1cic

IDIOTOPE-ANTI-IDIOTOPE FAB-FAB COMPLEX; D1.3-E225

Method: X-RAY DIFFRACTION D_max: 139.0 Å Quality: REASONABLE

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

PROTEIN (IG HEAVY CHAIN V REGIONS)

物种未注明

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4）与蛋白拷贝数一致	链 A； UniProt 1–214 链 C； UniProt 15–228	片段：FAB IMMUNOGLOBULIN FRAGMENT	PROTEIN (IG HEAVY CHAIN V REGIONS) × 1 （P01867） PROTEIN (IG HEAVY CHAIN V REGIONS) × 1 （P01869）	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：pH 4.9；12% PEG 800, 75 MILLIMOLAR SODIUM ACETATE PH 4.85 10MGM/ML PROTEIN CONCENTRATION , pH 4.9	分辨率 2.50 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 1CIC	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
1K6Q Crystal structure of antibody Fab fragment D3 提交 2001-10-17	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 L 5–210（206 aa）片段：Fab fragment	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 3.6；293 K；lithium sulphate, sodium acetate, pH 3.6, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K	分辨率 2.40 Å R-free 0.298

共 1 个其他 PDB 条目、1 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	Q9R1A5_MOUSE
Isoform	—
PDB实体	1, 3
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–214； UniProt 1–214 作者链 C； PDB构建体 1–214； UniProt 15–228

PROTEIN (IG HEAVY CHAIN V REGIONS)

物种未注明

UniProt P01867

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4）与蛋白拷贝数一致	链 B； UniProt 1–217	片段：FAB IMMUNOGLOBULIN FRAGMENT	PROTEIN (IG HEAVY CHAIN V REGIONS) × 1 （Q9R1A5） PROTEIN (IG HEAVY CHAIN V REGIONS) × 1 （Q9R1A5） PROTEIN (IG HEAVY CHAIN V REGIONS) × 1 （P01869）	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：pH 4.9；12% PEG 800, 75 MILLIMOLAR SODIUM ACETATE PH 4.85 10MGM/ML PROTEIN CONCENTRATION , pH 4.9	分辨率 2.50 Å

数据库中的同蛋白其他状态

其他 PDB	相对当前条目 1CIC	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
1HQ4 STRUCTURE OF NATIVE CATALYTIC ANTIBODY HA5-19A4 提交 2000-12-14	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 1–99（99 aa）片段：VARIABLE REGIONS OF FAB LIGHT AND HEAVY CHAINS	未记录	CD CADMIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.2；298 K；PEG 6000, cadmium chloride, hepes, ph 7.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 2.70 Å R-free 0.265
1HQ4 STRUCTURE OF NATIVE CATALYTIC ANTIBODY HA5-19A4 提交 2000-12-14	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 D 1–99（99 aa）片段：VARIABLE REGIONS OF FAB LIGHT AND HEAVY CHAINS	未记录	CD CADMIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.2；298 K；PEG 6000, cadmium chloride, hepes, ph 7.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 2.70 Å R-free 0.265
1MAM CRYSTAL STRUCTURE TO 2.45 A RESOLUTION OF A MONOCLONAL FAB SPECIFIC FOR THE BRUCELLA A CELL WALL POLYSACCHARIDE ANTIGEN 提交 1992-01-14	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 H 1–98（98 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.45 Å
