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1a1w

FADD DEATH EFFECTOR DOMAIN, F25Y MUTANT, NMR MINIMIZED AVERAGE STRUCTURE

Method: SOLUTION NMR Dmax: 44.6 Å Quality: GOOD
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

FADD PROTEIN

Homo sapiens

UniProt Q13158

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白单体 单体 蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白拷贝数一致 链 A； UniProt 1–83 片段：DEATH EFFECTOR DOMAIN 突变：F25Y 无其他共同聚合物 SOLUTION NMR NMR测量条件：pH 4；288 K 分辨率未提供

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 1A1W Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
1A1Z FADD DEATH EFFECTOR DOMAIN, F25G MUTANT, NMR MINIMIZED AVERAGE STRUCTURE 提交 1997-12-18 突变/修饰不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–83（83 aa） 片段：DEATH EFFECTOR DOMAIN
突变：F25G 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 4；288 K；离子强度（mmCIF原始值）100 mM；压力 1
NMR样品组成 H2O
分辨率未提供
1E3Y Death domain from human FADD/MORT1 提交 2000-06-26 构建体不同 突变/修饰不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 93–192（100 aa） 片段：DEATH DOMAIN RESIDUES 93-192
突变：YES 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 6.2；298 K；离子强度（mmCIF原始值）50 MM PHOSPHATE BUFFER, 150MM NACL；压力 1
分辨率未提供
1E41 Death domain from human FADD/MORT1 提交 2000-06-27 构建体不同 突变/修饰不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 93–192（100 aa） 片段：DEATH DOMAIN RESIDUES 93-192
突变：YES 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 6.2；298 K；离子强度（mmCIF原始值）50 MM PHOSPHATE BUFFER, 150MM NACL；压力 1
分辨率未提供
2GF5 Structure of intact FADD (MORT1) 提交 2006-03-21 构建体不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 2–191（190 aa）
突变：F25Y 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 7；288 K；离子强度（mmCIF原始值）200mM phosphate；压力 1
NMR样品组成 200mM phosphate buffer, 95% H2O 5% D2O | 95% H2O/5% D2O
分辨率未提供
3EZQ Crystal Structure of the Fas/FADD Death Domain Complex 提交 2008-10-23 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 93–208（116 aa） 片段：Fadd DD, UNP residues 93-208
链 D 93–208（116 aa） 片段：Fadd DD, UNP residues 93-208
未记录 SO4 SULFATE ION × 2 NA SODIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 EVAPORATION；pH 4；291 K；0.95M citric acid, 1.9M ammonium sulfate, pH4, EVAPORATION, temperature 291K
分辨率 2.73 Å R-free 0.278
3EZQ Crystal Structure of the Fas/FADD Death Domain Complex 提交 2008-10-23 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 F 93–208（116 aa） 片段：Fadd DD, UNP residues 93-208
链 H 93–208（116 aa） 片段：Fadd DD, UNP residues 93-208
未记录 SO4 SULFATE ION × 3 NA SODIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 EVAPORATION；pH 4；291 K；0.95M citric acid, 1.9M ammonium sulfate, pH4, EVAPORATION, temperature 291K
分辨率 2.73 Å R-free 0.278
3EZQ Crystal Structure of the Fas/FADD Death Domain Complex 提交 2008-10-23 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 J 93–208（116 aa） 片段：Fadd DD, UNP residues 93-208
链 L 93–208（116 aa） 片段：Fadd DD, UNP residues 93-208
未记录 SO4 SULFATE ION × 4 NA SODIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 EVAPORATION；pH 4；291 K；0.95M citric acid, 1.9M ammonium sulfate, pH4, EVAPORATION, temperature 291K
分辨率 2.73 Å R-free 0.278
3EZQ Crystal Structure of the Fas/FADD Death Domain Complex 提交 2008-10-23 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 N 93–208（116 aa） 片段：Fadd DD, UNP residues 93-208
链 P 93–208（116 aa） 片段：Fadd DD, UNP residues 93-208
未记录 SO4 SULFATE ION × 3 NA SODIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 EVAPORATION；pH 4；291 K；0.95M citric acid, 1.9M ammonium sulfate, pH4, EVAPORATION, temperature 291K
分辨率 2.73 Å R-free 0.278
3OQ9 Structure of the FAS/FADD death domain assembly 提交 2010-09-02 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric
链 H 93–184（92 aa） 片段：UNP residues 93-184
链 I 93–184（92 aa） 片段：UNP residues 93-184
链 J 93–184（92 aa） 片段：UNP residues 93-184
链 K 93–184（92 aa） 片段：UNP residues 93-184
链 L 93–184（92 aa） 片段：UNP residues 93-184
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 hanging drop；pH 8.5；298 K；0.1 M Tris pH 8.5, 100 mM MgCl2, 5 % glycerol and 6-10 % PEG4000, hanging drop, temperature 298K
分辨率 6.80 Å R-free 0.354
6ACI Crystal structure of EPEC effector NleB in complex with FADD death domain 提交 2018-07-26 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 H 93–184（92 aa）
