1az6

THREE-DIMENSIONAL STRUCTURES OF THREE ENGINEERED CELLULOSE-BINDING DOMAINS OF CELLOBIOHYDROLASE I FROM TRICHODERMA REESEI, NMR, 23 STRUCTURES

Method: SOLUTION NMR D_max: 30.6 Å Quality: GOOD

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

CELLOBIOHYDROLASE I

Hypocrea jecorina

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白单体单体蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1）与蛋白拷贝数一致	链 A； UniProt 478–513	片段：CELLULOSE-BINDING DOMAIN 突变：Y5A	无其他共同聚合物	SOLUTION NMR NMR测量条件：pH 3.9；288 K	分辨率未提供

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 1AZ6	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
1AZH THREE-DIMENSIONAL STRUCTURES OF THREE ENGINEERED CELLULOSE-BINDING DOMAINS OF CELLOBIOHYDROLASE I FROM TRICHODERMA REESEI, NMR, 14 STRUCTURES 提交 1997-11-18	当前字段一致	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 478–513（36 aa）片段：CELLULOSE-BINDING DOMAIN	突变：Y5A	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 3.9；288 K	分辨率未提供
1AZJ THREE-DIMENSIONAL STRUCTURES OF THREE ENGINEERED CELLULOSE-BINDING DOMAINS OF CELLOBIOHYDROLASE I FROM TRICHODERMA REESEI, NMR, 18 STRUCTURES 提交 1997-11-18	突变/修饰不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 478–513（36 aa）片段：CELLULOSE-BINDING DOMAIN	突变：Y31A	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 3.9；288 K	分辨率未提供
1AZK THREE-DIMENSIONAL STRUCTURES OF THREE ENGINEERED CELLULOSE-BINDING DOMAINS OF CELLOBIOHYDROLASE I FROM TRICHODERMA REESEI, NMR, 19 STRUCTURES 提交 1997-11-18	突变/修饰不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 478–513（36 aa）片段：CELLULOSE-BINDING DOMAIN	突变：Y32A	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 3.9；288 K	分辨率未提供
1CBH DETERMINATION OF THE THREE-DIMENSIONAL STRUCTURE OF THE C-TERMINAL DOMAIN OF CELLOBIOHYDROLASE I FROM TRICHODERMA REESEI. A STUDY USING NUCLEAR MAGNETIC RESONANCE AND HYBRID DISTANCE GEOMETRY-DYNAMICAL SIMULATED ANNEALING 提交 1989-05-30	构建体不同突变/修饰不同实验环境不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 478–513（36 aa）	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR mmCIF 未提供已读取条件	分辨率未提供
1DY4 CBH1 IN COMPLEX WITH S-PROPRANOLOL 提交 2000-01-26	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 18–451（434 aa）片段：CATALYTIC DOMAIN, RESIDUES 18-451	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 SNP 1-(ISOPROPYLAMINO)-3-(1-NAPHTHYLOXY)-2-PROPANOL × 1 CO COBALT (II) ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；HANGING DROPS. EQUAL VOLUMES OF 9 MG/ML PROTEIN/7.5 MM S-PROPRANOLOL AND RESERVOIR SOLUTION CONTAINING 0.1 M MES (PH 7.0), 24% (W/V) MONOMETHYL ETHER PEG 5000, 15% GLYCEROL AND 10 MM COCL2.	分辨率 1.90 Å R-free 0.220
1EGN CELLOBIOHYDROLASE CEL7A (E223S, A224H, L225V, T226A, D262G) MUTANT 提交 2000-02-16	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 18–451（434 aa）片段：CATALYTIC DOMAIN, RESIDUES 1 - 434	突变：E223S, A224H, L225V, T226A, D262G 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 CO COBALT (II) ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；293 K；sodium acetate, PEG 5000 monomethyl-ether, glycerol, sodium morpholine-ethane-sulphonic acid, cobalt chloride , pH 5.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 1.60 Å R-free 0.270
