1ar7

P1/MAHONEY POLIOVIRUS, DOUBLE MUTANT P1095S + H2142Y

Method: X-RAY DIFFRACTION

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

P1/MAHONEY POLIOVIRUS

Human poliovirus 1

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 300	P1/MAHONEY POLIOVIRUS × 60 P1/MAHONEY POLIOVIRUS × 60 （P03299） SPHINGOSINE × 60 MYRISTIC ACID × 60 water × 300	与蛋白数一致
2	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 5	P1/MAHONEY POLIOVIRUS × 1 P1/MAHONEY POLIOVIRUS × 1 （P03299） SPHINGOSINE × 1 MYRISTIC ACID × 1 water × 5	与蛋白数一致
3	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 25	P1/MAHONEY POLIOVIRUS × 5 P1/MAHONEY POLIOVIRUS × 5 （P03299） SPHINGOSINE × 5 MYRISTIC ACID × 5 water × 25	与蛋白数一致
4	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 30	P1/MAHONEY POLIOVIRUS × 6 P1/MAHONEY POLIOVIRUS × 6 （P03299） SPHINGOSINE × 6 MYRISTIC ACID × 6 water × 30	与蛋白数一致
5	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 5	P1/MAHONEY POLIOVIRUS × 1 P1/MAHONEY POLIOVIRUS × 1 （P03299） SPHINGOSINE × 1 MYRISTIC ACID × 1 water × 5	与蛋白数一致
6	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 150	P1/MAHONEY POLIOVIRUS × 30 P1/MAHONEY POLIOVIRUS × 30 （P03299） SPHINGOSINE × 30 MYRISTIC ACID × 30 water × 150	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	POLH_POL1M
Isoform	—
PDB实体	2, 3, 4
链与序列区间	作者链 1； PDB构建体 1–302； UniProt 579–880 作者链 2； PDB构建体 1–272； UniProt 69–340 作者链 3； PDB构建体 1–238； UniProt 341–578

P1/MAHONEY POLIOVIRUS

Human poliovirus 1

UniProt P03299

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 300	P1/MAHONEY POLIOVIRUS × 60 P1/MAHONEY POLIOVIRUS × 60 （P03300） P1/MAHONEY POLIOVIRUS × 60 （P03300） P1/MAHONEY POLIOVIRUS × 60 （P03300） SPHINGOSINE × 60 MYRISTIC ACID × 60 water × 300	与蛋白数一致
2	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 5	P1/MAHONEY POLIOVIRUS × 1 P1/MAHONEY POLIOVIRUS × 1 （P03300） P1/MAHONEY POLIOVIRUS × 1 （P03300） P1/MAHONEY POLIOVIRUS × 1 （P03300） SPHINGOSINE × 1 MYRISTIC ACID × 1 water × 5	与蛋白数一致
3	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 25	P1/MAHONEY POLIOVIRUS × 5 P1/MAHONEY POLIOVIRUS × 5 （P03300） P1/MAHONEY POLIOVIRUS × 5 （P03300） P1/MAHONEY POLIOVIRUS × 5 （P03300） SPHINGOSINE × 5 MYRISTIC ACID × 5 water × 25	与蛋白数一致
4	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 30	P1/MAHONEY POLIOVIRUS × 6 P1/MAHONEY POLIOVIRUS × 6 （P03300） P1/MAHONEY POLIOVIRUS × 6 （P03300） P1/MAHONEY POLIOVIRUS × 6 （P03300） SPHINGOSINE × 6 MYRISTIC ACID × 6 water × 30	与蛋白数一致
5	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 5	P1/MAHONEY POLIOVIRUS × 1 P1/MAHONEY POLIOVIRUS × 1 （P03300） P1/MAHONEY POLIOVIRUS × 1 （P03300） P1/MAHONEY POLIOVIRUS × 1 （P03300） SPHINGOSINE × 1 MYRISTIC ACID × 1 water × 5	与蛋白数一致
6	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 150	P1/MAHONEY POLIOVIRUS × 30 P1/MAHONEY POLIOVIRUS × 30 （P03300） P1/MAHONEY POLIOVIRUS × 30 （P03300） P1/MAHONEY POLIOVIRUS × 30 （P03300） SPHINGOSINE × 30 MYRISTIC ACID × 30 water × 150	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	POLG_POL1M
Isoform	—
PDB实体	5
链与序列区间	作者链 4； PDB构建体 1–68； UniProt 1–68