未记录 UDP URIDINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MN MANGANESE (II) ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；4.5 M Sodium chloride, 100 mM HEPES pH 7.5
分辨率 1.87 Å R-free 0.209
8YBX Structure of the FADD/Caspase-8/cFLIP death effector domain assembly 提交 2024-02-16 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric
链 L 1–208（208 aa）
链 Q 1–208（208 aa）
链 R 1–208（208 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.68 Å
8YD7 Structure of FADD/Caspase-8/cFLIP death effector domain assembly 提交 2024-02-19 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric
链 L 1–208（208 aa）
突变：H9G 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） SE SELENIUM ATOM × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293.15 K；HEPES, TBG, PEG8000, TCEP, sodium chloride
分辨率 3.32 Å R-free 0.231
8YD8 Structure of FADD/Caspase-8/cFLIP death effector domain assembly 提交 2024-02-19 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric
链 L 1–208（208 aa）
突变：H9G 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293.15 K；HEPES, PEG 8000, TBG, TCEP, sodium chloride
分辨率 3.11 Å R-free 0.241
8YNI Structure of the FADD/Caspase-8/cFLIP death effector domain assembly 提交 2024-03-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：11-meric
链 L 1–208（208 aa）
链 Q 1–208（208 aa）
链 R 1–208（208 aa）
突变：F25G 突变：F25G 突变：F25G 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.66 Å
9L5W FADD-DED filaments coordinate complex IIa assembly during TNF-induced apoptosis 提交 2024-12-23 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 18 PDB 声明：18-meric
链 A 1–91（91 aa）
链 B 1–91（91 aa）
链 C 1–91（91 aa）
链 D 1–91（91 aa）
链 E 1–91（91 aa）
链 F 1–91（91 aa）
链 G 1–91（91 aa）
链 H 1–91（91 aa）
链 I 1–91（91 aa）
链 J 1–91（91 aa）
链 K 1–91（91 aa）
链 L 1–91（91 aa）
链 M 1–91（91 aa）
链 N 1–91（91 aa）
链 O 1–91（91 aa）
链 P 1–91（91 aa）
链 Q 1–91（91 aa）
链 R 1–91（91 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；25mM HEPES, 150mM NaCl
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.60 Å
9N94 Cryo-EM structure of FADD_DED filament 提交 2025-02-10 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 24 PDB 声明：24-meric
链 A 1–208（208 aa）
链 B 1–208（208 aa）
链 C 1–208（208 aa）
链 D 1–208（208 aa）
链 E 1–208（208 aa）
链 F 1–208（208 aa）
链 G 1–208（208 aa）
链 H 1–208（208 aa）
链 I 1–208（208 aa）
链 J 1–208（208 aa）
链 K 1–208（208 aa）
链 L 1–208（208 aa）
链 M 1–208（208 aa）
链 N 1–208（208 aa）
链 O 1–208（208 aa）
链 P 1–208（208 aa）
链 Q 1–208（208 aa）
链 R 1–208（208 aa）
链 S 1–208（208 aa）
链 T 1–208（208 aa）
链 U 1–208（208 aa）
链 V 1–208（208 aa）
链 W 1–208（208 aa）
链 X 1–208（208 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.07 Å
9NCQ Cryo-EM structure of Fas-FADD complex 提交 2025-02-17 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：12-meric
链 H 91–191（101 aa）
链 I 91–191（101 aa）
链 J 91–191（101 aa）
链 K 91–191（101 aa）
链 L 91–191（101 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.51 Å
9U6E FADD-DED filaments coordinate complex IIa assembly during TNF-induced apoptosis 提交 2025-03-23 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 24 PDB 声明：24-meric
链 B 1–208（208 aa）
链 C 1–208（208 aa）
链 D 1–208（208 aa）
链 E 1–208（208 aa）
链 F 1–208（208 aa）
链 G 1–208（208 aa）
链 H 1–208（208 aa）
链 I 1–208（208 aa）
链 J 1–208（208 aa）
链 K 1–208（208 aa）
链 L 1–208（208 aa）
链 M 1–208（208 aa）
链 N 1–208（208 aa）
链 O 1–208（208 aa）
链 P 1–208（208 aa）
链 Q 1–208（208 aa）
链 R 1–208（208 aa）
链 S 1–208（208 aa）
链 T 1–208（208 aa）
链 U 1–208（208 aa）
链 V 1–208（208 aa）
链 W 1–208（208 aa）
链 X 1–208（208 aa）
链 Y 1–208（208 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；25mM HEPES, 150mM NaCl
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.40 Å
9U7A FADD-DED filaments coordinate complex IIa assembly during TNF-induced apoptosis 提交 2025-03-24 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 24 PDB 声明：24-meric
链 B 1–92（92 aa）
链 C 1–92（92 aa）
链 D 1–92（92 aa）
链 E 1–92（92 aa）
链 F 1–92（92 aa）
链 G 1–92（92 aa）
链 H 1–92（92 aa）
链 I 1–92（92 aa）
链 J 1–92（92 aa）
链 K 1–92（92 aa）
链 L 1–92（92 aa）
链 M 1–92（92 aa）
链 N 1–92（92 aa）
链 O 1–92（92 aa）
链 P 1–92（92 aa）
链 Q 1–92（92 aa）
链 R 1–92（92 aa）
链 S 1–92（92 aa）
链 T 1–92（92 aa）
链 U 1–92（92 aa）
链 V 1–92（92 aa）
链 W 1–92（92 aa）
链 X 1–92（92 aa）
链 Y 1–92（92 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；25mM HEPES, 150mM NaCl
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.82 Å