1Q2B CELLOBIOHYDROLASE CEL7A WITH DISULPHIDE BRIDGE ADDED ACROSS EXO-LOOP BY MUTATIONS D241C AND D249C 提交 2003-07-24	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 18–451（434 aa）片段：CATALYTIC DOMAIN 1-434	突变：D241C, D249C 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 CO COBALT (II) ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；298 K；PEG 5000 monomethyl ether, sodium morpholine-ethane-sulphonic acid, glycerol, cobalt chloride, sodium acetate, pH 6.00, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 1.60 Å R-free 0.223
2CBH DETERMINATION OF THE THREE-DIMENSIONAL STRUCTURE OF THE C-TERMINAL DOMAIN OF CELLOBIOHYDROLASE I FROM TRICHODERMA REESEI. A STUDY USING NUCLEAR MAGNETIC RESONANCE AND HYBRID DISTANCE GEOMETRY-DYNAMICAL SIMULATED ANNEALING 提交 1989-05-30	构建体不同突变/修饰不同实验环境不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 478–513（36 aa）	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR mmCIF 未提供已读取条件	分辨率未提供
2CEL ACTIVE-SITE MUTANT E212Q DETERMINED AT PH 6.0 WITH NO LIGAND BOUND IN THE ACTIVE SITE 提交 1996-08-24	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 19–451（433 aa）片段：CATALYTIC DOMAIN, RESIDUES 1 - 434	突变：E212Q 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 CA CALCIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 6；4.5 MM MES PH 6.0, 4.5% MONOMETHYL ETHER PEG 5000, 4.5 MM CACL2	分辨率 2.00 Å R-free 0.208
2CEL ACTIVE-SITE MUTANT E212Q DETERMINED AT PH 6.0 WITH NO LIGAND BOUND IN THE ACTIVE SITE 提交 1996-08-24	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 19–451（433 aa）片段：CATALYTIC DOMAIN, RESIDUES 1 - 434	突变：E212Q 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 CA CALCIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 6；4.5 MM MES PH 6.0, 4.5% MONOMETHYL ETHER PEG 5000, 4.5 MM CACL2	分辨率 2.00 Å R-free 0.208
2MWJ Solution structure of Family 1 Carbohydrate-Binding Module from Trichoderma reesei Cel7A with O-mannose residues at Thr1 and Ser3 提交 2014-11-12	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 478–513（36 aa）片段：CBM1 DOMAIN RESIDUES 478-513;	未记录	MAN alpha-D-mannopyranose × 2	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 5；300 K；离子强度（mmCIF原始值）30；压力 ambient NMR测量条件 pH 5；288 K；离子强度（mmCIF原始值）30；压力 ambient NMR样品组成 1.7 mg CBM_2M, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 1.7 mg CBM_2M, 100% D2O \| 100% D2O	分辨率未提供
2MWK Family 1 Carbohydrate-Binding Module from Trichoderma reesei Cel7A with O-mannose residues at Thr1, Ser3, and Ser14 提交 2014-11-12	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 478–513（36 aa）片段：CBM1 domain residues 478-513	未记录	MAN alpha-D-mannopyranose × 3	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 5；300 K；离子强度（mmCIF原始值）30；压力 ambient NMR测量条件 pH 5；288 K；离子强度（mmCIF原始值）30；压力 ambient NMR样品组成 1.5 mg CBM_3M, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 1.5 mg CBM_3M, 100% D2O \| 100% D2O	分辨率未提供
2V3I Hypocrea jecorina Cel7A in complex with (R)-dihydroxy-phenanthrenolol 提交 2007-06-18	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 18–451（434 aa）片段：CATALYTIC MODULE, RESIDUES 18-451	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 CO COBALT (II) ION × 2 GOL GLYCEROL × 1 XX6 2-{[(2R)-2-HYDROXY-3-(9-PHENANTHRYLOXY)PROPYL]AMINO}PROPANE-1,3-DIOL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；298 K；POLYETHYLENE GLYCOL MONOMETHYL ETHER 5000, GLYCEROL, COBALT CHLORIDE, SODIUM ACETATE, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, TEMPERATURE 298 K	分辨率 1.05 Å R-free 0.140