1NBV AN AUTOANTIBODY TO SINGLE-STRANDED DNA: COMPARISON OF THE THREE-DIMENSIONAL STRUCTURES OF THE UNLIGANDED FAB AND A DEOXYNUCLEOTIDE-FAB COMPLEX 提交 1993-03-16	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 H 1–98（98 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.00 Å
1OSP CRYSTAL STRUCTURE OF OUTER SURFACE PROTEIN A OF BORRELIA BURGDORFERI COMPLEXED WITH A MURINE MONOCLONAL ANTIBODY FAB 提交 1996-11-23	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 H 1–98（98 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 1.95 Å R-free 0.295
2RGS FC-fragment of monoclonal antibody IGG2B from Mus musculus 提交 2007-10-05	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 117–334（218 aa）片段：Fc-fragment 链 B 117–334（218 aa）片段：Fc-fragment	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；301 K；20% PEG2000, 0.1 M HEPES pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 301K	分辨率 2.13 Å R-free 0.213
5UBX Crystal structure of a mutant mIgG2b Fc heterodimer in complex with Protein A peptide analog Z34C 提交 2016-12-21	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 108–335（228 aa）片段：UNP residues 108-335 链 B 108–335（228 aa）片段：UNP residues 108-335	突变：P307T, Q309L, V370K, K409R 突变：I253D, F405L	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；293 K；17% PEG 3350, 0.2 M LiCl, 0.1 M Tris, pH 8.0	分辨率 2.70 Å R-free 0.257
6KRU Crystal structure of mouse IgG2b Fc 提交 2019-08-22	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 117–334（218 aa）链 B 117–334（218 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；16% PEG3350, 0.2 M lithium chloride, and 0.1 M Bis-Tris (pH 6.5)	分辨率 2.30 Å R-free 0.237
6KRU Crystal structure of mouse IgG2b Fc 提交 2019-08-22	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 其他组合同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 117–334（218 aa）链 D 117–334（218 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；16% PEG3350, 0.2 M lithium chloride, and 0.1 M Bis-Tris (pH 6.5)	分辨率 2.30 Å R-free 0.237
6KRU Crystal structure of mouse IgG2b Fc 提交 2019-08-22	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 其他组合同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 E 117–334（218 aa）链 F 117–334（218 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；16% PEG3350, 0.2 M lithium chloride, and 0.1 M Bis-Tris (pH 6.5)	分辨率 2.30 Å R-free 0.237
6KRV Crystal structure of mouse IgG2b Fc complexed with B domain of Protein A 提交 2019-08-22	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 117–334（218 aa）链 B 117–334（218 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；60% (v/v) Tacsimate (pH 7.0)	分辨率 3.30 Å R-free 0.250
6KRV Crystal structure of mouse IgG2b Fc complexed with B domain of Protein A 提交 2019-08-22	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 其他组合异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 C 117–334（218 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；60% (v/v) Tacsimate (pH 7.0)	分辨率 3.30 Å R-free 0.250

