205 aa)
链 O 1–205(205 aa)
链 U 1–205(205 aa)
链 Y 1–205(205 aa)
链 Z 1–205(205 aa)
链 a 1–205(205 aa)
链 b 1–205(205 aa)
链 c 1–205(205 aa)
链 d 1–205(205 aa)
链 e 1–205(205 aa)
链 f 1–205(205 aa)
链 g 1–205(205 aa)
链 h 1–205(205 aa)
链 i 1–205(205 aa)
链 j 1–205(205 aa)
链 k 1–205(205 aa)
链 l 1–205(205 aa)
链 m 1–205(205 aa)
链 n 1–205(205 aa)
未记录 NA SODIUM ION × 24 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5;25 mM Tris/HCl pH 7.5, 150 mM NaCl
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
8TVB Ghanaian virus fusion glycoprotein (GhV F) 提交 2023-08-17 Assembly 1 信息不足 同源多聚体;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 A 2–205(204 aa)
链 B 2–205(204 aa)
链 C 2–205(204 aa)
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 12 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
8TYC Lassa GPC (strain Josiah) bound to rabbit polyclonal base-targeting antibody Base-1 提交 2023-08-24 Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric(8) 与蛋白数一致
链 a 2–205(204 aa)
链 b 2–205(204 aa)
链 c 2–205(204 aa)
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
8TYE Lassa GPC (strain Josiah) bound to rabbit polyclonal fusion-peptide-targeting antibody FP-1 提交 2023-08-25 Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric(8) 与蛋白数一致
链 a 2–205(204 aa)
链 b 2–205(204 aa)
链 c 2–205(204 aa)
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 14 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
9FO3 Structure of a gp140 SpyTag-SpyCatcher mi3 nanoparticle including mi3 density only. 提交 2024-06-11 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 60 PDB 声明:60-meric(60) 与蛋白数一致
链 0 1–205(205 aa)
链 1 1–205(205 aa)
链 2 1–205(205 aa)
链 3 1–205(205 aa)
链 4 1–205(205 aa)
链 5 1–205(205 aa)
链 6 1–205(205 aa)
链 7 1–205(205 aa)
链 A 1–205(205 aa)
链 B 1–205(205 aa)
链 C 1–205(205 aa)
链 D 1–205(205 aa)
链 E 1–205(205 aa)
链 F 1–205(205 aa)
链 G 1–205(205 aa)
链 H 1–205(205 aa)
链 I 1–205(205 aa)
链 J 1–205(205 aa)
链 K 1–205(205 aa)
链 L 1–205(205 aa)
链 M 1–205(205 aa)
链 N 1–205(205 aa)
链 O 1–205(205 aa)
链 P 1–205(205 aa)
链 Q 1–205(205 aa)
链 R 1–205(205 aa)
链 S 1–205(205 aa)
链 T 1–205(205 aa)
链 U 1–205(205 aa)
链 V 1–205(205 aa)
链 W 1–205(205 aa)
链 X 1–205(205 aa)
链 Y 1–205(205 aa)
链 Z 1–205(205 aa)
链 a 1–205(205 aa)
链 b 1–205(205 aa)
链 c 1–205(205 aa)
链 d 1–205(205 aa)
链 e 1–205(205 aa)
链 f 1–205(205 aa)
链 g 1–205(205 aa)
链 h 1–205(205 aa)
链 i 1–205(205 aa)
链 j 1–205(205 aa)
链 k 1–205(205 aa)
链 l 1–205(205 aa)
链 m 1–205(205 aa)
链 n 1–205(205 aa)
链 o 1–205(205 aa)
链 p 1–205(205 aa)
链 q 1–205(205 aa)
链 r 1–205(205 aa)
链 s 1–205(205 aa)
链 t 1–205(205 aa)
链 u 1–205(205 aa)
链 v 1–205(205 aa)
链 w 1–205(205 aa)
链 x 1–205(205 aa)
链 y 1–205(205 aa)
链 z 1–205(205 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.30 Å
9UAQ CryoEM structure of GFP-like protein from Aequorea coerulescens with Trimbody 提交 2025-04-01 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 9 PDB 声明:nonameric(9) 与蛋白数一致
链 A 2–205(204 aa)
链 B 2–205(204 aa)
链 C 2–205(204 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.29 Å
9UBR CryoEM structure of human Galectin-10 with iTrimbody 提交 2025-04-03 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 18 PDB 声明:octadecameric(18) 与蛋白数一致
链 A 2–205(204 aa)
链 B 2–205(204 aa)
链 C 2–205(204 aa)
链 D 2–205(204 aa)
链 E 2–205(204 aa)
链 F 2–205(204 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.62 Å
9UCL CryoEM structure of IgV domain of human Nectin-4 with Trimbody 提交 2025-04-04 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 9 PDB 声明:nonameric(9) 与蛋白数一致
链 A 2–205(204 aa)
链 B 2–205(204 aa)
链 C 2–205(204 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.43 Å
9XOU CryoEM structure of LacY with Trimbody 提交 2025-11-15 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 9 PDB 声明:nonameric(9) 与蛋白数一致
链 A 2–205(204 aa)
链 B 2–205(204 aa)
链 C 2–205(204 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.50 Å