2V3R Hypocrea jecorina Cel7A in complex with (S)-dihydroxy-phenanthrenolol 提交 2007-06-21	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 18–451（434 aa）片段：CATALYTIC MODULE, RESIDUES 18-451	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 CO COBALT (II) ION × 2 XX7 2-{[(2S)-2-HYDROXY-3-(9-PHENANTHRYLOXY)PROPYL]AMINO}PROPANE-1,3-DIOL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；298 K；POLYETHYLENE GLYCOL MONOMETHYL ETHER, GLYCEROL, COBALT CHLORIDE, SODIUM ACETATE PH 5.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, TEMPERATURE 298 K	分辨率 1.60 Å R-free 0.179
4C4C Michaelis complex of Hypocrea jecorina CEL7A E217Q mutant with cellononaose spanning the active site 提交 2013-09-05	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 18–451（434 aa）片段：CATALYTIC MODULE, RESIDUES 18-451	突变：YES 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	CO COBALT (II) ION × 3 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；0.1 M MES (PH 6.0), 20% MONOMETHYL ETHER PEG 5000, 0.01 M COCL2, 12% GLYCEROL., VAPOR DIFFUSION - HANGING DROP	分辨率 1.45 Å R-free 0.196
4C4D Covalent glycosyl-enzyme intermediate of Hypocrea jecorina Cel7a E217Q mutant trapped using DNP-2-deoxy-2-fluoro-cellotrioside 提交 2013-09-05	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 18–451（434 aa）片段：CATALYTIC MODULE, RESIDUES 18-451	突变：YES 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	CO COBALT (II) ION × 3 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 6；PROTEIN FIRST INCUBATED WITH 80 UM 2,4-DINITROPHENYL-2-DEOXY-2-FLUORO-BETA-CELLOTRIOSIDE (DNP-2F-G3)4 IN 10 MM SODIUM MES, PH 6.0. ALIQUOTS WERE TAKEN AT REGULAR TIME INTERVALS AND CONCENTRATED FOR CRYSTALLISATION IN THE PRESENCE OF 1 MM FRESH DNP-2F-G3 ADDED TO THE CRYSTALLISATION DROPS. CRYSTALLISATION CONDITION: 0.1 M MES (PH 6.0), 20% MONOMETHYL ETHER PEG 5000, 0.01 M COCL2, 12% GLYCEROL.	分辨率 1.32 Å R-free 0.187
4CEL ACTIVE-SITE MUTANT D214N DETERMINED AT PH 6.0 WITH NO LIGAND BOUND IN THE ACTIVE SITE 提交 1996-08-24	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 19–451（433 aa）片段：CATALYTIC DOMAIN, RESIDUES 1 - 434	突变：D214N 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 CA CALCIUM ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 6；4.5 MM MES PH 6.0, 9% PEG 6000, 4.5 MM CACL2	分辨率 2.20 Å R-free 0.239
4CEL ACTIVE-SITE MUTANT D214N DETERMINED AT PH 6.0 WITH NO LIGAND BOUND IN THE ACTIVE SITE 提交 1996-08-24	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 19–451（433 aa）片段：CATALYTIC DOMAIN, RESIDUES 1 - 434	突变：D214N 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 CA CALCIUM ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 6；4.5 MM MES PH 6.0, 9% PEG 6000, 4.5 MM CACL2	分辨率 2.20 Å R-free 0.239
4D5I Hypocrea jecorina cellobiohydrolase Cel7A E212Q soaked with xylotriose. 提交 2014-11-05	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 18–451（434 aa）片段：CATALYTIC MODULE, RESIDUES 18-451	突变：YES 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	CO COBALT (II) ION × 4 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；298 K；0.1 M NA-MES (PH 6.0), 20% MONOMETHYL ETHER PEG 5000, 0.01 M COCL2, 12.5% GLYCEROL, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, TEMPERATURE 298K	分辨率 1.42 Å R-free 0.230