共 8 个其他 PDB 条目、12 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	GCBM_MOUSE
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 B； PDB构建体 1–217； UniProt 1–217

PROTEIN (IG HEAVY CHAIN V REGIONS)

物种未注明

UniProt P01869

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4）与蛋白拷贝数一致	链 D； UniProt 1–218	片段：FAB IMMUNOGLOBULIN FRAGMENT	PROTEIN (IG HEAVY CHAIN V REGIONS) × 1 （Q9R1A5） PROTEIN (IG HEAVY CHAIN V REGIONS) × 1 （P01867） PROTEIN (IG HEAVY CHAIN V REGIONS) × 1 （Q9R1A5）	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：pH 4.9；12% PEG 800, 75 MILLIMOLAR SODIUM ACETATE PH 4.85 10MGM/ML PROTEIN CONCENTRATION , pH 4.9	分辨率 2.50 Å

数据库中的同蛋白其他状态

其他 PDB	相对当前条目 1CIC	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
15C8 CATALYTIC ANTIBODY 5C8, FREE FAB 提交 1998-03-18	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 H 2–217（216 aa）片段：FAB	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 5.5；pH 5.5	分辨率 2.50 Å R-free 0.251
1ACY CRYSTAL STRUCTURE OF THE PRINCIPAL NEUTRALIZING SITE OF HIV-1 提交 1994-02-10	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 H 1–100（100 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 3.00 Å
1AE6 IGG-FAB FRAGMENT OF MOUSE MONOCLONAL ANTIBODY CTM01 提交 1997-03-06	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 H 1–98（98 aa）片段：FAB FRAGMENT	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 5.6；20-25% PEG4000, BUFFERED AT PH 5.6 WITH 20MM BIS-TRIS.	分辨率 3.00 Å R-free 0.311
1CL7 ANTI HIV1 PROTEASE FAB 提交 1999-05-06	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 I 133–214（82 aa）片段：FAB	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 7；pH 7.0	分辨率 3.00 Å R-free 0.280
1F11 F124 FAB FRAGMENT FROM A MONOCLONAL ANTI-PRES2 ANTIBODY 提交 2000-05-18	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 2–102（101 aa）片段：FAB FRAGMENT (UNP Q65ZR6 residues 18-134, P01869 residues 2-102)	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.6；290 K；PEG 400, sodium acetate, ammonium sulfate, pH 4.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 290K	分辨率 3.00 Å R-free 0.271
1F11 F124 FAB FRAGMENT FROM A MONOCLONAL ANTI-PRES2 ANTIBODY 提交 2000-05-18	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 信息不足异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 D 2–102（101 aa）片段：FAB FRAGMENT (UNP Q65ZR6 residues 18-134, P01869 residues 2-102)	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.6；290 K；PEG 400, sodium acetate, ammonium sulfate, pH 4.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 290K	分辨率 3.00 Å R-free 0.271
1JHK Crystal structure of the anti-estradiol antibody 57-2 提交 2001-06-28	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 H 12–229（218 aa）片段：residues 1-215	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9.1；277 K；PEG4000, PEG8000, Tris-HCl, pH 9.1, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K	分辨率 2.51 Å R-free 0.262
1KC5 CRYSTAL STRUCTURE OF ANTIBODY PC287 IN COMPLEX WITH PS1 PEPTIDE 提交 2001-11-07	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 H 1–101（101 aa）片段：heavy chain	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.2；300 K；20% PEG 8K, pH 7.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 300K	分辨率 2.50 Å R-free 0.270
1KCR CRYSTAL STRUCTURE OF ANTIBODY PC283 IN COMPLEX WITH PS1 PEPTIDE 提交 2001-11-11	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 H 1–102（102 aa）片段：heavy chain	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.2；300 K；18% PEG 3K, pH 7.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 300K	分辨率 2.90 Å R-free 0.277
1L7T Crystal Structure Analysis of the anti-testosterone Fab fragment 提交 2002-03-17	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 H 1–103（103 aa）片段：fab77 fragment	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.8；298 K；peg3350, MES, pH 5.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 2.10 Å R-free 0.275
1ORS X-ray structure of the KvAP potassium channel voltage sensor in complex with an Fab 提交 2003-03-14	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 B 1–103（103 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；PEG4000, Hepes, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K	分辨率 1.90 Å R-free 0.251
1RUQ Crystal Structure (H) of u.v.-irradiated Diels-Alder antibody 13G5 Fab at pH 8.0 with a data set collected in house. 提交 2003-12-11	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 H 1–99（99 aa）片段：fab	未记录	ZN ZINC ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；295 K；0.1 M imidazole, pH 8.0, 0.2 M zinc acetate, 5-7% (v/v) isopropanol, 20% (w/v) PEG 3000, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K	分辨率 1.86 Å R-free 0.256
1RUR Crystal Structure (I) of native Diels-Alder antibody 13G5 Fab at pH 8.0 with a data set collected at SSRL beamline 9-1. 提交 2003-12-11	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 H 1–99（99 aa）片段：fab	未记录	ZN ZINC ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；295 K；0.1 M imidazole, pH 8.0, 0.2 M zinc acetate, 5-7% (v/v) isopropanol, 20% (w/v) PEG 3000, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K	分辨率 1.50 Å R-free 0.238
1S5I Fab (LNKB-2) of monoclonal antibody to Human Interleukin-2, crystal structure 提交 2004-01-21	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 H 1–102（102 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；300 K；PEG-8000, ZnAc, NaN3, Na(CH3)2AsO4, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 300K	分辨率 2.70 Å R-free 0.275
25C8 CATALYTIC ANTIBODY 5C8, FAB-HAPTEN COMPLEX 提交 1998-03-18	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 H 2–217（216 aa）片段：FAB	未记录	GEP N-METHYL-N-(PARA-GLUTARAMIDOPHENYL-ETHYL)-PIPERIDINIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 5.5；pH 5.5	分辨率 2.00 Å R-free 0.292

共 14 个其他 PDB 条目、15 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	IGH1M_MOUSE
Isoform	—
PDB实体	4
链与序列区间	作者链 D； PDB构建体 1–218； UniProt 1–218

