1bl8

POTASSIUM CHANNEL (KCSA) FROM STREPTOMYCES LIVIDANS

Method: X-RAY DIFFRACTION Dmax: 66.5 Å Quality: EXCELLENT

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

PROTEIN (POTASSIUM CHANNEL PROTEIN)

Streptomyces lividans

UniProt P0A334

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白同源多聚体 同源多聚体 蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白拷贝数一致 链 A; UniProt 23–119 链 B; UniProt 23–119 链 C; UniProt 23–119 链 D; UniProt 23–119 突变:L90C K POTASSIUM ION × 3 X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件:pH 7.5;ONE-TO-MIXTURE OF PROTEIN SOLUTION AND RESERVOIR (200 MM CACL2, 100 MM HEPES PH 7.5, 48% PEG 400). 分辨率 3.20 Å R-free 0.290

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 86 个其他 PDB 条目、96 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 KCSA_STRLI
Isoform
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 1–97; UniProt 23–119 作者链 B; PDB构建体 1–97; UniProt 23–119 作者链 C; PDB构建体 1–97; UniProt 23–119 作者链 D; PDB构建体 1–97; UniProt 23–119

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

SAXS profile for 1bl8

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

P(r) distribution for 1bl8
下载 Download

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id1bl8
沉积日期 deposition_date1998-07-23
结构标题 titlePOTASSIUM CHANNEL (KCSA) FROM STREPTOMYCES LIVIDANS
关键词 keywordsPOTASSIUM CHANNEL, INTEGRAL MEMBRANE PROTEIN, MEMBRANE PROTEIN; MEMBRANE PROTEIN
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier21.64
回转半径 Rg (电子) rg_electron20.58
零角强度 I(0) i021788600.00
分子量 molecular_weight39876.0 kDa
排除体积 excluded_volume51698 ų
包络体积 envelope_volume58465 ų
水化壳体积 shell_volume23381 ų
包络直径 envelope_diameter66.3
壳层 Rg shell_rg27.49
包络 Rg envelope_rg20.84
形状 Rg shape_rg20.61
总 Rg total_rg21.46
总原子数 total_atoms2823
残基数 n_residues388
球谐函数阶数 n_harmonics20
q 范围 q_range— – 0.5000 −1
数据点数 n_points101
壳层类型 shell_typedirectional
溶剂电子密度 solvent_density0.3340 e/ų
壳层衬度 contrast_shell0.0300 e/ų
CRYSOL 版本 crysol_version4.1.3

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax66.5
Rg (实空间) rg_real21.51
Rg 误差 (实空间) rg_real_error0.31
I(0) (实空间) i0_real2.1790e+07
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error2.5590e+05
Rg (倒空间) rg_reciprocal21.53
I(0) (倒空间) i0_reciprocal21790000.0000
解质量估计 total_estimate0.9087
解质量评级 solution_quality EXCELLENT a EXCELLENT solution
P(r) 峰数 n_peaks2
主峰位置 r_peak_primary27.8
偏度 Skewness skewness0.149
峰度 Kurtosis kurtosis-0.475
角度范围 angular_range— – 0.3650 −1
当前正则化参数 α current_alpha0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha4267000.0000
实空间数据点数 n_real_points68
GNOM 版本 gnom_version4.1.3
质量判据 quality_criteria AN1: 0.000; Oscil: 0.945; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.998; Smooth: 0.975

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 8 domains

SCOP 2.08 (4 domains)

结构域编号 domain_idd1bl8a_
类 Class classf — Membrane and cell surface proteins and peptides
折叠类型 Fold foldf.14 — Gated ion channels
超家族 Superfamily superfamilyf.14.1 — Voltage-gated ion channels
家族 Family familyf.14.1.1 — Voltage-gated potassium channels
结构域编号 domain_idd1bl8b_
类 Class classf — Membrane and cell surface proteins and peptides
折叠类型 Fold foldf.14 — Gated ion channels
超家族 Superfamily superfamilyf.14.1 — Voltage-gated ion channels
家族 Family familyf.14.1.1 — Voltage-gated potassium channels
结构域编号 domain_idd1bl8c_
类 Class classf — Membrane and cell surface proteins and peptides
折叠类型 Fold foldf.14 — Gated ion channels
超家族 Superfamily superfamilyf.14.1 — Voltage-gated ion channels
家族 Family familyf.14.1.1 — Voltage-gated potassium channels
结构域编号 domain_idd1bl8d_
类 Class classf — Membrane and cell surface proteins and peptides
折叠类型 Fold foldf.14 — Gated ion channels
超家族 Superfamily superfamilyf.14.1 — Voltage-gated ion channels
家族 Family familyf.14.1.1 — Voltage-gated potassium channels

CATH v4.4 (4 domains)

结构域编号 domain_id1bl8A00
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology287 — Helix Hairpins
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily70
结构域编号 domain_id1bl8B00
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology287 — Helix Hairpins
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily70
结构域编号 domain_id1bl8C00
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology287 — Helix Hairpins
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily70
结构域编号 domain_id1bl8D00
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology287 — Helix Hairpins
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily70

8. 引用文献 (1)

9. 文件与曲线 (10)