4D5J Hypocrea jecorina cellobiohydrolase Cel7A E217Q soaked with xylotriose. 提交 2014-11-05	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 18–451（434 aa）片段：CATALYTIC MODULE, RESIDUES 18-451	突变：YES 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	CO COBALT (II) ION × 4 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；0.1 M MES (PH 6.0), 20% MONOMETHYL ETHER PEG 5000, 0.01 M COCL2, 12.5% GLYCEROL, VAPOR DIFFUSION - HANGING DROP	分辨率 1.50 Å R-free 0.199
4D5O Hypocrea jecorina cellobiohydrolase Cel7A E212Q soaked with xylopentaose. 提交 2014-11-07	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 18–451（434 aa）片段：CATALYTIC MODULE, RESIDUES 18-451	突变：YES 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	CO COBALT (II) ION × 4 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 GOL GLYCEROL × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；298 K；0.1 M NA-MES (PH 6.0), 20% MONOMETHYL ETHER PEG 5000, 0.01 M COCL2, 12.5% GLYCEROL, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, TEMPERATURE 298K	分辨率 1.52 Å R-free 0.250
4D5P Hypocrea jecorina cellobiohydrolase Cel7A E217Q soaked with xylopentaose. 提交 2014-11-07	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 18–451（434 aa）片段：CATALYTIC MODULE, RESIDUES 18-451	突变：YES 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	CO COBALT (II) ION × 2 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；0.1 M MES (PH 6.0), 20% MONOMETHYL ETHER PEG 5000, 0.01 M COCL2, 12.5% GLYCEROL. VAPOR DIFFUSION - HANGING DROP	分辨率 1.89 Å R-free 0.268
4D5Q Hypocrea jecorina Cel7A (wild type) soaked with xylopentaose. 提交 2014-11-07	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 18–451（434 aa）片段：CATALYTIC MODULE, RESIDUES 18-451	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	CO COBALT (II) ION × 4 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 XYP beta-D-xylopyranose × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；298 K；0.1 M NA-MES (PH 6.0), 20% MONOMETHYL ETHER PEG 5000, 0.01 M COCL2, 12.5% GLYCEROL, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, TEMPERATURE 298K	分辨率 1.68 Å R-free 0.186
4D5V Hypocrea jecorina cellobiohydrolase Cel7A E217Q soaked with xylotetraose. 提交 2014-11-07	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 18–451（434 aa）片段：CATALYTIC MODULE, RESIDUES 18-451	突变：YES [E217Q] 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	CO COBALT (II) ION × 2 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；0.1 M MES (PH 6.0), 20% MONOMETHYL ETHER PEG 5000, 0.01 M COCL2, 12.5% GLYCEROL, VAPOR DIFFUSION - HANGING DROP	分辨率 1.62 Å R-free 0.179
4P1H Crystal structure of wild type Hypocrea jecorina Cel7a in a monoclinic crystal form 提交 2014-02-26	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 18–449（432 aa）片段：Catalytic Domain (UNP residues 18-449)	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 SM SAMARIUM (III) ION × 1 BEN BENZAMIDINE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；308 K；PEG3350, Benzamidine, Gadolinium(III) chloride hexahydrate, HEPES	分辨率 1.50 Å R-free 0.190
4P1J Crystal structure of wild type Hypocrea jecorina Cel7a in a hexagonal crystal form 提交 2014-02-26	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 18–451（434 aa）片段：UNP residues 18-451	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 SM SAMARIUM (III) ION × 5	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；308 K；PEG 6000, Cellohexaose, Samarium(III) chloride hexahydrate, HEPES	分辨率 2.62 Å R-free 0.213