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

下载 Download SAXS (.dat) P(r) (.pr.out) CIF

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	1cic
沉积日期 deposition_date	1999-03-31
结构标题 title	IDIOTOPE-ANTI-IDIOTOPE FAB-FAB COMPLEX; D1.3-E225
关键词 keywords	IMMUNOGLOBULIN, FAB COMPLEX, IDIOTOPE, ANTI-IDIOTOPE; IMMUNOGLOBULIN
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier	39.45 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron	40.03 Å
零角强度 I(0) i0	141823000.00
分子量 molecular_weight	93908.0 kDa
排除体积 excluded_volume	116370 Å³
包络体积 envelope_volume	155140 Å³
水化壳体积 shell_volume	36460 Å³
包络直径 envelope_diameter	146.9 Å
壳层 Rg shell_rg	39.60 Å
包络 Rg envelope_rg	40.14 Å
形状 Rg shape_rg	39.96 Å
总 Rg total_rg	40.22 Å
总原子数 total_atoms	6605
残基数 n_residues	863
球谐函数阶数 n_harmonics	20
q 范围 q_range	— – 0.5000 Å⁻¹
数据点数 n_points	101
壳层类型 shell_type	directional
溶剂电子密度 solvent_density	0.3340 e/Å³
壳层衬度 contrast_shell	0.0300 e/Å³
CRYSOL 版本 crysol_version	4.1.3

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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax	139.0 Å
Rg (实空间) rg_real	40.32 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error	1.76 Å
I(0) (实空间) i0_real	1.4180e+08
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error	2.7530e+06
Rg (倒空间) rg_reciprocal	39.78 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal	141700000.0000
解质量估计 total_estimate	0.7387
解质量评级 solution_quality	REASONABLE a REASONABLE solution
P(r) 峰数 n_peaks	2
主峰位置 r_peak_primary	31.3 Å
偏度 Skewness skewness	0.680
峰度 Kurtosis kurtosis	-0.191
角度范围 angular_range	— – 0.2000 Å⁻¹
当前正则化参数 α current_alpha	0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha	13370000.0000
实空间数据点数 n_real_points	41
GNOM 版本 gnom_version	4.1.3
质量判据 quality_criteria	AN1: 0.000; Oscil: 0.589; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.436; Smooth: 0.396

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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	PROTEIN (IG HEAVY CHAIN V REGIONS)
分子量 formula_weight	23761.3 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A
原子数 atom_count	6733

DIVMTQSHKFMSTSVGDRVSITCKASQDVRIAVAWYQQKPGQSPKLLIYWASTRHTGVPDRFTGSGSGTDFTLTISNVQSEDLADYFCQHCGSYPFTFGSGTKLEIKRADAAPTVSIFPPSSEQLTSGGASVVCFLNNFYPKDINVKWKIDGSERQNGVLDSWTDQDSKDSTYSMSSTLTLTKDEYERHNSYTCEATHKTSTSPIVKSFNRNEC

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	PROTEIN (IG HEAVY CHAIN V REGIONS)
分子量 formula_weight	23157.7 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B

QVQLQQPGSELVRPGASVKLSCKASGYTFTNYWMHWVKQRPGQGLEWIGNIYPGSGDSNYDEKFKSKATLTVDTSSSTAYMQLSGLTSEDSAVYYCARGLAFYFDHWGQGTTLTVSSALTTPPSVYPLAPGCGDTTGSSVTLGCLVKGYFPEPVTVTWNSGSLSSSVHTFPALLQSGLYTMSSSVTVPSSTWPSETVTCSVAHPASSTTVDKKLEPS

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	PROTEIN (IG HEAVY CHAIN V REGIONS)
分子量 formula_weight	23678.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	C

DIQMTQSPASLSASVGETVTITCRASGNIHNYLAWYQQKQGKSPQLLVYYTTTLADGVPSRFSGSGSGTQYSLKINSLQPEDFGSYYCQHFWSTPRTFGGGTKLELKRADAAPTVSIFPPSSEQLTSGGASVVCFLNNFYPKDINVKWKIDGSERQNGVLDSWTDQDSKDSTYSMSSTLTLTKDEYERHNSYTCEATHKTSTSPIVKSFNRNEC

实体 4 Entity 4 polymer

描述 description	PROTEIN (IG HEAVY CHAIN V REGIONS)
分子量 formula_weight	23398.2 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	D

QVQLKESGPGLVAPSQSLSITCTVSGFSLTGYGVNWVRQPPGKGLEWLGMIWGDGNTDYNSALKSRLSISKDNSKSQVFLKMNSLHTDDTARYYCARERDYRLDYWGQGTTLTVSSASTTPPSVFPLAPGSAAQTNSMVTLGCLVKGYFPEPVTVTWNSGSLSSGVHTFPAVLQSDLYTLSSSVTVPSSPRPSETVTCNVAHPASSTKVDKKIVPRDC