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	1ar7
沉积日期 deposition_date	1997-08-11
结构标题 title	P1/MAHONEY POLIOVIRUS, DOUBLE MUTANT P1095S + H2142Y
关键词 keywords	PICORNAVIRUS, POLIOVIRUS, COAT PROTEIN, Icosahedral virus, Virus; VIRUS
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

1ar7__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

1ar7__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

1ar7__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	0.00 Å
Rg（电子密度）	131.70 Å
总 Rg	131.70 Å
原子数	400140
残基数	51060
排除体积	7114500 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`1ar7__assembly_1__model_1`	300-MERIC （300）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
2	1	`1ar7__assembly_2__model_1`	pentameric （5）	排除	—	—
	排除原因：辅助对称表示，不是完整或代表性的 biological assembly。
3	1	`1ar7__assembly_3__model_1`	25-meric （25）	排除	—	—
	排除原因：辅助对称表示，不是完整或代表性的 biological assembly。
4	1	`1ar7__assembly_4__model_1`	30-meric （30）	排除	—	—
	排除原因：辅助对称表示，不是完整或代表性的 biological assembly。
5	1	`1ar7__assembly_5__model_1`	pentameric （5）	排除	—	—
	排除原因：辅助对称表示，不是完整或代表性的 biological assembly。
6	1	`1ar7__assembly_6__model_1`	150-meric （150）	排除	—	—
	排除原因：辅助对称表示，不是完整或代表性的 biological assembly。

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (8)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	P1/MAHONEY POLIOVIRUS
分子量 formula_weight	437.4 kDa
突变 mutation	CHAIN 1, P95S, CHAIN 2, H142Y
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	0
原子数 atom_count	7212

GSSST

来源 Source

来源生物 organism	Human poliovirus 1
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	12081

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	P1/MAHONEY POLIOVIRUS
分子量 formula_weight	33478.6 kDa
突变 mutation	CHAIN 1, P95S, CHAIN 2, H142Y
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	1

GLGQMLESMIDNTVRETVGAATSRDALPNTEASGPTHSKEIPALTAVETGATNPLVPSDTVQTRHVVQHRSRSESSIESFFARGACVTIMTVDNSASTTNKDKLFAVWKITYKDTVQLRRKLEFFTYSRFDMELTFVVTANFTETNNGHALNQVYQIMYVPPGAPVPEKWDDYTWQTSSNPSIFYTYGTAPARISVPYVGISNAYSHFYDGFSKVPLKDQSAALGDSLYGAASLNDFGILAVRVVNDHNPTKVTSKIRVYLKPKHIRVWCPRPPRAVAYYGPGVDYKDGTLTPLSTKDLTTY

来源 Source

来源生物 organism	Human poliovirus 1
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	12081

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	P1/MAHONEY POLIOVIRUS
分子量 formula_weight	30100.8 kDa
突变 mutation	CHAIN 1, P95S, CHAIN 2, H142Y
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	2

SPNIEACGYSDRVLQLTLGNSTITTQEAANSVVAYGRWPEYLRDSEANPVDQPTEPDVAACRFYTLDTVSWTKESRGWWWKLPDALRDMGLFGQNMYYHYLGRSGYTVHVQCNASKFHQGALGVFAVPEMCLAGDSNTTTMYTSYQNANPGEKGGTFTGTFTPDNNQTSPARRFCPVDYLLGNGTLLGNAFVFPHQIINLRTNNCATLVLPYVNSLSIDSMVKHNNWGIAILPLAPLNFASESSPEIPITLTIAPMCCEFNGLRNITLPRLQ

来源 Source

来源生物 organism	Human poliovirus 1
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	12081

实体 4 Entity 4 polymer

描述 description	P1/MAHONEY POLIOVIRUS
分子量 formula_weight	26547.5 kDa
突变 mutation	CHAIN 1, P95S, CHAIN 2, H142Y
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	3