4UWT Hypocrea jecorina Cel7A E212Q mutant in complex with p-nitrophenyl cellobioside 提交 2014-08-14	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 18–451（434 aa）片段：CATALYTIC MODULE, RESIDUES 18-451	突变：YES 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 CO COBALT (II) ION × 2 GOL GLYCEROL × 1 NPO P-NITROPHENOL × 2 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；298 K；0.1 M NA-MES (PH 6.0), 21% MONOMETHYL ETHER PEG 5000, 0.005 M COCL2, 12% GLYCEROL, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, TEMPERATURE 298K	分辨率 1.20 Å R-free 0.159
4V0Z o-nitrophenyl Cellobioside as an Active Site Probe for Family 7 Cellobiohydrolases 提交 2014-09-19	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 18–451（434 aa）片段：CATALYTIC MODULE, RESIDUES 18-451	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 CO COBALT (II) ION × 2 GOL GLYCEROL × 1 OPO O-NITROPHENOL × 2 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 7；0.1 M NAMES (PH 7.0), 25% M5K, 12.5% GLYCEROL AND 10 MM COCL2	分辨率 1.70 Å R-free 0.157
5OA5 CELLOBIOHYDROLASE I (CEL7A) FROM HYPOCREA JECORINA WITH IMPROVED THERMAL STABILITY 提交 2017-06-20	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 19–451（433 aa）片段：CATALYTIC DOMAIN, RESIDUES 18-451	突变：S8P, T41I, N49S, A68T, N89D, S92T, S113N, S196T, P227L, D249K, T255P, S278P, E295K, T296P, T332Y, V304D, S411F 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；293 K；25.5% POLYETHYLENE GLYCOL (PEG) 4000, 0.17 M AMSO4 AND 15% GLYCEROL	分辨率 2.10 Å R-free 0.244
5OA5 CELLOBIOHYDROLASE I (CEL7A) FROM HYPOCREA JECORINA WITH IMPROVED THERMAL STABILITY 提交 2017-06-20	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 19–451（433 aa）片段：CATALYTIC DOMAIN, RESIDUES 18-451	突变：S8P, T41I, N49S, A68T, N89D, S92T, S113N, S196T, P227L, D249K, T255P, S278P, E295K, T296P, T332Y, V304D, S411F 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3 GOL GLYCEROL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；293 K；25.5% POLYETHYLENE GLYCOL (PEG) 4000, 0.17 M AMSO4 AND 15% GLYCEROL	分辨率 2.10 Å R-free 0.244
5X34 Solution structure of the Family 1 carbohydrate-binding module, unglycosylated form 提交 2017-02-04	构建体不同突变/修饰不同实验环境不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 478–513（36 aa）片段：UNP residues 478-513	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 5；298 K；离子强度（mmCIF原始值）50；压力 1 NMR样品组成 5 mg/mL CBM, 50 mM [U-2H] sodium acetate, 0.1 mg/mL DSS, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 5 mg/mL CBM, 50 mM [U-2H] sodium acetate, 0.1 mg/mL DSS, 100% D2O \| 100% D2O	分辨率未提供
5X35 Solution structure of the Family 1 carbohydrate-binding module with mannosylated Thr1 提交 2017-02-04	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 478–513（36 aa）片段：UNP residues 478-513	未记录	MAN alpha-D-mannopyranose × 1	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 5；298 K；离子强度（mmCIF原始值）50；压力 1 NMR样品组成 5 mg/mL CBM, 50 mM [U-2H] sodium acetate, 0.1 mg/mL DSS, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 5 mg/mL CBM, 50 mM [U-2H] sodium acetate, 0.1 mg/mL DSS, 100% D2O \| 100% D2O	分辨率未提供