实体 5 Entity 5 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	128

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7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 16 domains

SCOP 2.08 (8 domains)

结构域编号 domain_id	d1cica1
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.1 — Immunoglobulin-like beta-sandwich
超家族 Superfamily superfamily	b.1.1 — Immunoglobulin
家族 Family family	b.1.1.1 — V set domains (antibody variable domain-like)

结构域编号 domain_id	d1cica2
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.1 — Immunoglobulin-like beta-sandwich
超家族 Superfamily superfamily	b.1.1 — Immunoglobulin
家族 Family family	b.1.1.2 — C1 set domains (antibody constant domain-like)

结构域编号 domain_id	d1cicb1
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.1 — Immunoglobulin-like beta-sandwich
超家族 Superfamily superfamily	b.1.1 — Immunoglobulin
家族 Family family	b.1.1.1 — V set domains (antibody variable domain-like)

结构域编号 domain_id	d1cicb2
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.1 — Immunoglobulin-like beta-sandwich
超家族 Superfamily superfamily	b.1.1 — Immunoglobulin
家族 Family family	b.1.1.2 — C1 set domains (antibody constant domain-like)

结构域编号 domain_id	d1cicc1
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.1 — Immunoglobulin-like beta-sandwich
超家族 Superfamily superfamily	b.1.1 — Immunoglobulin
家族 Family family	b.1.1.1 — V set domains (antibody variable domain-like)

结构域编号 domain_id	d1cicc2
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.1 — Immunoglobulin-like beta-sandwich
超家族 Superfamily superfamily	b.1.1 — Immunoglobulin
家族 Family family	b.1.1.2 — C1 set domains (antibody constant domain-like)

结构域编号 domain_id	d1cicd1
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.1 — Immunoglobulin-like beta-sandwich
超家族 Superfamily superfamily	b.1.1 — Immunoglobulin
家族 Family family	b.1.1.1 — V set domains (antibody variable domain-like)

结构域编号 domain_id	d1cicd2
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.1 — Immunoglobulin-like beta-sandwich
超家族 Superfamily superfamily	b.1.1 — Immunoglobulin
家族 Family family	b.1.1.2 — C1 set domains (antibody constant domain-like)

CATH v4.4 (8 domains)

结构域编号 domain_id	1cicA01
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Immunoglobulins

结构域编号 domain_id	1cicA02
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Immunoglobulins

结构域编号 domain_id	1cicB01
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Immunoglobulins

结构域编号 domain_id	1cicB02
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Immunoglobulins

结构域编号 domain_id	1cicC01
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Immunoglobulins

结构域编号 domain_id	1cicC02
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Immunoglobulins

结构域编号 domain_id	1cicD01
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Immunoglobulins

结构域编号 domain_id	1cicD02
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Immunoglobulins

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8. 引用文献 (1)

▶

晶胞边长 a length_a	75.110 Å
晶胞边长 b length_b	77.650 Å
晶胞边长 c length_c	96.750 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	111.80 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	2

空间群 space_group	P 1 21 1
空间群编号 int_tables_number	4
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	2.500 Å
最低分辨率 resolution_low	7.000 Å
R 因子 r_factor	—
R_work r_work	0.1790
R_free r_free	—

fit	/app/data/saxs_computation/ci/1cic/1cic.fit
pddf	/app/data/pr_computation/ci/1cic/1cic.pr.out
profile	/app/data/saxs_computation/ci/1cic/1cic.dat

IDIOTOPE-ANTI-IDIOTOPE FAB-FAB COMPLEX; D1.3-E225

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

PROTEIN (IG HEAVY CHAIN V REGIONS)

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

PROTEIN (IG HEAVY CHAIN V REGIONS)

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

PROTEIN (IG HEAVY CHAIN V REGIONS)

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

实体 4 Entity 4 polymer

聚合物 Polymer

实体 5 Entity 5 water

7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 16 domains

SCOP 2.08 (8 domains)

CATH v4.4 (8 domains)

8. 引用文献 (1)

9. 文件与曲线 (10)

Files (7)

Curves (3)