GLPVMNTPGSNQYLTADNFQSPCALPEFDVTPPIDIPGEVKNMMELAEIDTMIPFDLSATKKNTMEMYRVRLSDKPHTDDPILCLSLSPASDPRLSHTMLGEILNYYTHWAGSLKFTFLFCGSMMATGKLLVSYAPPGADPPKKRKEAMLGTHVIWDIGLQSSCTMVVPWISNTTYRQTIDDSFTEGGYISVFYQTRIVVPLSTPREMDILGFVSACNDFSVRLLRDTTHIEQKALAQ

来源 Source

来源生物 organism	Human poliovirus 1
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	12081

实体 5 Entity 5 polymer

描述 description	P1/MAHONEY POLIOVIRUS
分子量 formula_weight	7393.1 kDa
突变 mutation	CHAIN 1, P95S, CHAIN 2, H142Y
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	4

GAQVSSQKVGAHENSNRAYGGSTINYTTINYYRDSASNAASKQDFSQDPSKFTEPIKDVLIKTAPMLN

来源 Source

来源生物 organism	Human poliovirus 1
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	12081

实体 6 Entity 6 non-polymer

描述 description	SPHINGOSINE
分子量 formula_weight	299.5 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

实体 7 Entity 7 non-polymer

描述 description	MYRISTIC ACID
分子量 formula_weight	228.4 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

实体 8 Entity 8 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	543

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 7 domains

SCOP 2.08 (3 domains)

结构域编号 domain_id	d1ar7.1
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.121 — Nucleoplasmin-like/VP (viral coat and capsid proteins)
超家族 Superfamily superfamily	b.121.4 — Positive stranded ssRNA viruses
家族 Family family	b.121.4.1 — Picornaviridae-like VP (VP1, VP2, VP3 and VP4)

结构域编号 domain_id	d1ar71_
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.121 — Nucleoplasmin-like/VP (viral coat and capsid proteins)
超家族 Superfamily superfamily	b.121.4 — Positive stranded ssRNA viruses
家族 Family family	b.121.4.1 — Picornaviridae-like VP (VP1, VP2, VP3 and VP4)

结构域编号 domain_id	d1ar73_
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.121 — Nucleoplasmin-like/VP (viral coat and capsid proteins)
超家族 Superfamily superfamily	b.121.4 — Positive stranded ssRNA viruses
家族 Family family	b.121.4.1 — Picornaviridae-like VP (VP1, VP2, VP3 and VP4)

CATH v4.4 (4 domains)

结构域编号 domain_id	1ar7100
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	120 — Jelly Rolls
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	20 —

结构域编号 domain_id	1ar7200
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	120 — Jelly Rolls
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	20 —

结构域编号 domain_id	1ar7300
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	120 — Jelly Rolls
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	20 —

结构域编号 domain_id	1ar7400
类 Class class	4 — Few Secondary Structures
架构 Architecture architecture	10 — Irregular
拓扑 Topology topology	80 — Rhinovirus 14, subunit 4
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Picornavirus coat protein VP4

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晶胞边长 a length_a	319.950 Å
晶胞边长 b length_b	355.100 Å
晶胞边长 c length_c	377.300 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	120

空间群 space_group	P 21 21 2
空间群编号 int_tables_number	18
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	2.900 Å
最低分辨率 resolution_low	11.000 Å
R 因子 r_factor	—
R_work r_work	0.2340
R_free r_free	—

P1/MAHONEY POLIOVIRUS, DOUBLE MUTANT P1095S + H2142Y

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

P1/MAHONEY POLIOVIRUS

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

P1/MAHONEY POLIOVIRUS

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

1ar7__assembly_1__model_1

1ar7__assembly_1__model_1 | I(q)

1ar7__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (8)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 4 Entity 4 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 5 Entity 5 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 6 Entity 6 non-polymer

实体 7 Entity 7 non-polymer

实体 8 Entity 8 water

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 7 domains

SCOP 2.08 (3 domains)

CATH v4.4 (4 domains)

7. 引用文献 (3)