5X36 Solution structure of the Family 1 carbohydrate-binding module with mannosylated Ser3 提交 2017-02-04	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 478–513（36 aa）片段：UNP residues 478-513	未记录	MAN alpha-D-mannopyranose × 1	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 5；298 K；离子强度（mmCIF原始值）50；压力 1 NMR样品组成 5 mg/mL CBM, 50 mM [U-2H] sodium acetate, 0.1 mg/mL DSS, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 5 mg/mL CBM, 50 mM [U-2H] sodium acetate, 0.1 mg/mL DSS, 100% D2O \| 100% D2O	分辨率未提供
5X37 Solution structure of the Family 1 carbohydrate-binding module with mannosylated Ser14 提交 2017-02-04	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 478–513（36 aa）片段：UNP residues 478-513	未记录	MAN alpha-D-mannopyranose × 1	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 5；298 K；离子强度（mmCIF原始值）50；压力 1 NMR样品组成 5 mg/mL CBM, 50 mM [U-2H] sodium acetate, 0.1 mg/mL DSS, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 5 mg/mL CBM, 50 mM [U-2H] sodium acetate, 0.1 mg/mL DSS, 100% D2O \| 100% D2O	分辨率未提供
5X38 Solution structure of the Family 1 carbohydrate-binding module with glucosylated Ser3 提交 2017-02-04	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 478–513（36 aa）片段：UNP residues 478-513	未记录	BGC beta-D-glucopyranose × 1	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 5；298 K；离子强度（mmCIF原始值）50；压力 1 NMR样品组成 5 mg/mL CBM, 50 mM [U-2H] sodium acetate, 0.1 mg/mL DSS, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 5 mg/mL CBM, 50 mM [U-2H] sodium acetate, 0.1 mg/mL DSS, 100% D2O \| 100% D2O	分辨率未提供
5X39 Solution structure of the Family 1 carbohydrate-binding module Q2A mutant with mannosylated Ser3 提交 2017-02-04	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 478–513（36 aa）片段：UNP residues 478-513	突变：Q2A	MAN alpha-D-mannopyranose × 1	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 5；298 K；离子强度（mmCIF原始值）50；压力 1 NMR样品组成 5 mg/mL CBM-Q2A, 50 mM [U-2H] sodium acetate, 0.1 mg/mL DSS, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 5 mg/mL CBM-Q2A, 50 mM [U-2H] sodium acetate, 0.1 mg/mL DSS, 100% D2O \| 100% D2O	分辨率未提供
5X3C Solution structure of the Family 1 carbohydrate-binding module Y5A mutant with mannosylated Ser3 提交 2017-02-04	构建体不同配体/离子不同实验环境不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 478–513（36 aa）片段：UNP residues 478-513	突变：Y5A	MAN alpha-D-mannopyranose × 1	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 5；298 K；离子强度（mmCIF原始值）50；压力 1 NMR样品组成 5 mg/mL CBM-Y5A, 50 mM [U-2H] sodium acetate, 0.1 mg/mL DSS, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 5 mg/mL CBM-Y5A, 50 mM [U-2H] sodium acetate, 0.1 mg/mL DSS, 100% D2O \| 100% D2O	分辨率未提供
6GRN CELLOBIOHYDROLASE I (CEL7A) FROM Trichoderma reesei with S-dihydroxypropranolol in the active site 提交 2018-06-11	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 19–451（433 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 CO COBALT (II) ION × 2 F9B 2-[[(2~{S})-3-naphthalen-1-yloxy-2-oxidanyl-propyl]amino]propane-1,3-diol × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；293 K；18% mPEG 5000, 10 mM sodium acetate (ph 5.0), 14% glycerol, 11 mM cobalt chloride	分辨率 1.79 Å R-free 0.188