共 16 个其他 PDB 条目、19 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 FADD_HUMAN
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A； PDB构建体 1–83； UniProt 1–83

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

SAXS profile for 1a1w

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

P(r) distribution for 1a1w
下载 Download
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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id1a1w
沉积日期 deposition_date1997-12-18
结构标题 titleFADD DEATH EFFECTOR DOMAIN, F25Y MUTANT, NMR MINIMIZED AVERAGE STRUCTURE
关键词 keywordsAPOPTOSIS, DEATH EFFECTOR DOMAIN; APOPTOSIS
实验方法 methodSOLUTION NMR
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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier13.96 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron12.11 Å
零角强度 I(0) i02034790.00
分子量 molecular_weight9546.0 kDa
排除体积 excluded_volume11992 ų
包络体积 envelope_volume14114 ų
水化壳体积 shell_volume9986 ų
包络直径 envelope_diameter43.3 Å
壳层 Rg shell_rg17.71 Å
包络 Rg envelope_rg12.53 Å
形状 Rg shape_rg12.08 Å
总 Rg total_rg13.67 Å
总原子数 total_atoms1360
残基数 n_residues83
球谐函数阶数 n_harmonics20
q 范围 q_range— – 0.5000 Å−1
数据点数 n_points101
壳层类型 shell_typedirectional
溶剂电子密度 solvent_density0.3340 e/ų
壳层衬度 contrast_shell0.0300 e/ų
CRYSOL 版本 crysol_version4.1.3
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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax44.6 Å
Rg (实空间) rg_real13.85 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error0.33 Å
I(0) (实空间) i0_real2.0350e+06
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error2.0210e+04
Rg (倒空间) rg_reciprocal13.86 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal2035000.0000
解质量估计 total_estimate0.8649
解质量评级 solution_quality GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks2
主峰位置 r_peak_primary19.2 Å
偏度 Skewness skewness0.066
峰度 Kurtosis kurtosis-0.236
角度范围 angular_range— – 0.5000 Å−1
当前正则化参数 α current_alpha0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha750300.0000
实空间数据点数 n_real_points80
GNOM 版本 gnom_version4.1.3
质量判据 quality_criteria AN1: 0.000; Oscil: 0.767; Stabil: 0.999; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.985; Smooth: 0.958
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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (1)

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7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 2 domains

SCOP 2.08 (1 domains)

结构域编号 domain_idd1a1wa_
类 Class classa — All alpha proteins
折叠类型 Fold folda.77 — DEATH domain
超家族 Superfamily superfamilya.77.1 — DEATH domain
家族 Family familya.77.1.4 — DEATH effector domain, DED

CATH v4.4 (1 domains)

结构域编号 domain_id1a1wA00
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology533 — Death Domain, Fas
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Death Domain, Fas
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8. 引用文献 (1)

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9. 文件与曲线 (10)