7NYT Trichoderma reesei Cel7A E212Q mutant in complex with lactose. 提交 2021-03-23	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 18–451（434 aa）	突变：E212Q 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 BGC beta-D-glucopyranose × 1 GAL beta-D-galactopyranose × 1 NPO P-NITROPHENOL × 1 CO COBALT (II) ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；294 K；50 mM morpholinoethane sulphonic acid (pH 6.0), 21.25% polyethylene glycol 5000 monomethyl ether, 12.5% glycerol, 5 mM cobalt chloride	分辨率 1.09 Å R-free 0.142
7OC8 Trichoderma reesei Cel7A E212Q mutant in complex with pNPL 提交 2021-04-26	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 18–451（434 aa）	突变：E212Q 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 NPO P-NITROPHENOL × 2 CO COBALT (II) ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；294 K；50 mM morpholinoethane sulphonic acid(pH 6.0), 21.25% polyethylene glycol 5000 monomethyl ether, 12.5% glycerol, 5 mM cobalt chloride	分辨率 1.60 Å R-free 0.184
7YHF Solution structure of S3C mutant of carbohydrate binding module (CBM) of the glycoside hydrolase Family 7 cellobiohydrolase from Trichoderma reesei 提交 2022-07-13	构建体不同突变/修饰不同实验环境不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 478–513（36 aa）	突变：S3C	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 5；298 K；离子强度（mmCIF原始值）50；压力 1 NMR样品组成 4 mg/mL CBMS3C, 50 mM [U-100% 2H] sodium acetate, 0.01 % w/v DSS, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 2 mg/mL CBMS3C, 50 mM [U-100% 2H] sodium acetate, 0.01 % w/v DSS, 100% D2O \| 100% D2O	分辨率未提供
7YHG Solution structure of S-mono-mannosylated S3C mutant of carbohydrate binding module (CBM) of the glycoside hydrolase Family 7 cellobiohydrolase from Trichoderma reesei 提交 2022-07-13	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 478–513（36 aa）	未记录	MAN alpha-D-mannopyranose × 1	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 5；298 K；离子强度（mmCIF原始值）50；压力 1 NMR样品组成 4 mg/mL CBMS3C-Man, 50 mM [U-100% 2H] sodium acetate, 0.01 % w/v DSS, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 4 mg/L CBMS3C-Man, 50 mM [U-100% 2H] sodium acetate, 0.01 % w/v DSS, 100% D2O \| 100% D2O	分辨率未提供
7YHH Solution structure of S-di-mannosylated S3C mutant of carbohydrate binding module (CBM) of the glycoside hydrolase Family 7 cellobiohydrolase from Trichoderma reesei 提交 2022-07-13	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同	Assembly 1 其他组合单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 478–513（36 aa）	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 5；298 K；离子强度（mmCIF原始值）50；压力 1 NMR样品组成 4 mg/mL CBMS3C-ManMan, 50 mM [U-100% 2H] sodium acetate, 0.01 % w/v DSS, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 4 mg/mL CBMS3C-ManMan, 50 mM [U-100% 2H] sodium acetate, 0.01 % w/v DSS, 100% D2O \| 100% D2O	分辨率未提供
7YHI Solution structure of O-di-mannosylated carbohydrate binding module (CBM) of the glycoside hydrolase Family 7 cellobiohydrolase from Trichoderma reesei 提交 2022-07-13	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同	Assembly 1 其他组合单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 478–513（36 aa）片段：UNP residues 478-513	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 5；298 K；离子强度（mmCIF原始值）50；压力 1 NMR样品组成 4 mg/mL CBM020, 50 mM [U-100% 2H] sodium acetate, 0.01 % w/v DSS, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 4 mg/mL CBM020, 50 mM [U-100% 2H] sodium acetate, 0.01 % w/v DSS, 100% D2O \| 100% D2O	分辨率未提供

共 41 个其他 PDB 条目、44 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	GUX1_TRIRE
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–36； UniProt 478–513

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

下载 Download SAXS (.dat) P(r) (.pr.out) CIF

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	1az6
沉积日期 deposition_date	1997-11-25
结构标题 title	THREE-DIMENSIONAL STRUCTURES OF THREE ENGINEERED CELLULOSE-BINDING DOMAINS OF CELLOBIOHYDROLASE I FROM TRICHODERMA REESEI, NMR, 23 STRUCTURES
关键词 keywords	CELLULASE, NUCLEAR MAGNETIC RESONANCE SPECTROSCOPY, PROTEIN-CARBOHYDRATE INTERACTION; CELLULASE
实验方法 method	SOLUTION NMR

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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier	8.55 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron	9.19 Å
零角强度 I(0) i0	123141000.00
分子量 molecular_weight	84020.0 kDa
排除体积 excluded_volume	101170 Å³
包络体积 envelope_volume	9516 Å³
水化壳体积 shell_volume	7844 Å³
包络直径 envelope_diameter	37.1 Å
壳层 Rg shell_rg	16.04 Å
包络 Rg envelope_rg	11.03 Å
形状 Rg shape_rg	9.22 Å
总 Rg total_rg	9.27 Å
总原子数 total_atoms	11132
残基数 n_residues	828
球谐函数阶数 n_harmonics	20
q 范围 q_range	— – 0.5000 Å⁻¹
数据点数 n_points	101
壳层类型 shell_type	directional
溶剂电子密度 solvent_density	0.3340 e/Å³
壳层衬度 contrast_shell	0.0300 e/Å³
CRYSOL 版本 crysol_version	4.1.3

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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax	30.6 Å
Rg (实空间) rg_real	8.57 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error	0.37 Å
I(0) (实空间) i0_real	1.2310e+08
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error	1.3800e+06
Rg (倒空间) rg_reciprocal	8.56 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal	123100000.0000
解质量估计 total_estimate	0.7669
解质量评级 solution_quality	GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks	3
主峰位置 r_peak_primary	9.7 Å
偏度 Skewness skewness	0.390
峰度 Kurtosis kurtosis	-0.170
角度范围 angular_range	— – 0.5000 Å⁻¹
当前正则化参数 α current_alpha	0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha	20140.0000
实空间数据点数 n_real_points	80
GNOM 版本 gnom_version	4.1.3
质量判据 quality_criteria	AN1: 0.000; Oscil: 0.698; Stabil: 0.999; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.873; Smooth: 0.000

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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

▶

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (1)

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7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 1 domains

SCOP 2.08 (1 domains)

结构域编号 domain_id	d1az6a_
类 Class class	g — Small proteins
折叠类型 Fold fold	g.3 — Knottins (small inhibitors, toxins, lectins)
超家族 Superfamily superfamily	g.3.8 — Cellulose-binding domain
家族 Family family	g.3.8.1 — Cellulose-binding domain

▶

8. 引用文献 (1)

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晶胞边长 a length_a	1.000 Å
晶胞边长 b length_b	1.000 Å
晶胞边长 c length_c	1.000 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	1

空间群 space_group	P 1
空间群编号 int_tables_number	1
晶系 crystal_system	—

描述 description	CELLOBIOHYDROLASE I
分子量 formula_weight	3654.0 kDa
EC 编号 ec_number	3.2.1.91
突变 mutation	Y5A
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A
原子数 atom_count	11132

来源生物 organism	Hypocrea jecorina
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	51453

THREE-DIMENSIONAL STRUCTURES OF THREE ENGINEERED CELLULOSE-BINDING DOMAINS OF CELLOBIOHYDROLASE I FROM TRICHODERMA REESEI, NMR, 23 STRUCTURES

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

CELLOBIOHYDROLASE I

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (1)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 1 domains

SCOP 2.08 (1 domains)

8. 引用文献 (1)

9. 文件与曲线 (10)

Files (7)

Curves (3)

fit	/app/data/saxs_computation/az/1az6/1az6.fit
pddf	/app/data/pr_computation/az/1az6/1az6.pr.out
profile	/app/data/saxs_computation/az/1az6/1az6.dat